rna3662 (mRNA) Diuraphis noxia

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameXM_015507635.1
Unique Namerna3662
TypemRNA
OrganismDiuraphis noxia (Russian wheat aphid)
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
JOTR01000065contigJOTR01000065:637477..652498 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diuraphis noxia NCBI Gnomon annotation (20160302)2016-03-02
Properties
Property NameValue
Transcript idXM_015507635.1
ProductPHD finger protein rhinoceros, transcript variant X3
Model evidenceSupporting evidence includes similarity to: 3 Proteins, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns
GeneLOC107161283
GbkeymRNA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
GenbankXM_015507635.1
GeneID107161283
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
LOC107161283gene2475Diuraphis noxiageneJOTR01000065 637477..652498 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
XM_015507635.1rna3662Diuraphis noxiapolypeptideJOTR01000065 642734..652114 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
id31990id31990Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 637477..637773 +
id31991id31991Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 638211..638329 +
id31992id31992Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 641454..641505 +
id31993id31993Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 642682..642782 +
id31994id31994Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 642842..642990 +
id31995id31995Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 643064..643314 +
id31996id31996Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 643374..643537 +
id31997id31997Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 643599..643747 +
id31998id31998Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 645446..645733 +
id31999id31999Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 645804..645977 +
id32000id32000Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 646059..646186 +
id32001id32001Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 646249..646495 +
id32002id32002Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 646583..649700 +
id32003id32003Diuraphis noxiaexonJOTR01000065 649764..652498 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
XP_015363121.1cds3566Diuraphis noxiaCDSJOTR01000065 649764..652114 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>rna3662 ID=rna3662|Name=XM_015507635.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=7972bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000065:637477..652498+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
tgtacctatatcgcCAATCGCTACTCGCAAGTGTCGAGCATGAAACGATA
AGTGCGAAATTCGTACCGCTCGCATTTTGGTGTTTTCGTACACCGTTTTT
ACCGCCGCTGTTTGGACGTTCGCCGTCGCGTATTCGTCGCCGTGACCGTT
CGTCCGCTAGTGGATATCGCCGCCATCGTCCATTGAACCGCGCTCTCGCC
CGACCTGTACCGCCGCCGATGTAAACGGGCCCCCCCGACCAAATGTGTTG
GACGTGTTGAGAGCTGTTTGAGATTACCTAGTTGGTGTTACACTCATTGA
TTGTCAGTCGCCAGATGACGTCCCGTGTTTCAACTGCAATGGAATGCACT
AGTATTGGTACAGTCCCAACCTGTTTGGCGCTTGAAAATTGATTTctgca
atacaatatatacctgctaATTCTTCTAAAATAACATTCAGACATCTTTA
TTTCTACTCTGCTATGTGgCATCAATGCTGCAGAAGGCGGAGTTAGGTTT
TTATCATTTGCAAACTCAGCATGTCATATAGAACTAAACGTCAACCAATT
TCTAAAGATGAATGTCCATtaccgACAAAGAGGCGGAAGGGGCGCCCTTC
GACGCTACAGGAAGAAGAAGAAGCGTCCTCTTTAGATACTCAAAGTGGCT
CGCGTTCAGATATGAAAATACCAtcatcaatttataatacaagaaTAACA
ACTGATGCACCAGCAGAATTATTTCGTAAAGACTTGATCAGTGCCATGAA
GCTTCCTGATTCTGAACAGTTATCTACTGATGCATATTGGATTATTAGTG
ACCAATGGAAACAAGAATGGGAACGGGGTGTGCAAGTACCTGTTAATCCA
GACTCTTTGCCTGGGTCAAGTGTTCATGAAATTCCAGTTGTCTGCTTACA
GTCTTCAACTAAATCACCTAGGCGTTCACCATCATCAATTTATCACTCTC
AACATAATGAATTTAAactgccaaaacataaatatattcgCATCACTAAA
GACGAACATTTTAAATCCGAAGAACATCAACTGTCACTCTTACCTTTAAA
AGCTGAAAAATCTTGTTCATATGATATGGATGATGTAGATACAGCTTGGT
TAAAACTGTGTAATGGTGAAAGAACATTAGGAGgctTCCCAAAAATAAAA
GATGATCAATTTGAGCGTGTTATGGAAGAATTAGAAATGAGGTGTTGGGA
AAAAGTGCAAACAATAATCAAGGAAGAAGAAGGCCTTGGAATCGAATACG
ATGAGAATGTAATCTGCGATGTATGCCGTTCGccTGATTCAGAAGATGGT
AATGAAATGGTGTTTTGTGATAATTGCAATATTTGTGTTCATCAAGCGTG
TTATGGTATTACCACAATCCCATCTGGGTCTTGGCTATGTCGTACTTGTA
CTTTACGTTTTCGTCCTGAATGTGTACTTTGTCCAAATAAAAATGGTGCA
ATGAAATGCACACGGTCAGGTCATAAATGGGCRCATGTGTCATGTGCATT
GTGGATACCAGAAGTTAGCATTGGATGTGTAGAAAAAATGGAACCTATTA
CCAAAATATCAAGTATACCTccTAGTCGATGGGCTcttatatgtgtattg
tgtcgAGAACGAGTCGGAGCATGTATACAGTGTTCAGTTAAAACATGCAA
GACTGCATATCATGTTACTTGTGCTTTTAAGCACGGTCTTGAAATGAGAG
CTATTATTGAAGATGAGAGTGCTGAAGATGGAGTTAAATTACGGTCATAC
TGTCAAAAACATAGTGTAACTAGTAAAAAAGATAGAAATTCTGGTTCAGA
AGATGAAGATTCTACAAAAAGGAAACGAAAAGATATGACTtctgaagaaa
aaaatcaaGCTAGAGCGGCCAAGCTGCAAGAAATTGAAGGCGAATTTGAA
AAGCATGTCAGTGTCATTGATGTTACACAATGTCGTGATGTTGATAATGA
TggtattctatatatttataattattgggtATTAAAAAGAAGATCTGGAA
ATAACAGACCTTTGTTATTACCAAAATCTGATGATGGTGATCTTCTTGGA
AGACAACAAGAACAAGCagatttagaaaaacataaaatgtttgtacaact
TAGACAAGATTTAGAAAGGGTACGGAATTTGTGCTACATGGTCAGCAGAA
GAGAAAAGCTTTCTCGTAATTTACTCAGCTTACGTGAGCAAACTTTTCAT
AAACAAGTTGCAGTTCTTACAGATAACAAGCTTAATCTTAGTTCAGCAGA
AGTTTCAGCCRTCCAGGAAGCTAATCATGGGCCATCAATATATGATCGAT
TGTATTCGTATCCTGATGCTCCAGACTTGAGCACTGATTTTGAAACTATG
TTATCTCGTATTGCTGGAGATGGTTCTCCAGAAAAATCCAATTATACTGG
TTTAAAGTGGCCTCAAAGTAATAATCCATATAAACGGTCATATATTAATG
GATCTATACGATACTCGAGTATGTCAAGCAGTAGTGATCTTGAACTAAAA
CCTCCTAGACTAATTAGTAGTGAACGATCAAGTATGGATGAAGctgaatt
aattaaatctatgtTGAATAAAcgtaaattaaaagaaaaaaggcTTAATA
AAAAACgttcaaaaacaaaactttCTACTGATTCATCTACTGAAGAAGAA
AATGATAAAGTTAAACAAAAATGGAATGTATCRcctaataaaaaattgtt
acaaattGAAAAGCAATTTGGTAGTGATGATAGTGAAGATGTTTCCTTAC
CAAAACTTTCATCTAAACGTCCAactaaagttaataatatctattctgAC
TCAGATTCTGAAGTGTCAACCAAAGATGATAGTCTCTCGTACACACACAC
TAAAGCAGCAGTTAAAGAGTTCTCTCAAGGAAAGTCTAAAACTAAAGTTC
TTAAAGATAAAAGTACTTCTGTTTCTAAAACTAAAGAATCACTAGAGAag
gatactaaaaaaattaaaaaagatgatcctaaaaataatactacagTGCC
TACAGAACTTATTGTTCCTCAAAGACAAGCTGCTAAGAAAGCTACTGAAA
GTATTCATCGGGTACATAATAAACATGATGAAATTTCAAATGAAAAGAAA
TCTCCAGAAAAACTATTTTCATCACATAGAAAATCTCCTGAAAGGGTTTC
ATCTAATACTAAATCACCAGATAAACAACctattaaagttaataaaatta
aaaacgctgAAAAATTAAGTTCAGTAGAAAAAGAATCTGATCTACAAGAT
TCATTTAGTATTGTTCCACAGAGGCAGGCTGCTAAAAAAGCCATTCAAGG
CATTAAGAGTGGTATGACAAAACCTGTTGAAGAAACTAAAGTATCTGAAC
CTGTTAAAAAAGACGATTCAACTACCAAGTCGAAACGTAGTGCAAAGTCT
TCTTTATCCTCTACATCGAGTAGTAGTTCTTCTAGTAGTTCATCAAGTAC
TTCAAGTACTTCTAGTTCTTCTTCTTCATCAGGTTCGTCTACTTCTGAAA
GTGATACAGAACCAGAAAAGAAGAATAAATCTATTGATCGTGTAAGTCCA
CCAAAAGAAATTAGTAAAACTAAAAGCCCTCCTAAAGCTAAAGGTTGGTT
ATCAGAGAATAAGCCTATTAAAATTAGTTCCTCCTCTAGTAGTGAGTCTG
ATAAAGACCAGAAAGTGATCAGGGCGCCAGACAAGAAGCTTAAAACTTCC
GACAGGCGGCCTGAACACAGGTTTCAGGATCCGCCACCTAAGAGAGAGGA
ATCTAGAAGAAAATCGATTGGAAGTGATCGATGCGATTCTGTTCAAATCG
TCACATGTGGAGATTCTAGTATCGGGGATGATGGAAATAGAAAATCGAGC
GATAGTGACAACGTTGGAACATCAACTAGTCAGCCGGACGGAATTAAACA
AGAAACGAAACAGCCCATACATGCAGTTGAGGACAAAGAGGTTGAGAAGA
AGTTGAAACTTGATGATGGTGATCAGAGAGTTCTCAAAGAAGACCATGGc
cttaacaaaaatattcaagaagtgaaaaataaaaatgtaactccCGTACA
ACATACATCTGataaagaaaataagaaaaccgATGAATTAAACTTGTATT
TACCAGGTGGTCATCGTTTAAATGATCTCAAAGACGAAAATTTATTAAGC
TCTTCATTTCTAACCAGACAAGACATAGAACGagaattagttaataatat
tgattatgataataagAAATACTCTAAAATGYCGTTCAACtgtaataatc
atttttctGGAAGTCAAAGATCAATTTTTTCTCCACAACAATGTAATAAA
GATATTCCAGATTTTGACTTTGATAATGATATGTTAGCTGTTGAACAAGC
TGCAAATGAAGAAGGATTTGGGTTAACAAGAGACACAGATGTTCGAAATG
CTCCATTATCTTTTACATTCAACAATGAGTTCCTCTTCAAAGATGATTCA
AAAGAAATTACAGCTAGAGAAACATTAAACCTTGTTGAAAAGTTGAGATT
AGGAATCACCAAAAAAACTGTACCGTTAGAAAATGAGaacatagaaaata
ttgaattaaacgaTACTCCTAAAATACTTGATCCACCTAAACCATCTGAA
CCAGAACAAAAGACAGACAATATTCTGTATAATGCATACAACAAATTCCA
TCAACAGTCCAATGATGTAGTAGATGTGAATAAAGTTCCAGAACGAGATA
AATTGGATAGGAGTGAAAGTGCTTTATCTGACGAGAGGTGGGTACCACCT
AGTCAACGTAGTCAGGCAGAATCTCCTTATCAGGATATTAATGATGCCAA
CCGTTGGTCAGATAGCGTTGTGATGCCATCTAGACGTTCAGATACCTCCA
ATGAACCATCTCCAGAACATCAAAATCCACCTACAACAGAgtcattatat
caaaatatacactCGTTTCCTACATCTGTTCCAATGCAAATAGAAAGTAT
GCAGTTTCCTCAGTTTTCAGAACCATCATTTGTATTGAACCCACCTTCTA
GTAATCAGTTGTCTTTTATGTCTTCTTCGCGGAATTTTAATCCTCAACAA
TTTGCAATACCTCCACCATTCTCAGCTCATCAAAATTTGATGCCAGAGTT
GAATAAACCATTACATTTGCAGCAAACTCCTTGTACAGCAGCCTTCACTT
CATCAACTCAAAATATGGCATTTACTGCAGCCATGATATCTCCAATGACA
CATCACGATAATTTTATTCCACCGTTTAAtgatataaAATCTGTCATGCA
TACTGTATTCAATGCAATTAATCAAGCATCTATGATTGATAATCAACTAT
CTATTTTACCAACAATTCAAACTCCTAAAACTCCTAAAGTCTCTACCAGT
AATCAAATTTCTGGTAGTCATRATCTAATCCCAGCTTCAACAAATAACCA
AACCcaagaaattaatttacaatcaaCCTCAAATCAACACCAAGTACCAG
TAACTTCTAATAATCAAACTGAAATAACTCTTTCACAATCAATTTCAAAC
AATCAAGAACCTGTTTTTAgtcaaagtaaaattaatagtgAACAAGTAAC
GCCCAAGAATCAATTAGCAGCACCAATATCAAACCAAATACCATTGAATA
AACAACAATCGATTCCAGAAGTACATACACCGTTAGTATGTCAAGCAGAA
GTTAGTCAACAAAACATCATTAATCAAACACCAGTGCAGACCCCTATCAG
TGTCAGTCAAGTATCTAATCAAACTACTCCAAGTATACCAACTCCTAAAC
AATCACCTGCTCTTCCTACAACTCCTTTGCCAGAACGATCACCAATGTCA
ATTATTGCTTCATCTCCTTCTGTGACTAGTTCACCACATCCTAATCGCAC
ACCTTCTGATAAAAAATCTCCTTCTAAACCTACTCGATCTTCAAGTCGTG
TTACTGCTCAATCTTATAAATCACCTGAAATAGTTGATCATTCACCAGAA
GTTAAAAAACAGAATAAACGAGGACCAAAACCTCAATCCAAAACTTCTGG
ACGTGGTCGAGGTCGTGGGCGTGGGCGTTCATCGAATCATTTTACTGATT
ATAATCCTGCTGTTAGTAAGCTTGCTGGTACTGCTTATGATCTTGATTTT
GTCGAAGAATttggtaatgataataatggtgTTATGGAGAATCTTCGAGC
AATGCGTGAACGTAAAAAGTCTGATGTTAAAGCTGATAGTAAATCACCTG
TATCTCCTAAAGTACATAGCAGCCCTAATAACTATAGAAGAAAACATGCT
AGTATAAAAGAACTTAAACCTCCTTCCCCCATCACGGAAACTCCTATTGA
AGATCCACCAGCTCAAATAATAATGGATGAACTGACTCCTATGTTACCTG
CGCCCGTTGATATGAGAACATATGATTCATACGATAATACAACATCATAT
TCTGATAACATTTATGAAACCAACACTAATGTTGATGATAAAGTAACTGA
TATTGTGAATACCTTAAAAGAAGActtacataatttttcaaaattatctt
CCAAAGATAAAGATATTGAAGAtcagttaattttaattgatgacCAGATC
AAGATAATTAAATTACCCCCTCCTGTTGAAAAAGAACCAGTAGCATCGAG
TACAGTATTGCAAAGTGAATCTAGAAatcaattaaaagttaaaataaaag
gtCCTTTCTTAAATGCTAAATACAACAACATTCAAAATCAGCCAATATTA
CCAACAATTGATACATCAGctataagtatgaatatacCAAGCCATTCAGT
TCCTCCTTCAGAAGCTGCTAGTGTACCCTCCAATTTCAGACAAATGAGAA
AAAAAGAATTACTGCGACAATATTGTAACCAACAAGATAATATCGAACAG
ACAACAAACCATCCCGTAGTCCCTCCATTAAGTCGAAATATCATTACCAT
ACCAAAAGCGGTAGCATCAATGACTACAATCCCTACTAAAGAAGACTACA
AAGCAGTGGTAGATGCTAATATGGAAAAGAAGCGTACTAAATATGGATCT
GATGATCcaaaatctaattatttcaacaatattcGTAAAGAAGCWACAAC
acctaagataaaaataaaaattggtggCGAACAACCTATGGTCACAACAA
TGGAAGAAAAACGTAGTCTCCGTCCGCCCAAAAAAAGGATTTGTGATACT
CAAAATGATGATACTAATCATTTGATAGCACCTACTATGGAACAGTTAAG
GCGAGACAGTATgaaattcagaaaaaaagtatttgctCGTTTTGAAGAAG
ATGCATTAGCATCTACTTCAATTCCTATAGCTACtgttgcaaaaaataaa
aagaaacgtCGGTCTAGTCCATCAGTATCTAGAAAAAAGAAACCACGCAC
AAATAAAGAGATATCTCAGGTTCAAGTGATAGAAGCTAAAGAAAGCACTC
CAAAATTGATTATTAGATTCTCAAAAGCAGCACCTGATGAAGCTGAAGTA
AGTGCAGTAACAGAGCCAAAAAAAGCTTCTCCTATTAAACTGAAAATATC
TAGATGCAAAGAAGGATATGTTATGAAACCTCCTAGTAAYCAAACGAATC
CTGATActtcattaaacaataattgtgaAGTTAGGTGACggtaaaaattc
ttataaatttagATCAATCTTATCATTGATAAGCATTTYgtgtaaaaaaa
ttaataaaatgtaatttatttatttaattttagtttgtacattcttattt
atttatttaaaaaatttttaatttatttaaaatgtaaattcataatatta
agacGTTGTTTTCCTCAATTTGTTGTTAATTGAActattaatacaaacaa
atgtTCTATGAATACTccaagttattaatattatcatgttaaggCCAGCA
GatgtcaattaattttaattttgttatctaGTTTAAGATAAGAAATTTTC
ATGTTAATGTgcaatatgcaaaatattatgtaaagtattttttttttttt
tttaagtattgttaacctttta
back to top

protein sequence of XM_015507635.1

>rna3662 ID=rna3662|Name=XM_015507635.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=2356bp
MSYRTKRQPISKDECPLPTKRRKGRPSTLQEEEEASSLDTQSGSRSDMKI
PSSIYNTRITTDAPAELFRKDLISAMKLPDSEQLSTDAYWIISDQWKQEW
ERGVQVPVNPDSLPGSSVHEIPVVCLQSSTKSPRRSPSSIYHSQHNEFKL
PKHKYIRITKDEHFKSEEHQLSLLPLKAEKSCSYDMDDVDTAWLKLCNGE
RTLGGFPKIKDDQFERVMEELEMRCWEKVQTIIKEEEGLGIEYDENVICD
VCRSPDSEDGNEMVFCDNCNICVHQACYGITTIPSGSWLCRTCTLRFRPE
CVLCPNKNGAMKCTRSGHKWAHVSCALWIPEVSIGCVEKMEPITKISSIP
PSRWALICVLCRERVGACIQCSVKTCKTAYHVTCAFKHGLEMRAIIEDES
AEDGVKLRSYCQKHSVTSKKDRNSGSEDEDSTKRKRKDMTSEEKNQARAA
KLQEIEGEFEKHVSVIDVTQCRDVDNDGILYIYNYWVLKRRSGNNRPLLL
PKSDDGDLLGRQQEQADLEKHKMFVQLRQDLERVRNLCYMVSRREKLSRN
LLSLREQTFHKQVAVLTDNKLNLSSAEVSAXQEANHGPSIYDRLYSYPDA
PDLSTDFETMLSRIAGDGSPEKSNYTGLKWPQSNNPYKRSYINGSIRYSS
MSSSSDLELKPPRLISSERSSMDEAELIKSMLNKRKLKEKRLNKKRSKTK
LSTDSSTEEENDKVKQKWNVSPNKKLLQIEKQFGSDDSEDVSLPKLSSKR
PTKVNNIYSDSDSEVSTKDDSLSYTHTKAAVKEFSQGKSKTKVLKDKSTS
VSKTKESLEKDTKKIKKDDPKNNTTVPTELIVPQRQAAKKATESIHRVHN
KHDEISNEKKSPEKLFSSHRKSPERVSSNTKSPDKQPIKVNKIKNAEKLS
SVEKESDLQDSFSIVPQRQAAKKAIQGIKSGMTKPVEETKVSEPVKKDDS
TTKSKRSAKSSLSSTSSSSSSSSSSSTSSTSSSSSSSGSSTSESDTEPEK
KNKSIDRVSPPKEISKTKSPPKAKGWLSENKPIKISSSSSSESDKDQKVI
RAPDKKLKTSDRRPEHRFQDPPPKREESRRKSIGSDRCDSVQIVTCGDSS
IGDDGNRKSSDSDNVGTSTSQPDGIKQETKQPIHAVEDKEVEKKLKLDDG
DQRVLKEDHGLNKNIQEVKNKNVTPVQHTSDKENKKTDELNLYLPGGHRL
NDLKDENLLSSSFLTRQDIERELVNNIDYDNKKYSKMXFNCNNHFSGSQR
SIFSPQQCNKDIPDFDFDNDMLAVEQAANEEGFGLTRDTDVRNAPLSFTF
NNEFLFKDDSKEITARETLNLVEKLRLGITKKTVPLENENIENIELNDTP
KILDPPKPSEPEQKTDNILYNAYNKFHQQSNDVVDVNKVPERDKLDRSES
ALSDERWVPPSQRSQAESPYQDINDANRWSDSVVMPSRRSDTSNEPSPEH
QNPPTTESLYQNIHSFPTSVPMQIESMQFPQFSEPSFVLNPPSSNQLSFM
SSSRNFNPQQFAIPPPFSAHQNLMPELNKPLHLQQTPCTAAFTSSTQNMA
FTAAMISPMTHHDNFIPPFNDIKSVMHTVFNAINQASMIDNQLSILPTIQ
TPKTPKVSTSNQISGSHXLIPASTNNQTQEINLQSTSNQHQVPVTSNNQT
EITLSQSISNNQEPVFSQSKINSEQVTPKNQLAAPISNQIPLNKQQSIPE
VHTPLVCQAEVSQQNIINQTPVQTPISVSQVSNQTTPSIPTPKQSPALPT
TPLPERSPMSIIASSPSVTSSPHPNRTPSDKKSPSKPTRSSSRVTAQSYK
SPEIVDHSPEVKKQNKRGPKPQSKTSGRGRGRGRGRSSNHFTDYNPAVSK
LAGTAYDLDFVEEFGNDNNGVMENLRAMRERKKSDVKADSKSPVSPKVHS
SPNNYRRKHASIKELKPPSPITETPIEDPPAQIIMDELTPMLPAPVDMRT
YDSYDNTTSYSDNIYETNTNVDDKVTDIVNTLKEDLHNFSKLSSKDKDIE
DQLILIDDQIKIIKLPPPVEKEPVASSTVLQSESRNQLKVKIKGPFLNAK
YNNIQNQPILPTIDTSAISMNIPSHSVPPSEAASVPSNFRQMRKKELLRQ
YCNQQDNIEQTTNHPVVPPLSRNIITIPKAVASMTTIPTKEDYKAVVDAN
MEKKRTKYGSDDPKSNYFNNIRKEATTPKIKIKIGGEQPMVTTMEEKRSL
RPPKKRICDTQNDDTNHLIAPTMEQLRRDSMKFRKKVFARFEEDALASTS
IPIATVAKNKKKRRSSPSVSRKKKPRTNKEISQVQVIEAKESTPKLIIRF
SKAAPDEAEVSAVTEPKKASPIKLKISRCKEGYVMKPPSNQTNPDTSLNN
NCEVR.
back to top

mRNA from alignment at JOTR01000065:637477..652498+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>rna3662 ID=rna3662|Name=XM_015507635.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=15022bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000065:637477..652498+ (Diuraphis noxia)
tgtacctatatcgcCAATCGCTACTCGCAAGTGTCGAGCATGAAACGATA AGTGCGAAATTCGTACCGCTCGCATTTTGGTGTTTTCGTACACCGTTTTT ACCGCCGCTGTTTGGACGTTCGCCGTCGCGTATTCGTCGCCGTGACCGTT CGTCCGCTAGTGGATATCGCCGCCATCGTCCATTGAACCGCGCTCTCGCC CGACCTGTACCGCCGCCGATGTAAACGGGCCCCCCCGACCAAATGTGTTG GACGTGTTGAGAGCTGTTTGAGATTACCTAGTTGGTGTTACACTCATGTA AGTactcgtatattttttaaaacttctcTGGGCTTGCTTGATCGGTCTCT AACCCGGATGAGCCGTTGAGCCGATTGCAATTTTGGTTGTTAACGATTTT TTTCTCATGTCCTTTTTTTTCCTCTTCCCCGTCAAATCAAAACACGAAAA CACGGGAAAACGGCGGTGGTGCCATCTGCCGGCCGCCCGCATTTGTTGTC ATTATctacgttttattattacgcTCCtgagtgtaaaaatattaatttat gttatatttttattatattatagtatatattctTTCAGTGGGAAATCACA TACGGATTTTCCTAATTTTCTCCCCTCCCCCCCATTTAATAGTAGTCTAA TTTTACTTTCGTCACKTGCAACCAAATCCGTGATCTAACAAGCGCCCTAA CGTTTTTTCTTATGTCTCTTGTTTGTGTTCTTAGTGATTGTCAGTCGCCA GATGACGTCCCGTGTTTCAACTGCAATGGAATGCACTAGTATTGGTACAG TCCCAACCTGTTTGGCGCTTGAAAATTGATTTctgcaatacaatatatac ctggTAAGTTGTTGACGCTCATCACACACCATTCCTATTAGGTGTTGTAT AGATGTAAGTGTGTGCGTGTAATGCAACTAAGACCTCATAGTTCTTAGCA TCTTGAGCATCTTACATAGGTTCTATCTCTCAATTTCTATATGtactatc aatatttattttattttattctttcagTTCGTTCAATTGGCTAAATTATT AATGTCATACCTGCATGTATTGTTTAATTCATGCCGGGTCTCACTAAACA CTTGATAAATTAACAGTGAGCTAATTGTCCTTTAAACAACATTTAGTGgt ctattaaattttagtaatccattaatttcaatcaattttttatgcaacac gacatatatatgttaaaattgCGTCTGAGGAAGGTGCAGAACCGTTATAA CTTCAtcatataggtaacaataatatctGTTGGTTTTGCGTTAgagatta ttgtattatatttatttctttagaCTTAGTACTATAGAATACTTYttata ttataaattggtatatttttataattttatttgaagtgACTCTTAAGAAC AATGGccattgatataaaatatgcacataggtagttttatttatataaat atgaatcatATGATAATAGATTATTAGGAACATGgttcataaatacaaaa atatcaatttaagcAGTTTGTTAAGAAAATTGCGACAACTAAGaatttta ttgtgataaaaataatgttgaggTTCTAATTAACTTATGGGCAAAtcatt ggaaaataaaaataaaccaaatcaATTCACGTAACATTCACTTAACAAAA CTCTGACTGCCTTCCAGTTACACTCAGCAACAAAATCCTTCCTTCAGCAA ACAAAGTTAAGTACTTAGGGCTCACATTTGACAAACGTCTTACGTGGGKT CCACACCTAAAACTAAAGCGGAAACAAGTTAACTCCAGGCTGCACCTCCT TAGACCccttttaaaatctaaactatCCCTAACAAACAAGGTGACAATAT ATAAAGCGATAATCCGCCCTGTCTGGCTCTATGGCATTCAGCTATGGGGG TCTTCAAAGCCTTCCAATACCAGCTGAACTCTACAAGCTTTTCAATCAAT ATGCCTACGCCTAATAACCTCCGCCCCCTGGtacgtaacaaataaaaatc ttcACAAAGATTTAAATCTACCTACTCTTAACGATTTGGCCAAATCCCAT TATACCAAATTCTTTTCCAAACTCCACACTCATTACAACCCTTTAATCCA AAAATTATCCTCTGCCACACACGCTCCCAAAAGACTAATAAGGCTGTGGT CCCGAGACATGCTCAAagcataaacacaaaaaaaaaaaattaaaactata ccataattaacttaatgttaCTTGTCAGGTGGCACTACTGAGGGCCTTCC TTTTCTAATCTCCTTAATGTCGTAATAAAATTTTGTCATCATACTTActg attattgtaaaaatagattgtaaatatgttcttctaaataaattttaaaa aaaaaggttctaATCGAACAAATTCAATagtgataattaatatattttac actgaGATTCTCTAATGTTGCACTACAAATATTCAATTAGGTACCCATTA GTTTAAGTACTAAAAGtactacttatttattttggcattttatttgttca aaacaattttttatgttttgtaaattgAGTTAGCTGTTTTCATAAAAGTC TTATAATTAAACTCAATTGATTAAggataacttaaatttttattaaataa gattacctaaatattaatacaagaaGTTAAATCTTCtatgtttatcatta taataatttattaatgaaaatcctacttttataaatatttggttattatt ttataagctttctacctagtataatttaatataatattttctataaatat tcaaaacttgaaatatatattttttcaattataaataatctgcTGTTCTA AATTAGGCMttaaataaattataatttattaggtacctagtaggtattta atatttacaaaattggaacatttatattaagtaattactTCTTCTTGTTA GGCCCATTACCATTCCTGTGTGTAATTCCAATAGTTACATAAATGCAAAT TCAACAATTTGTAAAGTGTGAACCTACTTTTGTGATGTTGGTTCCAgtca ttaatatgtaaataactaCTACCTGATTTTAATGATCTTTTTTGACATAC TcattgaatcattttttatatttttggctTTATcgcataaatcaaaataa taaattaacccaagtaaattcaacatttttaaaagctcactaattaattt taataatcactaCTAACCTATTAATTGGCTTTGAATAGACAGAACTCACA TTTTGTGGAACTGAATAAAACTGCTATCCATCACCTAGTGACTTTCTATY cttaatattatataggtagttaaccACAAAAAAGCGAAACAATTTTCaag ttcttaaaaatgtataaacatgaTTTGGCCTttctaaaagaaatttaaag aCTATTCTTTGTAGTTKtaattataattttacaggtGGTAGCTACCTCTA GTGGAATTCAATCATTACAGACTTCAGCATTAGGGAAGTTTATTCAGTTT ATGCAAAACTAGTCTTTTTAATTCTGAATATACTATGATCACTATGCTTC CATTCTATTATAACTCAGTTTctcataatttgtaatttgtaaataaaaat aaaacatagccCATTCCTTTATTTTCTAAGGTCACTTACCAAATAGTCTT ACCCTTTGTATTGCCTTTGTATTgtatagtcattttttttagaattttta atcaaaaatatattgcagttttatcatttttatttggaCTTACAAAACGG AATATATTGTTAAGGTTCaacattttaaagattaatatttaaagaaataa ttccAGAGTAATTCAATCTTatccttattttaatttttgttttagtaacc tacctatatttatatttgcttACTAAACCATCATGCTGTGTGTTGAATGT ACCCTATTTATTTTCGGATCACTAGTCTGTATTGATACCTGGTTGTATCT AAATATTTGGCATTTTCTTTCTATATGAGCGAATTTATTTCCTCAATCCA gcttataatgatttatttatttttcagctaATTCTTCTAAAATAACATTC AGACATCTTTATTTCTACTCTGCTATGTGGTAAGTAGattcaattttttg ttgttttttttttaaacagattttttACCTCTCATTTTACTAATAGAGTG CCCATACCTATCTATAGGGTAGCTACAGTAATGACTTATCATAAATACAG CAGTGATGTattcctaaataatatattagaWCCATAAAGTTGTTGtgtga ttatttttaagaaaccaCTTAATTTATTCATCAGAAAATTATGTTAGAAT GAATTTTTGTCCTTTTGTGACTAGCTAAATACACACTTACAGGAACATTT CATTTTTGTACCTATGTTGGCAGGTACAGTGGCRTATCTAATAGAAAttc ttttttcttcaaatacCAATAgattttataccaatatttagataaataat gaaCTCAAGGCCTTAAGTTGCTTTCATTTAGTATTAtggaactaaattta aaaaaattacggaTAAGTATTATTTCATGGTACCTAATAGtttctaataa ttatgatttgaatTATAACTTAATTCCSGgcttaattctaatatttttat aaaaaacaataagtttTTTTRtgattaaatttaaaactgtttgCATTtgg ttaattttgatattagaatttgttattgtaaaaactattgcatttcttta tttaataatattatcMTTTACCGAAAGCtaactgtataattttaaataaa acctgGTTCTCATGATTTTCGTCTTAAATTACAAGATCATAAATATCCca agattaaataaaatctcgaataaaataaaaattaatgttgcagagcaaaa atagtataatagtgaaaaggttaataatgattttacgtacatacctactt taatttttGGAGGATGAATCCCCTTACAccctatataaacaatatacacc AATGATATAAggtctatattaaaaaatacatacctacatttattttacgc agatagaatatattatattatagttggttataattgaacttatttttgtg aaaaattattcatttcatagttaacaaaacatttttttatcaataaggTA CCTAGtaacttattacttttattaattttaatttaagtgttTATAGAAAC TAATGAATCAGACACTtttaaaagatacattttttatcctaaaaaaaaaa tgaaatagctatagttatttaatattgtattgtatagcttttttttatac aacaggCATCAATGCTGCAGAAGGCGGAGTTAGGTTTTTATCATTTGCAA ACTCAGCATGTCATATAGAACTAAACGTCAACCAATTTCTAAAGATGAAT GTCCATGTAAGTACTAAAAGTAACCAACTAAAATAAgtatatctaaattt attttatttttatagtaccgACAAAGAGGCGGAAGGGGCGCCCTTCGACG CTACAGGAAGAAGAAGAAGCGTCCTCTTTAGATACTCAAAGTGGCTCGCG TTCAGATATGAAAATACCAtcatcaatttataatacaagaaTAACAACTG ATGCACCAGCAGAAGtagatattttcttttatttacatattaYAAACTTT ATGTTAacgtttactttttttaaattttccattttaGTTATTTCGTAAAG ACTTGATCAGTGCCATGAAGCTTCCTGATTCTGAACAGTTATCTACTGAT GCATATTGGATTATTAGTGACCAATGGAAACAAGAATGGGAACGGGGTGT GCAAGTACCTGTTAATCCAGACTCTTTGCCTGGGTCAAGTGTTCATGAAA TTCCAGTTGTCTGCTTACAGTCTTCAACTAAATCACCTAGGCGTTCACCA TCATCAATTTATCACTCTCAACATAATGAATTTAAactgtatgtatttaa tatatttaatcttctctaataattataatttaatgatcttATTTTAGgcc aaaacataaatatattcgCATCACTAAAGACGAACATTTTAAATCCGAAG AACATCAACTGTCACTCTTACCTTTAAAAGCTGAAAAATCTTGTTCATAT GATATGGATGATGTAGATACAGCTTGGTTAAAACTGTGTAATGGTGAAAG AACATTAGGAGGTAATAAGTCAAAAgagttttaaacaaatacattaaaat attaaactaaatatttttttaggctTCCCAAAAATAAAAGATGATCAATT TGAGCGTGTTATGGAAGAATTAGAAATGAGGTGTTGGGAAAAAGTGCAAA CAATAATCAAGGAAGAAGAAGGCCTTGGAATCGAATACGATGAGAATGTA ATCTGCGATGTATGCCGTTCGGTTAGTTcgctgttaaataatattttata tctacttATTATAAAGGAACATtaagatacaaaatattatattacgtact aAGAAATCTTATACTTGCTTRTGTTCCCTCTGTCATGCCAATGTACAACA GCAAATTTATATTTAGCCAAACCAATTTTgtgttaatttgtatataaagt aaaaaaaaataaggtaatatagcgagtgattcttttatcattgaacactc attatttcaaaaattattgtttttgaaaatattattttacatagtttcaa gttgttaaaaaacctacgtttttattaaaaaaatattttttatccatata atttaataagttttttacttttttgaaccacaacatagatttttaatttc atattccaaagcagaatatttttctaagtattttgattcataaaaatYGA ATTTATAATGagtattttatgagttataagtatttaaagttcgacaagcg gagtagtggacaagcattttgcggggtaaccccgtaccactccactctgc caatcagaactttaaatacttataactcatcaactactcgtcctaaattc gatttttatgaatcaaaatattctgctttggactatgaaattaaaactat gttgtcatacaaaaaagtaatgaacttaaaaaatattttaaaataaaatt ttttaataaaaacgttggtttttgaaYAACttgaaactattaaaaaaata ttttcaaaaacattagtaatttttgaaataatgaatgttcaatgataaaa taatcaccagGTATAGGTAAACATMTTATCTCCATTATGATTGCAACACA CTGTAGGGTTGCTGGTAAAATTCTATTGTCTTGACGAGGGCAGTAATTGT GTCCGGCTGCAAGTAGGaacaattactattaaatattaaaatattgtaaa aatttagtttataaataggtaatattcttacctttaaatttgataaaagg tCAAAATTGGTTCTACTgcacacaaattatttatgatgtacATTGTAAGA TAGAGCAACACATGCATTTATGGCTGTGTTTTTGTCACTGACCAGATTAA GTAACAATTATTTGAATCGgcttagcatttttttttaaaaataatttggt tttaaCATTATTCTAATATCTCTAATGTTCCTAAAGAAACCTAGTAACAT AAAGatgacttatttaattttttcatttctgCAGTAACTTATAACTAGTT AACAGAATTCCATCATTTAAAGTATTTGAGCACTTACAGTAGTTTTAAGA CAGTTTACATGGAGCTTTTGTTTGGATTTtccttgttttatttattaaaa tgtgtatgcaAAGTCTGTATCAGATGAACCAGACAAATGAAGTAACTCaa gttaaaatcaatatttttttattatatttaaaaatactcctGTATTTcgt gcattataaaatatatatttttgttaattataaaatagacaatttttaga tcgattttttttaaaaatgattgatgGTAAAAAACGTTTATCCATGTTAa gtgtttcattttttataataaccatacttaaataataattgagaaaatta AGTACAGTTcttaaaatatctcaaaaacaTAAGATACTCTATAAACTATT ACAATAGTTATTGAGgctggaaataatttaatatttataaatatataata acaatttttatcattttagccTGATTCAGAAGATGGTAATGAAATGGTGT TTTGTGATAATTGCAATATTTGTGTTCATCAAGCGTGTTATGGTATTACC ACAATCCCATCTGGGTCTTGGCTATGTCGTACTTGTACTTTACGTTTTCG TCCTGAATGTGTACTTTGTCCAAATAAAAATGGTGCAATGAAATGCACAC GGTCAGGTCATAAATGGGCRCATGTGTCATGTGCATTGTGGATACCAGAA GTTAGCATTGGATGTGTAGAAAAAATGGAACCTATTACCAAAATATCAAG TATACCTGTAAGTATCATCAGAAACATGGTACTATAAAtcaagaattaaa taataataatatattacattattttagccTAGTCGATGGGCTcttatatg tgtattgtgtcgAGAACGAGTCGGAGCATGTATACAGTGTTCAGTTAAAA CATGCAAGACTGCATATCATGTTACTTGTGCTTTTAAGCACGGTCTTGAA ATGAGAGCTATTATTGAAGATGAGAGTGCTGAAGATGGAGTTAAATTACG GGTTAGTATCATTAGACATACATttcatgcatttaaaattttatgataca gtattattgaaacaatttactaaatattCTAGTCATACTGTCAAAAACAT AGTGTAACTAGTAAAAAAGATAGAAATTCTGGTTCAGAAGATGAAGATTC TACAAAAAGGAAACGAAAAGATATGACTtctgaagaaaaaaatcaaGCTA GAGCGGCCAAGTAAgcatatatcaaaaaaattaaaatgaataatacattt tataaaaatgatttttttgcaGGCTGCAAGAAATTGAAGGCGAATTTGAA AAGCATGTCAGTGTCATTGATGTTACACAATGTCGTGATGTTGATAATGA TggtattctatatatttataattattgggtATTAAAAAGAAGATCTGGAA ATAACAGACCTTTGTTATTACCAAAATCTGATGATGGTGATCTTCTTGGA AGACAACAAGAACAAGCagatttagaaaaacataaaatgtttgtacaact TAGACAAGATTTAGAAAGGGTAAGTTATTAAActgacttaaatattatta ctttagtacatgttacaataattgaagttaattattaaattaaatttggt tgTTAGGTACGGAATTTGTGCTACATGGTCAGCAGAAGAGAAAAGCTTTC TCGTAATTTACTCAGCTTACGTGAGCAAACTTTTCATAAACAAGTTGCAG TTCTTACAGATAACAAGCTTAATCTTAGTTCAGCAGAAGTTTCAGCCRTC CAGGAAGCTAATCATGGGCCATCAATATATGATCGATTGTATTCGTATCC TGATGCTCCAGACTTGAGCACTGATTTTGAAACTATGTTATCTCGTATTG CTGGAGATGGTTCTCCAGAAAAATCCAATTATACTGGTTTAAAGTGGCCT CAAAGTAATAATCCATATAAACGGTCATATATTAATGGATCTATACGATA CTCGAGTATGTCAAGCAGTAGTGATCTTGAACTAAAACCTCCTAGACTAA TTAGTAGTGAACGATCAAGTATGGATGAAGctgaattaattaaatctatg tTGAATAAAcgtaaattaaaagaaaaaaggcTTAATAAAAAACgttcaaa aacaaaactttCTACTGATTCATCTACTGAAGAAGAAAATGATAAAGTTA AACAAAAATGGAATGTATCRcctaataaaaaattgttacaaattGAAAAG CAATTTGGTAGTGATGATAGTGAAGATGTTTCCTTACCAAAACTTTCATC TAAACGTCCAactaaagttaataatatctattctgACTCAGATTCTGAAG TGTCAACCAAAGATGATAGTCTCTCGTACACACACACTAAAGCAGCAGTT AAAGAGTTCTCTCAAGGAAAGTCTAAAACTAAAGTTCTTAAAGATAAAAG TACTTCTGTTTCTAAAACTAAAGAATCACTAGAGAaggatactaaaaaaa ttaaaaaagatgatcctaaaaataatactacagTGCCTACAGAACTTATT GTTCCTCAAAGACAAGCTGCTAAGAAAGCTACTGAAAGTATTCATCGGGT ACATAATAAACATGATGAAATTTCAAATGAAAAGAAATCTCCAGAAAAAC TATTTTCATCACATAGAAAATCTCCTGAAAGGGTTTCATCTAATACTAAA TCACCAGATAAACAACctattaaagttaataaaattaaaaacgctgAAAA ATTAAGTTCAGTAGAAAAAGAATCTGATCTACAAGATTCATTTAGTATTG TTCCACAGAGGCAGGCTGCTAAAAAAGCCATTCAAGGCATTAAGAGTGGT ATGACAAAACCTGTTGAAGAAACTAAAGTATCTGAACCTGTTAAAAAAGA CGATTCAACTACCAAGTCGAAACGTAGTGCAAAGTCTTCTTTATCCTCTA CATCGAGTAGTAGTTCTTCTAGTAGTTCATCAAGTACTTCAAGTACTTCT AGTTCTTCTTCTTCATCAGGTTCGTCTACTTCTGAAAGTGATACAGAACC AGAAAAGAAGAATAAATCTATTGATCGTGTAAGTCCACCAAAAGAAATTA GTAAAACTAAAAGCCCTCCTAAAGCTAAAGGTTGGTTATCAGAGAATAAG CCTATTAAAATTAGTTCCTCCTCTAGTAGTGAGTCTGATAAAGACCAGAA AGTGATCAGGGCGCCAGACAAGAAGCTTAAAACTTCCGACAGGCGGCCTG AACACAGGTTTCAGGATCCGCCACCTAAGAGAGAGGAATCTAGAAGAAAA TCGATTGGAAGTGATCGATGCGATTCTGTTCAAATCGTCACATGTGGAGA TTCTAGTATCGGGGATGATGGAAATAGAAAATCGAGCGATAGTGACAACG TTGGAACATCAACTAGTCAGCCGGACGGAATTAAACAAGAAACGAAACAG CCCATACATGCAGTTGAGGACAAAGAGGTTGAGAAGAAGTTGAAACTTGA TGATGGTGATCAGAGAGTTCTCAAAGAAGACCATGGccttaacaaaaata ttcaagaagtgaaaaataaaaatgtaactccCGTACAACATACATCTGat aaagaaaataagaaaaccgATGAATTAAACTTGTATTTACCAGGTGGTCA TCGTTTAAATGATCTCAAAGACGAAAATTTATTAAGCTCTTCATTTCTAA CCAGACAAGACATAGAACGagaattagttaataatattgattatgataat aagAAATACTCTAAAATGYCGTTCAACtgtaataatcatttttctGGAAG TCAAAGATCAATTTTTTCTCCACAACAATGTAATAAAGATATTCCAGATT TTGACTTTGATAATGATATGTTAGCTGTTGAACAAGCTGCAAATGAAGAA GGATTTGGGTTAACAAGAGACACAGATGTTCGAAATGCTCCATTATCTTT TACATTCAACAATGAGTTCCTCTTCAAAGATGATTCAAAAGAAATTACAG CTAGAGAAACATTAAACCTTGTTGAAAAGTTGAGATTAGGAATCACCAAA AAAACTGTACCGTTAGAAAATGAGaacatagaaaatattgaattaaacga TACTCCTAAAATACTTGATCCACCTAAACCATCTGAACCAGAACAAAAGA CAGACAATATTCTGTATAATGCATACAACAAATTCCATCAACAGTCCAAT GATGTAGTAGATGTGAATAAAGTTCCAGAACGAGATAAATTGGATAGGAG TGAAAGTGCTTTATCTGACGAGAGGTGGGTACCACCTAGTCAACGTAGTC AGGCAGAATCTCCTTATCAGGATATTAATGATGCCAACCGTTGGTCAGAT AGCGTTGTGATGCCATCTAGACGTTCAGATACCTCCAATGAACCATCTCC AGAACATCAAAATCCACCTACAACAGAgtcattatatcaaaatatacact CGTTTCCTACATCTGTTCCAATGCAAATAGAAAGTATGCAGTTTCCTCAG TTTTCAGAACCATCATTTGTATTGAACCCACCTTCTAGTAATCAGTTGTC TTTTATGTCTTCTTCGCGGAATTTTAATCCTCAACAATTTGCAATACCTC CACCATTCTCAGCTCATCAAAATTTGATGCCAGAGTTGAATAAACCATTA CATTTGCAGCAAACTCCTTGTACAGCAGCCTTCACTTCATCAACTCAAAA TATGGCATTTACTGCAGCCATGATATCTCCAATGACACATCACGATAATT TTATTCCACCGTTTAAtgatataagtatgtataatgATAGCAATCTTTTA ATGGGTCCTAGTACTAATAATTCATCTTTACATTCAGAATCTGTCATGCA TACTGTATTCAATGCAATTAATCAAGCATCTATGATTGATAATCAACTAT CTATTTTACCAACAATTCAAACTCCTAAAACTCCTAAAGTCTCTACCAGT AATCAAATTTCTGGTAGTCATRATCTAATCCCAGCTTCAACAAATAACCA AACCcaagaaattaatttacaatcaaCCTCAAATCAACACCAAGTACCAG TAACTTCTAATAATCAAACTGAAATAACTCTTTCACAATCAATTTCAAAC AATCAAGAACCTGTTTTTAgtcaaagtaaaattaatagtgAACAAGTAAC GCCCAAGAATCAATTAGCAGCACCAATATCAAACCAAATACCATTGAATA AACAACAATCGATTCCAGAAGTACATACACCGTTAGTATGTCAAGCAGAA GTTAGTCAACAAAACATCATTAATCAAACACCAGTGCAGACCCCTATCAG TGTCAGTCAAGTATCTAATCAAACTACTCCAAGTATACCAACTCCTAAAC AATCACCTGCTCTTCCTACAACTCCTTTGCCAGAACGATCACCAATGTCA ATTATTGCTTCATCTCCTTCTGTGACTAGTTCACCACATCCTAATCGCAC ACCTTCTGATAAAAAATCTCCTTCTAAACCTACTCGATCTTCAAGTCGTG TTACTGCTCAATCTTATAAATCACCTGAAATAGTTGATCATTCACCAGAA GTTAAAAAACAGAATAAACGAGGACCAAAACCTCAATCCAAAACTTCTGG ACGTGGTCGAGGTCGTGGGCGTGGGCGTTCATCGAATCATTTTACTGATT ATAATCCTGCTGTTAGTAAGCTTGCTGGTACTGCTTATGATCTTGATTTT GTCGAAGAATttggtaatgataataatggtgTTATGGAGAATCTTCGAGC AATGCGTGAACGTAAAAAGTCTGATGTTAAAGCTGATAGTAAATCACCTG TATCTCCTAAAGTACATAGCAGCCCTAATAACTATAGAAGAAAACATGCT AGTATAAAAGAACTTAAACCTCCTTCCCCCATCACGGAAACTCCTATTGA AGATCCACCAGCTCAAATAATAATGGATGAACTGACTCCTATGTTACCTG CGCCCGTTGATATGAGAACATATGATTCATACGATAATACAACATCATAT TCTGATAACATTTATGAAACCAACACTAATGTTGATGATAAAGTAACTGA TATTGTGAATACCTTAAAAGAAGActtacataatttttcaaaattatctt CCAAAGATAAAGATATTGAAGAtcagttaattttaattgatgacCAGATC AAGATAATTAAATTACCCCCTCCTGTTGAAAAAGAACCAGTAGCATCGAG TACAGTATTGCAAAGTGAATCTAGAAatcaattaaaagttaaaataaaag gtCCTTTCTTAAATGCTAAATACAACAACATTCAAAATCAGCCAATATTA CCAACAATTGATACATCAGctataagtatgaatatacCAAGCCATTCAGT TCCTCCTTCAGAAGCTGCTAGTGTACCCTCCAATTTCAGACAAATGAGAA AAAAAGAATTACTGCGACAATATTGTAACCAACAAGATAATATCGAACAG ACAACAAACCATCCCGTAGTCCCTCCATTAAGTCGAAATATCATTACCAT ACCAAAAGCGGTAGCATCAATGACTACAATCCCTACTAAAGAAGACTACA AAGCAGTGGTAGATGCTAATATGGAAAAGAAGCGTACTAAATATGGATCT GATGATCcaaaatctaattatttcaacaatattcGTAAAGAAGCWACAAC acctaagataaaaataaaaattggtggCGAACAACCTATGGTCACAACAA TGGAAGAAAAACGTAGTCTCCGTCCGCCCAAAAAAAGGATTTGTGATACT CAAAATGATGATACTAATCATTTGATAGCACCTACTATGGAACAGTTAAG GCGAGACAGTATgaaattcagaaaaaaagtatttgctCGTTTTGAAGAAG ATGCATTAGCATCTACTTCAATTCCTATAGCTACtgttgcaaaaaataaa aagaaacgtCGGTCTAGTCCATCAGTATCTAGAAAAAAGAAACCACGCAC AAATAAAGAGATATCTCAGGTTCAAGTGATAGAAGCTAAAGAAAGCACTC CAAAATTGATTATTAGATTCTCAAAAGCAGCACCTGATGAAGCTGAAGTA AGTGCAGTAACAGAGCCAAAAAAAGCTTCTCCTATTAAACTGAAAATATC TAGATGCAAAGAAGGATATGTTATGAAACCTCCTAGTAAYCAAACGAATC CTGATActtcattaaacaataattgtgaAGTTAGGTGACggtaaaaattc ttataaatttagATCAATCTTATCATTGATAAGCATTTYgtgtaaaaaaa ttaataaaatgtaatttatttatttaattttagtttgtacattcttattt atttatttaaaaaatttttaatttatttaaaatgtaaattcataatatta agacGTTGTTTTCCTCAATTTGTTGTTAATTGAActattaatacaaacaa atgtTCTATGAATACTccaagttattaatattatcatgttaaggCCAGCA GatgtcaattaattttaattttgttatctaGTTTAAGATAAGAAATTTTC ATGTTAATGTgcaatatgcaaaatattatgtaaagtattttttttttttt tttaagtattgttaacctttta
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000065:637477..652498+

>rna3662 ID=rna3662|Name=XM_015507635.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=7068bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000065:637477..652498+ (Diuraphis noxia)
ATGTCATATAGAACTAAACGTCAACCAATTTCTAAAGATGAATGTCCATt
accgACAAAGAGGCGGAAGGGGCGCCCTTCGACGCTACAGGAAGAAGAAG
AAGCGTCCTCTTTAGATACTCAAAGTGGCTCGCGTTCAGATATGAAAATA
CCAtcatcaatttataatacaagaaTAACAACTGATGCACCAGCAGAATT
ATTTCGTAAAGACTTGATCAGTGCCATGAAGCTTCCTGATTCTGAACAGT
TATCTACTGATGCATATTGGATTATTAGTGACCAATGGAAACAAGAATGG
GAACGGGGTGTGCAAGTACCTGTTAATCCAGACTCTTTGCCTGGGTCAAG
TGTTCATGAAATTCCAGTTGTCTGCTTACAGTCTTCAACTAAATCACCTA
GGCGTTCACCATCATCAATTTATCACTCTCAACATAATGAATTTAAactg
ccaaaacataaatatattcgCATCACTAAAGACGAACATTTTAAATCCGA
AGAACATCAACTGTCACTCTTACCTTTAAAAGCTGAAAAATCTTGTTCAT
ATGATATGGATGATGTAGATACAGCTTGGTTAAAACTGTGTAATGGTGAA
AGAACATTAGGAGgctTCCCAAAAATAAAAGATGATCAATTTGAGCGTGT
TATGGAAGAATTAGAAATGAGGTGTTGGGAAAAAGTGCAAACAATAATCA
AGGAAGAAGAAGGCCTTGGAATCGAATACGATGAGAATGTAATCTGCGAT
GTATGCCGTTCGccTGATTCAGAAGATGGTAATGAAATGGTGTTTTGTGA
TAATTGCAATATTTGTGTTCATCAAGCGTGTTATGGTATTACCACAATCC
CATCTGGGTCTTGGCTATGTCGTACTTGTACTTTACGTTTTCGTCCTGAA
TGTGTACTTTGTCCAAATAAAAATGGTGCAATGAAATGCACACGGTCAGG
TCATAAATGGGCRCATGTGTCATGTGCATTGTGGATACCAGAAGTTAGCA
TTGGATGTGTAGAAAAAATGGAACCTATTACCAAAATATCAAGTATACCT
ccTAGTCGATGGGCTcttatatgtgtattgtgtcgAGAACGAGTCGGAGC
ATGTATACAGTGTTCAGTTAAAACATGCAAGACTGCATATCATGTTACTT
GTGCTTTTAAGCACGGTCTTGAAATGAGAGCTATTATTGAAGATGAGAGT
GCTGAAGATGGAGTTAAATTACGGTCATACTGTCAAAAACATAGTGTAAC
TAGTAAAAAAGATAGAAATTCTGGTTCAGAAGATGAAGATTCTACAAAAA
GGAAACGAAAAGATATGACTtctgaagaaaaaaatcaaGCTAGAGCGGCC
AAGCTGCAAGAAATTGAAGGCGAATTTGAAAAGCATGTCAGTGTCATTGA
TGTTACACAATGTCGTGATGTTGATAATGATggtattctatatatttata
attattgggtATTAAAAAGAAGATCTGGAAATAACAGACCTTTGTTATTA
CCAAAATCTGATGATGGTGATCTTCTTGGAAGACAACAAGAACAAGCaga
tttagaaaaacataaaatgtttgtacaactTAGACAAGATTTAGAAAGGG
TACGGAATTTGTGCTACATGGTCAGCAGAAGAGAAAAGCTTTCTCGTAAT
TTACTCAGCTTACGTGAGCAAACTTTTCATAAACAAGTTGCAGTTCTTAC
AGATAACAAGCTTAATCTTAGTTCAGCAGAAGTTTCAGCCRTCCAGGAAG
CTAATCATGGGCCATCAATATATGATCGATTGTATTCGTATCCTGATGCT
CCAGACTTGAGCACTGATTTTGAAACTATGTTATCTCGTATTGCTGGAGA
TGGTTCTCCAGAAAAATCCAATTATACTGGTTTAAAGTGGCCTCAAAGTA
ATAATCCATATAAACGGTCATATATTAATGGATCTATACGATACTCGAGT
ATGTCAAGCAGTAGTGATCTTGAACTAAAACCTCCTAGACTAATTAGTAG
TGAACGATCAAGTATGGATGAAGctgaattaattaaatctatgtTGAATA
AAcgtaaattaaaagaaaaaaggcTTAATAAAAAACgttcaaaaacaaaa
ctttCTACTGATTCATCTACTGAAGAAGAAAATGATAAAGTTAAACAAAA
ATGGAATGTATCRcctaataaaaaattgttacaaattGAAAAGCAATTTG
GTAGTGATGATAGTGAAGATGTTTCCTTACCAAAACTTTCATCTAAACGT
CCAactaaagttaataatatctattctgACTCAGATTCTGAAGTGTCAAC
CAAAGATGATAGTCTCTCGTACACACACACTAAAGCAGCAGTTAAAGAGT
TCTCTCAAGGAAAGTCTAAAACTAAAGTTCTTAAAGATAAAAGTACTTCT
GTTTCTAAAACTAAAGAATCACTAGAGAaggatactaaaaaaattaaaaa
agatgatcctaaaaataatactacagTGCCTACAGAACTTATTGTTCCTC
AAAGACAAGCTGCTAAGAAAGCTACTGAAAGTATTCATCGGGTACATAAT
AAACATGATGAAATTTCAAATGAAAAGAAATCTCCAGAAAAACTATTTTC
ATCACATAGAAAATCTCCTGAAAGGGTTTCATCTAATACTAAATCACCAG
ATAAACAACctattaaagttaataaaattaaaaacgctgAAAAATTAAGT
TCAGTAGAAAAAGAATCTGATCTACAAGATTCATTTAGTATTGTTCCACA
GAGGCAGGCTGCTAAAAAAGCCATTCAAGGCATTAAGAGTGGTATGACAA
AACCTGTTGAAGAAACTAAAGTATCTGAACCTGTTAAAAAAGACGATTCA
ACTACCAAGTCGAAACGTAGTGCAAAGTCTTCTTTATCCTCTACATCGAG
TAGTAGTTCTTCTAGTAGTTCATCAAGTACTTCAAGTACTTCTAGTTCTT
CTTCTTCATCAGGTTCGTCTACTTCTGAAAGTGATACAGAACCAGAAAAG
AAGAATAAATCTATTGATCGTGTAAGTCCACCAAAAGAAATTAGTAAAAC
TAAAAGCCCTCCTAAAGCTAAAGGTTGGTTATCAGAGAATAAGCCTATTA
AAATTAGTTCCTCCTCTAGTAGTGAGTCTGATAAAGACCAGAAAGTGATC
AGGGCGCCAGACAAGAAGCTTAAAACTTCCGACAGGCGGCCTGAACACAG
GTTTCAGGATCCGCCACCTAAGAGAGAGGAATCTAGAAGAAAATCGATTG
GAAGTGATCGATGCGATTCTGTTCAAATCGTCACATGTGGAGATTCTAGT
ATCGGGGATGATGGAAATAGAAAATCGAGCGATAGTGACAACGTTGGAAC
ATCAACTAGTCAGCCGGACGGAATTAAACAAGAAACGAAACAGCCCATAC
ATGCAGTTGAGGACAAAGAGGTTGAGAAGAAGTTGAAACTTGATGATGGT
GATCAGAGAGTTCTCAAAGAAGACCATGGccttaacaaaaatattcaaga
agtgaaaaataaaaatgtaactccCGTACAACATACATCTGataaagaaa
ataagaaaaccgATGAATTAAACTTGTATTTACCAGGTGGTCATCGTTTA
AATGATCTCAAAGACGAAAATTTATTAAGCTCTTCATTTCTAACCAGACA
AGACATAGAACGagaattagttaataatattgattatgataataagAAAT
ACTCTAAAATGYCGTTCAACtgtaataatcatttttctGGAAGTCAAAGA
TCAATTTTTTCTCCACAACAATGTAATAAAGATATTCCAGATTTTGACTT
TGATAATGATATGTTAGCTGTTGAACAAGCTGCAAATGAAGAAGGATTTG
GGTTAACAAGAGACACAGATGTTCGAAATGCTCCATTATCTTTTACATTC
AACAATGAGTTCCTCTTCAAAGATGATTCAAAAGAAATTACAGCTAGAGA
AACATTAAACCTTGTTGAAAAGTTGAGATTAGGAATCACCAAAAAAACTG
TACCGTTAGAAAATGAGaacatagaaaatattgaattaaacgaTACTCCT
AAAATACTTGATCCACCTAAACCATCTGAACCAGAACAAAAGACAGACAA
TATTCTGTATAATGCATACAACAAATTCCATCAACAGTCCAATGATGTAG
TAGATGTGAATAAAGTTCCAGAACGAGATAAATTGGATAGGAGTGAAAGT
GCTTTATCTGACGAGAGGTGGGTACCACCTAGTCAACGTAGTCAGGCAGA
ATCTCCTTATCAGGATATTAATGATGCCAACCGTTGGTCAGATAGCGTTG
TGATGCCATCTAGACGTTCAGATACCTCCAATGAACCATCTCCAGAACAT
CAAAATCCACCTACAACAGAgtcattatatcaaaatatacactCGTTTCC
TACATCTGTTCCAATGCAAATAGAAAGTATGCAGTTTCCTCAGTTTTCAG
AACCATCATTTGTATTGAACCCACCTTCTAGTAATCAGTTGTCTTTTATG
TCTTCTTCGCGGAATTTTAATCCTCAACAATTTGCAATACCTCCACCATT
CTCAGCTCATCAAAATTTGATGCCAGAGTTGAATAAACCATTACATTTGC
AGCAAACTCCTTGTACAGCAGCCTTCACTTCATCAACTCAAAATATGGCA
TTTACTGCAGCCATGATATCTCCAATGACACATCACGATAATTTTATTCC
ACCGTTTAAtgatataaAATCTGTCATGCATACTGTATTCAATGCAATTA
ATCAAGCATCTATGATTGATAATCAACTATCTATTTTACCAACAATTCAA
ACTCCTAAAACTCCTAAAGTCTCTACCAGTAATCAAATTTCTGGTAGTCA
TRATCTAATCCCAGCTTCAACAAATAACCAAACCcaagaaattaatttac
aatcaaCCTCAAATCAACACCAAGTACCAGTAACTTCTAATAATCAAACT
GAAATAACTCTTTCACAATCAATTTCAAACAATCAAGAACCTGTTTTTAg
tcaaagtaaaattaatagtgAACAAGTAACGCCCAAGAATCAATTAGCAG
CACCAATATCAAACCAAATACCATTGAATAAACAACAATCGATTCCAGAA
GTACATACACCGTTAGTATGTCAAGCAGAAGTTAGTCAACAAAACATCAT
TAATCAAACACCAGTGCAGACCCCTATCAGTGTCAGTCAAGTATCTAATC
AAACTACTCCAAGTATACCAACTCCTAAACAATCACCTGCTCTTCCTACA
ACTCCTTTGCCAGAACGATCACCAATGTCAATTATTGCTTCATCTCCTTC
TGTGACTAGTTCACCACATCCTAATCGCACACCTTCTGATAAAAAATCTC
CTTCTAAACCTACTCGATCTTCAAGTCGTGTTACTGCTCAATCTTATAAA
TCACCTGAAATAGTTGATCATTCACCAGAAGTTAAAAAACAGAATAAACG
AGGACCAAAACCTCAATCCAAAACTTCTGGACGTGGTCGAGGTCGTGGGC
GTGGGCGTTCATCGAATCATTTTACTGATTATAATCCTGCTGTTAGTAAG
CTTGCTGGTACTGCTTATGATCTTGATTTTGTCGAAGAATttggtaatga
taataatggtgTTATGGAGAATCTTCGAGCAATGCGTGAACGTAAAAAGT
CTGATGTTAAAGCTGATAGTAAATCACCTGTATCTCCTAAAGTACATAGC
AGCCCTAATAACTATAGAAGAAAACATGCTAGTATAAAAGAACTTAAACC
TCCTTCCCCCATCACGGAAACTCCTATTGAAGATCCACCAGCTCAAATAA
TAATGGATGAACTGACTCCTATGTTACCTGCGCCCGTTGATATGAGAACA
TATGATTCATACGATAATACAACATCATATTCTGATAACATTTATGAAAC
CAACACTAATGTTGATGATAAAGTAACTGATATTGTGAATACCTTAAAAG
AAGActtacataatttttcaaaattatcttCCAAAGATAAAGATATTGAA
GAtcagttaattttaattgatgacCAGATCAAGATAATTAAATTACCCCC
TCCTGTTGAAAAAGAACCAGTAGCATCGAGTACAGTATTGCAAAGTGAAT
CTAGAAatcaattaaaagttaaaataaaaggtCCTTTCTTAAATGCTAAA
TACAACAACATTCAAAATCAGCCAATATTACCAACAATTGATACATCAGc
tataagtatgaatatacCAAGCCATTCAGTTCCTCCTTCAGAAGCTGCTA
GTGTACCCTCCAATTTCAGACAAATGAGAAAAAAAGAATTACTGCGACAA
TATTGTAACCAACAAGATAATATCGAACAGACAACAAACCATCCCGTAGT
CCCTCCATTAAGTCGAAATATCATTACCATACCAAAAGCGGTAGCATCAA
TGACTACAATCCCTACTAAAGAAGACTACAAAGCAGTGGTAGATGCTAAT
ATGGAAAAGAAGCGTACTAAATATGGATCTGATGATCcaaaatctaatta
tttcaacaatattcGTAAAGAAGCWACAACacctaagataaaaataaaaa
ttggtggCGAACAACCTATGGTCACAACAATGGAAGAAAAACGTAGTCTC
CGTCCGCCCAAAAAAAGGATTTGTGATACTCAAAATGATGATACTAATCA
TTTGATAGCACCTACTATGGAACAGTTAAGGCGAGACAGTATgaaattca
gaaaaaaagtatttgctCGTTTTGAAGAAGATGCATTAGCATCTACTTCA
ATTCCTATAGCTACtgttgcaaaaaataaaaagaaacgtCGGTCTAGTCC
ATCAGTATCTAGAAAAAAGAAACCACGCACAAATAAAGAGATATCTCAGG
TTCAAGTGATAGAAGCTAAAGAAAGCACTCCAAAATTGATTATTAGATTC
TCAAAAGCAGCACCTGATGAAGCTGAAGTAAGTGCAGTAACAGAGCCAAA
AAAAGCTTCTCCTATTAAACTGAAAATATCTAGATGCAAAGAAGGATATG
TTATGAAACCTCCTAGTAAYCAAACGAATCCTGATActtcattaaacaat
aattgtgaAGTTAGGTGA
back to top