|
|
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107161413 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 7 Proteins, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
| Product | helicase SKI2W |
| Transcript id | XM_015507817.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107161413 |
| Genbank | XM_015507817.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107161413 | gene2587 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000069 123089..132625 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015363303.1 | cds3717 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000069 132285..132311 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna3815 ID=rna3815|Name=XM_015507817.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=3920bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000069:123089..132625- (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
TATCATAATTATTGTAAATTGTAATATTGTCATAAATCCTTCTAAACAGT
AAACACTAGATTAGTAGATTCTATTGATTCTAGATATAGACAGAAGTTTT
TAATTTCTGAAGTTAAAATTGTTATGTTAGTTGTCGTCTAAGAAAAAAAA
ATACAATATAATTTAGGTACAATGTATTGATTTTGTATGTTTCAAAAATC
ATTTAAAACTTAAAAAGTTAGAATCTAAAACCTAAATCATTAGTGTTCAA
CTGAGTTGTACAATTTAAATCTATATTTTAGTATGTCAACAATTTTTGAT
TACTGAATTAAACAATGGACAATTTAAAAATGAAATATGAGGTACCTGGT
GGTATTGCCTCAATAATGCCAAGCATTCCAGCAGATTTATTGAGTTATAT
TAATTGTATAGAAAGTATGCCAGTTTATAAAGGTGAATCAATTCTACTAA
AAAGAGATGTAAATTTATTATCCTTATATGCTGATAATAATATAAATTAT
ATGCCAACTAATTTAATACCTGAAAGGGATCCCAAGACTGGTAAAATTAT
TTCTTATGAAGAAGTTATTAATGATCCAATTTTTCAATCTGATGGTAATT
TAATACCTTGTTTAAAATCAATAAGCAATCAATGTACTGTCAATCAACAT
GAAGATAATCTGTTCCAATTTCAATTTGATCCTAATGATTTACCAGTAGC
ACCAGGATTGTCAAACAAATTGAAAATAACCCAAAATGATCAAAATACAT
CCATAAACATTTGTTCTATCGACACAACAGTAGAAAATGAATGGACTGAA
GATGTAGGAGGATTTTGGGATGATGAAGTACCAGAAATAGTTAGCCAACC
AGATACTATACCAGAACCAATTCCAGAAGATGAAATTAATCATATTAGGA
AAGATGAAAACTTTGTGCTTAAAATTTCTGGAAATGCAGAAAGGGTTCTA
GTGAAATCTAAGTGGGTTGAAGAATTAGATATTTCAAAACCAATTGATAA
CTTTGATGAGTTATTACCTGATCCTGCTTATAAATGGGAATTTGAATTAG
ATACATTTCAAAAACAAGCAGTACTTAAATTGGAAGAAAAAAATAGTGTT
TTTGTTGCAGCTCATACATCAGCAGGTAAAACTGTTATTGCAGAATATGC
TATCGCACTTGCTAAAAAACATCAATTGAGATGCATATATACATCTCCAA
TAAAAGCATTATCCAATCAAAAATTTCGAGATTTCAAAAAAAAGTTTGGA
GATGTTGGTCTTATTACAGGAGATTTTCAAGTGAAACCAGAAGCTCAATG
TCTCATTGTTACAACAGAAATACTATGTTCAATGCTATATAGTAATTCAG
ATAAAATTAAAGAAACTGAGTTTGTTATTCTTGATGAAGTTCATTATGTA
AACGATAGAGATAGAGGGCACATTTGGGAACAAATTTTAATTATGCTACC
TAAACGTGTGAAATTAGTTATGCTGAGTGCTACTGTCACTAATGTTATTG
ATTTTGCCAACTGGATCGGTCGTACTCGTGATTCTAAGATTTACGTTGTA
TTTACTCTTTATCGACCAGTTCCTCTTGAACATTATCTTTATATTGGTTC
AAATACATCTATGGAAATGAAGGACAATATGCATCTTATTAGAAAAGCAG
ACAGCGGGTTTCTAATTCAAGGTTATCGTAAAGCTTCAGAGCTATTTAAA
AAAAGTAAAGAAGTAAAAAAATATCAAGAATCTAAAAATTTAAAAGATCA
AAAACCAAAATGGGTCAATTTTTTGAGATTTCTGGACAAAAATAATTTGT
TCCCAGCTGTTGTTTTCATTTTGTCCAGAAAAAAATGTGATATGATGGCA
GAATCTTTAAAAAACTCTGTAAATTTCTTATTAAATAATAAAGAATCTCA
AGCAAATGAGTATTTTTTTAATGATGCTATAAAAAAATTAAAACCAGAAG
ATAGAGCTTTACCTCAAGTTGTTTTAATGAAAGAATTATTATGTCAAGGC
ATTGCAGTTCACCATAGTGGAATTTTACCCATACTAAAAGAAATAGTAGA
AATGCAATTTCAAAAAAGTTTAGTCAAGTGTCTATTCGCCACTGAAACAT
TTGCAATAGGTATTAATATGCCAGCCAGAACAGTGGTATTCGAAGCCATT
AACAAATTTGATGGTATAGAAAAAAGAAATTTAGCCCCGGCTGAGTACAC
TCAAATGGCAGGACGAGCAGGTCGCCGGGGCCATGATGACAGTGGTACTG
TTATAATAATGGCAAATGATCAATTACCTAATGATAGAGAATTAATAAAT
ATGATGCTAGGTAAATCAGCTAAATTAGAATCTCAGTTTAAAGTCAGTTA
TTCTATTATATTGAATATGTTCAAAAAGAAAAATTCTGAAACTCTAGAAG
AAATATTAGGTAGTAGTTTCATTGAAGCTGCTAGAGCTAAAAAAAAAGAT
GAATATACTGAAGAATTAAATTCTTTAAAAGAAATACATGGGAATGATGA
TTGGGAACCAACAGGAAAGCAAGATATAATTGTAAAAGAATTTTATCTTC
GTGCCAAAGAGTATTTAGACTGCAGAAATGAAGACTGGGATAAACTTTAT
GCAGCGAGTGATAAAAGTTTTAGTGAAGTTGGTAGATTTGTCATCATTAC
ACACCAACATTATATTGGAAATTTGGCTATTATATTATCAAGCAACGCAA
AAAAAATTCCAAAAGAATTTCGAGTATTAGTATTAGACAATGATAAGTTA
AATAATAAAGAATCTGACAATAAAATGGATTCCTGGTATAAATTTATTTA
CTTATCTAGAAAAAGAAGATTATTAGATAAATCATTAGATGTTATTTCTA
ATAATGCTCATACCATTTTAACTATATCTTCAAATTCAATATTTGCAATC
ACTAAATTTTCTGGTAATTTTGATAATGATTCAATTATAAAAAATTGGGA
AATGAGACAAAATGAGCGTTTTAGAGATGCAGCTATTTCTACACACTGCT
TGAGAGCCATTACAATGCTATCGGAAAAAACATTACTTTTAAATCGAGTA
GAAAATGAAGATTCAGTGCTAAGCTTGTTAGATCTAGGAATTGATAATTT
TGAATTACACCAAACTATGTTACGTATGCATGCTTTAGAAAATCAAGTGT
ACAGTATTGATTTGTCTGACATTATTGCATTTGATGATGTTTTCTCAAAA
TTATATGAATATCAAACAAGAGTAGAAAGAATAGCAGAATTACAACACCA
AATATCAAATAAAGCATTACAGTTGTATAATGAATATATCAACAAAGTTG
AAATTCTCAAAGAATTAAAATATATAAATCCAAGGAATGAAATAACTACC
CAAAAAGGGAATGTAGCTGCAACTATGGGTTCACATGAACTTTTAGTCAC
TGAACTACTATTATGTAATATGTTTGAAGAAATGAAACCAGAAGAAATTG
CTGCTGTTCTTTCGTGTTTAGTTTGCGAATCTAAGTCAAATATTGACTTG
GAACAAATCAAAGAACAAAGTTTGATAAACGGAATGAATTTAATAAAACA
AAAACATGATTACATTCAGTCGGTTGAATCAAACTATTTAAGCAACTATG
AACGTGTTAATCTCAACTTCAATTTGGTAAAAGTGCTGTATTTATGGGCT
CAAGAAAAGCCTTTTTCTGAAATAATKGAAATAACAGATATTCAAGAAGG
GATTATAGTCAGATGCATAGTTCAATTGAATGAAATTTTGACTGTTATTA
AAAATGCAGCAAAAATGATTGGTACTAACAAAATAAGTGAAAAAATGCAA
GAAGTATTAGACAAAATCAAAAGAAATATTGTATTCACTCCTTCTTTATA
TATGGAATGATTTTTAAATTATTTAATAACAAATGTAAAAATGTACTATA
GGTATTTTAATATTATTCAA back to topprotein sequence of XM_015507817.1 >rna3815 ID=rna3815|Name=XM_015507817.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=1182bp
MDNLKMKYEVPGGIASIMPSIPADLLSYINCIESMPVYKGESILLKRDVN
LLSLYADNNINYMPTNLIPERDPKTGKIISYEEVINDPIFQSDGNLIPCL
KSISNQCTVNQHEDNLFQFQFDPNDLPVAPGLSNKLKITQNDQNTSINIC
SIDTTVENEWTEDVGGFWDDEVPEIVSQPDTIPEPIPEDEINHIRKDENF
VLKISGNAERVLVKSKWVEELDISKPIDNFDELLPDPAYKWEFELDTFQK
QAVLKLEEKNSVFVAAHTSAGKTVIAEYAIALAKKHQLRCIYTSPIKALS
NQKFRDFKKKFGDVGLITGDFQVKPEAQCLIVTTEILCSMLYSNSDKIKE
TEFVILDEVHYVNDRDRGHIWEQILIMLPKRVKLVMLSATVTNVIDFANW
IGRTRDSKIYVVFTLYRPVPLEHYLYIGSNTSMEMKDNMHLIRKADSGFL
IQGYRKASELFKKSKEVKKYQESKNLKDQKPKWVNFLRFLDKNNLFPAVV
FILSRKKCDMMAESLKNSVNFLLNNKESQANEYFFNDAIKKLKPEDRALP
QVVLMKELLCQGIAVHHSGILPILKEIVEMQFQKSLVKCLFATETFAIGI
NMPARTVVFEAINKFDGIEKRNLAPAEYTQMAGRAGRRGHDDSGTVIIMA
NDQLPNDRELINMMLGKSAKLESQFKVSYSIILNMFKKKNSETLEEILGS
SFIEAARAKKKDEYTEELNSLKEIHGNDDWEPTGKQDIIVKEFYLRAKEY
LDCRNEDWDKLYAASDKSFSEVGRFVIITHQHYIGNLAIILSSNAKKIPK
EFRVLVLDNDKLNNKESDNKMDSWYKFIYLSRKRRLLDKSLDVISNNAHT
ILTISSNSIFAITKFSGNFDNDSIIKNWEMRQNERFRDAAISTHCLRAIT
MLSEKTLLLNRVENEDSVLSLLDLGIDNFELHQTMLRMHALENQVYSIDL
SDIIAFDDVFSKLYEYQTRVERIAELQHQISNKALQLYNEYINKVEILKE
LKYINPRNEITTQKGNVAATMGSHELLVTELLLCNMFEEMKPEEIAAVLS
CLVCESKSNIDLEQIKEQSLINGMNLIKQKHDYIQSVESNYLSNYERVNL
NFNLVKVLYLWAQEKPFSEIXEITDIQEGIIVRCIVQLNEILTVIKNAAK
MIGTNKISEKMQEVLDKIKRNIVFTPSLYME. back to topmRNA from alignment at JOTR01000069:123089..132625- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna3815 ID=rna3815|Name=XM_015507817.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=9537bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000069:123089..132625- (Diuraphis noxia)
TATCATAATTATTGTAAATTGTAATATTGTCATAAATCCTTCTAAACAGT
AAACACTAGATTAGTAGATTCTATTGATTCTAGATATAGACAGAAGTTTT
TAATTTCTGAAGTTAAAATTGTTATGTTAGTTGTCGTCTAAGAAAAAAAA
ATACAATATAATTTAGGTACAATGTATTGATTTTGTATGTTTCAAAAATC
ATTTAAAACTTAAAAAGTTAGAATCTAAAACCTAAATCATTAGTGTTCAA
CTGAGTTGTACAATTTAAATCTATATTTTAGTATGTCAACAATTTTTGAT
TACTGAATTAAACAATGGACAATTTAAAAATGAAATATGAGGTAGGTACC
TTACTTGTTTCCATACTTATTTGAACCATTGGCGTAATTCCATCAAATTT
CAGCAGGTGAAAAGTTTTATCGGTCCAATAATCGTAATGAATAATTAAGT
TTTATTACTCATATTTAAAGCGAATTGCATTGCTCGCATGCACTATAAGT
ATCTTTTTATATTTGATAACAATATAGCATAAACAAGTATCAAAATCTGT
AGGTACCTATATTGTAAATACTATATATGCTGTATCTGCACTATGATACA
TTATACATATAAAAATATAATATTTATATGAAATTAATTAAAGTGAACAG
AATTTTTAAATAAGTTAAAAAAATTAAACAAATTTATGAATTACATGAAA
TATAGTTGATATTGTATTTTAATAGGTATAAATTTCAGCATCTGTAGGTG
CAAAATCATATATTTGCACCTGCTACATAATACCAGGGGGTGAAAGTGCA
CCCCCATAATTACGCCACTGTTGTTCAATATAATATACTATGGACATTTT
GTGTTAATATAGATTTATTTAATTATTTCCTATTTATTTACATAAATCAT
ATCTACTACAATAAATTGTTTAGAATCCTGTTATTAAATCAGAATTCAAT
CTTACTTACCTTGTAGACAAATTTATTGTTTTTAAATAAATACTATTTTG
TTGCTCGTTAATCTTTGTAATTAGTAATACATTTTAATAATAAATTATAT
TATAATATTATAAAGGTACCTGGTGGTATTGCCTCAATAATGCCAAGCAT
TCCAGCAGATTTATTGAGTTATATTAATTGTATAGAAAGTATGCCAGTTT
ATAAAGGTGAATCAATTCTACTAAAAAGAGATGTAAATTTATTATCCTTA
TATGCTGATAATAATATAAATTATATGCCAACTAATTTAATAGTAAGTAT
ATACTATATAGGCTATGTTAAATAATTATTTTCTATTTTACAAACATAAA
AAATATATTATCTACAGCCTGAAAGGGATCCCAAGACTGGTAAAATTATT
TCTTATGAAGAAGTTATTAATGATCCAATTTTTCAATCTGATGGTAATTT
AATACCTTGTTTAAAATCAATAAGCAATCAATGTACTGTCAATCAACATG
AAGATAATCTGTTCCAATTTCAATTTGATCCTAGTATGTATCTTTATTTT
AATTTTTCAAGAAATATAATTTACATATTTTATATTGTTTTCTTAGATGA
TTTACCAGTAGCACCAGGATTGTCAAACAAATTGAAAATAACCCAAAATG
ATCAAAATACATCCATAAACATTTGTTCTATCGACACAACAGTAGAAAAT
GAATGGACTGAAGATGTAGGAGGATTTTGGGATGATGAAGTACCAGAAAT
AGTTAGCCAACCAGATACTATACCAGAACCAATTCCAGAAGATGAAATTA
ATCATATTAGGGTAATTATTTGTATTCTGAAGAAATTTGAATCAAACAAT
GTTTAATCTTGATTTTTTTTAATAGAAAGATGAAAACTTTGTGCTTAAAA
TTTCTGGAAATGCAGAAAGGGTTCTAGTGAAATCTAAGTGGGTTGAAGAA
TTAGATATTTCAAAACCAATTGATAACTTTGATGAGTTATTACCTGATCC
TGCTTATAAATGGGAATTTGAATTAGATACATTTCAAAAACAAGTATTAC
ACTAATAATTTAATTTGAAAAACATTTTTTATGAATTCAATATACTATTA
TAAATTACATTTTATTTTATAGGCAGTACTTAAATTGGAAGAAAAAAATA
GTGTTTTTGTTGCAGCTCATACATCAGCAGGTAAAACTGTTATTGCAGAA
TATGCTATCGCACTTGCTAAAAAACATCAATTGAGGTAAATATTTCATTA
TGTATACTATCCTCATTTTATTTATTCTTTTAAAATAGCATTAATATTTC
ATTGATATTTACATCCTCTTAGAAATATACAAATCATACATTTTTAAATA
ATAATTTAGATGCATATATACATCTCCAATAAAAGCATTATCCAATCAAA
AATTTCGAGATTTCAAAAAAAAGTTTGGAGATGTTGGTCTTATTACAGGA
GATTTTCAAGTGAAACCAGAAGCTCAATGTCTCATTGTTACAACAGAAAT
ACTATGTTCAATGCTATATAGTAATTCAGATAAAATTAAAGAAACTGAGT
TTGTTATTCTTGATGAAGTTCATTATGTAAACGATAGAGATGTAAGTAAT
CTAGTAAAATATACTTTTTTATTTAATAATTAAGCCGTTTAGTGAATAAT
ATGWATTTTATTTAATAGAGAGGGCACATTTGGGAACAAATTTTAATTAT
GCTACCTAAACGTGTGAAATTAGTTATGCTGAGTGCTACTGTCACTAATG
TTATTGATTTTGCCAACTGGATCGGTCGTACTCGTGATTCTAAGATTTAC
GTTGTATTTACTCTTTATCGACCAGTTCCTCTTGAACATTATCTTTATAT
TGGTTCAAATACATCTATGGAAATGAAGGACAATATGCATCTTATTAGAA
AAGCAGACAGCGGGTTTCTAATTCAAGGGTATGTATATTATACATCATTT
GTGTATATAATTAATATAAMAACTAAATTGGTTAATTAAATACATTTATA
GTTATCGTAAAGCTTCAGAGCTATTTAAAAAAAGTAAAGAAGTAAAAAAA
TATCAAGAATCTAAAAATTTAAAAGATCAAAAACCAAAATGGGTCAATTT
TTTGAGATTTCTGGACAAAAATAATTTGTTCCCAGCTGTTGTTTTCATTT
TGTCCAGAAAAAAATGTGATATGATGGCAGAATCTTTAAAAAACTCTGTA
AATTTCTTATTAAATAATAAAGAATCTCAAGCAAATGAGTATTTTTTTAA
TGATGCTATAAAAAAATTAAAACCAGAAGATAGAGCTTTACCTCAAGTAA
ATATCAATGTTTTTTTGTTGAAACTTTTTTTTTATAGCTTAGATAATAAA
TTTAATATTAAAAAAACTTATAATTTTTAGGTTGTTTTAATGAAAGAATT
ATTATGTCAAGGCATTGCAGTTCACCATAGTGGAATTTTACCCATACTAA
AAGAAATAGTAGAAATGCAATTTCAAAAAAGTTTAGTCAAGGTAATTGAT
AAATAAATAAAAAAAGAATTTGTTTTATTTTATTAACATGTTGAATAACT
TTACAGTGTCTATTCGCCACTGAAACATTTGCAATAGGTATTAATATGCC
AGCCAGAACAGTGGTATTCGAAGCCATTAACAAATTTGATGGTATAGAAA
AAAGAAATTTAGCCCCGGCTGAGTACACTCAAATGGCAGGACGAGCAGGT
CGCCGGGGCCATGATGACAGTGGTACTGTTATAATAATGGCAAATGATCA
ATTACCTAATGATAGAGAATTAATAAATATGATGCTAGGTTAGATTTTAA
TCAAAAAAATAGGTATGTGAAAATATGTCTCACCAATTTTAAAAATATTT
ACTTTTTGTAGGTAAATCAGCTAAATTAGAATCTCAGTTTAAAGTCAGTT
ATTCTATTATATTGAATATGTTCAAAAAGAAAAATTCTGAAACTCTAGAA
GAAATATTAGGTAGTAGTTTCATTGAAGCTGCTAGAGCTAAAAAAAAAGA
TGAATATACTGAAGAATTAAATTCTTTAAAAGAAATACATGGGAATGATG
ATTGGGAACCAACAGGAAAGCAAGATATAATTGTAAAAGAATTTTATCTT
CGTGCCAAAGAGTATTTAGACTGCAGAAATGAAGACTGGGTAATTAGAAT
ATAAATATAATTTAAAAAAACGTTAACCCTTATAAAGTTTATTTATCCAC
TTAGAAATATGTATGTTCAAATATATACATTTTTAACACATTGATTGCCA
TGCGGCCGGCGGCATCCGTATAAAAATAATTAGGTATTGATAATTTTTAG
ACCGACGACTGCTACACCATATCATTCGTAGGAGGCCATATAGCCACGAG
CTGCTGTAAATTAATTTGGATTTATAKTATTAACTTTTCTGTGGCACTAC
AATTATGATCTTGAAAATATGTTGTAGCGTAATGGGGATAAATGCAATTT
TTTTTTTATATTTTTAATTTTTTTTTAAATTCAATGGTATTTAGACACTG
AAAAATGTCCATGGTGTATCCATGATAAATATTCTTGAGACCGCTGGCAG
CCGCATTGCGGTTAACGTGTGAATGAAATAATAATATTTTTTTTGTAAAA
CATCTATTAATTGAATTTTAATACAATTTTTAATATTTAACATAAAATAT
AATTTTGTATATAATGTTAAATATTTTATTATTGAAATAATCCCATAAAA
ATTATAACTTTAGGATAAACTTTATGCAGCGAGTGATAAAAGTTTTAGTG
AAGTTGGTAGATTTGTCATCATTACACACCAACATTATATTGGAAATTTG
GCTATTATATTATCAAGCAACGCAAAAAAAATTCCAAAAGAATTTCGGTA
AGTAAATATTTTAACATATTTTCAACATTCATATATTTAGAGATCATGTT
TACATTAAACACTCATTATCTTGAAAGGAATAAATATTTTTTTTACATAA
TTTGAAGTTAATATTAAGAAGTCCTTTTTTTTTAATAAAAACTAATGGTA
CTTATTAGTCATCTTGACTATCTATGATTTTTTGATGTTCAAAATTCTGT
TATAATAGCTAATTATTGAATTTTAGGATTTTAGTATTCTAAAGATGGAG
TGTCATGGGATATTCTGCTAATAAGTTCCATCTGAACACTAAATTATTTT
AGATACTTATTTAAAATTCAATTTTTATACTTGAAAAATCTATCTCAGAA
AAATGTACTTTTTTTATAATATAAATATAAATGTGTTATCGCTTTCAAAA
AAAAAAAAAAATGAATTAACAACTTAAAAATAGTAGAAAAATATAATTGT
TTTTCAAACATGTTTTGTAATAAATAATGAAAAAATCTCAAAATTTTGTA
AAAAAAATATTTTTTGAAATGTTAATACATTTAAGGTAATAAGTGTTCCC
TTAGAATCACTTAATACTCAGTATATGTATGTATACTAAGTACTTTTAAC
TTTTTTCAGAGTATTAGTATTAGACAATGATAAGTTAAATAATAAAGAAT
CTGACAATAAAATGGATTCCTGGTATAAATTTATTTACTTATCTAGAAAA
AGAAGATTATTAGATAAATCATTAGATGTTATTTCTAATAATGCTCATAC
CATTTTAACTATATCTTCAAATTCAATATTTGCAATCACTAAATTTTCTG
GTAATTTTGATAATGATTCAATTATAAAAAATTGGGAAATGAGACAAAAT
GAGCGTTTTAGGTATGTTACATAAGATTATATTTTTCATAAATGTATTAT
TTCATGTTAATTGTATTTATAATTTGTTGTAATCAATAATTTTATCATAT
TATTCAGAGATGCAGCTATTTCTACACACTGCTTGAGAGCCATTACAATG
CTATCGGAAAAAACATTACTTTTAAATCGAGTAGAAAATGAAGATTCAGT
GCTAAGCTTGTTAGATCTAGGAATTGATAATTTTGAATTACACCAAACTA
TGTTACGTATGCATGCTTTAGAAAATCAAGTGTACAGTATTGATTTGTCT
GACATTATTGCATTTGATGATGTTGTAAGTGTGTGTTTTTATGCTAATGT
TATTTACATTGGAGTTATATTTATTAATAATAAGTTAATAATCATTATTT
ATACTCTTGATTATGGTATATTGATTTATAATGAATATATTTTATGAATG
GATGTACAGATAATTTAGATATAAGAGATATTTTAAATAGTTAATTTTAA
TCCAATTCATATATTATATTTATACCAATTCCCGACTATCTTGTTGTGTG
AGCTCTACCCAATTTAAATATTTATTGTCGTGACTTAATAGTAATTAAGA
TAATTTCATTTTGTCGACAATTCTTGGGTTAACACATTGTTTTGTAATTT
CACATCATGTTTCAAAATGTTCGCCCGAAGGATTGAAAGGTTATGACATC
TGTTGAGGCTAAGAATTATAAAAAAAAATGTTTGGTACAACTCCAGATTT
ACTTCCAAGGTGTAATATAATAATATAATTACTATTACATGTATSTCATT
GAAATATGGTGTATAGGTTTGAATGACGCATTGATAATATTATATAATTA
TTTTTAATAATATATTACTGATTCATAAAGATTTTTTTTGGTCATTAAAC
TACTTTTACATCATACACTTATTATGAGAATATAATACTGTCTAAAATTG
GAATATAGTGATAGAGTAGTTAATAACGGTTGAGTGAGTTCGTTCTGCAG
TCGTAATGTTGTGGATAGAACACATATGACAAGATAGTCCGATTTCCYTA
CTTAAGTGAATGTGAATAACTCACTATTTTTTTCTCTAGTCCACACTTAA
CACATACCAAATTTGTGTTCACCAGTACTCACCTTGTGTTGTTACCTTTA
GAGGATGCCACACCCATACATGTTGTCTCCGTCGTTCAAGTACCTAGCAT
GGCAAATTTTACCGTCAGCAGATCACGTTTATCTCCGTTAGTTTAAAATT
TAGAATGAATTGACCTATTATAAAAATTAAAGGCAAGATTATTATCTAGG
ACATCTCATTGGCTTTTTATTATATTTTAATTTTAAAGCGAGTTATGAAT
ATTTTAAAATTGTTTAACGGAGATAAACGTGATCTGCTGAGGGTAAAATT
TGCCATGCTACGCACTTGTACAACGGAGACAACATGTACGGGTGTGGCGT
CCTCTTAAGTATTAAAATTAACTTATCATCAAACTTAAACTTAAGAACAC
TGTTTTTAATTTAGCATTTTTTATGATATTTCAATATTTATACAAGTTAT
GAGTACCCAAATATTGTCAAAAATAGCCAAATTACTAACACAAATTATGT
TTTAAGCTTTAAGTTTGATGATATATAGGTACTGAATTTTTTTCTGTGCA
TCTACATCAATTTACTCTAACTCCAGAGATTACAACACTAAGTTGGTTTT
TTGAACACAAATAGTTAATTGAAGGGAGAAAACAAGTAGAATTCTCTTAA
ATGCTCATCATTTAAAAATAAAATTGTTATTAATTTTAATTTTAGTTCTC
AAAATTATATGAATATCAAACAAGAGTAGAAAGAATAGCAGAATTACAAC
ACCAAATATCAAATAAAGCATTACAGTTGTATAATGAATATATCAACAAA
GTTGAAATTCTCAAAGAATTAAAATATATAAATCCAAGGAATGAAATAAG
TTAGTAATCATTTATAAACAATCATTATTAATAAACGTGACCATACGTCT
CGCTTTGGGTGGGACAGTCCCACTTTTGGGATAAGTGTTCCGCTATCCCC
AAATAACCTAAAAACGTCCCGCTTTAAGAAAAGTTGATTTGTGGTAAGTA
TTTATTGATTGATGATTTATCACAATTATATTGCACCTATACAGTTTACA
GTATACCTACATATTTTATGTATATAGTTGAACTCCGATTATTCGAACCC
CAATCATCCAGACGAGAAAAAAAAAACGGCATGTGCTGTTATTCATACAC
GCGTCTCATAATTGTATATAACCTATTGTATATACAGGGTGATTCTTTTA
TCAAACAACACTTATAGGGTGATTGTGTGTAAATACCTTCTAACATACGC
CTATAACACACAAACACCACCCAAAACCACTCAACTTTGGGAGGCTATAT
CTTGTAAACGGATTAATGCAAAATGAAAATTTAAACGTGAAAATTCATTA
AAAAAAAATAGCCTCTTTAGTTTATGATATTTTAATTATAGGTTGTCAAT
TGAAAATCAAAAGTTGATAATGGTTTACCTGATAAATATAAGGGTGAAAA
TATTTAAAAAATATATAGTTCTATAACAAGATGGATCTAAAATTTAAAAA
AAAAAAAATTTAAAAAAGTCAATAGTTTTTGAAATAATGAGTGTTGTTTG
ATAAAAGAATCACCCTGAATATGATATATTATAATTAAGGCTTATTTTGT
TTCAGTTAAATATATAATAAAATAATTTGTTTATACAAATTTTAAATTAT
ATTACATATATATATCAATAATAAATAGTATATTCATACAATTATATAAC
TTTTGATATATTATATGTTAATCATCCGGATATTTGCTTGTCTGGACTCC
GGACCACCCTTGACATTAATTAGTCTAAATAATCGAAGTTCTACTGTACT
GTAAAACACACTAAAACCCATAGTCCATTGATTGTTGGGAGTCTATTATG
ATTAATATATGTATTAACAGATAATTATTTAATATATTATCTATGTTTTT
CTATTGGCATTTTATGTATAAACAATTAATGTTTTTTTTCAAAAAAAAAA
ATTATTATTTTAGTAAAATTATATGGTTTTCTTATTAAAATGTACAGATG
TTGTGCTTTGAAGAAAAAAAATTATGGTGACGTTATTAATGGTTATACAA
ATGTATAATGCTATAAATTTTAAAATTTCAGCTACCCAAAAAGGGAATGT
AGCTGCAACTATGGGTTCACATGAACTTTTAGTCACTGAACTACTATTAT
GTAATATGTTTGAAGAAATGAAACCAGAAGAAATTGCTGCTGTTCTTTCG
TGTTTAGTTTGCGAATCTAAGTCAAATATTGACTTGGAACAAATCAAAGA
ACAAAGTTTGATAAACGTAAATATTAAAGGTATACTAATATTCTATATTG
CTTAAACATCAAACTTTTATTATTATTTTTAGGGAATGAATTTAATAAAA
CAAAAACATGATTACATTCAGTCGGTTGAATCAAACTATTTAAGCAACTA
TGAACGTGTTAATCTCAACTTCAATTTGGTAAAAGTGCTGTATTTATGGG
CTCAAGAAAAGGTAAATTTACTAAAWAATTGGTAGTATTGACTAATTTAA
CATTCTTTTTTTTTGTTTTACCTTAGCCTTTTTCTGAAATAATKGAAATA
ACAGATATTCAAGAAGGGATTATAGTCAGATGCATAGTTCAATTGAATGA
AATTTTGACTGTTATTAAAAATGCAGCAAAAATGATTGGTACTAACAAAA
TAAGTGAAAAAATGCAAGAAGTATTAGACAAAATCAAAAGAAATATTGTA
TTCACTCCTTCTTTATATATGGAATGATTTTTAAATTATTTAATAACAAA
TGTAAAAATGTACTATAGGTATTTTAATATTATTCAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000069:123089..132625- >rna3815 ID=rna3815|Name=XM_015507817.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=3546bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000069:123089..132625- (Diuraphis noxia)
ATGGACAATTTAAAAATGAAATATGAGGTACCTGGTGGTATTGCCTCAAT
AATGCCAAGCATTCCAGCAGATTTATTGAGTTATATTAATTGTATAGAAA
GTATGCCAGTTTATAAAGGTGAATCAATTCTACTAAAAAGAGATGTAAAT
TTATTATCCTTATATGCTGATAATAATATAAATTATATGCCAACTAATTT
AATACCTGAAAGGGATCCCAAGACTGGTAAAATTATTTCTTATGAAGAAG
TTATTAATGATCCAATTTTTCAATCTGATGGTAATTTAATACCTTGTTTA
AAATCAATAAGCAATCAATGTACTGTCAATCAACATGAAGATAATCTGTT
CCAATTTCAATTTGATCCTAATGATTTACCAGTAGCACCAGGATTGTCAA
ACAAATTGAAAATAACCCAAAATGATCAAAATACATCCATAAACATTTGT
TCTATCGACACAACAGTAGAAAATGAATGGACTGAAGATGTAGGAGGATT
TTGGGATGATGAAGTACCAGAAATAGTTAGCCAACCAGATACTATACCAG
AACCAATTCCAGAAGATGAAATTAATCATATTAGGAAAGATGAAAACTTT
GTGCTTAAAATTTCTGGAAATGCAGAAAGGGTTCTAGTGAAATCTAAGTG
GGTTGAAGAATTAGATATTTCAAAACCAATTGATAACTTTGATGAGTTAT
TACCTGATCCTGCTTATAAATGGGAATTTGAATTAGATACATTTCAAAAA
CAAGCAGTACTTAAATTGGAAGAAAAAAATAGTGTTTTTGTTGCAGCTCA
TACATCAGCAGGTAAAACTGTTATTGCAGAATATGCTATCGCACTTGCTA
AAAAACATCAATTGAGATGCATATATACATCTCCAATAAAAGCATTATCC
AATCAAAAATTTCGAGATTTCAAAAAAAAGTTTGGAGATGTTGGTCTTAT
TACAGGAGATTTTCAAGTGAAACCAGAAGCTCAATGTCTCATTGTTACAA
CAGAAATACTATGTTCAATGCTATATAGTAATTCAGATAAAATTAAAGAA
ACTGAGTTTGTTATTCTTGATGAAGTTCATTATGTAAACGATAGAGATAG
AGGGCACATTTGGGAACAAATTTTAATTATGCTACCTAAACGTGTGAAAT
TAGTTATGCTGAGTGCTACTGTCACTAATGTTATTGATTTTGCCAACTGG
ATCGGTCGTACTCGTGATTCTAAGATTTACGTTGTATTTACTCTTTATCG
ACCAGTTCCTCTTGAACATTATCTTTATATTGGTTCAAATACATCTATGG
AAATGAAGGACAATATGCATCTTATTAGAAAAGCAGACAGCGGGTTTCTA
ATTCAAGGTTATCGTAAAGCTTCAGAGCTATTTAAAAAAAGTAAAGAAGT
AAAAAAATATCAAGAATCTAAAAATTTAAAAGATCAAAAACCAAAATGGG
TCAATTTTTTGAGATTTCTGGACAAAAATAATTTGTTCCCAGCTGTTGTT
TTCATTTTGTCCAGAAAAAAATGTGATATGATGGCAGAATCTTTAAAAAA
CTCTGTAAATTTCTTATTAAATAATAAAGAATCTCAAGCAAATGAGTATT
TTTTTAATGATGCTATAAAAAAATTAAAACCAGAAGATAGAGCTTTACCT
CAAGTTGTTTTAATGAAAGAATTATTATGTCAAGGCATTGCAGTTCACCA
TAGTGGAATTTTACCCATACTAAAAGAAATAGTAGAAATGCAATTTCAAA
AAAGTTTAGTCAAGTGTCTATTCGCCACTGAAACATTTGCAATAGGTATT
AATATGCCAGCCAGAACAGTGGTATTCGAAGCCATTAACAAATTTGATGG
TATAGAAAAAAGAAATTTAGCCCCGGCTGAGTACACTCAAATGGCAGGAC
GAGCAGGTCGCCGGGGCCATGATGACAGTGGTACTGTTATAATAATGGCA
AATGATCAATTACCTAATGATAGAGAATTAATAAATATGATGCTAGGTAA
ATCAGCTAAATTAGAATCTCAGTTTAAAGTCAGTTATTCTATTATATTGA
ATATGTTCAAAAAGAAAAATTCTGAAACTCTAGAAGAAATATTAGGTAGT
AGTTTCATTGAAGCTGCTAGAGCTAAAAAAAAAGATGAATATACTGAAGA
ATTAAATTCTTTAAAAGAAATACATGGGAATGATGATTGGGAACCAACAG
GAAAGCAAGATATAATTGTAAAAGAATTTTATCTTCGTGCCAAAGAGTAT
TTAGACTGCAGAAATGAAGACTGGGATAAACTTTATGCAGCGAGTGATAA
AAGTTTTAGTGAAGTTGGTAGATTTGTCATCATTACACACCAACATTATA
TTGGAAATTTGGCTATTATATTATCAAGCAACGCAAAAAAAATTCCAAAA
GAATTTCGAGTATTAGTATTAGACAATGATAAGTTAAATAATAAAGAATC
TGACAATAAAATGGATTCCTGGTATAAATTTATTTACTTATCTAGAAAAA
GAAGATTATTAGATAAATCATTAGATGTTATTTCTAATAATGCTCATACC
ATTTTAACTATATCTTCAAATTCAATATTTGCAATCACTAAATTTTCTGG
TAATTTTGATAATGATTCAATTATAAAAAATTGGGAAATGAGACAAAATG
AGCGTTTTAGAGATGCAGCTATTTCTACACACTGCTTGAGAGCCATTACA
ATGCTATCGGAAAAAACATTACTTTTAAATCGAGTAGAAAATGAAGATTC
AGTGCTAAGCTTGTTAGATCTAGGAATTGATAATTTTGAATTACACCAAA
CTATGTTACGTATGCATGCTTTAGAAAATCAAGTGTACAGTATTGATTTG
TCTGACATTATTGCATTTGATGATGTTTTCTCAAAATTATATGAATATCA
AACAAGAGTAGAAAGAATAGCAGAATTACAACACCAAATATCAAATAAAG
CATTACAGTTGTATAATGAATATATCAACAAAGTTGAAATTCTCAAAGAA
TTAAAATATATAAATCCAAGGAATGAAATAACTACCCAAAAAGGGAATGT
AGCTGCAACTATGGGTTCACATGAACTTTTAGTCACTGAACTACTATTAT
GTAATATGTTTGAAGAAATGAAACCAGAAGAAATTGCTGCTGTTCTTTCG
TGTTTAGTTTGCGAATCTAAGTCAAATATTGACTTGGAACAAATCAAAGA
ACAAAGTTTGATAAACGGAATGAATTTAATAAAACAAAAACATGATTACA
TTCAGTCGGTTGAATCAAACTATTTAAGCAACTATGAACGTGTTAATCTC
AACTTCAATTTGGTAAAAGTGCTGTATTTATGGGCTCAAGAAAAGCCTTT
TTCTGAAATAATKGAAATAACAGATATTCAAGAAGGGATTATAGTCAGAT
GCATAGTTCAATTGAATGAAATTTTGACTGTTATTAAAAATGCAGCAAAA
ATGATTGGTACTAACAAAATAAGTGAAAAAATGCAAGAAGTATTAGACAA
AATCAAAAGAAATATTGTATTCACTCCTTCTTTATATATGGAATGA back to top
|