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Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Gbkey | mRNA |
Gene | LOC107161441 |
Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 8 Proteins, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
Product | serine/threonine-protein kinase grp-like, transcript variant X2 |
Transcript id | XM_015507849.1 |
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
GeneID | 107161441 |
Genbank | XM_015507849.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
LOC107161441 | gene2624 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000070 584157..592416 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
XP_015363335.1 | cds3762 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000070 591924..591988 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna3860 ID=rna3860|Name=XM_015507849.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1611bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000070:584157..592416- (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ACTGTATTATGTTTACTGTTTACTGTTTAGTTTTAGTGTCTCAGCCTCTC AGCCTCTCAAGTTAGTGTGTTACCTCATGCCGTGCGGTTTTGATGTTCTT CCGTTCTTCTTTATTACGTGTCTAGTGTTAGCGATTAGTAATGATTTATT ACCTAATTTTTAAACTTTTAAAGTTGTAAAATCACAAATGAATACTCCGT TTGTTGAAGGATGGAATATTGTTCAAACATTGGGCGATGGAACATTTGGC GAAGTAAAACTTTTACTAAATCAAAATAATCATTGCTTTGTCGCCATGAA AACTATTGATTTGCAAAACTATTCTGATGCATTGGCTACAGTAAAAAAAG AAGCAGCAATACATAGCCGATTGAACCATTCAAGTATAATAAAATATTAT GGACAGCGTCATGCTAAAGATACATATTATATATTCTTAGAATATGCATC TGGAGGTGAACTATTTGATCGAATTGAACCTGATGTTGGAATGCCGCTAT CTAATGCTAGAAAGTTCTTCAAAGAGTTGATTGCTGGAGTTGAATATTTA CACAAAAATGGTATAGCTCATAGAGATTTGAAACCAGAAAATTTATTATT GGATGAATATGGAAATCTAAAAATAAGTGATTTTGGATTAGCCACTTTGT TTTTATGTGGTGGAAAACGGCGTAAACTGGATAAGTATTGTGGAACTCGT CCTTATTTAGCTCCAGAAGTTCTTTCACTTTTACCTTATCAAGCAGAACC TTCTGACATTTGGTCATGTGGTATTATACTGGTATCAATGCTTGCTGGAG AGTTACCTTGGGATGTGCCATCTGATAATGATGAAGATTATAAATTGTGG AAAACTACGGACTATGCTAATCATTCACCATGGAATAAATTAGATACTTT AGCTTTGTCTCTTGTGAGAAAAATATTAACACCAACACCATCCCAAAGAT ATGATATATTAAAAATTCAGTCACATCATTGGTTCAAAAAATCAGAAACT GGTGCCAATAAAAAAGTTGGGATTTCTGTTCGGTCCAATAAAGATATGGA TGATGGACGTCAATGTTATTCTCAACCAGCTTCAGCAGCTATTTCATTTG ATACGTCCATGTCGCGCAGTGAATCTGAAATACATTCATTTTCCCAGCCA ACACAGGTGGATGATCTGCTGTTGTCCTCACAACTTCTGACATCACAGTC CATCTCCACACCAAACAACTCTATGCAAAACCTTGTCAGAAGAATGACAA GATTTCTAGTTGATTTACCACCTGATGCAGCATTAACCAATTTAGTATTG TTCCTGGATGATTTGGGATATATATCAAAAATCAACACACCTAGTTTGGT TACAATTACTACTACAGATCAGCGCTTAGTGTTTAAATCAACTGTTATTC CAATGAATCATCAAACTCTGATTGACTTCAGACTTTCAAGAGGCTGTGGT TTAGAGTTTAAGCGAAATTTTGTTTCCATTAAAAATGCAATGTCTGCATT AATTAAAGTTGCGTGGCCTATTGCTACTGAAACTGTACCTTAAATTATTA GTAGTATTATGAATACATATAAGGCTGACTAATTATAGATTGGTTAAAAA TAATTTTGTTA back to topprotein sequence of XM_015507849.1 >rna3860 ID=rna3860|Name=XM_015507849.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=452bp
MNTPFVEGWNIVQTLGDGTFGEVKLLLNQNNHCFVAMKTIDLQNYSDALA TVKKEAAIHSRLNHSSIIKYYGQRHAKDTYYIFLEYASGGELFDRIEPDV GMPLSNARKFFKELIAGVEYLHKNGIAHRDLKPENLLLDEYGNLKISDFG LATLFLCGGKRRKLDKYCGTRPYLAPEVLSLLPYQAEPSDIWSCGIILVS MLAGELPWDVPSDNDEDYKLWKTTDYANHSPWNKLDTLALSLVRKILTPT PSQRYDILKIQSHHWFKKSETGANKKVGISVRSNKDMDDGRQCYSQPASA AISFDTSMSRSESEIHSFSQPTQVDDLLLSSQLLTSQSISTPNNSMQNLV RRMTRFLVDLPPDAALTNLVLFLDDLGYISKINTPSLVTITTTDQRLVFK STVIPMNHQTLIDFRLSRGCGLEFKRNFVSIKNAMSALIKVAWPIATETV P. back to topmRNA from alignment at JOTR01000070:584157..592416- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna3860 ID=rna3860|Name=XM_015507849.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=8260bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000070:584157..592416- (Diuraphis noxia) ACTGTATTATGTTTACTGTTTACTGTTTAGTTTTAGTGTCTCAGCCTCTC
AGCCTCTCAAGTTAGTGTGTTACCTCATGCCGTGCGGTTTTGATGTTCTT
CCGTTCTTCTTTATTACGTGTCTAGTGTTAGCGATTAGTAATGATTTATT
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ATCGGTTGATATGAATTTATGGAGCAGTTCAGTGGCCACCAAGATCACCA
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TGCTTATAATCAAATGACAGGAAAAAATTTTTTCTGTTATTAACCGAGAA
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ACCTTAAATTAAAATTAACAATGAGATGAATTCTGCTAAACACAATTTTG
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TGAAAGAATATCATATATGTATATTTCAATGAAATAAAAAATTATAATTT
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TTCATTTGATACGTCCATGTCGCGCAGTGAATCTGAAATACATTCATTTT
CCCAGCCAACACAGGTGGATGATCTGCTGTTGTCCTCACAACTTCTGACA
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TATCAGGTTACAATAGTAAAAATAGTATAACTAAACTGTTATTTTTTTAG
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ACAATTACTACTACAGATCAGCGCTTAGTGTTTAAATCAACTGTTATTCC
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ATTAAAGTTGCGTGGCCTATTGCTACTGAAACTGTACCTTAAATTATTAG
TAGTATTATGAATACATATAAGGCTGACTAATTATAGATTGGTTAAAAAT
AATTTTGTTA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000070:584157..592416- >rna3860 ID=rna3860|Name=XM_015507849.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=1356bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000070:584157..592416- (Diuraphis noxia) ATGAATACTCCGTTTGTTGAAGGATGGAATATTGTTCAAACATTGGGCGA TGGAACATTTGGCGAAGTAAAACTTTTACTAAATCAAAATAATCATTGCT TTGTCGCCATGAAAACTATTGATTTGCAAAACTATTCTGATGCATTGGCT ACAGTAAAAAAAGAAGCAGCAATACATAGCCGATTGAACCATTCAAGTAT AATAAAATATTATGGACAGCGTCATGCTAAAGATACATATTATATATTCT TAGAATATGCATCTGGAGGTGAACTATTTGATCGAATTGAACCTGATGTT GGAATGCCGCTATCTAATGCTAGAAAGTTCTTCAAAGAGTTGATTGCTGG AGTTGAATATTTACACAAAAATGGTATAGCTCATAGAGATTTGAAACCAG AAAATTTATTATTGGATGAATATGGAAATCTAAAAATAAGTGATTTTGGA TTAGCCACTTTGTTTTTATGTGGTGGAAAACGGCGTAAACTGGATAAGTA TTGTGGAACTCGTCCTTATTTAGCTCCAGAAGTTCTTTCACTTTTACCTT ATCAAGCAGAACCTTCTGACATTTGGTCATGTGGTATTATACTGGTATCA ATGCTTGCTGGAGAGTTACCTTGGGATGTGCCATCTGATAATGATGAAGA TTATAAATTGTGGAAAACTACGGACTATGCTAATCATTCACCATGGAATA AATTAGATACTTTAGCTTTGTCTCTTGTGAGAAAAATATTAACACCAACA CCATCCCAAAGATATGATATATTAAAAATTCAGTCACATCATTGGTTCAA AAAATCAGAAACTGGTGCCAATAAAAAAGTTGGGATTTCTGTTCGGTCCA ATAAAGATATGGATGATGGACGTCAATGTTATTCTCAACCAGCTTCAGCA GCTATTTCATTTGATACGTCCATGTCGCGCAGTGAATCTGAAATACATTC ATTTTCCCAGCCAACACAGGTGGATGATCTGCTGTTGTCCTCACAACTTC TGACATCACAGTCCATCTCCACACCAAACAACTCTATGCAAAACCTTGTC AGAAGAATGACAAGATTTCTAGTTGATTTACCACCTGATGCAGCATTAAC CAATTTAGTATTGTTCCTGGATGATTTGGGATATATATCAAAAATCAACA CACCTAGTTTGGTTACAATTACTACTACAGATCAGCGCTTAGTGTTTAAA TCAACTGTTATTCCAATGAATCATCAAACTCTGATTGACTTCAGACTTTC AAGAGGCTGTGGTTTAGAGTTTAAGCGAAATTTTGTTTCCATTAAAAATG CAATGTCTGCATTAATTAAAGTTGCGTGGCCTATTGCTACTGAAACTGTA CCTTAA back to top
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