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Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107161489 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 1 Protein, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
| Product | growth factor receptor-bound protein 14-like, transcript variant X1 |
| Transcript id | XM_015507912.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107161489 |
| Genbank | XM_015507912.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107161489 | gene2663 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000072 343093..360042 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015363398.1 | cds3807 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000072 357504..357527 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna3909 ID=rna3909|Name=XM_015507912.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=3056bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000072:343093..360042+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
AGCGAGCGAGCAGCAGCGCCGGCACCACCCCCTCCGCCCGGCAYCACCAC
CACGACCGTCAGTACTGTAGTACCGACGACGGCCCAATCCGTTCGATATC
AGCTGTTCCTTTGTGTAAGTGTCCGTCCGGCGGCCCCGATGCCGATCCGC
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AAGCCGAGACTGGTAGTGTGCGGCGAAGTTGGCGATCTAGTGGTCGATCA
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catattgtattttagttcTAAATGTCTACATTATATGTGTGACATGTATT
AATGTCATGGGTGTGTTTGTTTTTATGAAGTTGATTATATAGTTATGAAt
tacaag back to topprotein sequence of XM_015507912.1 >rna3909 ID=rna3909|Name=XM_015507912.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=212bp
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SGNVGRIVEDPKEALAIAQAETGSVRRSWRSSGRSTPGLQTAVTKLENDI
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KIIHTPIVTQMDPLNDQVCFTLDNGVIKFYDLLQLVEFYQLNAGSLPTRL
MHYVVQVPVTK. back to topmRNA from alignment at JOTR01000072:343093..360042+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna3909 ID=rna3909|Name=XM_015507912.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=16950bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000072:343093..360042+ (Diuraphis noxia)
AGCGAGCGAGCAGCAGCGCCGGCACCACCCCCTCCGCCCGGCAYCACCAC
CACGACCGTCAGTACTGTAGTACCGACGACGGCCCAATCCGTTCGATATC
AGCTGTTCCTTTGTGTAAGTGTCCGTCCGGCGGCCCCGATGCCGATCCGC
CGCGTTCAAAACccaatcgtcgtcgtcgtctccgGCCGCGTACTACTGTC
GCCGCCTCCGCTGTAATCGCGTGCCGTCGcgaaatacacaaaataatata
atatattacagtatttCACTTATCGCGTCCGTCCACCAAGCTGATTCGGC
GTCGTCGTTGCTTCtcgataacaacaacaataatattaattataattgtg
ttgCTATCGTCTACCAATACTGCCGCTGCKACCGCTAAACTGCCGTAACT
AAACAAGTCCCGGCGGAACGTCAGTCGCCGGCGTTTCCGTGCGTCGTCGG
CAACCGCTAAATCCGACCGCCACGCCATGTACGGGACGTGAAGATCGCCA
GCGAATTTTCCGAACTTTTCGCCAAGTGCGGCCGCCAACGGTTTGCCCAG
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CGGCCGAGAGTTGCGATGTTACAGCACAGTAATAGGTATCGGAGGCACTT
TGCGATTCGTGTCGCGAAATTTATTTCACGTCGTTTCCAAACCAAAGCGT
CGTCGTTAGTAGCGCGCTACACGGCCACGCGAATTGTGTAGGTGTTGACC
GACTGAAGCACAAGCGCCCGACCAACACCGTCGATCGCCTAAATTTGTTC
CGTTCTCGCCGAGTAACAAtccatattataacaaaaaaaaaaaatgaaat
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GCGAATGAATCATCGTCATTGTATAAAATtcctatcaaaaattaaaatta
aaatcaccgACCACGTGTTTTTTCActcgtatgtatatgtataatatata
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GAAGCTGTAGTAAGATATACTAAATTAGTAgtgaaatttaatatgaaatc
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back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000072:343093..360042+ >rna3909 ID=rna3909|Name=XM_015507912.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=636bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000072:343093..360042+ (Diuraphis noxia)
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