Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
AED | 0.17 |
QI | 0|0|0.5|1|0|0|2|255|356 |
eAED | 0.17 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AE3000784 | AE3000784 | Aphidius ervi | gene | scaffold7 272097..273920 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AE3000784-RA:three_prime_utr | AE3000784-RA:three_prime_utr | Aphidius ervi | three_prime_UTR | scaffold7 272097..272351 - |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AE3000784-RA:cds | AE3000784-RA:cds | Aphidius ervi | CDS | scaffold7 272352..273414 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AE3000784-RA:exon:250 | AE3000784-RA:exon:250 | Aphidius ervi | exon | scaffold7 273913..273920 - |
AE3000784-RA:exon:251 | AE3000784-RA:exon:251 | Aphidius ervi | exon | scaffold7 272097..273414 - |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >AE3000784-RA ID=AE3000784-RA|Name=AE3000784-RA|organism=Aphidius ervi|type=mRNA|length=1326bp ATGTTATTGAAAATAATAATAAAAATGGCACAAGAATCAAGTAGTAATTT AAGTCGTGAAGATTTTGATGCTGGACCAACAAGTTATGATAAAATTGAAG ATAATCTTTATCTTGGTAATTTAACAGCAGCAACAGATGTTAAATGGTTA AGAAAAAATAAAATAAGTCATATATTAACTGTTGATTCATGTCCATTACC AAGACAAATACAAGAATTACCAGATATAACATTAAAATATATACAAATAA CTGATATGCCACGTGAAGATATATTAACATATTTTGAAAATTCATATGAA TTTATTGATCATGCTATTAAATCAAATGGTAATGTTCTTGTACATTGTTA TTTTGGTGTATCAAGATCAGCAACACTTGTTATTGCATATATTATGAAAA AATATGAATTAACATTTATTGATGCTTATGATATTGTTAAAAATAAAAGA AGATTTGTTAGTCCAAATCCAGGTTTTTTAGCTCAGCTAAAATTATATGA AGATATGGGCTTTACAATTGATACACGTAATATAAAATTTAAATTATATC GTTTACAAATTGCTGCTGATAAAGTACGTAAAGCAAAAATATTACCATCA AATTATATTGATTTAATAAAACCAGATCCAGCACTTGAAACAGTACATCC AGAACCAACTGTTTATCGTTGTGCTAAATGTCGTAGAATTGTTGCATCAG CAAGTAATATACTTCCTCATTCACCACATGAACGACAAATATGGCGACAT GTTAGTACAAAAAAAAATAAAAAAAATCAAGATACTGATAATATTATTGT TAGAACAATCAATGATAATACGGACAATAATAAACAATCTGATATTTGTA AAAAAATATATTTTATTGAGCCATTAGCATGGATGCCAGATATACTTAAT CATGTTGATGGTAAATTAAATTGTCCAAAATGTGAAGCAAAATTAGGTGC ATTTAGTTGGATATCTGGTTGTCAGTGTCCTTGTGGTAGTAAAATTGCAC CAGCATTTTATCTTATACCATCAAAAGTTGATTGGAGTAATGCTGTGCAA AATGTTCTTGTTACTGTTTAAAAAAAAAAACAAAAACACAAGCTGATATA TTTTTTTTGAACAAATATATTTTCAAAGTTTCTATAAAAAAGCCTAAAGT ATCTAAATAAATAGTAAAAAAAAAAAAATCATATAAGCAATTATTATTGT CAAATGTAGAGAAAAATATTGACAAGACTGGAAATAATATTATCTATTTT ATGTGCCAATTTTATCTTCCTATGAATAATATTTAAAAAATGTTAAATAG TATTTTTCGAATCGATTGTTGTCGAT back to topspliced messenger RNA >AE3000784-RA ID=AE3000784-RA|Name=AE3000784-RA|organism=Aphidius ervi|type=mRNA|length=1326bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold7:272097..273920- (Aphidius ervi)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGTTATTGAAAATAATAATAAAAATGGCACAAGAATCAAGTAGTAATTT AAGTCGTGAAGATTTTGATGCTGGACCAACAAGTTATGATAAAATTGAAG ATAATCTTTATCTTGGTAATTTAACAGCAGCAACAGATGTTAAATGGTTA AGAAAAAATAAAATAAGTCATATATTAACTGTTGATTCATGTCCATTACC AAGACAAATACAAGAATTACCAGATATAACATTAAAATATATACAAATAA CTGATATGCCACGTGAAGATATATTAACATATTTTGAAAATTCATATGAA TTTATTGATCATGCTATTAAATCAAATGGTAATGTTCTTGTACATTGTTA TTTTGGTGTATCAAGATCAGCAACACTTGTTATTGCATATATTATGAAAA AATATGAATTAACATTTATTGATGCTTATGATATTGTTAAAAATAAAAGA AGATTTGTTAGTCCAAATCCAGGTTTTTTAGCTCAGCTAAAATTATATGA AGATATGGGCTTTACAATTGATACACGTAATATAAAATTTAAATTATATC GTTTACAAATTGCTGCTGATAAAGTACGTAAAGCAAAAATATTACCATCA AATTATATTGATTTAATAAAACCAGATCCAGCACTTGAAACAGTACATCC AGAACCAACTGTTTATCGTTGTGCTAAATGTCGTAGAATTGTTGCATCAG CAAGTAATATACTTCCTCATTCACCACATGAACGACAAATATGGCGACAT GTTAGTACAAAAAAAAATAAAAAAAATCAAGATACTGATAATATTATTGT TAGAACAATCAATGATAATACGGACAATAATAAACAATCTGATATTTGTA AAAAAATATATTTTATTGAGCCATTAGCATGGATGCCAGATATACTTAAT CATGTTGATGGTAAATTAAATTGTCCAAAATGTGAAGCAAAATTAGGTGC ATTTAGTTGGATATCTGGTTGTCAGTGTCCTTGTGGTAGTAAAATTGCAC CAGCATTTTATCTTATACCATCAAAAGTTGATTGGAGTAATGCTGTGCAA AATGTTCTTGTTACTGTTTAAAAAAAAAAACAAAAACACAAGCTGATATA TTTTTTTTGAACAAATATATTTTCAAAGTTTCTATAAAAAAGCCTAAAGT ATCTAAATAAATAGTAAAAAAAAAAAAATCATATAAGCAATTATTATTGT CAAATGTAGAGAAAAATATTGACAAGACTGGAAATAATATTATCTATTTT ATGTGCCAATTTTATCTTCCTATGAATAATATTTAAAAAATGTTAAATAG TATTTTTCGAATCGATTGTTGTCGAT back to topprotein sequence of AE3000784-RA >AE3000784-PA ID=AE3000784-PA|Name=AE3000784-RA|organism=Aphidius ervi|type=polypeptide|length=356bp
MLLKIIIKMAQESSSNLSREDFDAGPTSYDKIEDNLYLGNLTAATDVKWL RKNKISHILTVDSCPLPRQIQELPDITLKYIQITDMPREDILTYFENSYE FIDHAIKSNGNVLVHCYFGVSRSATLVIAYIMKKYELTFIDAYDIVKNKR RFVSPNPGFLAQLKLYEDMGFTIDTRNIKFKLYRLQIAADKVRKAKILPS NYIDLIKPDPALETVHPEPTVYRCAKCRRIVASASNILPHSPHERQIWRH VSTKKNKKNQDTDNIIVRTINDNTDNNKQSDICKKIYFIEPLAWMPDILN HVDGKLNCPKCEAKLGAFSWISGCQCPCGSKIAPAFYLIPSKVDWSNAVQ NVLVTV back to topmRNA from alignment at scaffold7:272097..273920- Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >AE3000784-RA ID=AE3000784-RA|Name=AE3000784-RA|organism=Aphidius ervi|type=mRNA|length=1824bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold7:272097..273920- (Aphidius ervi) ATGTTATTGTAAATAAACCACACAAAACATGTGTATTAATCTATTGACGG
TTTGCGTTAAATTGTTTGTGTCAAAATAATTTATTTATTTAAAAATTATT
GAGTTGAATTTAATTGTAATTAACAATTAAAATTAGTTTGACATCTTGAA
GTAGTTTTTTTATTTTTTTTTCACATCAATACTCTCATTGGTGATCAATA
AATCCGGGCTAAAAAGTCAAGTTGTATATATATTTTTTTTCTCATTGACG
TACACGTGAATAAAGGTGCAAAAATAAAAATAAAAAAAACCATCAAAGCT
TGAAAGGTAGAAAAGTAAAATCAATGAAGCTCATCTCTTAAATACGTCAA
ACGTTTATTGTCATTTTGTTGAAGAACATCGTTGTAATTCTATTAAATAA
ATAAATAAATTCGTCAACAAAAAAAAAGGTAAATAAAATTATTTATAATT
AATTAATGTTTAATTTTAAATAATTTGAATTATCAAAAAATTAAATTATG
TTTTAGGAAAATAATAATAAAAATGGCACAAGAATCAAGTAGTAATTTAA
GTCGTGAAGATTTTGATGCTGGACCAACAAGTTATGATAAAATTGAAGAT
AATCTTTATCTTGGTAATTTAACAGCAGCAACAGATGTTAAATGGTTAAG
AAAAAATAAAATAAGTCATATATTAACTGTTGATTCATGTCCATTACCAA
GACAAATACAAGAATTACCAGATATAACATTAAAATATATACAAATAACT
GATATGCCACGTGAAGATATATTAACATATTTTGAAAATTCATATGAATT
TATTGATCATGCTATTAAATCAAATGGTAATGTTCTTGTACATTGTTATT
TTGGTGTATCAAGATCAGCAACACTTGTTATTGCATATATTATGAAAAAA
TATGAATTAACATTTATTGATGCTTATGATATTGTTAAAAATAAAAGAAG
ATTTGTTAGTCCAAATCCAGGTTTTTTAGCTCAGCTAAAATTATATGAAG
ATATGGGCTTTACAATTGATACACGTAATATAAAATTTAAATTATATCGT
TTACAAATTGCTGCTGATAAAGTACGTAAAGCAAAAATATTACCATCAAA
TTATATTGATTTAATAAAACCAGATCCAGCACTTGAAACAGTACATCCAG
AACCAACTGTTTATCGTTGTGCTAAATGTCGTAGAATTGTTGCATCAGCA
AGTAATATACTTCCTCATTCACCACATGAACGACAAATATGGCGACATGT
TAGTACAAAAAAAAATAAAAAAAATCAAGATACTGATAATATTATTGTTA
GAACAATCAATGATAATACGGACAATAATAAACAATCTGATATTTGTAAA
AAAATATATTTTATTGAGCCATTAGCATGGATGCCAGATATACTTAATCA
TGTTGATGGTAAATTAAATTGTCCAAAATGTGAAGCAAAATTAGGTGCAT
TTAGTTGGATATCTGGTTGTCAGTGTCCTTGTGGTAGTAAAATTGCACCA
GCATTTTATCTTATACCATCAAAAGTTGATTGGAGTAATGCTGTGCAAAA
TGTTCTTGTTACTGTTTAAAAAAAAAAACAAAAACACAAGCTGATATATT
TTTTTTGAACAAATATATTTTCAAAGTTTCTATAAAAAAGCCTAAAGTAT
CTAAATAAATAGTAAAAAAAAAAAAATCATATAAGCAATTATTATTGTCA
AATGTAGAGAAAAATATTGACAAGACTGGAAATAATATTATCTATTTTAT
GTGCCAATTTTATCTTCCTATGAATAATATTTAAAAAATGTTAAATAGTA
TTTTTCGAATCGATTGTTGTCGAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold7:272097..273920- >AE3000784-RA ID=AE3000784-RA|Name=AE3000784-RA|organism=Aphidius ervi|type=CDS|length=1071bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold7:272097..273920- (Aphidius ervi) ATGTTATTGAAAATAATAATAAAAATGGCACAAGAATCAAGTAGTAATTT AAGTCGTGAAGATTTTGATGCTGGACCAACAAGTTATGATAAAATTGAAG ATAATCTTTATCTTGGTAATTTAACAGCAGCAACAGATGTTAAATGGTTA AGAAAAAATAAAATAAGTCATATATTAACTGTTGATTCATGTCCATTACC AAGACAAATACAAGAATTACCAGATATAACATTAAAATATATACAAATAA CTGATATGCCACGTGAAGATATATTAACATATTTTGAAAATTCATATGAA TTTATTGATCATGCTATTAAATCAAATGGTAATGTTCTTGTACATTGTTA TTTTGGTGTATCAAGATCAGCAACACTTGTTATTGCATATATTATGAAAA AATATGAATTAACATTTATTGATGCTTATGATATTGTTAAAAATAAAAGA AGATTTGTTAGTCCAAATCCAGGTTTTTTAGCTCAGCTAAAATTATATGA AGATATGGGCTTTACAATTGATACACGTAATATAAAATTTAAATTATATC GTTTACAAATTGCTGCTGATAAAGTACGTAAAGCAAAAATATTACCATCA AATTATATTGATTTAATAAAACCAGATCCAGCACTTGAAACAGTACATCC AGAACCAACTGTTTATCGTTGTGCTAAATGTCGTAGAATTGTTGCATCAG CAAGTAATATACTTCCTCATTCACCACATGAACGACAAATATGGCGACAT GTTAGTACAAAAAAAAATAAAAAAAATCAAGATACTGATAATATTATTGT TAGAACAATCAATGATAATACGGACAATAATAAACAATCTGATATTTGTA AAAAAATATATTTTATTGAGCCATTAGCATGGATGCCAGATATACTTAAT CATGTTGATGGTAAATTAAATTGTCCAAAATGTGAAGCAAAATTAGGTGC ATTTAGTTGGATATCTGGTTGTCAGTGTCCTTGTGGTAGTAAAATTGCAC CAGCATTTTATCTTATACCATCAAAAGTTGATTGGAGTAATGCTGTGCAA AATGTTCTTGTTACTGTTTAA back to top
Synonyms
The feature 'AE3000784-RA' has the following synonyms
Synonym |
maker-scaffold7-snap-gene-2.211-mRNA-1 |
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