Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
AED | 0.70 |
QI | 0|0|0|0.09|1|1|11|0|229 |
eAED | 0.70 |
Full name | DV3009676 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >DV3009676-RA ID=DV3009676-RA|Name=DV3009676-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=690bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold240:785635..790462+ (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGAAAGATATACATGAAATATGTGTGCACTACTATAACGGTGGTCTAAA AAAATTACTTAAAAAAATTTTGTCCTCCTACCATCTAAATTTGTTTTCTA GAAATAACCTACGTAAATTAAAAATGACAACGCGAAGTAATACTTATATT TATTTAATTGGTCAGCCTATTTCAACTGTACCAAGTAATCGTTTGCCGTC TAATGGTGAAGTATTACGTACAGAAGAAAACCATTCTAGTGATAATACTA ATTCCGACGATGATTTTATTGTCAATGAAAAAAAATCAAAAAAAGTTCAA AAAAAATTGAAACCTTTGATCACATCAGAATTATCAGCTGTGCTAGATAG AACTAAGGTCAGTGATCGGCAAGCCACCTTTATCATTGGAGCTACACTAA AAAGTCTTGGAGAGAATATTGATACGTTTGCATGTAGTCAAAGTACGATA AAACTACATCTTAAAAATTTTCAAATAGCTTGGGATGGCTCAAAAATTAA TTTTTCGTGTTTTTTTTTCTTGAGAATTGTATTAAACAATGTGGCCATAT CATTAAATTCTTTACACGTGTGTGAAGAATTTGCTAACGCTGTTTGTCGC ATTATGAAAACACATAGTCTTAAAAAGGAAAAGTGTTTGAACATGTTAAG TGAAATTTTATATATAAGAAGTATTCCAATTGAATTTTAA back to topprotein sequence of DV3009676-RA >DV3009676-PA ID=DV3009676-PA|Name=DV3009676-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=230bp
MKDIHEICVHYYNGGLKKLLKKILSSYHLNLFSRNNLRKLKMTTRSNTYI YLIGQPISTVPSNRLPSNGEVLRTEENHSSDNTNSDDDFIVNEKKSKKVQ KKLKPLITSELSAVLDRTKVSDRQATFIIGATLKSLGENIDTFACSQSTI KLHLKNFQIAWDGSKINFSCFFFLRIVLNNVAISLNSLHVCEEFANAVCR IMKTHSLKKEKCLNMLSEILYIRSIPIEF. back to topmRNA from alignment at scaffold240:785635..790462+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >DV3009676-RA ID=DV3009676-RA|Name=DV3009676-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=4828bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold240:785635..790462+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGAAAGATATACATGAAAGTATCATCAATAACTCAAACATCATTTTACC
ATGAATTAACATATTATTATTTTTCAATTAAACAATGTTTAATTTAAAAT
CGTTTTAATGAACATATTAAACTTTTTTTTAATTGTGCAAGTTTTTAATT
TTAATTTTTTCTTTATTAGTATGTGTGCACTACTATAACGTTCATTAATT
TGATTTTTTTAATATAAATGTTTATACATTTTTATACAATATATATATAT
ATATATATATATATATATTAGGGTGGTCTAAAAAAATTACTTAAAAAAAT
TTTGTCCTCCTACCATCTAAATTTGTTTTCTAGAGTTTAAAAATAGTTTC
CACATTTATACTTATGAAAAAAAATTATTTTTGAGCCATCCCAAGCAATT
TAAAGTTTTTATTGTACAGAATAACCTACGGTATTTTTCCTATACTATAC
TTATAAGTATTAGTATTATCGCAATTGTAATATTTTCTTATACGACTGTA
TTATTACTATATCAATAAATAAAACATTTTATCTACACCTCTGACAGGGT
TATTCCTATGTATTGTACAGTGTATAACTTATTATACTATGACTATGTAT
TAAAGGTTGATGTACGTCTATTATCATTGTAGAATTATATTTTAGTTGAC
AGTGCGCTGTTTTGATGTTCGTGTCACTCTAATTGTTAATTGTCAGTGTG
CTTTAAATGTGAATCAGTGCTAATTTAATTATACATATATTTATTCAGTA
AATTAAAAATGACAACGCGAAGTAATACTTATATTTATTTAATTGGTCAG
CCTATTTCAACTGTACCAAGTAATCGTTTGCCGTCTAATGGTGAAGTATT
ACGGTTTTTCTTTCATATTTATCGTATTGAAAAAAATTTGTTTAAATATG
CATGCAATAAAGTGATCGAAGAAGTTACATTTGTTTGGAATAAAGCAAGA
ATACCGACAACTCGAAAAGATAATGCTATAAATAAGTTTAAAAAACTTTA
TAATCAATGGCTAAATCTTTTCAAACATAAAAATAGAAAAACAGAGCTTC
ACCGACAACACGAATGTGGGTTTCATATAAAATTGACCAATCTCTTCGAT
ATCGCTGATGCTGATGCTTTAAAAAAAATTAAAATTGATGAAGATAGACA
GTTTTTACTGGCACAACGGATGCCAGGGAGAAGAGGTTTTATGTCTACAG
TGGACGTTTTTACCACGCAAAAAGAGAATCGTAAAGATAAACGAAAAGAA
AAACAACAACTCTATAAAGAAAAAGTTACTAATCAAAATTTGAGTAATTT
TTATGATTTTACATCATTAAGTACAGAAGAAAACCATTCTAGTGATAATA
CTAATTCCGACGATGATTTTATTGTCAATGAAAAAAAATCAAAAAAAGTT
CAAAAAGTAAAAAGAAATTGAAACCTTTGATCACATCAGAATTATCAGCT
GTGCTAGATAGAACTAAGGTCAGTGATCGGCAAGCCACCTTTATCATTGG
AGCTACACTAAAAAGTCTTGGAGAGAATATTGATACGTTTGCATGTAGTC
AAAGTACGATAAAACTACATCGTAAGAAATTAAGGCAAGAAATGGCTAGT
TTTATTAAAGAATCATTTACAATAAACAGCAAATTAACAGTTCACTGGGA
TGGAAAACTGATGTTGGACCTCACTCATTTACAATATGTGGACTGTCTCC
CAGTATTGGTGTCAGGTGGAGATGAAATTAAATTACTGAGTATTAAAAAA
TTATCTTGTTCAACAGGAGAAATGCAGGCACAAACCGTTTTCGATTGTTT
GAGTGAAAAAGAATGGAATTTATACAAAAATATCGTTGCAATGTGTTTTG
ATACAACATTTTCGAATACTGGTAAAAACAATGGGTCATGTGTACTATTA
GAACGTAAACTTGGAAAAAACTTATTTTGGCTTGCATGCAGATATCATAT
TTTTGAATTAGTCATTGGAGCAGCATTTCAAGCAGTGTTACCTTCAGCGA
CAACAGGCCCTGATAACCGAATGTTTGTACGATTTCGATCTTCTTGGTCT
AAAATTGATCATTCTGCATACGTTATAGCAAACTCGGCTATTATTCAAAG
GATTACAGAGAATATACGACATGAACTAGTTAATTTTTGCCAAGAAATGC
TTAAAATAAAACAAGTAAGAGATGATTATCGTGAGATGCTGGAATTATCA
GTTATATTTCTTGGTGAAGAACCTACCAGAGGAATAAAATTTATGACTCC
AGGTGCTACTAGTCATTCACGTTGGATGTCAAAAGTAATTTACTGTTTAA
AAATATTTATGTTTAGTGGACAATTTCATCTAAGTACCAAAGAAAAAAGG
GGCCTCGAGGAAATATGTGTTTTCATTGTAACCGTCCATTTAAAAAATTG
GTTCACTGCAACTTTGGCGGCATGTGCTCCAAATAATGACTTGCAACTGA
TAAAGACCTTAATAAAATATGATAATCCACATATTTCAAAAGCCACTGTA
AAAAAAATGATGGGTCATTTATGGTATTTGTCAGATGAGTTAGTTGGTCT
TTGTCTGTTCGACAAAAATGTCCCTGTTGAAACCAAATGTAAGATAATTT
ACGCCATAAATAATAACCCCTCTCCAGAAGTTCCCAATGTAAGACCGAAA
ATTGACCAACACGATGTAGAAAATTTACAGCTTCATGATTTAGCTAACAA
AAATACAATACAAATTTTCACAGAATTTGGTGTCGATGAATTTTTGAAAA
ATGACGTGGTAAACTGGACCGAGTCTAAAAGCTACTTAAAAGCAGAGGAA
GTTTTTAAGAATCTTCGTGTTACCAATGACGTGGCAGAAAGAGGAGTTTC
ATTGATCCAAGACCTTAATCGCAAAATTACCCATGATGAGGATCAACTTC
AGTTTCTCTTACAAGTAGTTTCTGAGCATCGGAAGATTTACCCTGATTGC
AGCAAACACACTTTAAAAAAAAGCAATTCAACTTTTATATAATTTTTTAA
TTCTTTAGTAAGTAAAATTAGAAATGTTAAAAATGATTTATATAATATAG
CTTGACTTATTGATAAAAAAATATAAGAACGAATACATAAAATAGTTTTC
ATTATTATTTTATTTTTTTTTTTAAGTTAAAAATTTTCAAATAGCTTGGG
ATGGCTCAAAAATTAATTTTTCGTGTTTTTTTTTCTTGAGAATTGTATAT
AAAACCAGGTAGAACAATTTTCAAGTGTAGGAGTATAACATAAAAAAAAA
AATTTTTTTTTTGTCACTTTTAGACCACCCTAATATATATATATATATAT
TGTTAATTTTTTTCTAATATGTAAAAATTCAGTGAATTTCAATTTGGTCT
AGCTAAGTTTAATTTTCATTTTTGTAATGGTCCGGTCCAATCCCTAAGTT
TTAAGAATTAATATTTCTGTTTGGTTTGTTACAGTCAATTCCATAAAAGA
TTCCATATTTATAATACATAGTGATAGTGTCAAGTGTTTTGAAAGGATAC
CAAAATATATTAGATAATAATTAACAGCATTCATTCAATTTTTTACGTCT
AATATTTCTAAGTTAATTTAGTTTTGTTGGTAGTACTTTTTTATAAAAAC
ATTATAATAACGTTTATACGTAGAATTTAGAATGTACAAATCATGAAATC
TTTCTTTTTTCCGTAAGGTATATTGCAATATTTATGTGTCAAGTAATCTA
GTGGTCTTAGATAACAAGCTAAGTAGTGTACTTTATAAATAATCAAGATA
CTGTTTCATTGGATAGACGCATTTGTATAATGTAAATTTGTCAGTTTTAT
TATTAAAATTAACCAACTAAGCTTTTAAACGTCTTATTTATAACATTAAC
ATATTGTTATTTTACAAACATGTTAATAGGTATTAAACAATGTGGCCATA
TCATTAAATTCTTTACACGTGTGTGAAGAATTTGCTAACGCTGTTTGTCG
CATTATGAAAACACATAGTCTTAAAAAGGAAAAGTGTTTGAACATGTTAA
GTGAAAGTATTAAATAATTTAAGTTGATTATAATAAAAAATGATTAAAAT
TCAAATTAAAGTCAATAAATGATTTTCAGTGTAGTGTATCCCTTTTTTAA
CGGATCTCATTCCCCTTTTAAAAAAAAAAAATATTTAAAAACTAGATATT
ATGATATTGATATTATAACTTTAGTTTTATATATAAGGTAAATTTTAATT
ATTTTATGTACAGGCGAAATTTGAACAAAATTTTTGGAGAATCTAACTTA
ATTTTATCTATTATACATTTTTTTAATTTAAATTAACATCTAAATTTCAA
CTTGTTTTAGTAAAAGTGAGGTGCAGCAGAATTAGAGGGCTAAGCCCTCT
CTGGACGTCCCAAATTGTACCTACTTTCCTTTGATTTCGTGATATTATGA
TTTTAGTGTAATAATTTATTTAATATTTTGAATACATTATTTATATATCA
GATTTTAATACAAAAAATATTTTTAATAATCAACGTAAAGGCACATTTTT
ATTAATAACTTTTAGAAAAAAATAACCATTTTATAACCAATAAGATTTAA
AGGAAATGTAAATTTAGTTCATTAATTTCTAAAGGAAACAGTTCCTATCT
TCGTTTTTATAATAATAATTTGTTTCAGGAATCATTTAATTTTGGAATGA
AAGTTCTTACAACACTGATGATTTTGAATTCTTTTAATAGACAGTATTTT
ATTTTATAGTATTTTTGCGTTTGGATTTTCTAATAGATATGCTATGTCTC
TCTAATGATTTTTGTATTTCATTAATTACTTATTTTTTATATTAAAAATG
TATTAGAAGTATTCCAATTGAATTTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold240:785635..790462+ >DV3009676-RA ID=DV3009676-RA|Name=DV3009676-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=690bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold240:785635..790462+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGAAAGATATACATGAAATATGTGTGCACTACTATAACGGTGGTCTAAA AAAATTACTTAAAAAAATTTTGTCCTCCTACCATCTAAATTTGTTTTCTA GAAATAACCTACGTAAATTAAAAATGACAACGCGAAGTAATACTTATATT TATTTAATTGGTCAGCCTATTTCAACTGTACCAAGTAATCGTTTGCCGTC TAATGGTGAAGTATTACGTACAGAAGAAAACCATTCTAGTGATAATACTA ATTCCGACGATGATTTTATTGTCAATGAAAAAAAATCAAAAAAAGTTCAA AAAAAATTGAAACCTTTGATCACATCAGAATTATCAGCTGTGCTAGATAG AACTAAGGTCAGTGATCGGCAAGCCACCTTTATCATTGGAGCTACACTAA AAAGTCTTGGAGAGAATATTGATACGTTTGCATGTAGTCAAAGTACGATA AAACTACATCTTAAAAATTTTCAAATAGCTTGGGATGGCTCAAAAATTAA TTTTTCGTGTTTTTTTTTCTTGAGAATTGTATTAAACAATGTGGCCATAT CATTAAATTCTTTACACGTGTGTGAAGAATTTGCTAACGCTGTTTGTCGC ATTATGAAAACACATAGTCTTAAAAAGGAAAAGTGTTTGAACATGTTAAG TGAAATTTTATATATAAGAAGTATTCCAATTGAATTTTAA back to top
Synonyms
The feature 'DV3009676-RA' has the following synonyms
Synonym |
snap_masked-scaffold240-processed-gene-8.21-mRNA-1 |
|