Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Gbkey | mRNA |
Gene | LOC107161889 |
Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 4 Proteins, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
Product | twinkle protein, mitochondrial, transcript variant X1 |
Transcript id | XM_015508485.1 |
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
GeneID | 107161889 |
Genbank | XM_015508485.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
LOC107161889 | gene3044 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000085 170019..174614 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
XP_015363971.1 | cds4326 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000085 170119..170377 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna4453 ID=rna4453|Name=XM_015508485.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1949bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000085:170019..174614+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATTACTATgtcctatattaatttaaatatagaatttgTGTTTACATAGCA TTCATAAATCAATTCAAAATCTATACttatttacctataaaaaaaataat atgaaattttactATTCAATAAGGAATTGTTCGAAAATTCTTTTCCATGG AaaattaatcaaacaaaaattattttttagtattcaaaATCGAATGTCTA AAATTAGTTCAACCGACCATGATAGAACAACGTCAGCAGATTTTTTTGTT GCAAAATTATTAGACAGTTTTAAAGTACCatacaaaaatcaatttacttG CTTATTGGTAAGATGcagtttttgtaataatacatcgttatacattaata aagtaACAGGATGGTTTATTTGTACACATTGTTTGAGATATGGCGATTGG TCAGTATTTAAGTcacatgtaaataaaaataatgaaaaaatttgtGTACC CACTCCAAAAAATTTTGAAGCTGGTAAAGATTTTAAGAAAAAAGCTgata atttaatgcattttaaatcgTTAAGAATTAGCAGTAAAAAGAGTATTTTA AAAGCACTTAGTATGGAGgaattaaaaatacaagacCTTGATCGTATTCC GGGTTTATACGTTAATTCAGAAAATAGTTCCTTGTACTTGACTATGatgc ttaataataaaatagttgttggatataaagaaattaaattagaaaatagt cTCAATCAAAATACTGTACCTGATGATTGTTGCTGGGGAATTGCTCAAGT TCCACCATTCACTTCAAATCATAGTCAAAGTGCAATTATTGTTgatgatt ttaaacatttattagtaTTAGCTGGTCATCAATCATCTCATCATATTATT TGCTTACCTCATGgtgTGCGTAAATTACCACAAGAATTACTGCCATCATT GGAGTATTTTAACAGATTAATCTTATGGTTTGGAAATGATCAAATTGCAT GGAATTCAGCAAGAACATTTGCAaagaaattaatagaaaatagatGTTAT TTTATAAGACCTACTGATGATCAACCATCCCCTTATTTAGCATATAAACT CGGTTTGAATATtgacaaaatacttaaaacagcAGATAAAATGGTTCATC CTagtattattcaattttcaacaatACGTAATGAAGTTTATGCAGAGTTA CAGAATCATGATaagACTCTTGGAATGAAATGGACAAAATTTCCGACATT AAATAAGATTATTGGAGGCCATCGTCGTGGAGAACTTACTCTATTAACTG GTCCAACCGGATCAGGAAAAACAACTTTTATAAGTGAATATTCATTAGAT TTAGCTGAACAAGGCTTGCCAACGTTATGGGGAAGTTTTGAAATACGTAA TCAACGTTTAGCAAAAATCATGCTTCAGCAATTTGCAAAGGAACCTGTGC ATCTTAATTTAGACTTATTTGACAACTTAGCARATCAATTTGAAAAGCTT CCACTTTATTTTTTGACTTTCCATGGTCCCCAACCACTAAATATGGTKAT GGATgctGTTGTAAACGCtgtttatgtatatgatattggCCATGTGATCA TTGATAATGTACAATTTATGATGGGCATTGGTGCCAAGTATGATATGGGT TCAGAGCGATTTTGGCAACAAGATTCAATTATAGCAGAGTTTAGGAGGTT TGCTACATATTCAAACTGTCATGTGACATTAGTAATGCATCCTAGGAAAG AAAAAGATGTTGAACAGTTATCCATAAATTCTATTTTTGGTACTGCTAAA GCCACTCAAGAAGCTgacaatattcttataatacaaaataaaattatgga atctttacaaattaaaaaatatttacaggTTTCCAAAAATCGATATAATG GTAATCTTGGAGTTATGTCTTTAGAATTCAATAAACAAAGTTTGAGTTTT TCACAGCAAAAAacctaactatataattttttatatattcataaactaC back to topprotein sequence of XM_015508485.1 >rna4453 ID=rna4453|Name=XM_015508485.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=606bp
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CAGCAAAAAacctaactatataattttttatatattcataaactaC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000085:170019..174614+ >rna4453 ID=rna4453|Name=XM_015508485.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=1818bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000085:170019..174614+ (Diuraphis noxia) atgaaattttactATTCAATAAGGAATTGTTCGAAAATTCTTTTCCATGG AaaattaatcaaacaaaaattattttttagtattcaaaATCGAATGTCTA AAATTAGTTCAACCGACCATGATAGAACAACGTCAGCAGATTTTTTTGTT GCAAAATTATTAGACAGTTTTAAAGTACCatacaaaaatcaatttacttG CTTATTGGTAAGATGcagtttttgtaataatacatcgttatacattaata aagtaACAGGATGGTTTATTTGTACACATTGTTTGAGATATGGCGATTGG TCAGTATTTAAGTcacatgtaaataaaaataatgaaaaaatttgtGTACC CACTCCAAAAAATTTTGAAGCTGGTAAAGATTTTAAGAAAAAAGCTgata atttaatgcattttaaatcgTTAAGAATTAGCAGTAAAAAGAGTATTTTA AAAGCACTTAGTATGGAGgaattaaaaatacaagacCTTGATCGTATTCC GGGTTTATACGTTAATTCAGAAAATAGTTCCTTGTACTTGACTATGatgc ttaataataaaatagttgttggatataaagaaattaaattagaaaatagt cTCAATCAAAATACTGTACCTGATGATTGTTGCTGGGGAATTGCTCAAGT TCCACCATTCACTTCAAATCATAGTCAAAGTGCAATTATTGTTgatgatt ttaaacatttattagtaTTAGCTGGTCATCAATCATCTCATCATATTATT TGCTTACCTCATGgtgTGCGTAAATTACCACAAGAATTACTGCCATCATT GGAGTATTTTAACAGATTAATCTTATGGTTTGGAAATGATCAAATTGCAT GGAATTCAGCAAGAACATTTGCAaagaaattaatagaaaatagatGTTAT TTTATAAGACCTACTGATGATCAACCATCCCCTTATTTAGCATATAAACT CGGTTTGAATATtgacaaaatacttaaaacagcAGATAAAATGGTTCATC CTagtattattcaattttcaacaatACGTAATGAAGTTTATGCAGAGTTA CAGAATCATGATaagACTCTTGGAATGAAATGGACAAAATTTCCGACATT AAATAAGATTATTGGAGGCCATCGTCGTGGAGAACTTACTCTATTAACTG GTCCAACCGGATCAGGAAAAACAACTTTTATAAGTGAATATTCATTAGAT TTAGCTGAACAAGGCTTGCCAACGTTATGGGGAAGTTTTGAAATACGTAA TCAACGTTTAGCAAAAATCATGCTTCAGCAATTTGCAAAGGAACCTGTGC ATCTTAATTTAGACTTATTTGACAACTTAGCARATCAATTTGAAAAGCTT CCACTTTATTTTTTGACTTTCCATGGTCCCCAACCACTAAATATGGTKAT GGATgctGTTGTAAACGCtgtttatgtatatgatattggCCATGTGATCA TTGATAATGTACAATTTATGATGGGCATTGGTGCCAAGTATGATATGGGT TCAGAGCGATTTTGGCAACAAGATTCAATTATAGCAGAGTTTAGGAGGTT TGCTACATATTCAAACTGTCATGTGACATTAGTAATGCATCCTAGGAAAG AAAAAGATGTTGAACAGTTATCCATAAATTCTATTTTTGGTACTGCTAAA GCCACTCAAGAAGCTgacaatattcttataatacaaaataaaattatgga atctttacaaattaaaaaatatttacaggTTTCCAAAAATCGATATAATG GTAATCTTGGAGTTATGTCTTTAGAATTCAATAAACAAAGTTTGAGTTTT TCACAGCAAAAAacctaa back to top
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