Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Gbkey | mRNA |
Gene | LOC107161873 |
Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 7 Proteins, and 87% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments |
Product | tyramine receptor 1-like |
Transcript id | XM_015508466.1 |
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
GeneID | 107161873 |
Genbank | XM_015508466.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
LOC107161873 | gene3048 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000085 214736..221975 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
XP_015363952.1 | cds4332 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000085 217559..217619 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna4460 ID=rna4460|Name=XM_015508466.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1055bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000085:214736..221975+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
GCAACATTCCGTGTACAATatctttcttttttcttttttttttttctaaa acaattttttcgctTTCCACGTCTAcccattaacaataattataataata tacacattatgttTGGTACAATATCCATCGCGTTgtaaatatatctatgt ataatacataaacaatataatatataatcatcacgacaattacaattatt attcatctgATCCGCTGCGGCACTTCGACCCCGTCAGCGCGACCGCCATG TTACCGGAATCTGgCTGTGATGTGTGACAGATAGCAACAATGGCGGTGGG CACGTACTACTGAAGCCCACCCCCACCACAACCTGGAGCCCTTAACCCAG GCATCGCTGGTGCTCACCATGGCGGTCGCCATCATCCTCCTTAATATCCT CATAATCGCTACGTTCACCAACATAagaggtGGAGGAGAGGTGATGAATG TATACTTGGTGTCACTGGCTCTAGCCGACCTGCTCTACGGTGTGCTCGTA GTGCCATTTTCCGTGTATCCTGCACTTGTGCAACAATGGGTTTACGGGAA AATTGCTTGTAGAATAATCGGATACATCGAAGTCGCACTGTGGACCGTGT CTGCATACACACTTATGTGGATTAGTGTGGACAGGTACATAGCAGTACGT AAACCGGTCCGGTACTTTACGGTGCAGACGCGCACCAGGTGTCAGTGCTG GATGGCGTTCACGTGGATATCGTCGGCGATGCTCTGCAGCCCACCGCTGC TCGAGTTCGGTGATCCGGTATTCGACCAGGACACGGCGGTGTGCATGCTC GACTGGCAAGGCATGGCGGCATATTCGGTGACGCTGTCCATACTGGTGCT GGGGCCCAGTCTGATCACAATTCTGTACACGTACGTGTATATTTATGGTG CGATCAGACGGTTGCGACGTGGCTTTCTAGCACACGACAAgATGAAAATG GAGATTATATGGCAAAAACACCAAGAATCCATGAAATATGCATTTCTTGT AGAAAAAGTCAATTATGTGCACATAAtccatgatatatttttaaaatggg tATAA back to topprotein sequence of XM_015508466.1 >rna4460 ID=rna4460|Name=XM_015508466.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=229bp
MAVAIILLNILIIATFTNIRGGGEVMNVYLVSLALADLLYGVLVVPFSVY PALVQQWVYGKIACRIIGYIEVALWTVSAYTLMWISVDRYIAVRKPVRYF TVQTRTRCQCWMAFTWISSAMLCSPPLLEFGDPVFDQDTAVCMLDWQGMA AYSVTLSILVLGPSLITILYTYVYIYGAIRRLRRGFLAHDKMKMEIIWQK HQESMKYAFLVEKVNYVHIIHDIFLKWV. back to topmRNA from alignment at JOTR01000085:214736..221975+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna4460 ID=rna4460|Name=XM_015508466.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=7240bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000085:214736..221975+ (Diuraphis noxia) GCAACATTCCGTGTACAATatctttcttttttcttttttttttttctaaa
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TGTGCACATAAtccatgatatatttttaaaatgggtATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000085:214736..221975+ >rna4460 ID=rna4460|Name=XM_015508466.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=687bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000085:214736..221975+ (Diuraphis noxia) ATGGCGGTCGCCATCATCCTCCTTAATATCCTCATAATCGCTACGTTCAC CAACATAagaggtGGAGGAGAGGTGATGAATGTATACTTGGTGTCACTGG CTCTAGCCGACCTGCTCTACGGTGTGCTCGTAGTGCCATTTTCCGTGTAT CCTGCACTTGTGCAACAATGGGTTTACGGGAAAATTGCTTGTAGAATAAT CGGATACATCGAAGTCGCACTGTGGACCGTGTCTGCATACACACTTATGT GGATTAGTGTGGACAGGTACATAGCAGTACGTAAACCGGTCCGGTACTTT ACGGTGCAGACGCGCACCAGGTGTCAGTGCTGGATGGCGTTCACGTGGAT ATCGTCGGCGATGCTCTGCAGCCCACCGCTGCTCGAGTTCGGTGATCCGG TATTCGACCAGGACACGGCGGTGTGCATGCTCGACTGGCAAGGCATGGCG GCATATTCGGTGACGCTGTCCATACTGGTGCTGGGGCCCAGTCTGATCAC AATTCTGTACACGTACGTGTATATTTATGGTGCGATCAGACGGTTGCGAC GTGGCTTTCTAGCACACGACAAgATGAAAATGGAGATTATATGGCAAAAA CACCAAGAATCCATGAAATATGCATTTCTTGTAGAAAAAGTCAATTATGT GCACATAAtccatgatatatttttaaaatgggtATAA back to top
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