Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107162326 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 1 Protein, and 8% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments |
| Product | uncharacterized LOC107162326 |
| Transcript id | XM_015509170.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107162326 |
| Genbank | XM_015509170.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107162326 | gene387 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000005 1312946..1318545 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015364656.1 | cds556 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000005 1312946..1313005 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna571 ID=rna571|Name=XM_015509170.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1239bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000005:1312946..1318545+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
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TTTatgaatcaattaaaaaatataaacgaaaataGATGA back to topprotein sequence of XM_015509170.1 >rna571 ID=rna571|Name=XM_015509170.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=413bp
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FMNQLKNINENR. back to topmRNA from alignment at JOTR01000005:1312946..1318545+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna571 ID=rna571|Name=XM_015509170.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=5600bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000005:1312946..1318545+ (Diuraphis noxia)
ATGAATAGAAATGAAGAGAAGATGTTGGGGATATTACGCCACAAAACGAA
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back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000005:1312946..1318545+ >rna571 ID=rna571|Name=XM_015509170.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=1239bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000005:1312946..1318545+ (Diuraphis noxia)
ATGAATAGAAATGAAGAGAAGATGTTGGGGATATTACGCCACAAAACGAA
GATTTATACAGATATGTTGACAAAAAATGTGGACGATACCATAGATAGTA
CTAAGATTCTTACTAAACATTGGGAAAACATATTGTCTGAATATAATGAC
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AGGTCAGGATAAATGAGAACGACWCGTTTTGGAAGATGCTAAAATATGAT
AGCAAAGTGGTACAACTTGAAATAGATAAGTGGAaatctaaaattcaaaa
caagCACATTGAAAATATGGACATCGAACGTGGGAGGTTCGAatcaatta
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GATGTATATTCTTCTGTTTTGGatgattatgtaaaaaaaactcaaaatat
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accttGGAAAAAGAAACAGGCAAACCTAAATTATTGaaggaattaaatat
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ACAAAGTcgcaaataattttaagctcGGCCACAAACAAAAGTCACTTCTT
TGCCAATCTACCAAACAAATAATTAGCaatttaaacattaaattgaaGAT
GGGTGAAGATATAATGAAATGTATCCACTTATGTCAAGAATTGGAAACAT
CCGATGACAAAGCGAATATAATTCCAATATTCAATGCCTGTGAACAAATA
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