Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107164956 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 1 EST, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
| Product | protein lingerer, transcript variant X4 |
| Transcript id | XM_015512991.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107164956 |
| Genbank | XM_015512991.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107164956 | gene5845 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000231 195138..210285 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015368477.1 | cds8388 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000231 196092..196226 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna8659 ID=rna8659|Name=XM_015512991.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=3671bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000231:195153..210285+ (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
tgtacaaaatacaaaaataatgttagtcTGATACCGAGGTTAAATGCATC
GATCGCGCTCccgtatttagttttaaatgtgTATCGTATTTTGATTACCC
TGTAAATACCGTTGTACATAAGGAATAGGTGAACCATAagcgaaaaatat
aaatacattataatgagCAGCGTTAAAGGTGTTGTGAATCGCAACGCCAA
GACGTCTGGTAAGAATAGCACTACCAACACAGCTACGCTGAATGCTGATT
CAAAAGATGCAGTACCTAACAAAACAcacgaaaaagaaaaattgcaGccA
ACAGCTGAGCAACTCAGAATTGCTAAAATTATTGATCTTAAACCTGATGA
AgaaattaacaacaaaataaagcAGGTGATgcaaataactcaaaaaacag
AAGATGAAGTAGTTATTGCGCTCCATGACAATGCTTTAGATATTGCATTA
ACTATTGAGGCACTTTTGGAAGGACCACAGGAATCATGGTCAACAACAGG
CAAGAAAAAAAAGAATCGAGCAAGTAGCgtaaacaaaaaagaaaaagatg
aTGTGATAAAAAATGGTGAAGCAGATGGAGATGCTGAATGGGACGAAACC
ATTACACAAGCAGCTAGTATTACTGCTCAGAACAATGGTGGATTTAGTGA
GCGACGGGGTCGAGGTGGCCGTGGTGGCCGAGGAGGCTTTACTAATAGGC
CTAGACCAACTGAAGGTGGTCAGCGATTTGGAGAGTCACGGAGAGAACGT
GAGAACAAAGAAAATGAAAAGAATTTAGCTGAAGATGGTGCTAGTGGTGA
GAATCGTAACTTCCGTTCTGAAAGTAGAGGTTCAAGAAGAGGCATAAATG
GACCACGTTATAATGGTCGGTCTAGAGGTACTCGTATGTTCCAGAACAGT
GAACGTGGTAATTCAGGACCCGGTGGTGGTAACAATAGCGGATTCAGTCA
ACCAATTGATACTTGGTTCAATCCTACTGCTAAAGAATCAAAGAAggaaa
attggGGTACATTTCCATCACCTGAAGACTGGGACAATGAAGAGTATACT
GGTTCGTTGGCTGACACTAAAGTATTTACACCTAGTGGTGGTACTGAGAG
TACTGTTGTTAATAATGATGTTGAGGTGCCAAAACCAAATGAAAATGCTT
ATTTAGAAGTTGAAGATTGGAATGATGCTGTTCAAGCACCAAATCAGCAA
GCAGCAGCTTCtaatAATGCTACTTCTGAAAACCTTGCGGCATCAATTGC
TAACAGTAAAACATTAACACCTGAACAGTCTCAGTACTTATCTTCATTAA
CTCAAGAGAGTCAACAAAAAAAAGTAGTTACTCTACCGCCAGCTGCTGCA
ACATTCAATTCTCATCCTccagTGGAATTTGTTTCTTTGCCTTTTGAAGA
GAATTCAATTGGTCCTGGGAAAAAACCAACCTTACGTGCGCGCATACCCC
CTCCTTCTAAGATACCATTAAGTGCTGTTGAAATGCCACCTGAAGATTCT
AGTGTCAACATCAACTTCTTAGATGTATCATTTGGTGCTGTCGATCTTTC
TGGTGATGTACCACAACTTTGTGATCCATCACAAGATCAAAATTCATTGC
CACCTGTTGTTAAATATGATGACTCAGTTGCTCAGAAAGTAGATTCTGTC
CTTACTCAAACTGAATATTCAACTATATCTAATCAAGCTTCAGTTCAAAC
TCAAAGATCACCTCAAGTAAATCAAGCGCCTCAGCCATCAACAAAAATTG
GGCCGCCCCCTGGTGTTCCTCCTCCTGCCGATTATTTGACTAAGCAGAAT
GCAGCAGTAGCtaatcaatatcaaaatattaatactggACAACCAACATC
AATGTATAATTCTTCAGTTTATTCTAATAATCCTCAAGGTTTATCCAGTC
ATACAAGTTTATATGGTACAACTGCGTCCAACATCGGTGTTAATAGTACA
AATCCCCACATTCCTCAATTATCTCAATctaatcattcaattttaaatgc
taACTACCCTCAAACTGCAGCACAACCTCAATTCCCTTCTTATTCATACC
CTCATTCATATCAGGCATCTGGAATTTCCTATCCTCCTATTGTTTCAGCT
GCCAATTTAGCGTCAATGTATACCCCATCAACGTACTCTAACTATATACA
CCAAAATTTGCATCAAACTGGGAACACAAACTTGTCTAAGTCAACTGTTT
CGCTAACTTCAACTACTAATTCAACTAAAGAAAGTCTGtatgatCAGTCT
CAACCTTCAAATAACTCATTGACGTCAAGTGCTAGTAATCcaaatggaaa
taatataagTGGTACAACGTCAAGCATTGGACTTGCACAGAGTACTTTAT
TGACTACAAAAACGACTACACCaacaacaaataAAAGTGGTGTACTATCA
GGAATGCCTCCTGGTGTTGCTCCACTTGTTGGTGCTCAGTATATATTAAG
CCAACAGGGTATTCCTGGATACTATCACCAATCTCATCCTGTAATGTATA
GTGAGGAACATTTACAAATGGTGCAATCAAGGTTACCTCATcatatgACT
AACTTTTATTCGCCTGATCCAATGTATCCTAGTGTATCATCAAGTCTGAC
TGGAAGAGAAACTGCTGGAACTGGTATTTCAAATGTTGCAGGTTATTCGT
CACTAACAGATTCAAGATATGCACGTGCAGACAATAATGCTTCACCAGTT
TCATCTACTCTATCTCAAcagaCGGGAACTTTGGCTCATCAGCAAACATT
GTTAAATCCACCTATTACTCccagttatacatattattatggacaaTCTG
TTATACCTGCTAATCCGTTCCAATATGGTACAATGTACCCgATGGCGCCA
GCAGCAAGTGCAACCAGTCATGGCACAGGAGCTACAAACACTATGTCCGG
GTACAGTAAGACTGCAGCTGCACCTGCTGGTTACAACAATGTTTATGAAA
CTCTGGGATCGTCTTCAGTCACTGGTTCAAGCAATGACTATGGCAGTTCA
AGTAAAGTGGGTGTGACCGGTCAACAGACTTCTCAAGCTCAGGGCAAAAC
TAATTCGTCTGATCTCGCTGCTATGTATTCCAGCAAATCGACATTAAATA
AGGTtagtCCTTATGACAAACAACAACAGTCATTTCAATCTCCACCGCCT
TTTTCTGTAACTTTAAATAACGGTGGAGTTGGCGGTCATCATAGTGCCGG
TAGTTATGCTCCAGTATTCATTTCTCCTCTACCTCCTGGCAACCCGCAGC
CTCATCATATCGCACCTTTGCACCATCAGATTGATATGAGAGTTCAGAAC
AGGCAAGGGCAAGAACTTAGTAATGGAACAAGCAATATGAGCCGTAACCA
ATCCGTAAATCCTACAGCCAGCAAGGTGAATGTTAAACAGAACTATAGCC
AAGGAGCTACACCCTATTGGAACTCCAATTAATGACTAATGTCATGTCTG
CATTTACACTTTGACGACCTGTCTTTAGTCGTTAATGAGCATTACCCATT
GGGAGAATGGTGATCATACAGACGTATCATTTTCTCCTATTAACCTATTA
AACCCTTTGTTTATTCAATAGTATcaggtatcattttttttttctgagta
ATGTTTCATTTTGATCACAAATATCaggtgtaataatttattattttgag
ttaaatattttttttttttat back to topprotein sequence of XM_015512991.1 >rna8659 ID=rna8659|Name=XM_015512991.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=1090bp
MSSVKGVVNRNAKTSGKNSTTNTATLNADSKDAVPNKTHEKEKLQPTAEQ
LRIAKIIDLKPDEEINNKIKQVMQITQKTEDEVVIALHDNALDIALTIEA
LLEGPQESWSTTGKKKKNRASSVNKKEKDDVIKNGEADGDAEWDETITQA
ASITAQNNGGFSERRGRGGRGGRGGFTNRPRPTEGGQRFGESRRERENKE
NEKNLAEDGASGENRNFRSESRGSRRGINGPRYNGRSRGTRMFQNSERGN
SGPGGGNNSGFSQPIDTWFNPTAKESKKENWGTFPSPEDWDNEEYTGSLA
DTKVFTPSGGTESTVVNNDVEVPKPNENAYLEVEDWNDAVQAPNQQAAAS
NNATSENLAASIANSKTLTPEQSQYLSSLTQESQQKKVVTLPPAAATFNS
HPPVEFVSLPFEENSIGPGKKPTLRARIPPPSKIPLSAVEMPPEDSSVNI
NFLDVSFGAVDLSGDVPQLCDPSQDQNSLPPVVKYDDSVAQKVDSVLTQT
EYSTISNQASVQTQRSPQVNQAPQPSTKIGPPPGVPPPADYLTKQNAAVA
NQYQNINTGQPTSMYNSSVYSNNPQGLSSHTSLYGTTASNIGVNSTNPHI
PQLSQSNHSILNANYPQTAAQPQFPSYSYPHSYQASGISYPPIVSAANLA
SMYTPSTYSNYIHQNLHQTGNTNLSKSTVSLTSTTNSTKESLYDQSQPSN
NSLTSSASNPNGNNISGTTSSIGLAQSTLLTTKTTTPTTNKSGVLSGMPP
GVAPLVGAQYILSQQGIPGYYHQSHPVMYSEEHLQMVQSRLPHHMTNFYS
PDPMYPSVSSSLTGRETAGTGISNVAGYSSLTDSRYARADNNASPVSSTL
SQQTGTLAHQQTLLNPPITPSYTYYYGQSVIPANPFQYGTMYPMAPAASA
TSHGTGATNTMSGYSKTAAAPAGYNNVYETLGSSSVTGSSNDYGSSSKVG
VTGQQTSQAQGKTNSSDLAAMYSSKSTLNKVSPYDKQQQSFQSPPPFSVT
LNNGGVGGHHSAGSYAPVFISPLPPGNPQPHHIAPLHHQIDMRVQNRQGQ
ELSNGTSNMSRNQSVNPTASKVNVKQNYSQGATPYWNSN. back to topmRNA from alignment at JOTR01000231:195153..210285+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna8659 ID=rna8659|Name=XM_015512991.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=15133bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000231:195153..210285+ (Diuraphis noxia)
tgtacaaaatacaaaaataatgttagtcTGATACCGAGGTTAAATGCATC
GATCGCGCTCccgtatttagttttaaatgtgTATCGTATTTTGGTAAGTA
CGTCTCAAAACTTATTATTTCATCTAGTTACGGGCTCCATAATCGTTTGG
CTCGTCGGCAGCGATTTTGGCGGACGCCGGACCGCAAGATTTTGATTTCT
CGGTCGTCGTCTCGTCGAAATGGCGTCATCCATCGTCTCTCCAGCGCGCC
AGTCCCCACCACATGTTTCACGCGCGTAACGCCGTCGCGCAATGTCTGTT
TCGCGCCGACCAACTCGTCGCCTTGTGGTGGTGTTTACGCATCAGAAAAG
CTCGACGGGCTTATGATTTTCCGTCCCTTCCCCTAATCTGAAAATTCCGT
AATTATCGCGCCAAACCGCACATATGCTCCCTTAGCGTGTTTTTACTCCC
TCTCCCCCACCAACCCCCCGGCCCATGCTCACCGCCACTGCCGCTGTCCC
TACCACCACCACCCTTGTCACCGACACCGCCGGTGTGTTTCACACGTATT
TATATGAGAAAAGAATTTTGGACGTGTGCAACAAAGAGGCTCCAGTCGGT
TTTTCACGTTTTTCGTTTTTACTTCAGTTTATCTGTAATTGTTtacattg
ttgttgttgtttttaacgctgttgttattattgttgtatagcTGTAGAGT
TCATTCACTGCTTCTTTACCTGTGCCATTATACacatgcatatttatttt
tcgtcaCTGTGGGTGGGTACTTGCAGTGTTTGTCTTTTGATAATTCTTAT
TTACCTGTTTTATTCTTGACTTAGTATAAATGATGTCAAATCTACTCAAC
TAATTGTTTTGTCGTTTCAGATTACCCTGTAAATACCGTTGTACATAAGG
AATAGGTGAACCATAagcgaaaaatataaatacattataatgagCAGCGT
TAAAGGTGTTGTGAATCGCAACGCCAAGACGTCTGGTAAGAATAGCACTA
CCAACACAGCTACGCTGAATGCTGATTCAAAAGATGCAGTACCTAACAAA
ACAcacgaaaaagaaaaattgcaGGTAAATTCAATTTGTTGCTTACATTC
TTTTTCAGTAGTATTTTATTGTCTGCAAatctttaatcattaaaaaattg
aaatttgacttctagcattaaaattattgttgtcaaTTAAACTTACTtat
ggacataatatatatcagtaatattatctacatcttatagtataaatgtt
atattatgttagaattAAATGctagaatacaataataaaatttaactgct
tttttatttatagaaaaattaatatcagcTTAAGAAGTCGCCATATCCGC
ATGTGTTACCTTCGTCTTACAAGTATGGAACATAGGAAATTTAGTTCAGC
atatcacgtttagctccgttattttaaaatttttaagtgaatcGACCTCC
TATAAATGTagtgttaagaacattatctgtgttcatATGTTGAGTTTCAC
AATAGTTCAGTTTTATGTgtgttatgagcatttttaatttacgctataTA
TTGTTTGCAAAACTTGCTAAAAAGTGTACTATCCTATAAACCCAGCATAC
AAATACagatcttacctttaaattttataggaagtcaattcactctcatt
tttaaactaacagagcttaACATGATTTGCTAAGcttaaatttggtatgt
tacgcacttgtaagacggaaacaagaCATGTGGGTATAGTGTCCAGAGTG
TCctcttaataatatacctaataattttttatgatcataAACTTCCATCC
AACTTAGTTCTTATGATAGCAAAgattacattgtattttatgtgtGTAAT
GTAAGTAATGAGTTTAGGAAGAATCTACACTGtcatttgttgtctctgtc
ttacaattGCATAACAGCCAATTTGCGcttagcaaattatttttagatta
gtttgtttaaaaattagagtgagtTGACCTAAGTACTATGAAAATTAATG
GTAAGAACAATATCTGTATGTGGGGCTTTTTTTATgacaattcaattttt
agctagtgtatgtataatatacagttaattaaaattgctaataactaatt
tgaaaataaacgaTTATAAAACCCATCTGCAAACACAGATTGTCCTTCAG
ATTGTGTTCTTACTATcaagtttaataatagtttgatTTGCTCTAATTTT
TGTAAACTAATTTGATATGTTACACACTAGTAAAATGGAGATAACAAATG
TCTGTATAGTATCATCTTATAATAAATGAGAAACCCATTAgtggataatt
ttattatcaattttggtgttcttacctaatttaaattttgaaagagttca
attattaaaacgttaatactaaaaacaattaaattagaaaatgattgtat
aaaaaaatataatatactatgtaataatgCATCTAGCATTTATCACCCAT
ACTTcgacaatttttacaaataacaaatgttacattttacatttaaaaaa
aaaaatcttaaattagaATAAGTTTAGAAtttggtatttaattaatattt
tgttcctgatttcatattttaatattaacttacatATCTAGTAGAACAAT
GGTCATATACTGTTTTACTTGacacattaaaatgtatgtgtatttgaata
tgaatttttgttttagccAACAGCTGAGCAACTCAGAATTGCTAAAATTA
TTGATCTTAAACCTGATGAAgaaattaacaacaaaataaagcAGGTgtgt
gttttgtatttttaataattttaatatacataaaatattaaaatttgtaa
gtacATTTACAATTATCAGGCGTTTACTATAAAGTGCTTTATCATTTTTA
GGTGATgcaaataactcaaaaaacagAAGATGAAGTAGTTATTGCGCTCC
ATGACAATGCTTTAGATATTGCATTAACTATTGAGGCACTTTTGGAAGGA
CCACAGGTATGCTTAGTTTTAAAGTATAAGTTATTAGTAATGTATTTTCC
TTAAATTACTTAATCCAACTTAAATGACTTATATTTGTTGTTAGGAATCA
TGGTCAACAACAGGCAAGAAAAAAAAGAATCGAGCAAGTAGCgtaaacaa
aaaagaaaaagatgaTGTGATAAAAAATGGTGAAGCAGATGGAGgtagtt
attaatattgttattgttgaacAAATTTCTCagtttatctattatattgt
atattattctatttaactAGATGCTGAATGGGACGAAACCATTACACAAG
CAGCTAGTATTACTGCTCAGAACAATGGTGGATTTAGTGAGCGACGGGGT
CGAGGTGGCCGTGGTGGCCGAGGAGGCTTTACTAATAGGCCTAGACCAAC
TGAAGGTGGTCAGCGATTTGGAGAGTCACGTAAATGTtggtgtaatttta
ttttattttgaattcacttaatttatttgatatttacagGGAGAGAACGT
GAGAACAAAGAAAATGAAAAGAATTTAGCTGAAGATGGTGCTAGTGGTGA
GAATCGTAACTTCCGTTCTGAAAGTAGAGGTTCAAGAAGAGGCATAAATG
GACCACGTTATAATGGTCGGTCTAGAGGTACTCGTATGTTCCAGAACAGT
GAACGTGGTAATTCAGGACCCGGTGGTGGTAACAATAGCGGATTCAGTCA
ACCAATTGATACTTGGTTCAATCCTACTGCTAAAGAATCAAAGAAgggta
atataaatatcaaatttaatttaattgcatttCAATACTATTTAAtcatg
ttaataaatttaaaatcttggCATTGCATGcacttttctaaaaatttaaa
gacattttgttttataaatagtgAGTGCttattgtgtaataaattgTGCC
Actattatatctttaattttaatttttccatatattgcttaatagttaaa
attaaagatgtgataaaactaataaatcagttaaatattttaatttctgt
tGTTTAACAGTAGGATATTTCAATAgttcatttaaattgtttgttacaTT
TGTTGACAGAATTGTCAGAATTgtctataatcaataatattttgattgct
AGAGATTAAACTAATTTGCTTATTGGTTAACTCTTATTAATAGGTTATTT
CTAACCAATCTTATGtcaacatacatatttataacacTGATAACCAATTA
TATAAGTTAtcagaaaatttatttataatttaaatattaagttcttTAGT
TAAGTACCCATGTAAGTTAgtcaaaaaatatgataaatggtaaaagttta
atataattaagttaaataattcttAACATTAAtcatcttattaatattat
tagaataaaaccagttaatatatagtatttattattgtaacaccAATTAC
ACAtaagtatctaaataaaaatattattatcaaggcTCGTGACTTGTagc
ttttgcatattttggtataGTCCGTAGTTTTGATGCTATTTTGATCTTTT
AAGCACTATTTTATGTTAGTTTTGTAATTTGAATggaaaaaatagatatt
aagcAAAAACTATTTTCCGCTTGATAGAATCTCAGGCTGTAGTCACAACT
AAGGTTTGAAATTTTCATACCGTAAAAAAagagaacatttactgtgcaac
attgcttttatttgtttgatatcacaaatacaaaaaaataaaataaaata
gttattgtttaaaaaatcaatatttcaaacttgaataactttttttgtat
ttgtgatattaaaaatataaaaaacaatgttaCATAGtatatgttctttt
ttttacagtatgaacattttgatttttagttatGATTACAGTCTAAGTGG
TTCTATCCCACGTGaaatagtttttgttatgttacgcacttgtgaaacag
agacaacacatgcgggtatagcATCTTCTTAGTAGCTAATACTTGAAGAT
ATACTATACATTCCTTTAGTTTGACTTAAAATTTTCTATAGATACttgaa
tttctaatttttataaaatttgataataatcaataaataaaaatgttttc
tcttatgataatagttattattttggtatttgaaaaacaattagcATAGG
GACTTAGAATACTATTCCATAATGTgataacattacatttttatacaact
ttgactaattttaagctattaataCTATTCTACAAGTAATTAACCATAAT
ATTCTTTTGATATTTGATctttgattcaattttttttaaaaactttttga
ttaattgatttatttattagaaaattggGGTACATTTCCATCACCTGAAG
ACTGGGACAATGAAGAGTATACTGGTTCGTTGGCTGACACTAAAGTATTT
ACACCTAGTGGTGGTACTGAGAGTACTGTTGTTAATAATGATGTTGAGGT
GCCAAAACCAAATGAAAATGCTTATTTAGAAGTTGAAGATTGGAATGATG
CTGTTCAAGCACCAAATCAGCAAGCAGCAGCTTCtaatgtaattattcaa
aaataaaagtattatatttaaaactaatttattgtttttataatgtaata
ccaGAATGCTACTTCTGAAAACCTTGCGGCATCAATTGCTAACAGTAAAA
CATTAACACCTGAACAGTCTCAGTACTTATCTTCATTAACTCAAGAGAGT
CAACAAAAAAAAGTAGTTACTCTACCGCCAGCTGCTGCAACATTCAATTC
TCATCCTccaggtaaaaataaaattaatgaaatacttatgttttaataat
ttaactaaaatttgaatattaaacatacatttttgtggTTTAGTGGAATT
TGTTTCTTTGCCTTTTGAAGAGAATTCAATTGGTCCTGGGAAAAAACCAA
CCTTACGTGCGCGCATACCCCCTCCTTCTAAGATACCATTAAGTGCTGTT
GAAATGCCACCTGAAGATTCTAGTGTCAACATCAACTTCTTAGATGTATC
ATTTGGTGCTGTCGATCTTTCTGGTGATGTACCACAACTTTGTGATCCAT
CACAAGATCAAAATTCATTGCCACCTGTTGTTAAATATGATGACTCAGTT
GCTCAGAAAGTAGATTCTGTCCTTACTCAAACTGAATATTCAACTATATC
TAATCAAGCTTCAGTTCAAACTCAAAGATCACCTCAAGTAAATCAAGCGC
CTCAGCCATCAACAAAAATTGGGCCGCCCCCTGGTGTTCCTCCTCCTGCC
GATTATTTGACTAAGCAGAATGCAGCAGTAGCtaatcaatatcaaaatat
taatactggACAACCAACATCAATGTATAATTCTTCAGTTTATTCTAATA
ATCCTCAAGTAtgtatctaaacattttttcaaacttggtttttttgttcc
ttgtattgtttgtattttttYAAATATCAAACTTAACTATAAATAGCTAG
TTGCAGCACAtagcaattaaaatgtttaagtaaaaaaacaataacaaagg
AAAATATTAMAAATTAGTGATTTTTAAAAGCAATTCAAATGGagcttaaa
aacaattaaaattacttttaatttttgttaaaataatatcaaatttttct
aGGGTTTATCCAGTCATACAAGTTTATATGGTACAACTGCGTCCAACATC
GGTGTTAATAGTACAAATCCCCACATTCCTCAATTATCTCAATctaatca
ttcaattttaaatgctaACTACCCTCAAACTGCAGCACAACCTCAATTCC
CTTCTTATTCATACCCTCATTCATATCAGGCATCTGGAATTTCCTATCCT
CCTATTGTTTCAGCTGCCAATTTAGCGTCAATGTATACCCCATCAACGTA
CTCTAACTATATACACCAAAATTTGCATCAAACTGGGAACACAAACTTGT
CTAAGTCAACTGTTTCGCTAACTTCAACTACTAATTCAACTAAAGAAAGT
CTGGTGAGTAAAAGTCAATATACCAACAACATTGAAACAaaagaatgtat
ttattattcaaaaaaatgtgattccttatatttttatgaaaacttaCATC
TATTTCTAatgatagtataattatttttgaacatatAGTTAATTAGttgt
aagtaggtatttaaagtatttacttGAAATTTGTGGgcactgatattata
tatatattggattttcttataacaattttaaattaggtgCCCTAAGAGTT
CAAGATCTGTCACTGGCCAGTGTTCAAGAAATTCTCCTagtcattttaca
tttatttttctatttacctGCTTGTCACTAGATGGAATGTGCACACTTAT
TTATGGTATTTcagaatttgaattcaaataatttgctTGGTTGTATTGTC
CCCTTAGCGTTTCCAACATTATTCCCAGTTTATTTCcaaccattttaaaa
ttttcacatTGTGACATGACCTGATCATTGAGATATGCATAATGTTGTGT
CACTTCTCCGTTCGTCTgatcattataatttcattaaaatgtgtaaatgC
CATGATGCTACTTTGAGCTAATCCTTCATTTATTTTGATGCTTTTACTCT
GGTATGTAACATACAATGTAAAGTCTTTCGTCCTTGATATCTTAGTTTTA
CAAATTCATAATCATTGATTAagtcataaattatgttttattagtaTCAA
CTTAATCCTGGTTAACTATTAGGCCTATTCTCTGTACATGATTTCTCTCC
TCAAAGTCTTGTCTGTTGCTTTATCAGCTTTGCATCTATTGTCCGTGATA
AGCGCTTTAATGTCTTTTGAATAGTTTGAATGAGTACCATAGTAGTAAAA
GTGGTCAGATATTCTTTGGATCATCTGGttgttgttttcttttttttaat
aaaacatttataattgcTTTTCTTccattatttaggtattacatTTGATC
TTGCTACTTGAACATATCCAGGAAATTCTTTCTGCAACCTTTAGGTATAC
AATTTGTTGAAATTGTTAACTAAATGCATAaagcatatataatttttgat
actaGTTTTATCCTAAttacttcaaataaaattttcgaTTTACTTACATT
TACTATTTTGgagttttatcttttaaaaggtacttacaagttttttttta
tttgcctaataaataaccccggaaaaaataaccctataataaaattgatt
ggtAAGGTGTACCTCCAGGCACCTTCCTATttgtaatacaatacaatttc
aataatataataatttaaaacaaatttttcaattacgGTAAAAACGAATg
gaaatgtcaataatatataaataaaaaatattcaccataaatgtgtaata
caatGATGTTCatgatcaattttaattaaacgtttTTTATCCAGGGAAGT
TTTTAAAATGCATGGACATttgtgactattttttttttcagcattTGCCA
TTTCCaccttataaaatttaaacactctttgtgtaaaacacattttttaa
atgccaACTTTTTTTTGCCCTTCTGGCTCTCAAAAATATCTAgtttatcc
atattattattcaaatagaaattaaaacaaagctcagagaaatatataat
atacgaaagcACACTGTAGTACCAAATACTGAGAAATGGACTCACAGGAC
ttgacaaattttataaattactgcTTCTATCAGAACATTAAAGATAAAGG
TACCTTTcttatccattataatattatttcacattgtCGCTGTACCTTGT
TATTATATATCTGATCGATATGACAGACAGATTGGTATCATgctttgaat
tgtttttatcgtaggcaatcaataatttatcattgaatacaaaattaacg
ttatttgtgggaacataaaaattgtatgtaggtaataggtatattaaaca
ttttttaatttttttcacgcaAAGACATATTAACaccaatatttagatta
atttgcAAAATCTCATTTGGGGTTATTTTTTCTGTGGTTATTTTTTCACG
GGGTTATTTATTCGGGGTCTAAATTtccgtggttattttttcgcggTACT
GGTTTTTTCACCGCTGctgttatttgtattataaatgacCTGTGTTGTGA
TTttggtatatgtattattactgtttttcgACTTAcaaattttttccaaa
acataAATATCATCTGGATCATAACTTTTTCTTCATTTTCCATTTTGAAA
TAAAGATAATAGCTTTGGATCATTTAAAAGCATTAAATTGGTAGTACTaa
tctatatctataatttatccaCTTTAATCTGTAACTGTGTAGCTAAATAG
TGTTAAGTTAGGTTATTTATATTggttacacaattttttaaatttcaaat
tagagAGTAATATACTGCCTTCATTATAGATATGTCAAAGTAGTCCTATC
CTTTTTAACTTCTATTATAATTAGCTTAAGGATTTCTGCGGGAATGTtgc
acaaaaacaatattaaggacaataatgattatgaacttgtttcaattaat
tattaattgtttgtttagttattaatttatgaaagaatatgcttatttta
tttattatgaaattcaatttttgagtGTTGAAATttccagtaaaatattt
tgcttgtaatatgaaattaataaaatttatcttgtcacttaaaatattga
aaaaataatattttaaaaaacttgtaACTTATTGatgtaataaagttttt
ttgggGTATAATAGCCGCCGTAGCCGGGGTAGATTAAGGTGTCGGTTGCT
ACTCGCCATTGCCGGTTTGAATCCTGGTCATAGTTGTAATCACTTTCCGG
GTAGTTAATACTGTCAGGAAAGAGAGGCCGCCGCCACCCCCCAGTCATAA
CAGAAACCTACAGGTGCTCATTCGAAATTCTGCTAAAAATATCCACGAAT
TCCCAACCAATAGTTCCTCCTCCACAGTTCCAAAGGCTAATGGCCCTTGT
TGTCGAAGCCTCAACCCcccattaaaaaaaagtctttttattaagtaata
acatttttttttaaaagtatgatCAGTCTCAACCTTCAAATAACTCATTG
ACGTCAAGTGCTAGTAATCcaaatggaaataatataagTGGTACAACGTC
AAGCATTGGACTTGCACAGAGTACTTTATTGACTACAAAAACGACTACAC
CaacaagtaattatttaatttaatttgtttagtgTGGTCTTTTCTATTTG
TTTGAAGAATCTTAAAGCTTTTAAGAAtttcgtttattataaattaaaat
gaattatgattttttttaaaatattttagcaaataAAAGTGGTGTACTAT
CAGGAATGCCTCCTGGTGTTGCTCCACTTGTTGGTGCTCAGTATATATTA
AGCCAACAGGGTATTCCTGGATACTATCACCAATCTCATCCTGTAATGTA
TAGTGAGGAACATTTACAAATGGTGCAATCAAGGTTACCTCATcatatgg
taaaatatatagcaattatgaaataaactaaaaattatataatattaaat
tactaatttcagACTAACTTTTATTCGCCTGATCCAATGTATCCTAGTGT
ATCATCAAGTCTGACTGGAAGAGAAACTGCTGGAACTGGTATTTCAAATG
TTGCAGGTTATTCGTCACTAACAGATTCAAGATATGCACGTGCAGACAAT
AATGCTTCACCAGTTTCATCTACTCTATCTCAAcaggtaatttattatca
tactgtatgtcaaacatattattttattgagctCAGCGTGTGAAGTTTGG
TGTATATTAATGGCATGAGAAAAGATACAGCTAGGCATTATTTAYCATCA
CTGCTGCAGTGTCTagatctttattttaaaatttagttagtCTGACAAAA
AATCTCATAATAATAgttctgtaatatatatatttttctaatgtgtatat
ataaattactagaAGATTAAGGATTTTATGGGttgcaaaattaaattagt
gcattttaatgtatgaataattttatggtacaaaaattaaattaagtact
ttataatatttctgctgtataaataactatttttaagtaacattgaaaat
atttttattttttattttttgctttattATATAGTCCAAAAAACCATGTA
TGcgtacatttttgaaaatactttaaaactGTTTCAtagtcaaatttatt
taatttaattactaacaaatattaagttttttaattatataatgaaaata
aaaaaaataaaaaatcaatataattgcagaatttaaattttaacaatagc
aTATTATCATAAACGGGCTagctaaatttataatacattaaaaataatta
agtatttactgtggttaaatatttaaagattgaGTTGGCATGTttgatgt
aaattatattaactatttagtatataatattgaattagtttttttaattc
ccattattatttgttttaaataaaataataatttttgaatttttttctag
aCGGGAACTTTGGCTCATCAGCAAACATTGTTAAATCCACCTATTACTCc
cagttatacatattattatggacaaTCTGTTATACCTGCTAATCCGTTCC
AATATGGTACAATGTACCCggtaagttaattaatttatattctaagaaca
cttatcatttataaatctaatttttaagttctttGGACTATATTGCTTCC
TTAAACTATACTTTGAATAATATCTAAGTGTACacttattaacaatattg
ttaatgttcttcaattgttataattatgttaaaaatataaatgtatttaa
ataataacttagttTCTTCGATTTAAATTGCTTACCCTATAGATATATGT
TTCAGTAatatatttgcataaaaattcacttaaaatatttcaattcaatC
ATGTATATACTGtctaaagttataaattagttattactttataattataa
tatatgggaaCATAATAGTGTGAATGAATAAGTTATGAGTGTTGGTTATT
ACTGGggctgttatatatatatatattaatttgtacttCGATTTTCCTTG
AAAATACTattagtgttttattaaaaaacaaaaattgggtgtaaatttaa
aatcaaaatacttaaacaaatgtttgaaacaaactacctatatatttttt
taaagtttttgggtggaattgattaatattttatgattaacgttttcttt
aatttgtaaaatttagattttttatgatCATCAAACTGTAGGGTGGTAAT
TGggtgttttagaaaaatattgttttacgtCTTGTCAATTACTTGATGAA
ACTATTCACTGTTTTTACAGTAGTCTTAAtatctgtaaattaataatata
gttttttttttctgataattgttgaataattaaaaatttaaatttaaaat
acatttgtatcactttttaaatatcaatgtgatattttttttaataccta
ataataattatttaaatatttggttgTTTGTGTGTCATTATttctaacat
ttaatttaaaaacaaaatatttttatgaacaagtagtctttatttctttt
tttaattggtcTTACTTAGGGGTATCATAAAGTGTGAAATATTCCAACTC
AATTATAgatgtattatgaatatatcATTCTTACCTTAGTAAGGCATTTG
GAATGAAGCTAAATAGTTTCTTAAATTTCTCAAATTATTTGTCTTGGATT
TATATGATCTGATTGTTGTCATTTcatcataaaaattactatttgagTAT
AAGCAcattaaattagataaatatttacaatttcaatTGTTMtaatttct
ttatatattttgaaaaattgttttattattttttaattaaacattctttt
gacagaattaaaaataataatgtactttttttgttttatataagaaGGAA
ACTCAATAGtctgttattagtttattacataagTGGCTGAGTGTATCACA
TACCATTTGATTTAATACTATTTGACAGTCTGacagttatttattgttaa
agaGTTTCCTTCTCATATTGAACCTATTGagtattaataaactataaatt
atatatatatattaaatattatcatattattgactTACCAAATAAGAAAT
GATTaactcaatatatttattaacacattttaagGTTCAATTCTAAGAAA
CAGATTTAAGATGTAAATAAGGGTGTGTATTTAAAATCACcactttaatt
ttattgcaaCTTCGGTTCTTAAGCATATTTCTGtatgattttttcttttt
ttctttttgttagaTCTATTGCTACACAACGGACGAACAAAATACTTGAT
GAATGTTTAATCATCCAAATCACCTTATCCAGTTTCAACTTATTTTGACA
TCCTTTTCCTTAGTATTagttgtaaaaaattgtataaaaaatttctcAGG
ATTTGGGGGagcaaacattttgtttataccTTTTCgttaaaactaaaaag
aataagtgtatatataaacatactgcctataattttttaagtacatatat
agtatatatgtatttatatttatgcatcaatatatcattttttttctttt
tgggttactaattcaaaaaaagtaaaaaaattatatcagtataaaactct
tatgaatgtttattttgatatataaaataaataaataataaaatgaaaca
ctGAAAAAACACACCGACGCGGTTCGTTATCAGATGGCGCCAGCAGCAAG
TGCAACCAGTCATGGCACAGGAGCTACAAACACTATGTCCGGGTACAGTA
AGACTGCAGCTGCACCTGCTGGTTACAACAATGTTTATGAAACTCTGGGA
TCGTCTTCAGTCACTGGTTCAAGCAATGACTATGGCAGTTCAAGTAAAGT
GGGTGTGACCGGTCAACAGACTTCTCAAGCTCAGGGCAAAACTAATTCGT
CTGATCTCGCTGCTATGTATTCCAGCAAATCGACATTAAATAAGGTtagt
gtaagtataatataaattacaagacatatgatttaatgaaaaacattaaa
aaactaGTCACGTAATCAATTTCTTTATTTAGCCTTATGACAAACAACAA
CAGTCATTTCAATCTCCACCGCCTTTTTCTGTAACTTTAAATAACGGTGG
AGTTGGCGGTCATCATAGTGCCGGTAGTTATGCTCCAGTATTCATTTCTC
CTCTACCTCCTGGCAACCCGCAGCCTCATCATATCGCACCTTTGCACCAT
CAGGTTTGAATTAAGCATATTTctgttagtttattatttattttaatatc
aaactttaatttaatatctatttgttATTAGATTGATATGAGAGTTCAGA
ACAGGCAAGGGGTAAGTAaagtaaatatgtaaaatatatatatacagtat
gtGTAACAGAAAaacctgaccaaaaaaaaaaaaaaaattatgcaaattcA
ATGTATGaccaaaatttttaatattatgtgataagtaaataatttcagag
gtatactcatgtcagcaaatctcaaaaatcatttttttttttaaattatt
acgttcTAAATTAAACtaactataaaagttttaaaaatgaactacTTTAC
TTAGATTAATCTTTTTaccttaaaaattgttctaataatcagattcacaa
atagactattttgaatttatccaaaaaaaaattgtattttctaacTTATT
ATAACTAATCTTATTATAGAAATGACTTgtagaataacttttgttcaaat
atttttttgttaaataagtGACCCTAgtgctatgtataatatattttttt
taatgtttattttttagtactgaaaataaaaaatgcattatacataGTGC
TAGGTTCacttatttaacaaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatttg
aacacAAGTTATTCTataagtcagttctatctgttataccttgtattata
tatatgttttatatattatataaaacactaCTTTAAGGTATTTGTTATGA
AATGAATTTGTATGATTTTAGCAAGAACTTAGTAATGGAACAAGCAATAT
GAGCCGTAACCAATCCGTAAATCCTACAGCCAGCAAGGTGAATGTTAAAC
AGAACTATAGCCAAGGAGCTACACCCTATTGGAACTCCAATTAATGACTA
ATGTCATGTCTGCATTTACACTTTGACGACCTGTCTTTAGTCGTTAATGA
GCATTACCCATTGGGAGAATGGTGATCATACAGACGTATCATTTTCTCCT
ATTAACCTATTAAACCCTTTGTTTATTCAATAGTATcaggtatcattttt
tttttctgagtaATGTTTCATTTTGATCACAAATATCaggtgtaataatt
tattattttgagttaaatattttttttttttat back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000231:195153..210285+ >rna8659 ID=rna8659|Name=XM_015512991.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=3270bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000231:195153..210285+ (Diuraphis noxia)
atgagCAGCGTTAAAGGTGTTGTGAATCGCAACGCCAAGACGTCTGGTAA
GAATAGCACTACCAACACAGCTACGCTGAATGCTGATTCAAAAGATGCAG
TACCTAACAAAACAcacgaaaaagaaaaattgcaGccAACAGCTGAGCAA
CTCAGAATTGCTAAAATTATTGATCTTAAACCTGATGAAgaaattaacaa
caaaataaagcAGGTGATgcaaataactcaaaaaacagAAGATGAAGTAG
TTATTGCGCTCCATGACAATGCTTTAGATATTGCATTAACTATTGAGGCA
CTTTTGGAAGGACCACAGGAATCATGGTCAACAACAGGCAAGAAAAAAAA
GAATCGAGCAAGTAGCgtaaacaaaaaagaaaaagatgaTGTGATAAAAA
ATGGTGAAGCAGATGGAGATGCTGAATGGGACGAAACCATTACACAAGCA
GCTAGTATTACTGCTCAGAACAATGGTGGATTTAGTGAGCGACGGGGTCG
AGGTGGCCGTGGTGGCCGAGGAGGCTTTACTAATAGGCCTAGACCAACTG
AAGGTGGTCAGCGATTTGGAGAGTCACGGAGAGAACGTGAGAACAAAGAA
AATGAAAAGAATTTAGCTGAAGATGGTGCTAGTGGTGAGAATCGTAACTT
CCGTTCTGAAAGTAGAGGTTCAAGAAGAGGCATAAATGGACCACGTTATA
ATGGTCGGTCTAGAGGTACTCGTATGTTCCAGAACAGTGAACGTGGTAAT
TCAGGACCCGGTGGTGGTAACAATAGCGGATTCAGTCAACCAATTGATAC
TTGGTTCAATCCTACTGCTAAAGAATCAAAGAAggaaaattggGGTACAT
TTCCATCACCTGAAGACTGGGACAATGAAGAGTATACTGGTTCGTTGGCT
GACACTAAAGTATTTACACCTAGTGGTGGTACTGAGAGTACTGTTGTTAA
TAATGATGTTGAGGTGCCAAAACCAAATGAAAATGCTTATTTAGAAGTTG
AAGATTGGAATGATGCTGTTCAAGCACCAAATCAGCAAGCAGCAGCTTCt
aatAATGCTACTTCTGAAAACCTTGCGGCATCAATTGCTAACAGTAAAAC
ATTAACACCTGAACAGTCTCAGTACTTATCTTCATTAACTCAAGAGAGTC
AACAAAAAAAAGTAGTTACTCTACCGCCAGCTGCTGCAACATTCAATTCT
CATCCTccagTGGAATTTGTTTCTTTGCCTTTTGAAGAGAATTCAATTGG
TCCTGGGAAAAAACCAACCTTACGTGCGCGCATACCCCCTCCTTCTAAGA
TACCATTAAGTGCTGTTGAAATGCCACCTGAAGATTCTAGTGTCAACATC
AACTTCTTAGATGTATCATTTGGTGCTGTCGATCTTTCTGGTGATGTACC
ACAACTTTGTGATCCATCACAAGATCAAAATTCATTGCCACCTGTTGTTA
AATATGATGACTCAGTTGCTCAGAAAGTAGATTCTGTCCTTACTCAAACT
GAATATTCAACTATATCTAATCAAGCTTCAGTTCAAACTCAAAGATCACC
TCAAGTAAATCAAGCGCCTCAGCCATCAACAAAAATTGGGCCGCCCCCTG
GTGTTCCTCCTCCTGCCGATTATTTGACTAAGCAGAATGCAGCAGTAGCt
aatcaatatcaaaatattaatactggACAACCAACATCAATGTATAATTC
TTCAGTTTATTCTAATAATCCTCAAGGTTTATCCAGTCATACAAGTTTAT
ATGGTACAACTGCGTCCAACATCGGTGTTAATAGTACAAATCCCCACATT
CCTCAATTATCTCAATctaatcattcaattttaaatgctaACTACCCTCA
AACTGCAGCACAACCTCAATTCCCTTCTTATTCATACCCTCATTCATATC
AGGCATCTGGAATTTCCTATCCTCCTATTGTTTCAGCTGCCAATTTAGCG
TCAATGTATACCCCATCAACGTACTCTAACTATATACACCAAAATTTGCA
TCAAACTGGGAACACAAACTTGTCTAAGTCAACTGTTTCGCTAACTTCAA
CTACTAATTCAACTAAAGAAAGTCTGtatgatCAGTCTCAACCTTCAAAT
AACTCATTGACGTCAAGTGCTAGTAATCcaaatggaaataatataagTGG
TACAACGTCAAGCATTGGACTTGCACAGAGTACTTTATTGACTACAAAAA
CGACTACACCaacaacaaataAAAGTGGTGTACTATCAGGAATGCCTCCT
GGTGTTGCTCCACTTGTTGGTGCTCAGTATATATTAAGCCAACAGGGTAT
TCCTGGATACTATCACCAATCTCATCCTGTAATGTATAGTGAGGAACATT
TACAAATGGTGCAATCAAGGTTACCTCATcatatgACTAACTTTTATTCG
CCTGATCCAATGTATCCTAGTGTATCATCAAGTCTGACTGGAAGAGAAAC
TGCTGGAACTGGTATTTCAAATGTTGCAGGTTATTCGTCACTAACAGATT
CAAGATATGCACGTGCAGACAATAATGCTTCACCAGTTTCATCTACTCTA
TCTCAAcagaCGGGAACTTTGGCTCATCAGCAAACATTGTTAAATCCACC
TATTACTCccagttatacatattattatggacaaTCTGTTATACCTGCTA
ATCCGTTCCAATATGGTACAATGTACCCgATGGCGCCAGCAGCAAGTGCA
ACCAGTCATGGCACAGGAGCTACAAACACTATGTCCGGGTACAGTAAGAC
TGCAGCTGCACCTGCTGGTTACAACAATGTTTATGAAACTCTGGGATCGT
CTTCAGTCACTGGTTCAAGCAATGACTATGGCAGTTCAAGTAAAGTGGGT
GTGACCGGTCAACAGACTTCTCAAGCTCAGGGCAAAACTAATTCGTCTGA
TCTCGCTGCTATGTATTCCAGCAAATCGACATTAAATAAGGTtagtCCTT
ATGACAAACAACAACAGTCATTTCAATCTCCACCGCCTTTTTCTGTAACT
TTAAATAACGGTGGAGTTGGCGGTCATCATAGTGCCGGTAGTTATGCTCC
AGTATTCATTTCTCCTCTACCTCCTGGCAACCCGCAGCCTCATCATATCG
CACCTTTGCACCATCAGATTGATATGAGAGTTCAGAACAGGCAAGGGCAA
GAACTTAGTAATGGAACAAGCAATATGAGCCGTAACCAATCCGTAAATCC
TACAGCCAGCAAGGTGAATGTTAAACAGAACTATAGCCAAGGAGCTACAC
CCTATTGGAACTCCAATTAA back to top
|