Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107164960 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 1 Protein, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
| Product | DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, transcript variant X1 |
| Transcript id | XM_015512997.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107164960 |
| Genbank | XM_015512997.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107164960 | gene5851 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000232 183784..187981 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015368483.1 | cds8398 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000232 187526..187657 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna8667 ID=rna8667|Name=XM_015512997.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1505bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000232:183784..187981- (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
GGTATATTAATATATAATTACGTTGTGCATATATACGCATAACAGTGTAA
TATAATTTTATGTAATTTGTGATCTGAAATATTGTTACTCGTTTGCAAAA
AATTGTTATGAATATAGAATTGTTAATGCAGATCCAGCATTCAGCAGCTA
TTACAATTGTGGGCATATATTATGCTAGGAAAATAGTAAATTGAATCATT
TGCATCTGGTAACCAACTATTGTATTAATTACAATCATGTACATTATGGA
CAATTTCTACAAAGCATTGAGATTGTTTGTTCGTACACATATGGAGCTAG
AAATCGACTTTAAATTGCCTATGATAAAACACCACATTAATGGAGACATC
CGTTTCTATTCAACTAAAGACTTACAAAACCTAATTGAAAAGTTAGTGGA
AGATTTGACAATTGTTGAACGTTGCTCATGGTCYTCAAATTATACATCAA
TATGGTTAAAAAAAGAWTTATGGACATCCACAGTGATGAAAGAGACATTA
ACATCTGGTTGTAAATATGGTAGTAATGATGAACACCAAGGCACTATAGT
CTTGGTCAGTTCTGATGAGTGGAATGATTCAGTTACATGCTTGCGCATTG
CATTATTGAAAGAGACAATTCAAAATTTAGCCAAAATAAATGGGTATGTG
ATAGGAAGTRATGGACTGAATTTATTGGTGTCAAAAAAAAACAATCCATA
TAACAGTAATCTTGTATTGTGTGGTAATGTTGTTTGTAATATGACAGTCG
AAGATTATAAACAGCAAAAAAAAGATGCTATTACTAAAATGTCAGCTAAT
CGTGTTGAATCTGATGAATATCCAATTGATATCATATCTAAACTTTGCCA
TGCATCGATTGTCTATGAATTATTAAGTGTTCGCCATTGTAAAGTTATTA
ATACAGAATGTGATACATCAAATAAAGACAGTGGTATTTTTGTAATGTAC
AATTACTCAAGGCTTTGTCAAGTATGGAAAGCATTTGAAAAAGGGGTTAT
TGAAAATTACTATGAATCTTTACCTGACATTGGTGCCGTTAACTTTGGAT
TGTTGACTAGTAAAGAAGAATGGATTTTAATCCTTAACCATATATCAATG
TATCCTTTGGTTATTCAACAATCTGTTAAACATTTGTTGTCAGCAAGTGT
GGATGTCCATAGATTGTGCAAGTTTTTGATGGAAATGTCATCTGCTGTTA
GCCTATTTTATCATAGGCATCATATTTTATCAGACCCGATTTCAAGTTTA
TTACCGCTGATGCATGCTCGATTATATTTGGTCAAATCATCAATACAAGT
GTATGAAAATGTTTTCCAATTATTAGGTATTGAAGCTGTACACGAAATGT
GAATGGTACTTATCAACAACAGCGTTATGGAAGCTAATGCTGACTAATTG
TCAAGAAATAATTCTATTTTGCCAAACTAAATTATGTCACATTATATTAT
GAGGATTGATGACTTGTTATGTTAAAAATACCTATAAACTAATATGACAC
TTTTA back to topprotein sequence of XM_015512997.1 >rna8667 ID=rna8667|Name=XM_015512997.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=372bp
MYIMDNFYKALRLFVRTHMELEIDFKLPMIKHHINGDIRFYSTKDLQNLI
EKLVEDLTIVERCSWSSNYTSIWLKKXLWTSTVMKETLTSGCKYGSNDEH
QGTIVLVSSDEWNDSVTCLRIALLKETIQNLAKINGYVIGSXGLNLLVSK
KNNPYNSNLVLCGNVVCNMTVEDYKQQKKDAITKMSANRVESDEYPIDII
SKLCHASIVYELLSVRHCKVINTECDTSNKDSGIFVMYNYSRLCQVWKAF
EKGVIENYYESLPDIGAVNFGLLTSKEEWILILNHISMYPLVIQQSVKHL
LSASVDVHRLCKFLMEMSSAVSLFYHRHHILSDPISSLLPLMHARLYLVK
SSIQVYENVFQLLGIEAVHEM. back to topmRNA from alignment at JOTR01000232:183784..187981- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna8667 ID=rna8667|Name=XM_015512997.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=4198bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000232:183784..187981- (Diuraphis noxia)
GGTATATTAATATATAATTACGTTGTGCATATATACGCATAACAGTGTAA
TATAATTTTATGTAATTTGTGATCTGAAATATTGTTACTCGTTTGCAAAA
AATTGTTATGAATATAGAATTGTTAATGCAGATCCAGCATTCAGCAGCTA
TTACAATTGTGGGCATATATTATGCTAGGAAAATAGTAAAGTAGGTTGTT
ACATTTTTATCTCAACTTTAACTTGGTGGACATAACTTTTATGTCGTGAA
TTTTAAATTACTTTTGTTATATGAGTAGTTGAATCATTTGCATCTGGTAA
CCAACTATTGTATTAATTACAATCATGTACATTATGGACAATTTCTACAA
AGCATTGAGATTGTTTGTTCGTACACATATGGAGCTAGAAATCGACTTTA
AATTGCCTATGATAAAACACCACATTAATGGAGACATCCGTTTCTATTCA
ACTAAAGTAAGTGTCATTAAACATATTAATTCACAAAGAGTTTGAAATTT
TGATGTATTTAAAATTGATGTGTTTSATATTTTCTAGGACTTACAAAACC
TAATTGAAAAGTTAGTGGAAGATTTGACAATTGTTGAACGTTGCTCATGG
TCYTCAAATTATACATCAATATGGTTAAAAAAAGAWTTATGGACATCCAC
AGTGATGAAAGAGACATTAACATCTGGTTGTAAATATGGTAGTAATGATG
AACACCAAGGCACTGTAAAGTAYATAATCACATTATTTAAAAAACATCAG
TTAGTTTTTTTTATTTTGTATGAATGTAGATAGTCTTGGTCAGTTCTGAT
GAGTGGAATGATTCAGTTACATGCTTGCGCATTGCATTATTGAAAGAGAC
AATTCAAAATTTAGCCAAAATAAATGGGTATGTGATAGGAAGTRATGGAC
TGAATTTATTGGTGTCAAAAAAAAACAATCCATATAACAGTAATCTTGTA
TTGTGTGGTAATGTTGTTTGTAATATGACAGTCGAAGATTATAAACAGTG
AGCCTATAATTAATTATTTAAATAGTTAAATACATAATACATAATACATC
TATTCAATATAAAGTATTATATTTTTGGTTTTCAGGCAAAAAAAAGATGC
TATTACTAAAATGTCAGCTAATCGTGTTGAATCTGATGAATATCCAATTG
ATATCATATCTAAACTTTGCCATGCATCGATTGTCTATGAATTATTAAGT
GTTCGCCATTGTAAAGTTATTAATACAGAATGTGATACATCAAATAAAGA
CAGTCAGTTTAAATAAATTTATTTGTGTTTGAAATGTACAACTAAAATTA
TTTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTTAGGTGGTATTTTTGTAATG
TACAATTACTCAAGGCTTTGTCAAGTATGGAAAGCATTTGAAAAAGGGGT
TATTGAAAATTACTATGAATCTTTACCTGACATTGGTGCCGTTAACTTTG
GATTGTTGACTAGTAAAGTAAGTTATATTAAGTGATGGCACCTAGGGGGG
GGGATATCTTAGATTGTTTTGGCCACATAGTTGGCTCATCTGGATTGTAA
TTTTGTAGTTGTAAAAATATTATTTTAGTTTTTTCTATGTATGCATCCAT
GAGATGTTTATTTTGTCATGTATGAACTATAAACATAACCTATTAAACTA
TAAAAATGGACAAAATGATAAAATATGTAATTAATTTCTTAATATCTTTA
ATTCATATTTTTATGGGTAGTAGAAGACCAAAATGAAGGTCTCCTGTTAT
CATTTGGTATACCCATTACATTTTTTCTAGTTTTTACCTTTGATTCAGGA
GTTTTAGGAAATTAAATTACAATGAATAATATTGTTTATACTTTAGGAAG
AATGGATTTTAATCCTTAACCATATATCAATGTATCCTTTGGTTATTCAA
CAATCTGTTAAACATTTGTTGTCAGCAAGTGTGGATGTCCATAGATTGTG
CAAGTTTTTGATGGAAATGTCATCTGCTGTTAGCCTATTTTATCATAGGC
ATCATATTTTATCAGTGAGTGTGTTGTTTTAAAATGCAGCAAAAGTTTTT
TTTTTTAATATTAGCTTTTTAAACATAACTATAATTGTTGTATAGTGAAC
AACAATATTATAATCTTTATTATGATATACTGTGCCATAAACCACAAAAG
TAATTATTTAGATAAGTATATTAGATATTRATGATAATAATAATAAAATA
ATAAACTGAATTATATGTAAATGTAACAATATTTGCACTGGCACAGAAAA
GACTTAAAAGTGAATTCATTAATGTTTAATCACTACTTATTCTATGAGAA
TCTGGGGACTTATGATAAAGCTAAAGCAATAAGAAAATATTGTCTATGCA
TGTATTGTCTCTGTCTTACAAACTTGTATCATACCAAATCCATGTACCGG
TTTATTACTACAGTTTATTTATAGTTAATATTAGAACAAATTTACATATT
TGTGCTAGAGCAAAGTTTTTTTAAACATTTTTATTTAAAAATTAGTTATA
TAAATTTGAAATTATTATGCACTTATACTTATTAAAAAAATGTTAAATGA
AATATGAAAAATATACTCTGCCTGAACACAGTTTTTATTCTGATATACAA
GTTTGATAACATATAAAATTGCTTTATATAAATAAACTGTATTTAGAATT
ATTTAGATTTGCTTTTTATATGTGTCAGATGTGTAAGATGGAGACAACAT
ATGCACAGGATACCTTGTTTTCTTAACGAACATACATTTAGAAAAYATAA
TGTATTAACATTTAAACAATCAATAATATTTTATAATTTTTTGTTTATCC
TACCAATATCTTCATTTACTTTTTTTCATGTTAAATTTTAAATACATTTT
TACTGTACTAGTATTAATTTTTATTGTTACTATCATGATTATTTTATAAT
TATTATTAATCCATTACTTTGCATTGCATCAATAATGAATAAACCAATTA
CTTTAAACTATGCATGATAATTTCTATGTTTATTATAAATATAATATTAC
ATTATCAGTATTTGATTGAAACAATGAAAATATTGTAAATTGAAATTTTA
AAAAGACTAAGAACAATAATTGTCTGTATTCTGTAAATGTATCTTGCATA
AAGAGATAAGTCGGTAAATTAAATAGTACTAAGTTAATAATTATTAAGCA
AATTAACGATGTTAGTATTATTCATTTAGATAAAAAAAAAATTCTTTAAT
CCTAATCATTGATTGAATAAAAACTCTTTAATATACATATTTCATAATGA
AGTAAGAAATACTGATGAGAGATTCATTATGATGTATCAGGTGCTAGGTG
TTATTCGTATTAATCTTTTATAATTTTTTCTTTTTWTTTTATAGTCACAA
TTAAATGTACGAATGATTATTTGATAATTAAATACTTATATARAAAATTA
CAACTAGAGCTAGTTGAAAACATAATATAAAATAAATGTAATGACATAAA
AGTACTTCTATGATTAAAAGAATATACTTTTTAATTCCTATTAGAAAGTT
TTTTCCCATAAAYTATGCAAAGGGAAATCTACAGAATTTTTGTCAACATA
AGTGAACCYAAAATCTAAATGATCATTGCACAATTTTTATTTTCTACTGA
CCTTTTTTATTTCATTCACATTATTGAAATTGCTTGTACTTGTACTTGCA
TTATMAATTCCATAATTATGTTTTTGTTTTAGAATTTTGTCATTTAAATA
GTTGCTACAAATTAACTTCTGATTCCACTAAAAATCAAAATTGTATGACA
GTGAAACTAAAATTTTTAATTACTTTATGGATTTTTTCTGCCAATTGTAA
AATATTTATTATATGTTCAAGTCCTTGGTACACTGGTTAAAAATCAATGC
TATATACTCACATATTAATTTTATTTTATACAACTAAATTATTATATTAA
TATTATGAATATATTATATTCTCAGGACCCGATTTCAAGTTTATTACCGC
TGATGCATGCTCGATTATATTTGGTCAAATCATCAATACAAGTGTATGAA
AATGTTTTCCAATTATTAGGTATTGAAGCTGTACACGAAATGTGAATGGT
ACTTATCAACAACAGCGTTATGGAAGCTAATGCTGACTAATTGTCAAGAA
ATAATTCTATTTTGCCAAACTAAATTATGTCACATTATATTATGAGGATT
GATGACTTGTTATGTTAAAAATACCTATAAACTAATATGACACTTTTA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000232:183784..187981- >rna8667 ID=rna8667|Name=XM_015512997.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=1116bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000232:183784..187981- (Diuraphis noxia)
ATGTACATTATGGACAATTTCTACAAAGCATTGAGATTGTTTGTTCGTAC
ACATATGGAGCTAGAAATCGACTTTAAATTGCCTATGATAAAACACCACA
TTAATGGAGACATCCGTTTCTATTCAACTAAAGACTTACAAAACCTAATT
GAAAAGTTAGTGGAAGATTTGACAATTGTTGAACGTTGCTCATGGTCYTC
AAATTATACATCAATATGGTTAAAAAAAGAWTTATGGACATCCACAGTGA
TGAAAGAGACATTAACATCTGGTTGTAAATATGGTAGTAATGATGAACAC
CAAGGCACTATAGTCTTGGTCAGTTCTGATGAGTGGAATGATTCAGTTAC
ATGCTTGCGCATTGCATTATTGAAAGAGACAATTCAAAATTTAGCCAAAA
TAAATGGGTATGTGATAGGAAGTRATGGACTGAATTTATTGGTGTCAAAA
AAAAACAATCCATATAACAGTAATCTTGTATTGTGTGGTAATGTTGTTTG
TAATATGACAGTCGAAGATTATAAACAGCAAAAAAAAGATGCTATTACTA
AAATGTCAGCTAATCGTGTTGAATCTGATGAATATCCAATTGATATCATA
TCTAAACTTTGCCATGCATCGATTGTCTATGAATTATTAAGTGTTCGCCA
TTGTAAAGTTATTAATACAGAATGTGATACATCAAATAAAGACAGTGGTA
TTTTTGTAATGTACAATTACTCAAGGCTTTGTCAAGTATGGAAAGCATTT
GAAAAAGGGGTTATTGAAAATTACTATGAATCTTTACCTGACATTGGTGC
CGTTAACTTTGGATTGTTGACTAGTAAAGAAGAATGGATTTTAATCCTTA
ACCATATATCAATGTATCCTTTGGTTATTCAACAATCTGTTAAACATTTG
TTGTCAGCAAGTGTGGATGTCCATAGATTGTGCAAGTTTTTGATGGAAAT
GTCATCTGCTGTTAGCCTATTTTATCATAGGCATCATATTTTATCAGACC
CGATTTCAAGTTTATTACCGCTGATGCATGCTCGATTATATTTGGTCAAA
TCATCAATACAAGTGTATGAAAATGTTTTCCAATTATTAGGTATTGAAGC
TGTACACGAAATGTGA back to top
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