Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Gbkey | mRNA |
Gene | LOC107165008 |
Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
Product | nose resistant to fluoxetine protein 6-like |
Transcript id | XM_015513054.1 |
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
GeneID | 107165008 |
Genbank | XM_015513054.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
LOC107165008 | gene5888 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000236 142650..152917 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
XP_015368540.1 | cds8441 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000236 152503..152785 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna8713 ID=rna8713|Name=XM_015513054.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=2354bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000236:142650..152917- (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
TGTTGTAATATTATTCGAACAGATAACTTCCGGGACTTGCTATATAACTC GCATCTGCATTGCCGACGTTTATGTTTGTGTTCATAATAACAATAATGTT ACATATCGTTATAATTGGCGACGCGCGGATCAATGTCGAGTGCGCAGACT TTTGTTCGATATTGTTATTTATCTCGGTGCATTTCGTACGGCGATGAGTC TTCAGCCATGCAGTCGGTGACAGTGCTTATAGTGTCAATTTTAGTAGTGA TTGTCTCCGGCGAGACGGAATTTTATCAACCACAACAACGATGGGTCACG AAAATACTGTACGACACGCTCGAAAGTTATGTCCCGGACGGCGGACCGAC GTGCAGGCGGGATGGACAGGCATATCGTGAAGGGCTGAAAGATCTCAGGC TATGGGCAACACAAATGTATGACGCTTCAGCAAAGTTTCCAACAGGAATA TTATCTGGGAAAGCAGTAGATTTTGGTGATTACGACGAATGTTTGGAAAT CAATACATCTAGTTTAGATTTTAAGCCTCAGTATTGTATTGTGAACATAC GTTTTTCACCATCTGTTAAGCTGTATCCAAATTACTACAAAACCACTCCA CTGGATATTTTAAATTCTTCAATTTCTGTATGGGAAGCTGTAAAGGTAAA TCCTAATCCGGCTAAGGTTCAGCGTAATGAAATCAGCACTGCGATTTGCA TTCCGTCTTCGTGCACCCATTCGGATCTACAGTCCACGTTGTCTCAGAAA ATTATTTCTGCATTTAATGAAGAAGAAATAAACACCACCGTTACCGTGGA CTCGCTATACTGCACCACGCAACACGACAAACCACCCAAGACATCAGGAT TTATAATTTTTTGGTGTTTCATTTTATTTATAGTTGTATTAACAATTGTT GGAACACTACTCGATTTACATCCAAAGAAAGAAACTGAGTCGAAATGCAA ATCTATCTTAGTAGCATTTTCAATCCAATCAAACCTGCAAAAGTTATTTT ACAACAATACTAAGACTGCGGAATTTGCTGGCTGTAATTTCCTTAAAATA ATGGCTTGTCTAATTGTTTTATTGGGACACCGATTGATGTACATTAGTGC ACAGCCAGTTTACAATATTAACAAAATTGAAGAGACTTTTGAAATTATGA TTTTTGGAATAGTGCATAATGGACCATTGGTAGTAGATATTTTTTTTGTC ATCTGTGGATTCCTAACTTTTGTTAATATGTACAATGAACTAGTGAAGAC CAAACWATTTAATATGCCATTTATATTATTTTGGAGATGGTGCAGACTAA TCCCTCTATACAGTGTGATGATTGCGTTTTATTCTTTCGTGTTGATACAC CTTTCGGACGGACCTTTATGGAAGCATATGGCTGTTCAAGAGTCGGAAAA CTGTCAAAAAAATTGGTGGACCAACTTACTGTTTGTAAACAATTACGTCA ATGTCGATCAACCATGCATGATTCAATCCTGGTATTTGGCGTGCGACCTG CATCTGTGCGCTGTGGGCATACTAATTGTATACTTTATTTGGAAATTCCC GAAGAGCGAAAAAATTGTCCTGATGAGTGCAATAGTCACGTCATGTTTTA TTTCAGCGTATGTTGTGTACGACCACAAATTTTACCCAACGTTCTTTGGT TTTATTTCAAACTTGAAATMCCCATCGAGCCACGAAGTGTTCACGCTACT TTACATACCCACGCACACGAGAGCGACGCCTTACTTCGTGGGAATGTTCG GTGGCCACGTTTACCGGACAACAAGAGCTCGGAAGCCYAACTTCCGGTTC CCGTATCCGACATTGTGTCTATGGACACTCGTCGGTGGCTGTGTACTTTG GATGATGTCTATATTTTACTTTTTCGTACATGAGTACAATGTGTGGGCGA GCGTCTTGTACGCYCTCGTGTTCCGTCTCGTATACTCGGGCGCAATATCG ACGTTTATCGTTGTTTCCGCCGTAAACACTTGTTTCACAGGATCTTGGAC ATTGATACTCGCGCCATTAGGTAGACTCACGTACGGAGTGTATATGGGTG GATTGTCAATACAATTGTACCATATGGCTTCTGCACGTACTCATATATAT TTTAATCATCTACTAAACTCATGGTTTGTGATTGGTGATTCAGTACATGG ATTAATTATTGCATTCATCCTTTATATGTTGATCGAGAGTCCRTTTGAAA ATCTATTAAAACTATTGATTGACAAAATAAAAGGAGGAAAACACGAAACT GAAGAAAAAATACCAAACAACACTGTTGAAATGTTACAACATACTATAGA AATAAATAGTTAGCATAACTTTTTTAAATGTATGTACCCAGTCACTAGAA TATG back to topprotein sequence of XM_015513054.1 >rna8713 ID=rna8713|Name=XM_015513054.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=727bp
MSSAQTFVRYCYLSRCISYGDESSAMQSVTVLIVSILVVIVSGETEFYQP QQRWVTKILYDTLESYVPDGGPTCRRDGQAYREGLKDLRLWATQMYDASA KFPTGILSGKAVDFGDYDECLEINTSSLDFKPQYCIVNIRFSPSVKLYPN YYKTTPLDILNSSISVWEAVKVNPNPAKVQRNEISTAICIPSSCTHSDLQ STLSQKIISAFNEEEINTTVTVDSLYCTTQHDKPPKTSGFIIFWCFILFI VVLTIVGTLLDLHPKKETESKCKSILVAFSIQSNLQKLFYNNTKTAEFAG CNFLKIMACLIVLLGHRLMYISAQPVYNINKIEETFEIMIFGIVHNGPLV VDIFFVICGFLTFVNMYNELVKTKXFNMPFILFWRWCRLIPLYSVMIAFY SFVLIHLSDGPLWKHMAVQESENCQKNWWTNLLFVNNYVNVDQPCMIQSW YLACDLHLCAVGILIVYFIWKFPKSEKIVLMSAIVTSCFISAYVVYDHKF YPTFFGFISNLKXPSSHEVFTLLYIPTHTRATPYFVGMFGGHVYRTTRAR KPNFRFPYPTLCLWTLVGGCVLWMMSIFYFFVHEYNVWASVLYALVFRLV YSGAISTFIVVSAVNTCFTGSWTLILAPLGRLTYGVYMGGLSIQLYHMAS ARTHIYFNHLLNSWFVIGDSVHGLIIAFILYMLIESPFENLLKLLIDKIK GGKHETEEKIPNNTVEMLQHTIEINS. back to topmRNA from alignment at JOTR01000236:142650..152917- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna8713 ID=rna8713|Name=XM_015513054.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=10268bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000236:142650..152917- (Diuraphis noxia) TGTTGTAATATTATTCGAACAGATAACTTCCGGGACTTGCTATATAACTC
GCATCTGCATTGCCGACGTTTATGTTTGTGTTCATAATAACAATAATGTT
ACATATCGTTATAATTGGCGACGCGCGGATCAATGTCGAGTGCGCAGACT
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TTCAGCCATGCAGTCGGTGACAGTGCTTATAGTGTCAATTTTAGTAGTGA
TTGTCTCCGGCGAGACGGAATTTTATCAACCACAACAACGATGGGTCACG
AAAATACTGTACGACACGCTCGAAAGTTATGTCCCGGACGGCGGACCGAC
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AAAAATAATTGATAACTATCATCAACTATCTATACACCAATAATACACCG
ATTGCCTACTGAATTATGATGATAAATAATAAAACGTATATAATATTTAA
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TTTGATACATAAAAATTGAATTCCTAACGAGTAATTAATTAGTTACAACT
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ACCGTAATTATTTATTCGTTGAAAATTCAATTGTATGCATTGAAGTACTT
TAAAAAATATCCAGCTTTGAAATATGAAATAACAAAGCATGTTGTAAATT
GGCATTCAAAAAACTAAAAAATTATAATGATAACATTCACATTAATATCA
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GTAGGTACCCTTTGGTATTAATAGTATAGAAAGTATATAAAGTTTAAATA
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ATTACTTTTTAAATTTTAACCAGTGTCTAGTTTATATTTTYAAACTGCTA
CAGTACTACTGAAGTTAGATAAATGYATCTACATCTTTTGTTATATTTAA
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TCTGTTTATCTAATWWGTTTTTATAAGRCTCTTAATTAACACATGAATAT
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ATATCATTAAATATTATACTGTTGCTAGACAAAATTCTTTGCATYCTATT
CTGCATGTATGATGAATTTKTTTTTTTTTCTACGGGTACACATTATAGCC
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CTATATTGTACAAGATCATTGAGTCCAATATAAACAAAAGTAAAACACTG
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TCAATTACTGAATTTCAACGTTTAAAAAAATCATCAAGTATAATATTAAG
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ATGACGCTTCAGCAAAGTTTCCAACAGGAATATTATCTGGGAAAGCAGTA
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AGCTGTATCCAAATTACTACAAAACCACTCCACTGGATATTTTAAATTCT
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ACCTACGCCATTGTTTTTAATCGGGGTACTGTCAAACAGTTACCTACTTG
TTGTTCATTTATTTATAACAGATTGCTACATATATATTTTAATGATTTAA
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GGTTATATCATGATAATCAATATCAATAAGTATGCACAATACGTCATAAT
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CCTAATATTAATGTGTTTATGTATGCGTATACACAGGTAAATCCTAATCC
GGCTAAGGTTCAGCGTAATGAAATCAGCACTGCGATTTGCATTCCGTCTT
CGTGCACCCATTCGGATCTACAGTCCACGTTGTCTCAGAAAATTATTTCT
GCATTTAATGAAGAAGAAATAAACACCACCGTTACCGTGGACTCGCTATA
CTGCACCACGCAACACGACAAACCACCCAAGACATCAGGATTTATAATTT
TTTGGTAATGTGTATTGGGTCATGGTCATAGAAATCATAATAAATGATAT
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CTTTAATATCAAATATCAATCTTATGTTCTTGCAGCACATTATTTAAAAA
TAACGAGTTTTCATAAATTTATTTGTTTAGGTGTTTCATTTTATTTATAG
TTGTATTAACAATTGTTGGAACACTACTCGATTTACATCCAAAGAAAGAA
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AAAACTTGTTCCATTTTTTATTATTATTATTTTACAACATAAATATGGTT
TTTAGAATCTATCTTAGTAGCATTTTCAATCCAATCAAACCTGCAAAAGT
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AAAATAATGGCTTGTCTAATTGTTTTATTGGGACACCGATTGATGTACAT
TAGTGCACAGCCAGTTTACAATATTAACAAAATTGAAGAGGTGAATTGAA
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CCATTGGTAGTAGATATTTTTTTTGTCATCTGTGGATTCCTAACTTTTGT
TAATATGTACAATGAACTAGTGAAGACCAAACWATTTAATATGCCATTTA
TATTATTTTGGAGATGGTGCAGGTAACAATATATACCTAAAATTTTTTGT
TATRCTTTATCTCGTATAAGGATCTTATAATTTTATGAACTATAACTGAG
TACCTCATTATTTTTTGTATTCATTTCTTTTATTAGTGATAAAGTTAGTA
GAAAATTGTAGAATAAATATTTAAAACAGATAGGTARGTATATTATAACA
AAAATGATTAAGACTTTCAAATTTGATTTAAAAATATATAGGTTCTTACC
TTTACCTAATATATAACTTTATACAATATTATGCATGTATCCAACTAAAT
ATTAATTAAAAACAATTACAAAATCGAAAAAATATTTATTCAGCTTTGTA
GTATACTGTATATTGTACCTATAGGTACCTAACTATCCTAACCTATACAT
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TTTGTTGGTAACTGTCAAAATAAATTATTTTTTTAGGGATGACACAAGAA
TAAAATTGAAATTCAATAAACTATATTTTTTCACATTTTTATTGATTTTG
TAAAATTTAATTTTCAATTATTAATTTAGCTGGATTTAATGCCTACTGTA
TTAAATTACTGTACTTATTACCTACTGTATTTAAATTATTTTATATCAAG
AATAACTTTGTAACAATTATAATATGTTACATGATACCTAAATATATAAT
ATATATGTACTACACGTCTACACACTTAACATTATGTACGATGAACGATA
AATTAATGGATACATTTTAAAATAATAAAATCGTTACAGACTAATCCCTC
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AAAAAATTGGTGGACCAACTTACTGTTTGTAAACAATTACGTCAATGTCG
ATCAACCAGTGAGTGCAGGAATATTATATAGTAATTAGTAGTATAGACTG
GGCAATTATTATATGTGATTAAAACGATTTCATACAAACAGTGCATGATT
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TGAGTGCAATAGTCACGTCATGTTTTATTTCAGCGTATGTTGTGTACGAC
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TTCTATAGTACTAAAGGTGAATGTTTAATATATTATATAATATTTAAGTG
AATTAATGATATACTGGAATGAGACATTTATAGGTGGTACCTATATTTTT
AAACATTTTTGAATTTCAGTAAAAACTATTTATTGAAATCAATTTTCAAA
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AAATTGTCAAATGCCTATAAAGTAAAAATAGCATAAAATTAGTCTAAATG
TTTTGAAAATTTCATTAAATAGAATATTTTTATAACTGTTATTATTTTTT
GAGTTACAACAAAAAATTTAGTTTTGCATTAAATAATTTTATTTTCCAAG
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TGAAATMCCCATCGAGCCACGAAGTGTTCACGCTACTTTACATACCCACG
CACACGAGAGCGACGCCTTACTTCGTGGGAATGTTCGGTGGCCACGTTTA
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TGTGTCTATGGACACTCGTCGGTGGCTGTGTACTTTGGATGATGTCTATA
TTTTACTTTTTCGTACATGAGTACAATGTGTGGGCGAGCGTCTTGTACGC
YCTCGTGTTCCGTCTCGTATACTCGGGCGCAATATCGACGTTTATCGTTG
TTTCCGCCGTAAACACTTGTTTCACAGGTACCTGTTATAACGGTTTGTCA
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TTGATACTCGCGCCATTAGGTAGACTCACGTACGGAGTGTATATGGGTGG
ATTGTCAATACAATTGTACCATATGGCTTCTGCACGTACTCATATATATT
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TCAAATTAAAAATCAAAACATTTCTWAGGTTCCAAAAGTTATTAGGAAAA
AAAAATAAACATATAATTTTAAAATCAATATAATAATCGATCCACTCAAG
ATTTAAGTTTTTTCAAGAAAATCAAAATAAATTGCTTCTGCGTAAAATTT
TACTGTACGAYGCCTGTATCTGTTGAAAATATTGACTTAGATTAATTTAT
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AATGCCTAAATATTACTCYTTATAAGTTATAACATGTCATTTTCCAGATA
GGTACGAAAATAAATGTACCAACTTATTTTTCATTACCCAAGGAACATGT
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ACTTAATTACTTAAACAAGTTAAATCATTAAAAAACTACTCGTTTTAATT
TTGATTTAAATTTATCAATATTTCAAAATAATAATAATAATAATAATAAT
AATAATAATCACAAAAATAAGTTTGTGTATAAGAAAATTAAAATATAATA
TATAAATTATAGTATAGAGGTAGCTAAAATTTTAATAAATGTATTATTAA
AGGAAAAAAAGTGTGGGCATGCTTGTTGAATAATCCCATATATAGTTAGG
ACATATTAGTTATTATAGTTAGGACACCTCAAAAATCTAGCTTCAAGACA
TAATCTAGATTTTTCTTTTAACTTTCCTTCAAACTTTTTGATTATTAATC
ATTGGTGTGCATTATAATTAACAGTCATGGTTTGTGATTGGTGATTCAGT
ACATGGATTAATTATTGCATTCATCCTTTATATGTTGATCGAGAGTCCRT
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AGACTAGGAACTATTATAATATGCAGGTATATGCCATTTAAAATTCAAGG
TTAGTCATGGATTTTTTAAAATTGTTTTTAAATAACATTTTAATAGTTGG
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TTAATATTTGCTTACAATTCATTCAACATATTTTTTAGATACCTAATTTA
GTAGTTAGAACACATTATTTGTCCCTACTCCCTGGTATGTGAATCTAGTT
CATACAAAACAAATGTGCAACTATTTGTTCAAATTGATCAATATTCAATA
CATATATTATTGGTTTTATATTATCTACTTACCTATATAATATATACAGG
GTGATTMTTTTATCAAACAACACTCATTATTTCAAAAACTATTGAATTTT
TTCAAATTTTTTTTTTTCAAAATTTTGGAACCATCTTGTTCTAGAACTAT
ATATTTTTTAAATATTTTCACCCTTATATTTATCAGGTTAACCATTATCA
ACTTTTGATTTTCAAATGACAACCTATACTTAAAATTTGATAAACTAAWA
AGACTATTTTTTCAATGAATTTTCACGTTTAAATTTTCATTTTTCGTCAA
TTCGTTTACAAGATATAGCCTCCCAAAGTTGGGTGGTTTTGGGTGGTATT
TGTGTGTTATAGGTGTATGTTAGGTGGTATTTACACACAAACACCATATA
AGTGTTGTTTGATAAAAGAATCACCCTGTATAGACTACAATTATAAGATT
TTTTACATTTAATATGGCAGTACATTTATAATTACAATCAATAATTATCA
AATTAATTAAATATTAGACTAAGAGTAAGAATATTTTAACTATATAATAT
GAATGATGATACAATAATTTTAAAGAAATTAATTAAAATTTTTAATTCAG
GAAAACACGAAACTGAAGAAAAAATACCAAACAACACTGTTGAAATGTTA
CAACATACTATAGAAATAAATAGTTAGCATAACTTTTTTAAATGTATGTA
CCCAGTCACTAGAATATG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000236:142650..152917- >rna8713 ID=rna8713|Name=XM_015513054.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=2181bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000236:142650..152917- (Diuraphis noxia) ATGTCGAGTGCGCAGACTTTTGTTCGATATTGTTATTTATCTCGGTGCAT TTCGTACGGCGATGAGTCTTCAGCCATGCAGTCGGTGACAGTGCTTATAG TGTCAATTTTAGTAGTGATTGTCTCCGGCGAGACGGAATTTTATCAACCA CAACAACGATGGGTCACGAAAATACTGTACGACACGCTCGAAAGTTATGT CCCGGACGGCGGACCGACGTGCAGGCGGGATGGACAGGCATATCGTGAAG GGCTGAAAGATCTCAGGCTATGGGCAACACAAATGTATGACGCTTCAGCA AAGTTTCCAACAGGAATATTATCTGGGAAAGCAGTAGATTTTGGTGATTA CGACGAATGTTTGGAAATCAATACATCTAGTTTAGATTTTAAGCCTCAGT ATTGTATTGTGAACATACGTTTTTCACCATCTGTTAAGCTGTATCCAAAT TACTACAAAACCACTCCACTGGATATTTTAAATTCTTCAATTTCTGTATG GGAAGCTGTAAAGGTAAATCCTAATCCGGCTAAGGTTCAGCGTAATGAAA TCAGCACTGCGATTTGCATTCCGTCTTCGTGCACCCATTCGGATCTACAG TCCACGTTGTCTCAGAAAATTATTTCTGCATTTAATGAAGAAGAAATAAA CACCACCGTTACCGTGGACTCGCTATACTGCACCACGCAACACGACAAAC CACCCAAGACATCAGGATTTATAATTTTTTGGTGTTTCATTTTATTTATA GTTGTATTAACAATTGTTGGAACACTACTCGATTTACATCCAAAGAAAGA AACTGAGTCGAAATGCAAATCTATCTTAGTAGCATTTTCAATCCAATCAA ACCTGCAAAAGTTATTTTACAACAATACTAAGACTGCGGAATTTGCTGGC TGTAATTTCCTTAAAATAATGGCTTGTCTAATTGTTTTATTGGGACACCG ATTGATGTACATTAGTGCACAGCCAGTTTACAATATTAACAAAATTGAAG AGACTTTTGAAATTATGATTTTTGGAATAGTGCATAATGGACCATTGGTA GTAGATATTTTTTTTGTCATCTGTGGATTCCTAACTTTTGTTAATATGTA CAATGAACTAGTGAAGACCAAACWATTTAATATGCCATTTATATTATTTT GGAGATGGTGCAGACTAATCCCTCTATACAGTGTGATGATTGCGTTTTAT TCTTTCGTGTTGATACACCTTTCGGACGGACCTTTATGGAAGCATATGGC TGTTCAAGAGTCGGAAAACTGTCAAAAAAATTGGTGGACCAACTTACTGT TTGTAAACAATTACGTCAATGTCGATCAACCATGCATGATTCAATCCTGG TATTTGGCGTGCGACCTGCATCTGTGCGCTGTGGGCATACTAATTGTATA CTTTATTTGGAAATTCCCGAAGAGCGAAAAAATTGTCCTGATGAGTGCAA TAGTCACGTCATGTTTTATTTCAGCGTATGTTGTGTACGACCACAAATTT TACCCAACGTTCTTTGGTTTTATTTCAAACTTGAAATMCCCATCGAGCCA CGAAGTGTTCACGCTACTTTACATACCCACGCACACGAGAGCGACGCCTT ACTTCGTGGGAATGTTCGGTGGCCACGTTTACCGGACAACAAGAGCTCGG AAGCCYAACTTCCGGTTCCCGTATCCGACATTGTGTCTATGGACACTCGT CGGTGGCTGTGTACTTTGGATGATGTCTATATTTTACTTTTTCGTACATG AGTACAATGTGTGGGCGAGCGTCTTGTACGCYCTCGTGTTCCGTCTCGTA TACTCGGGCGCAATATCGACGTTTATCGTTGTTTCCGCCGTAAACACTTG TTTCACAGGATCTTGGACATTGATACTCGCGCCATTAGGTAGACTCACGT ACGGAGTGTATATGGGTGGATTGTCAATACAATTGTACCATATGGCTTCT GCACGTACTCATATATATTTTAATCATCTACTAAACTCATGGTTTGTGAT TGGTGATTCAGTACATGGATTAATTATTGCATTCATCCTTTATATGTTGA TCGAGAGTCCRTTTGAAAATCTATTAAAACTATTGATTGACAAAATAAAA GGAGGAAAACACGAAACTGAAGAAAAAATACCAAACAACACTGTTGAAAT GTTACAACATACTATAGAAATAAATAGTTAG back to top
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