Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Gbkey | mRNA |
| Gene | LOC107165050 |
| Model evidence | Supporting evidence includes similarity to: 4 Proteins, and 100% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 1 sample with support for all annotated introns |
| Product | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-like |
| Transcript id | XM_015513101.1 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| GeneID | 107165050 |
| Genbank | XM_015513101.1 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| LOC107165050 | gene5925 | Diuraphis noxia | gene | JOTR01000238 9244..14158 - |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| XP_015368587.1 | cds8484 | Diuraphis noxia | CDS | JOTR01000238 13844..13973 - |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >rna8756 ID=rna8756|Name=XM_015513101.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=1552bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000238:9244..14158- (Diuraphis noxia)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
AGTACTTTAATGATTTTGCGTTATCTAGTATCTACTATCTACTTAAGTAT
CAATCGAATGTCCGGTATTCTCTTCTAAATCAAAACAAAATATTATGTCT
CATTTTACGTAGTACACAATCAAATTTAAATTGAATATGTTTTTATAGCG
TTTAGATTAAGAATTAAACCTTCAATCGGTCATTTATGGAAAAATTACTA
TTTTTCGTGTACTCGATTGGAATCCTTATTAGGATCTATTTGAATTTAAG
CGATTTCAGCACTTCCATTGCAGACCGGGTTGAAGTGTCAACACCATTGA
ACTCTTGGAAAAGAGTTATTGAAGGTGTATCTTTATACAATGAGAATATC
AATCCATATGATGGGGATTTATTTCACGAGACTCCATTGGCTCTTGTATT
TTTCAGTCACTTGACATCAACTTTTTCAGATTTTTATGTATCATTAGTAT
TTATTGCGTGTGATCTCATAACTGCCTTCGTATTGTACTATACGTCTAAA
ATTTACACTGAAAATTTGCTTAAACAGCAAACCAAAACAAAGCATGTCTA
CAATAAAGAATTTAGCAAATTATTGATACCAGATGACTTCTCAGTTATAA
ATCCGTTTTATGTTTGTTCAGTTTACATGCTTAACCCATATACGGTGTTT
AGCTGTATTTCAAGAACAACAACAGTATTCAACAACTTATTTTTAGCACT
ATGTTTATATTCCATGGTAAAACGGCATAGACTATTAGGATGTCTGAGCT
TAGTATTAGCATCATTGCCAACGTTTTACACATTTGGTCTACTAGCCCCG
TTAATGATAAGTTGTGTACCAAATGACTCTAAAAATAAGACTGGTTCATT
CATAATTACATTTTTAACTTGTGGTACCATTAGTTGCTCACTTCTGTACT
TATGCTATACCATTATGAACGAATGGACATTCCTAGACTCTGTTTATGGC
TTTATATTAAATGTACGTGATTTAAAACCAAATATTGGCTTGTTTTGGTA
TTTCTTTACTGAGATGTTTGAACATTTTCGTGCACTATTTGTTTGTGCTT
TTCAATTAAATGCATCTGTTCTATATGTTATTCCATTAAGTATACGTCTC
CGCCGTGACCCATTGTTGTTAGCCACCAGTTTGTTAGCATTAACTGCGGT
TTTTAAGTCATATCCAAGCATAGGAGATGTTGGATTTTACCTCAGTCTTC
TTCCAATTCATAGACATCTATTCTACTTTATGCAACAAGCATTTATTGTA
TCATGTTTCTTTGTGGGTTGTACCGTTTTTGCTCCTACTGTGTGGCATTT
GTGGATTTATTCACGTTCAGCAAATGCAAATTTCTATTTTGGAGTTACTC
TTGCTTTTGCCACAACTCAAATATTCCTGATCACTGATTTATTGTTTGCA
TATATCAAGCGAGAGTTTGCACTGAAACATGGCATGAAACGTATGATCAA
TGGAAAAGAAGCTCGTTTAATGCTTGATTAATATAATTTTATGTCAAATA
TTTAATGAAGAATTCTAAAATTTTGATTATTTAACAACTTAGAAAAAAAC
AT back to topprotein sequence of XM_015513101.1 >rna8756 ID=rna8756|Name=XM_015513101.1|organism=Diuraphis noxia|type=polypeptide|length=432bp
MEKLLFFVYSIGILIRIYLNLSDFSTSIADRVEVSTPLNSWKRVIEGVSL
YNENINPYDGDLFHETPLALVFFSHLTSTFSDFYVSLVFIACDLITAFVL
YYTSKIYTENLLKQQTKTKHVYNKEFSKLLIPDDFSVINPFYVCSVYMLN
PYTVFSCISRTTTVFNNLFLALCLYSMVKRHRLLGCLSLVLASLPTFYTF
GLLAPLMISCVPNDSKNKTGSFIITFLTCGTISCSLLYLCYTIMNEWTFL
DSVYGFILNVRDLKPNIGLFWYFFTEMFEHFRALFVCAFQLNASVLYVIP
LSIRLRRDPLLLATSLLALTAVFKSYPSIGDVGFYLSLLPIHRHLFYFMQ
QAFIVSCFFVGCTVFAPTVWHLWIYSRSANANFYFGVTLAFATTQIFLIT
DLLFAYIKREFALKHGMKRMINGKEARLMLD. back to topmRNA from alignment at JOTR01000238:9244..14158- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >rna8756 ID=rna8756|Name=XM_015513101.1|organism=Diuraphis noxia|type=mRNA|length=4915bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000238:9244..14158- (Diuraphis noxia)
AGTACTTTAATGATTTTGCGTTATCTAGTATCTACTATCTACTTAAGTAT
CAATCGAATGTCCGGTATTCTCTTCTAAATCAAAACAAAATATTATGTCT
CATTTTACGTAGTACACAATCAAATTTAAATTGAATATGTTTTTATAGCG
TTTAGATTAAGAATTAAACCTTCAATCGGTCATTTATGGAAAAATTACTA
TTTTTCGTGTACTCGATTGGAATCCTTATTAGGATCTATTTGAATTTAAG
CGATTTCAGCACTTCCATTGCAGACCGGGTTGAAGTGTCAACACCATTGA
ACTCTTGGAAAAGAGGTTTGAATAATTTACTGTGTTCAATAGTTCATCTG
TTAGCATCAGTTTACTTATTACTATACTGTGTATTCTCATATTATGTTAG
ATGATTATATTTTGTGCCTACACCACAGCTAAGAATAAAACTAGGGTGTG
ACCTTTTATAAATGTCTTTTCATTGTAGGTATTAAAATGATTATTGCAAA
TATTTATTAAAGCATGGCACATTGTCTACTATAGAATGTTAAATTGCATG
CTAGTTTCCTTATAAGTTATAAATTATTGAATGGCTTGTTTTTCAAAGTT
CATCTTGTACTTTTTTTGTGCAATAAAAGTTCTTTGCTATTTGATCATCT
CATTTCTATTATCAGATCTTTTGGGCAGTACTATTGTACAGAGAAGGACT
GGTCCAGGAGGCTGGTTGGTAAATCCTTATTACCTAGGCCACTTTCTATG
TTGATGCCATGTCAGGTTATACAAAATGAATTCTTTTTTTTTTATTTGTG
TTACACACCATACAATTTGAGTACAATAAGCGTAAATTATAACACAGAAA
AAAAGACATTTAAAATTTGATTTGAAGAAGCCTTCCATTGACAACACTCC
TTAGGGCGCTATGTTATACAAGTATAGGATTAATTAAAGAAAAGATCACG
GCACTATTTTCTTTTCATTCTTTTGGGAGAGTTTCCTGGGATAGGTAAGG
TCAAATTTTTTGCAAGGTTGTTCAGGTGAATAAAATGAATTCTATAGACT
TAATGTAATACACTATAGTGTAGATATGTAAGCTACAGTGTAGGGTTTTA
ATTTTTTTATCATACTGTGGTAAACAATGTATGTTCAAGTAATATTGAAT
CTGCAAAACTCTAAAGATTTCAAAAAGTTTCTGAAACCAATAGGTACTAG
TTAATGGTCTAGAAAAAAATCTCTAAACTAGTGTAACTAGCAACTGCAAC
TACTAGTGATGTCTATTTATTTCCTGCTGTCATGTACATATTAAATCATA
TGTTGACAGATTATTTATTCAATGCTAAAATTTCAGCAGAAGGTTRCTCM
TTATTAATTGACCTATGTGAATTTTAAACAATATTAACAGATCGTCTATT
TCTACATATTTGTAATATGGTTGGTCCAATTTCTGATTATTTACAAACAA
ATAAAATTAATATTACATGGTTTAAAGTAGAATGTGTCTAAAAAGCAATT
TATTAGATGAAATAAAGCTTGATATTATATATTCTGATGCCTAAAACTTT
CTGACCTAAATTTATCCGTTTTGTTAAAAAAGGAATTTCTCAACCTTAAA
AGTTCAACAATTAAAAAAATTAAGGGAAAACATGATATTGAGAGCATTTG
TATAACAAGTAATCTACTTTGGTAGAATGTTCTATGTACAAATTAAAGAA
AAACATATTTTGTATTACTAGTACCTACGCTATATCATACATTTGTTCAT
CAAATATAAAAAAATAAATAATAATTAGTCAAATATAATAAAAATTTCTA
TTACAGTTTTATTTTTAGTAGGTATTATTTAAAAATTTTAAAAAATTATT
TCGAAGATTAATTGATCTCAACCATGCTTCAGTAAGATGATAATGTAAAA
GTTCYGATGTAGTGCCACACATTTTTCAAAGTATTTTCATTTTAAGATGT
GACCAAATACATTTTATATTCCTATTGTCTAGATGTTGGCTCCTGTGTGT
TGATTTTCCATCAACAATCATTTTATAAAATTCAGACATACGCATTATAG
GTAAACTCCGATTGATGAACAATTTAAAACAAACTGTTCCGAGATCAGCA
ACATTGCTAATGACTGGTCATATTGTAAATATCTTTAATCGTTATCGTAA
CAAAATGAATCGTCTGCGATAATGTGCGTATAATAATAGTATAGTATAAT
ATAATATAATAATAGGTAATAATAATTGTAGATCACCAACTACACCTAGT
TTAATATGATAGATCACCTGATACACCTTAAAGAGGTCGTAGATGATTGC
CTGCTACACGAATGCTATATTGAGGACTGTATGAATTGTTTGATATGTTG
TTATAAAATCTTTTATAACTTATTAGTACCATATTCATTCCATTGCCTAT
ACAAATATATTTTTAGCACATGAATACATACTTAGATTATCTTTCACACA
AATCAGCTGTGAAAGGTTATTGAGTTAAAACAAGATTGAGAGCAACATTG
GGCCAAGATAAACTTGAAGCTTTTCTAATGATGAGTATAAAGAAAGATTT
TTTAAGAGATTTAAAATTCAAAGAAATATTTGAGTCCATTAACAACAATA
ACTGTTGGTGAAATGAATGAACTGCTTATCATTGATGAAAAAAATGTATG
AATATAATATAAATATCAGATATCTAAATTTCTTTTTTTTATTTATAAAT
TTCTCACCAAAATATGTTATTTAAGAAAATTGTATCTTTTTAATATTGAT
ATTATTATAAAATTAAGCAATATGGGTACAAGAGGAAGAATAACTTACAT
TACAACCCCCTTGTAGTGATGTGATAATCTCCCAAAAAAAACTTAAAATT
TATTTTTATTTTTTGGTTTCAAACTTATATTGTTTCTAGTACCTAATTAA
TACTTAAATACAATTTATTTTTTGTACTGCAGCTTAATTAATACCTAATG
TAATCTAATTTTTTTTTTTCTAGTTATTGAAGGTGTATCTTTATACAATG
AGAATATCAATCCATATGATGGGGATTTATTTCACGAGACTCCATTGGCT
CTTGTATTTTTCAGTCACTTGACATCAACTTTTTCAGATTTTTATGTATC
ATTAGTATTTATTGCGTGTGATCTCATAACTGCCTTCGTATTGTACTATA
CGTCTAAAATTTACACTGAAAATTTGGTATGTTAAGTGCATAATATTATT
TTTATTTTCAATTTGAATACTTGTAGTACTTACATAGTTTTCTTATTTTA
ATACTAATTTAGCTTAAACAGCAAACCAAAACAAAGCATGTCTACAATAA
AGAATTTAGCAAATTATTGATACCAGATGACTTCTCAGTTATAAATCCGT
TTTATGTTTGTTCAGTTTACATGCTTAACCCATATACGGTGTTTAGCTGT
ATTTCAAGAACAACAACAGTATTCAACAACTTATTTTTAGCACTATGTTT
ATATTCCATGGTAAAACGTAAGTATCTATATTCTGTGTCTCTGTTTTGTT
AGAGAACAATCACATGTTGCGCATCATGAATGATGCGATTGATACGTTAA
TACTGGGAACTTGGTAAGAGATGTAGAGATGTGCATTACTTACGTAAATC
AGTTGGCCCACTGATTATTCTCTTTTGAGACAGAGTATACATTTTTCTAA
ATGTTATAATTATTAATATTTTGACTTTTATTAAATCCTTAAATACTGCT
ACTGAATAAAATTATTTAATGAATATTTTTTTTTTTTTAGGGCATAGACT
ATTAGGATGTCTGAGCTTAGTATTAGCATCATTGCCAACGTTTTACACAT
TTGGTCTACTAGCCCCGTTAATGATAAGTTGTGTACCAAATGACTCTAAA
AATAAGACTGGTTCATTCATAATTACATTTTTAACTTGTGGTACCATTAG
TTGCTCACTTCTGTACTTATGCTATACCATTATGAACGAATGGACATTCC
TAGACTCTGTTTATGGCTTTATGTACATACTTAATTTTAATGTTACTCTA
CTCTATGGTTTTTAAGTATTAATATGATAATTTATTTTTTCAGATTAAAT
GTACGTGATTTAAAACCAAATATTGGCTTGTTTTGGTATTTCTTTACTGA
GATGTTTGAACATTTTCGTGCACTATTTGTTTGTGCTTTTCAATTAAATG
CATCTGTTCTATATGTTATTCCATTAAGTATACGTCTCCGCCGTGACCCA
TTGTTGTTAGCCACCAGTTTGTTAGCATTAACTGCGGTTTTTAAGTCATA
TCCAAGCATAGGAGATGTTGGATTTTACCTCAGTCTTCTTCCAATTCATA
GACATCTATTCTACTGTATGTCAACTGAATAATTAATATCATTCATTAGC
TTATAAAAAAAATACATATATATTATTTAATAAACTTTTATATTAATTTC
CAGTTATGCAACAAGCATTTATTGTATCATGTTTCTTTGTGGGTTGTACC
GTTTTTGCTCCTACTGTGTGGCATTTGTGGATTTATTCACGTTCAGCAAA
TGCAAATTTCTATTTTGGAGTTACTCTTGCTTTTGCCACAACTCAAGTAA
GAATTAAAAATGTTTTTATGATCTAGGTATATCCAGTTTGTTCAAAAAAA
TTTAATTGATTAGGTTTTATCACTGTTTTATGTTTATGATTTAATATATG
TATTAAATAATAATAAATATCATATAAATATATGGTATTAAATTGTTTAT
CAATATCATGGTTTATATATAATATTTTTCTAGATATTCCTGATCACTGA
TTTATTGTTTGCATATATCAAGCGAGAGTTTGCACTGAAACATGGCATGA
AACGTATGATCAATGGAAAAGAAGCTCGTTTAATGCTTGATTAATATAAT
TTTATGTCAAATATTTAATGAAGAATTCTAAAATTTTGATTATTTAACAA
CTTAGAAAAAAACAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at JOTR01000238:9244..14158- >rna8756 ID=rna8756|Name=XM_015513101.1|organism=Diuraphis noxia|type=CDS|length=1296bp|location=Sequence derived from alignment at JOTR01000238:9244..14158- (Diuraphis noxia)
ATGGAAAAATTACTATTTTTCGTGTACTCGATTGGAATCCTTATTAGGAT
CTATTTGAATTTAAGCGATTTCAGCACTTCCATTGCAGACCGGGTTGAAG
TGTCAACACCATTGAACTCTTGGAAAAGAGTTATTGAAGGTGTATCTTTA
TACAATGAGAATATCAATCCATATGATGGGGATTTATTTCACGAGACTCC
ATTGGCTCTTGTATTTTTCAGTCACTTGACATCAACTTTTTCAGATTTTT
ATGTATCATTAGTATTTATTGCGTGTGATCTCATAACTGCCTTCGTATTG
TACTATACGTCTAAAATTTACACTGAAAATTTGCTTAAACAGCAAACCAA
AACAAAGCATGTCTACAATAAAGAATTTAGCAAATTATTGATACCAGATG
ACTTCTCAGTTATAAATCCGTTTTATGTTTGTTCAGTTTACATGCTTAAC
CCATATACGGTGTTTAGCTGTATTTCAAGAACAACAACAGTATTCAACAA
CTTATTTTTAGCACTATGTTTATATTCCATGGTAAAACGGCATAGACTAT
TAGGATGTCTGAGCTTAGTATTAGCATCATTGCCAACGTTTTACACATTT
GGTCTACTAGCCCCGTTAATGATAAGTTGTGTACCAAATGACTCTAAAAA
TAAGACTGGTTCATTCATAATTACATTTTTAACTTGTGGTACCATTAGTT
GCTCACTTCTGTACTTATGCTATACCATTATGAACGAATGGACATTCCTA
GACTCTGTTTATGGCTTTATATTAAATGTACGTGATTTAAAACCAAATAT
TGGCTTGTTTTGGTATTTCTTTACTGAGATGTTTGAACATTTTCGTGCAC
TATTTGTTTGTGCTTTTCAATTAAATGCATCTGTTCTATATGTTATTCCA
TTAAGTATACGTCTCCGCCGTGACCCATTGTTGTTAGCCACCAGTTTGTT
AGCATTAACTGCGGTTTTTAAGTCATATCCAAGCATAGGAGATGTTGGAT
TTTACCTCAGTCTTCTTCCAATTCATAGACATCTATTCTACTTTATGCAA
CAAGCATTTATTGTATCATGTTTCTTTGTGGGTTGTACCGTTTTTGCTCC
TACTGTGTGGCATTTGTGGATTTATTCACGTTCAGCAAATGCAAATTTCT
ATTTTGGAGTTACTCTTGCTTTTGCCACAACTCAAATATTCCTGATCACT
GATTTATTGTTTGCATATATCAAGCGAGAGTTTGCACTGAAACATGGCAT
GAAACGTATGATCAATGGAAAAGAAGCTCGTTTAATGCTTGATTAA back to top
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