SFRICE020554-RA (mRNA) Spodoptera frugiperda rice

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Overview
NameSFRICE020554-RA
Unique NameSFRICE020554-RA
TypemRNA
OrganismSpodoptera frugiperda rice (Fall armyworm - rice variant)
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
SFRU_RICE_026934contigSFRU_RICE_026934:188..18826 -    View in Apollo
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Spodoptera frugiperda rice annotation OGS2.32015-12-04
Properties
Property NameValue
Full nameSFRICE020554
eAED0.15
QI0|0|0|1|0.66|0.81|16|0|916
AED0.12
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE020554SFRICE020554Spodoptera frugiperda ricegeneSFRU_RICE_026934 188..18826 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE020554-RASFRICE020554-PASpodoptera frugiperda ricepolypeptideSFRU_RICE_026934 188..18826 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-16Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 188..377 -
SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-15Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 488..793 -
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SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-8Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 8060..8227 -
SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-7Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 8414..8647 -
SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-6Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 8748..8997 -
SFRICE020554-RA-exonSFRICE020554-RA-exon-5Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_026934 9079..9235 -
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The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-16Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 188..377 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-15Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 488..793 -
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SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-11Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 4829..4910 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-10Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 6290..6457 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-9Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 7520..7657 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-8Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 8060..8227 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-7Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 8414..8647 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-6Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 8748..8997 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-5Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 9079..9235 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-4Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 9517..9742 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-3Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 9838..10045 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-2Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 10429..10635 -
SFRICE020554-RA-CDSSFRICE020554-RA-CDS-1Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_026934 18753..18826 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>SFRICE020554-RA ID=SFRICE020554-RA|Name=SFRICE020554-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=2748bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_026934:188..18826- (Spodoptera frugiperda rice)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGACTCGAAAGTGGTATTGAAAGAAAAGAACCCCCACGACAAAGCGAA
CTTCATCTCGAAAATATTTCTAACATGGAGCTTTAGCCTATTTCGTCGTG
GATTTAAGCATGGTCTCACTGTGGAAGACTTGTGGCAAGCCCGAGCCGGC
GACCACTCCGGCCGCCTGGGGGACCGCCTCGAACAAGCGTGGCAGGAGGA
ACTCGACAATGCCAAGAGAAAAGGCATCAAACCTTCTTTCTCAAAGGCTA
TCGTACGGTCGTTTTGGCTTGAATATCTAATGCCATTAATTCCATACACG
TTAGCTTTATTCATAAATTATTTTTCCGAAGATAAAACCCCAGAGAGTTA
TAGAAATGCACACATTTACAACTTTCTCATGAACTTCCTGAGTATATTGA
CGGCATTGATGCTCAATCATTTACAATTAAGTCAAGGACGAGTAGGAATG
AGAGTGAGAATAGCTAGCTGTTCATTATTGTATAGAAAAATATTAAAACT
CGATAGAACTGGGTTGAATAAAACGGAGCCAGGACAGGTGATCAACCTGA
TGTCTAACGATGTAAATCGTTTCGATTTAGTGGCTCTATTTCTGAACTAC
TTGTGGGTGATGCCTATCGTGGTGCCGGTGGTCTCGTACCTAGTGTGGCA
GCACGTCGGCTGGGCCACTCTGGCCGCGCTCGTCGTCATATTCGTACAAA
CTGTACTCGTCCAAGCCTACTTGAGTAACCGCCAAGGAGTATTACGAGGA
AAAATTGCCAAACGCACAGATGAAAGGGTAAAAGTTATGAGTGAACTTGT
AAACGGTGTACAAGTCATCAAAATGTATGCGTGGGAGAAACCTTTTGAGA
GGTTGGTCGACAAACTGCGGAAGATGGAAGTGAGCTTCATAATGCGCACA
TCTATGATCAAAGGGTTCTCGACGGCGCTGAGCGTGTTCACAGAGCGCTT
CATCTTGTTCTCTGCTGTCGTTGCGTTTGTGGTCATGGGCGGGGACATCC
GCGCCGAGATCACGTTCTCCCTCGTTCAGTATTTCAATCTACTCCAACTC
GCCTGCAACATATTCTTCCCACTGGCCCTCGCATTTCTCGCAGAAACTAA
AGTCTCAGTGAGACGACTTGAGGAGTTCTTGTTGTTGGACGAACTGACAC
CTGCGAAATTACCGCTAGCAATCGATTCGAAGGAAATAATTAGCAATGGT
ACTGAGAAGGAAAAGCCGAAGCATACGGGCTTGATATTGAATGGACTGAG
CGCGAGCTGGCAACCAGAGGCCATTGTCAACACGTTGAGGAACATCACGC
TGACTGCAGAACCTGGAGAGTTTGTGGGCATTGCTGGCCTTGTGGGTTCT
GGAAAGTCGACCCTTCTGCAAGTCATCTTGGGTGAGTTGCCTCCAACGCA
GGGCACCATATCGTTGGGAGGCGCACGAGTCTCCTACGCCAGCCAGGAAC
CCTGGCTCTTCGTGGCAACCGTTCGTCAAAATATACTCTTCGGACTTCCA
TACGATCGCATACGTTACAAAAAGGTCGTGAGCGCATGCGCACTGTTGCG
GGACTTCGAGCAGTTGCCTGCAGGAGACTCGACACTGGTTGGAGAACGAG
GCATCAGTCTGAGTGGAGGACAGCGCGCGCGCATCGGTCTCGCCAGAGCA
TGTTATAGACAGGCTGACATATACCTACTGGACGACCCCCTCTCGGCAGT
GGACACGCACGTCGGTAAACACCTGGTATCAGAATGTGTGATGGGTTTAC
TAAGACATTCTACGAGGATCCTGGTCACACATCAGCTACACCATCTCAAG
TCTGCTGATAAAGTCGTCATCCTACACAACATAATACAGATTGAAGGTAA
GCGTCCACAGGCCCGCATCGTACGCATCGCACGGATCGTACGCATTCCGT
ATGACGTCATCAGCATTGCTGACGATGCGGTCCGCACTATGCGGATCAGT
GGACACAGTTGTATGAATTTCTATACAAAACAACTACCGTTGCGTGCGGT
GCGTGCGATGCGGGCCTGTGGATGCGGTGAAATAGAGACTACTGGATCGT
TTGATGATGTGTCGCGGTCGCCACTATTTGCGGAGTTGCTCCAGGAAGAG
GAACAACCAGAAGATCCGAAAGTTCAGTACCTTCGACAAAGAACTCTTTC
TATACAGGTCGTGTACCAGGCGCGGTGTATCGTCAATACTTTCGCGCCGG
CGCTGGCTGGGGTCTCATCCTATGGACAACGTTCAGCATTCTTCTGGCAC
AAGATGAACGTCGTGGAAATAAGACATGGATTGGAAAACAACCAAACAAC
TACTCCTCTCTTCCATAACATCACAAATGGCAACAATTCTATTGGCAGCA
ATGACACCATTAGCAATTTCACTACAGAGCTGCCGACCACGATACCGTCG
TCCACAGAACTGCCCAATATGACTGTTATTGATACGATGGTGAAGACTGT
CCTAACTATGCAGAATATTACGTCTGTCTACGAACCAATCAACCACGACT
ATTATATTTATATTTGGGCGATTGCTATTCTAGGATGCATCATACTCACA
ACTGGAAGATCGATTTTGTTCCTGTGGGTATGCATGCGTAGCTCCATAAA
GTTGCACAACCAGATGTTCAGCAATATACTGGCGGCCACTATGCGCTTCT
TTGACACCAACCCTTCTGGACGAATCCTCAACAGGTTCTCTAAAGACATG
GGAGTGGTTGATGAGATCCTACCGAGGATGTATTTGGACAGTATACAG
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protein sequence of SFRICE020554-RA

>SFRICE020554-PA ID=SFRICE020554-PA|Name=SFRICE020554-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=polypeptide|length=916bp
MDSKVVLKEKNPHDKANFISKIFLTWSFSLFRRGFKHGLTVEDLWQARAG
DHSGRLGDRLEQAWQEELDNAKRKGIKPSFSKAIVRSFWLEYLMPLIPYT
LALFINYFSEDKTPESYRNAHIYNFLMNFLSILTALMLNHLQLSQGRVGM
RVRIASCSLLYRKILKLDRTGLNKTEPGQVINLMSNDVNRFDLVALFLNY
LWVMPIVVPVVSYLVWQHVGWATLAALVVIFVQTVLVQAYLSNRQGVLRG
KIAKRTDERVKVMSELVNGVQVIKMYAWEKPFERLVDKLRKMEVSFIMRT
SMIKGFSTALSVFTERFILFSAVVAFVVMGGDIRAEITFSLVQYFNLLQL
ACNIFFPLALAFLAETKVSVRRLEEFLLLDELTPAKLPLAIDSKEIISNG
TEKEKPKHTGLILNGLSASWQPEAIVNTLRNITLTAEPGEFVGIAGLVGS
GKSTLLQVILGELPPTQGTISLGGARVSYASQEPWLFVATVRQNILFGLP
YDRIRYKKVVSACALLRDFEQLPAGDSTLVGERGISLSGGQRARIGLARA
CYRQADIYLLDDPLSAVDTHVGKHLVSECVMGLLRHSTRILVTHQLHHLK
SADKVVILHNIIQIEGKRPQARIVRIARIVRIPYDVISIADDAVRTMRIS
GHSCMNFYTKQLPLRAVRAMRACGCGEIETTGSFDDVSRSPLFAELLQEE
EQPEDPKVQYLRQRTLSIQVVYQARCIVNTFAPALAGVSSYGQRSAFFWH
KMNVVEIRHGLENNQTTTPLFHNITNGNNSIGSNDTISNFTTELPTTIPS
STELPNMTVIDTMVKTVLTMQNITSVYEPINHDYYIYIWAIAILGCIILT
TGRSILFLWVCMRSSIKLHNQMFSNILAATMRFFDTNPSGRILNRFSKDM
GVVDEILPRMYLDSIQ
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mRNA from alignment at SFRU_RICE_026934:188..18826-

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>SFRICE020554-RA ID=SFRICE020554-RA|Name=SFRICE020554-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=18639bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_026934:188..18826- (Spodoptera frugiperda rice)
ATGGACTCGAAAGTGGTATTGAAAGAAAAGAACCCCCACGACAAAGCGAA
CTTCATCTCGAAAATATTTCTAACGTAAGTATTACCACGTGTTATTAAAC
ATTGTATTATTTATCTATCTTCATTGATGCTGCATCCGGTCTAGCCGAGT
CAAGCACCAACGAGTTGAAAAGAAGAAAAAAATACCACTTGTCCGGTGCT
TCAGTAAAAAATATAACACAGGTCGTAGATCTTACTTTTCTATGCTCTAT
GTTAACATTTGATATTATTTTTAGTTGCGTTATTTGAATCAAAAACAAAA
TAGTAATAATGCAAACCCGTTCATCAATATTCAACACCGGTCTCACTCAG
TCACCGTGACCTTCTTGCTTTCATACCAATAACAATTTCACGTGTATCTG
TTGCTCTTATACTCTACTAGCTTTTACCCGCTACGTCGCTCGCGTTAAGA
AGTATTATTAATGGAATTAATCAAAATTCTTTCTTAGGGGATGCCTACGT
CATAGTATTTTAATGCAGACAAATTAAGTCACAACCCGATCGGTTTTAAA
TTGACAGTTTCATAAAAAACTTTCATCCCCTATTATATCCTCTTGGGGAT
GGATTTAATCAAAATCCTTTCTTAGCGGATGCCTACGTCATAGCATTTAC
CTGCATGCTTAATTTCAACCCGATCCGTCAAGTGGTTTGGGCTGTGCGTT
GATAGATCACTCCGTCAGTCAATCAGTCAGGCAGTCAGTCAGTCAATCAG
CCAGCCACCTTTGAGTTATACATATACCTACTCATATTTAGATTTACGAA
TACGAACACATATGCGAAGCTAGATAATTTAACTTTTAAATTAAATCATT
GTGCACACAGCATGAGTTAGCTTTTCATACCAATTCCTTTTATATATGAC
TAACATAAGTCACAAAATTGTGTTAAAATATTATCAATGTGACCGTGAAC
TTTGCTGTTTTTGTTGAGAGTTAATTATAGCAACGCTCGTCAGGTTCATT
GATTAGGTAATTTAAAATAGTTATTTATTTTTCAGGAATAAGGAAAGTTA
AGTAATGAATATCTATGTATTACCTAGTCGGTTTGAACACTATAAATTCT
CATCTATAGGTAGGTATCTGTCCTTCCGTCACGCTATGGCTGGTAGGTAT
CAAATATTAAAGACATAAACATGGTACTTATGTAGGTCGTCAACTTAATA
CCTAGTTAACAACCTGCAATGAAATTAATTCTCAAGGTAAAACAAATAAA
ATTTCTCACAGTTACTTATTTTTCTACCTATACCGATGCTCTTGGCTCGG
TTGATATTCGATCCGGGACTGCTCAGGTAGTCGCGACCGCGACTTTCGTC
CATTTGGTAAATTCAAACTTGGGTACCGACTCAAATGGTAGTTGAGCAGA
AGATGAATGACTGCACTAGTTCAGCATTTTTTTAAAGTGTGTTACAAGGA
AGTATACATAAAATACATTTATTTAATTAATACAAAAATCGAAAAAATAT
AGAGTTGTTAGTAGTTTTGTTAAAAAAAAAAAACGAAAAAAATGCTATGC
TGCTTTTAATAGTCTAAGTAGATTTGTTGTATCAAATTGGATAAATATAA
TTATTTTTTGAGTGTTAGGAAATAATGTTTGCTTAGCAGATTCTACGTAG
GTAGTACCTTGGTACCTACATATTATTTTTATTCAAAATTTATACCAGAA
GATTTCGACCTCGATGAAGACCTTTACAGACCTTTAGAGAAACTTTAAAG
AAACTTAAATTATGAAACATTTTGTTTTTTAAAAACATTTTTGTAAACAC
TATAAAAGAATTTCGGAAGTCGGTAACTCGGTATCAATGATTGAGGTCAA
TGACATAGTTCCGAATTCGCTTCACACATTAATATTGAAGTGTTAAGTAG
GTAGAGTTGGACAATTGATCCTTTGGTAACCTACATATACAATAACATTA
TGTTCATACTGGCTGTACGTAATTATAATACATGTGTCATAGTCGTATCA
CTTAAACTAACGATAAGAAATGTATGCCATAAAAATCTGGTAATAAAATG
TTAGACTGTGAGTCTGATTTATCGCGGTCGAATTGCAGGCGGTGTGTCGA
TTGTACAAAAAACAATAGAGAAATATTACTTGTAAAATAGCACCGCAACG
TAAGATTTCACGCATCATTTTCATGGAATGTGTTTTAAATACTAAACACC
CGTAGTGTGTAAATGTAGAATTTCCACCAGTACCTACCTTCAATATCTAC
GAGTAAAGCGCGTTCGTCTTTCTGATTGGCCGGCTCGACTGATTCAAATC
ACAGCGCCGAACACGCTCTCGTTTCGATTCCTTTAAATGTATAGCACACT
CACACTAAGGGTACAGGTTACTGTTAATTTCAGACTTTAACCACGGTATT
GGAATTGAAACCCATAGTAACTTACATAGGACCATTTTGTTTGTGATGGT
ACCCATATTCGACCATGCAATAATGTAATCATGGAATACAGGATTTCCTC
GAAGTGAGTGTCGATATATTCACCTTTAGTCGACATTAAAAGTCTTAGTC
TCAATAAAAAATAAAAACAAAATGATTTAAAATTTAGCTTTTTTATAGTT
TGAAAGGTCGTTTGTTCGAGTTCGCCGGGTTTGCTAGTTACATCTAAAAA
CATGGATATAAAAATAATAAAGAATAATAATTCGAATATAAGTCGGTATC
TACTAGCAATGTTCTATAGGAAATGAAATTAACCACAGCATTAGGAATAA
AATAAATAAAGAATGTAAAAAAAAAAACTTAGAGCACAGAATACTCGTCT
ACCACCAGTATTGATTTAAAATAACGCAATTAGTTTTAACACAAATTATT
CACTTCCGTCCTTTTATTCTTTTTTAAGATCAAGGATATTATTAGTCTAC
TCGTATATTAAAGATATATGTTATGTATCAAGTTTCGGAACTTGATAATC
ACTTATCAATGCCGTGTTTTTTGGATATGTTCAGAGATGTTTATTTAGAT
TTCTGCGATGTGAATGGATAGATAATATGAACGTATTAGGTATATAAGCA
TATGGGATGTATACAGCAAAGCTTCAGCGTAAAATATCACTAGGAAATAC
AATTCCCTAATTGATTTAACAGTGTCACCAAAATGAATGATGAGTTGGTA
CCTCTTTATAGGAAGGATTGAGGATTAAGTAGGTATTTAATTATGATGAT
AATGACAGTTATCATTGATCTGTTTGCAGAGAAATTGAGAGAAAGGTTAT
CAATATCAATGAGATATGACTAATTATGTAAGGGTTAATTAAGTCAATGT
TTCTGTTTGATCATTGCCTTTTTATTAGAATAGTATCTAAGTAGTACTAG
TACTAGTACTCGTAGGTATCTAGTATTACATAAAGACGTACCTACCTAAC
TAAAAAAAATGTGAAATGTTTCGTAACATTATGAAATTGATTATTATCTG
TTCGTGATAAGATTTATCTTATGTTCATGAAATCGTAGACAGTGAGCTTT
TTCATGATTTAAGTACGACTGTTCTACACTCCACTCCCGTAGGTAACTAT
CTGTTATCTTTGGCTGAAAGGCTAATTGATCTAAGCGAATTTTTTTACGA
AATTGAGTTGAAGCTATAATCGGAATCAGTGAACTTTTTCCATCGAATGA
TCTATATAACTTAATATTGCTAAAAATTGTCGCTTGGATCAATTAACCTT
TCAACGGACGTATGTTACTTAACATTTAAGTAAGTAATATTATACTTAAA
AAACTACTGATTTCGTTTGGAAATAATACACGATTGGAAATACGGAATCC
TTGACGTACCATTTGCACATTGGCTTGCCGGTTCTTCACAGGAATCAGTA
AATAAGTAGGTAGGTACTGTCAGTTTGTTTATTTAAAACAAAATCTCAAA
TTCCCCAAGTGTAAAATAGTTACGCAACATTGCACAATATCATGAAATCG
ATCATTTTTTGAGATAATATGCATGTTTTTCTTACATCTGTCTGTCAGAT
ATTTTTAAACGCTACAACTAAGATAAAATAGACGTCTAATTTATATCCTT
AATAGAATCACCATTTTATTAATATTTTGGGTATTATCAGTAGTTCCCAA
AGTTATCTGGACTACGACCTATCTAAATTAAGTTCCTAAACTGAGGACCC
ACCTTCAGGGAATTAAACCGTCATCAATATGAACAATAAAATACAAAACG
GTTGGTTAGTGTGTTTTTCTACAGACAAGATTCACTAGAAATTCGCTTGC
GACCCACCAATGAGTCGCGACCCATAGTTTGGGAAGCCCAGTATTAGATA
ATACATGAACTACATCTTATGCGTTTGTAAATGTAATCGGACAAACTTTA
TAAATACCTCAGCAAGTAAGCACTCACTAGATTCTAGGTACTAATTATAG
TCTAGCGACTGGACTACTTAGTTACCTAGCAATAAAAAGTTAAAGGTAAT
TAATTCAACAGTCATACCTAGTTAGAGGTTAATTAATTGGCAAAAGTACA
GTATTATGTATTTGTGTAAGATTTATTTATTGGCAGGAATATTACAACAT
TTTATTTGCTTCATGTAGATATAGACTATAGAGAACAATCTTTAAAGTAG
ATACTGGGATGAGAGAAGAATTAGGCAGTCATCGTTTAAAAGTTCACCCG
AAATCTGAAAAGGTACCTACAAAGAAAACGAAATACACAAAAGTCTGCTC
TATAAGGACTATACGCAGTTGCAAAAGCGGCTCGGGAATAAGCGACCACG
AGGCCGCCATGTAAATCTGCTTGTGAAAAATCGCAGATAAAGAAATTTTA
AACATTCGTCGCTAGTTGTTGACAAATACGGTCGAGACACTCATTGCCTA
GTCTCAGAGGAAAATATTTATAAAAAAATGCGAAACCGGTCTGTTGTCGC
CGACAGAATCTGTGACTGGCACTGGCCATCTCGTTCTTGTCTATCGAAGG
TTAAACTTTATAGGTATGTTCATATGTTGTACTTTCATTGGTTCATCTCG
AAGGTTGAATAAACTCTGCATGAGTGTGTACGTAGGTACTTGTTTTAGCT
ATTTGTAAAGGTAAACTTAATAGTCTTAAAAGATATGTCGACGGCAACTT
TAAAGGCAACTCTTTTTTTTTCTAAGCCTACTCATGCTAGAAATTGAATG
TATCAAACAAAGTAACTCTTCTAGGTTTTGTAGAGTGTTATATCGATATT
CGATAGCCGATCGGGCCATGGTTTGCGTGAATATATTCTAAGTTCAGTTA
GCTCTTAGCTTGCTCTCGATCGTAGAGATGAGTACACCAATGTCCTCACA
GACAATCTTGTTCTATTGACACACTTAGATTAGATTAGATTAAAGTAAGA
TTCTGAAATGTAACACACCATTATTTGCTCTATTTACTCAGTATTTGCAT
TTCAGTAATTTTCGTGTGCTAGTCATTACTGTAGGAAATAAAGTTGCTTA
GAATGTGTGTAATTGTACCATCAGTGACGTTATAAATTGCTTATGTATGT
TCATACTAAAGAAAATTTTGTGAACCTAATACCTAGATTTACCTGTGCCT
ATAAAGGTATTACCTATGTACATTGATGTATAAAACATCATACATGGGTA
TGATACTTTAACACTTTAAGATATCTTGGATACCATCAGGATTGAGTACT
ATGGATTATGTTTAGATTTCTATACAAGTTTGTAATTATTATGATAATAA
GGTAAAATTATGAGAAGGAAAACGTGCAACAAAATGTTCTGTATCAGTAT
AATCTACAAAGGACAATTACTTACAATATTACATTAACATCTTTATGAAA
TTCCCAATACCGAATACGCCAATGACGTAGCAACGCAGAAATGCACAAAC
CTTATGACAACATTGGCAACATTTCGTGTTATTTTAGGAATCTTAAACAA
ATGTCTAAATTAAATCCTAAGTACAAACAGACACCAAAAGTTACTACTTA
TGTAGTTTACACTGATATTATATGAATCACTCGTCTGTTAGTTTACTGAT
TGTGAACATTTCTCGAAACTTGAATCATTCTTTATTTTATGTCTATAGTA
TTTTTACTGCTAGTTTAAGTTTATCACTAGATACACTATACTTACTTACC
TACTCTCTTTATATCGTGTAAAGAATTTTTTTTTTGGAAGAGTGTACCTA
TTATTTCTGCTTACTAGTCTACAATATGGAACCAGCACCTAGCCTCACTA
CTACTGCGGACTGACTAACAGGTTACGGGGGCTCGGGCTCGAAAAGCAGG
AGTAGGAACGGGGTGGTTTTTAGTCAGTAAGAGTCTGACACTCCCTCTCG
TCTCCCTCAAGGTTTGAGAAGTCTTTGGATGATTTCCTCCCCTTTAAAAA
CAAGCGTCATTAACAGATAGACTAACAGCGAATCCTATAATATCGTTTCA
AAGAGCACCTATGTGGTTTGTTTGAAAATCTTTGATATCGGTCATTATAC
TATATATCTACATAAAAATATATTATAGGTAAGGGGATCTACAGGAAAAA
TAGCAACCATAAATGAAACGGCTAACCACAAAACCAAACAAGCTCTGTAC
CTTTAGCTAGGAATGTTCTAATAAAATAACAGGACCAGTATTTCTTTACC
TACTGGAAAATTACCTAGTTTCTAAGAAAAATTGTGTAAATATTTCCTAC
AGTACCTAAGTACTTACACCACTACGAACTACGAGTATAAGGTTGGGATG
ATTGATTGGATTCTATTTCACCAACAAACAAAACTGCTTGCGTAATAAGT
ACTTTACGAGTGTTGTAGCCGTTCATGTTATTTCACTGATTTGCGTATAA
AAACCTTTTTGTTAGTTCTTTTCATTTCATTTTACTACCGGCATGCGGTA
TTTTTGAGAGTTTATTTTAGTTCTGCTTGGTTGGTTCAAATTTCGTGCTT
AGCAACAGGTTCCACTATCATATTGGAATTAAATTATGATTTAGGTAGGT
ACATTACTGTATCTCTCTAAGAGATACATATGACGGTACTAGGTACTGTA
CATAAGGAATTACGTCCGATATTTGACTGCACTCGCTTAATGAAAATGTA
GTCTTTAAGTAGTATAAAAAAACATTACAAGATTAACCTAATGCAGCGCT
TCGCGGAACAATAGATAACTAAATATTTACATATTCTCTATTTCAGATTT
AATTGCAGATAATTTTATTGACTATCCAAGCCTATCTCTCTATATCAAGC
ACACTATCAACAGTACTATAAAAGCTTTTATTTGTCTTTATTAATTCCAC
GCGTTTGATAATTAACGTTTGTTGTTACAACACAGATCTGTAGCGATGTG
CCACCGAGGCCTGAGACCAATGGGATGCGCTCACCAATTTGTCGCGATAA
ATACTCACAAATTGATTCTTAACAAGCCTAGATTGAAATATTTTAGAATC
ATGCATTTAATATCGACAGGCTACATATACCATAATTTTAACTTAGGTAC
CGTACTTAGTTTAAGATAGACAGTAAGTAAGTTAAGAAGTACCTAATGTA
TCAAGCATTTATTAGGTTCCCAAAACAAAGAAAGTTTGAGTGTATTTAAT
TTGTCAAATTCATCTTTTCGTAAATCGCTCGTAGAAATTTGCTTAAAAAA
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CATTTCGGCGAAATGCGATAACTGCGGATAGATTTTAAATACATATAAAT
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ATGATGAGTATATTTGAAGGTCGTGAGCGCATGCGCACTGTTGCGGGACT
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GTCATGGATATAAAAGAAATATTATTATACCGTGGCGAACAATATTCAAA
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ATGTATCGCATGTAGGCATTGCTGACGATGCGGTCCGCACTATGCGGATC
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CGAGGACGTCGCGCATGTTACTAGTCATTATGGGCCCCTGTCGTGACTTG
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TTTTTGGAATAGTTTCAAAGTATTTCTAAGCTAATTAGCAACAATTTATT
TCGTTTTTCATTCTTATCATTTGACTTTGACATTTTGGAATAAGTACCTA
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TACACGTGCGTCTACGTCCTCTACCATAGTAGACTTTAACAAAAAATATA
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CTATTACCAGAGCTACCTGCACCCCGGTACAATGTGTGTCGCTTGGGGTA
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AATTCACGCTCGATACTACGCCACTGACGTCATTGTGTGATTTGATTACT
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Coding sequence (CDS) from alignment at SFRU_RICE_026934:188..18826-

>SFRICE020554-RA ID=SFRICE020554-RA|Name=SFRICE020554-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=CDS|length=2748bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_026934:188..18826- (Spodoptera frugiperda rice)
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TCGTACGGTCGTTTTGGCTTGAATATCTAATGCCATTAATTCCATACACG
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TACGATCGCATACGTTACAAAAAGGTCGTGAGCGCATGCGCACTGTTGCG
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TGTTATAGACAGGCTGACATATACCTACTGGACGACCCCCTCTCGGCAGT
GGACACGCACGTCGGTAAACACCTGGTATCAGAATGTGTGATGGGTTTAC
TAAGACATTCTACGAGGATCCTGGTCACACATCAGCTACACCATCTCAAG
TCTGCTGATAAAGTCGTCATCCTACACAACATAATACAGATTGAAGGTAA
GCGTCCACAGGCCCGCATCGTACGCATCGCACGGATCGTACGCATTCCGT
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Synonyms
The feature 'SFRICE020554-RA' has the following synonyms
Synonym
SFRICE020554-PA
SFRICE020554
maker-SFRU_RICE_026934-snap-gene-0.6-mRNA-1