Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
AED | 0.01 |
QI | 0|0|0|1|0|0|3|0|139 |
eAED | 0.02 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AG6000769 | AG6000769 | Aphis glycines Ag_bt1 | gene | SBAphidCtg1001 6204598..6212748 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
AG6000769-RA:cds | AG6000769-RA:cds | Aphis glycines Ag_bt1 | CDS | SBAphidCtg1001 6204598..6204707 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=mRNA|length=420bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC AGCTCCTCGCATTTTTACCAAAAATATCAATGACAACCTTTAAAAACTAT AATTTTGTTTACAGGGGATTCGGGTTCGTTACTTTTGCTGATCCGTCCAG CGTGGACAAAGTTCTGGCACTAGGATCACACGAGTTGGATGGCAAAAAAC ACGTCACTTACAAAGGTTTTGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGT CATGTAATGCGCTATTTAGATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAA TTTTACACCACCGCTGAGACGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGT TTGTAATTAATAAACCCTAG back to topprotein sequence of AG6000769-RA >AG6000769-PA ID=AG6000769-PA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=polypeptide|length=139bp
MLGNGFRDGGNVFTNNTFHAKTEHKSTVSPRLLQLLAFLPKISMTTFKNY NFVYRGFGFVTFADPSSVDKVLALGSHELDGKKHVTYKGFGVRRTTIKLG HVMRYLDNDRRVAEGVNFTPPLRRFQTSPAKRSFVINKP back to topmRNA from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=mRNA|length=8151bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1) ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC
GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC
AGCTCCTCGCGTGTGTTCTGCCACCGTTGCACAAGTCTCTCGCACCCTCT
CGCACCCCCTTAACCCACGCACTACTCTCTTTACCAACACCCCACCTACC
AACGTTCTCTCTGCCCTCTGTGCGTTCCGCTTTGTGTATGATTTAAGGCT
CGAACCCTTTATTATATACGGTTTTGCATCCTATGTATTATGTTATACAT
CTCACCGCTGTTTGATTTGCTATGCGGCTCTTTACTTTTTGTACTAACCG
CGCACTAGCTCGTTCTACGCGCTAAAGCCGACAACGGCCAGTTTTTATGA
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GTTTGTTATGTATTGTTTTTCAACCGTAGTCTTTCGTTATTTGATTGTGG
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AACCAGCTACCTTGAAATGTTATTTTTTGAGTTACCTACGGAGAGAGAAA
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TTAAATTAAAATACTGTACCTACTATAGTAATGTGTATTACAAAAACCCA
TATAATATTTTACATCATCACAGTGTTACTTCGATTGCAACTCAATAGCC
ATGGTGATTGGGGTGGATGATTCTAGCGTCCCCTTTTTGCAGGTAAGGCG
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TCACATGACGGACTGGCGACTTTCCGGCCGGTTTCATCCCCACCCACCGA
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GGAAGCTACTGCTTGCCTTTTTTTAGTCACGAGTGTTTTCACTTCACGGT
CTATTACCAGCGTGGAATAATACCATTATTAAATGCAGTCGAAGATGTTT
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CTACCCTTTCCCTTTTCCATGGTTATTCATTAGATGAGTGCGTTGTTATG
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ATTTATATATAATATATATATATATATATGTACATTCGTATAAAATACAG
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ATTGCACGATTGTAGGGGGTGACAAACCGTTAGACGTCCGTAAATCTAAT
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GGAAAAAATATAGGGTCTTACCAGAGTCCGAGAGATCAATTAATTAAAAG
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AAGCTGCAGGTTTTCGAGAGATAGTAATTCATTTGGTATTTTTCATCGTG
GACGGGAAGGACGCAAGAGATTATCCTATACGGTTGTATGGTAGCAAGAC
CGTATGACGTTGTTCGGAGTCACGGTCGATTATTACCACACTGGCGGTAG
TTGTAGTGATGTCACCCTACCGCAGAAACGACAGTTTGATTAAAAAACTC
ACCTCCACCCTTAGATACATGAACTTTTGTAGACTAACCTTTACTTTTTT
TCCGTCCCTTCGGCCACCGTTCAGGTTCTATACCCACCCAGTTACCAAAT
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ACCTTATACCTACCTACCTACGTTTCCTTTCCATTAATAATAACTTATTT
TATCCAATAGTGACTTTTATATCGGAAATTGATTTTGTTTCACCACCATT
GGGCATTTAGAGTCGGCTGACAAGTTTTCATTTGTGAATATTGTGAGAAA
AAAAACTCACTCAACGTAATTTTATCACAGTATTTTTATTATTATTATTA
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GTAAACTACCAAGTTTTTACCCTTTACAATAATGTAAAGAATTTCAAAGT
ATTTTTTCCGGCACCATTTCAAATTGAATACTATAATGGTCGTCTTGATT
CTTGGTAGTCAATATTATTATTCTTACATTATTTATTCAATTTAAATCAT
TAACCTTTATAGCTTAAATATTCAAGTATTGATGATATTTAAATATTGTT
TTATCGTTAAACTTGTTTTCAATTAAAGAAAAAAAATCATAATAAATAAT
GCAAAGAAGTCCACGTTCTATTAGTTTATAATCGATTGTATGACACATTT
TGAAGAAGTAGTAAAGTTTTTAATAACAACGAAAGTAATAGCCGTTTAAT
ATTGACAATTATTATATTTTTTATTGTTGAAAATATGGAAATTGAGCAAC
TAAACACCGTACTGGTTAAAAATAATATTTTCGGTGACCGCGTTGAAAAT
TTGTATTGTACATATGATTTTTTATGTGAATCTAATGTTAATGTCTATGA
ATCCGTTTTTGTTAGATATGTCTGAACAACGCGTGACGTACATATTCATA
ATAAAATACAATACAGTTTATGGTTTAGTATTGTATTTGTATATATATAT
GTAATATAATATATTTATTAATCTTGTAATGTGTATAATAAACAGAAGTT
TATTGTTGTTATTTGAGATGTGTGATGAATGTAAATTATATTTTCTCCTC
ATCCCTTCCAAATAATTGTAAACTTAGCTTTAAACGCACACTAATAATAG
TCAACTGTCGACGAAATCATCAAAAGTTAATTTTGTTTTATGGTCAATTA
TACAAACTGATAAGTTTTTTCTAAAATTATCCGACGCATTTATTTTTTAT
TCATTATATTCATAGGTTATAAATCGTACTTTTTTTGTGATTGTAAATAA
GGGAGCAATATTATTAAAGATAGAAACTAATATTCTACTCTGATAATAAT
GAAGAATATCAGAAATTGCAATGTATTTTTTTTCACTTTGATAACTATTT
TTTGCGGTATACGGTGTTACGTCCGTTTAGCACGTCACTTACAAAGGTTT
TGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGTCATGTAATGCGCTATTTAG
ATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAATTTTACACCACCGCTGAGA
CGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGTTTGTAATTAATAAACCCTA
G back to topCoding sequence (CDS) from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ >AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=CDS|length=420bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1) ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC AGCTCCTCGCATTTTTACCAAAAATATCAATGACAACCTTTAAAAACTAT AATTTTGTTTACAGGGGATTCGGGTTCGTTACTTTTGCTGATCCGTCCAG CGTGGACAAAGTTCTGGCACTAGGATCACACGAGTTGGATGGCAAAAAAC ACGTCACTTACAAAGGTTTTGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGT CATGTAATGCGCTATTTAGATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAA TTTTACACCACCGCTGAGACGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGT TTGTAATTAATAAACCCTAG back to top
Synonyms
The feature 'AG6000769-RA' has the following synonyms
Synonym |
maker-SBAphidCtg1001-augustus-gene-62.1-mRNA-1 |
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