AG6000769-RA (mRNA) Aphis glycines Ag_bt1

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Overview
NameAG6000769-RA
Unique NameAG6000769-RA
TypemRNA
OrganismAphis glycines Ag_bt1 (aglycines_bt1)
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
SBAphidCtg1001contigSBAphidCtg1001:6204598..6212748 +    View in Apollo
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly (v6.0) and Annotation OGS6.0 of Aphis glycines, Biotype 1 (Ag_bt1)2018-01-26
Properties
Property NameValue
AED0.01
QI0|0|0|1|0|0|3|0|139
eAED0.02
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
AG6000769AG6000769Aphis glycines Ag_bt1geneSBAphidCtg1001 6204598..6212748 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
AG6000769-RAAG6000769-PAAphis glycines Ag_bt1polypeptideSBAphidCtg1001 6204598..6212748 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
AG6000769-RA:1AG6000769-RA:1Aphis glycines Ag_bt1exonSBAphidCtg1001 6204598..6204707 +
AG6000769-RA:2AG6000769-RA:2Aphis glycines Ag_bt1exonSBAphidCtg1001 6207420..6207558 +
AG6000769-RA:3AG6000769-RA:3Aphis glycines Ag_bt1exonSBAphidCtg1001 6212578..6212748 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
AG6000769-RA:cdsAG6000769-RA:cdsAphis glycines Ag_bt1CDSSBAphidCtg1001 6204598..6204707 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=mRNA|length=420bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC
GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC
AGCTCCTCGCATTTTTACCAAAAATATCAATGACAACCTTTAAAAACTAT
AATTTTGTTTACAGGGGATTCGGGTTCGTTACTTTTGCTGATCCGTCCAG
CGTGGACAAAGTTCTGGCACTAGGATCACACGAGTTGGATGGCAAAAAAC
ACGTCACTTACAAAGGTTTTGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGT
CATGTAATGCGCTATTTAGATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAA
TTTTACACCACCGCTGAGACGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGT
TTGTAATTAATAAACCCTAG
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protein sequence of AG6000769-RA

>AG6000769-PA ID=AG6000769-PA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=polypeptide|length=139bp
MLGNGFRDGGNVFTNNTFHAKTEHKSTVSPRLLQLLAFLPKISMTTFKNY
NFVYRGFGFVTFADPSSVDKVLALGSHELDGKKHVTYKGFGVRRTTIKLG
HVMRYLDNDRRVAEGVNFTPPLRRFQTSPAKRSFVINKP
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mRNA from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=mRNA|length=8151bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1)
ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC
GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC
AGCTCCTCGCGTGTGTTCTGCCACCGTTGCACAAGTCTCTCGCACCCTCT
CGCACCCCCTTAACCCACGCACTACTCTCTTTACCAACACCCCACCTACC
AACGTTCTCTCTGCCCTCTGTGCGTTCCGCTTTGTGTATGATTTAAGGCT
CGAACCCTTTATTATATACGGTTTTGCATCCTATGTATTATGTTATACAT
CTCACCGCTGTTTGATTTGCTATGCGGCTCTTTACTTTTTGTACTAACCG
CGCACTAGCTCGTTCTACGCGCTAAAGCCGACAACGGCCAGTTTTTATGA
CGACATTGAATTCACGCCCACGTTGTAACCTATAGGTCCGTTATTTGAAC
GAAACCCTATGCAGCTGTAGAATCCACTGTCTAAGCTGTTTTCACTGTAG
TCGTCATCCACGAAACAAAACGTCAGACCTTAACCGTCATCAACGAATGT
TGTGTTTATAACACAAATTATATGGATATATCGTTGGACGTGGAATGAGG
GGGTGAACTCGGAATAATAGTTATTAAAAATGAATTACAACTTATGAATA
TCATAATATATTATAGGTACCATTTGGGTATTAAGAACTATGATTGTAAG
TTATATAGTAAGATTATTTCTTAATTAAATTGTATATTTAATTTAAAATA
AGTAATTCAAGATAATTATTTGCGATATTGACACACTTGATATATTTAAT
TTGACTGAAATTACTATACACAAGATTTTCATAGATTTATAGAAAACAAA
AATGTTTTTTTATGTATAGTAATTCTATGATTTATTGTCTAAATTGACAT
ACTTGTTAAATTCAATTATTATGATTAGATCTTATAAAATGGTATATTAT
GCTAGGTACCACTAATTACCAACGCATTATACACATCATTTAAAGTTAAT
ACCTATTTTATGAACTTAAAAATATAAAAGAAAGTTAATTAAACGAAATT
GTCCATCATTTAAAAAATTGAAAGTACCTATGCTTAAGCAAATAATATAT
TTATTTTACATCAATTATATAATAATTATGTTTTGAACACATAACTTGAA
CATTTTTTATGTAGATTGAGAATTGTAATGAAATAACTTAATATGTTACA
CAGTTTGTTATAGTGGTTATTTTGAAAATTAAATTGTAATTATTGAGCAT
TTTTAATATTCTATACTTCATTTTAACAGCATTATAATTGTTTTTATTTA
ATGATAATTAAAATACTTAACATAAAATAATATTTAACAAGTTTTAAAAT
TTTTTTAATAGTTATATTATTTACAAAAATAATAATTATAGTACTCAAGA
TATAAAGAACGTTTATGAACCTACTAAAATAATATTTTTTAAAGTTGAAT
ATAATCGGTCTTTGCAAAATGCACTAACAATAAAACTAACGTATTCAAAT
TCTTTCCTTAAATACATGTATTGAAAGTTATTGTACTTCATATTTTTATT
TTTACTAACCAATTAACGTTTTAATTTCTTAAACTGTAACATTTTTTAAA
TTATCTATTTAATGTTCGAAATTTCTCCATTATTTTCATTCCATGAAACA
TGTTTATTTTTTTCATCACAGTCAATTATTGTTCTACTTATTTGGACATA
CTGTTTGATAAAAAAATATTTAAATTTAAAAAAAAATTAGATCATAAACA
AATAATAATTTTAAATTTAATATTGTATTAACATTTTGGCTACTTTTAAT
ATTTTGTTTTAAATTTATACAAAAATTAATATATATGTAATAATAATAAA
TTATACTAATTTTTTTATTAAATACCTATATATTTAAGTTTGTAATTTAT
ACTAAATACCAACGTTTTTATTAGAATAAAGCTTGTATGGATTAAATAAA
AAATGTTTCGTAAATAATTAGTTGACAATTTTATTAGAATATGGAATGAT
AAAATGTAGCTTTCATAATGAAAAATTCGAAATTTGTTTGAAGAAAGAGT
TGATCAAAGAAATGATGAATAGTAGTGTAACAAGTGAACAATGTTAAAAA
TTAAACATTCAAAGTAAATTGCATGAGAGATGAAGGAATTATTGAAGATG
TTTTAAATTTAATTATATGCTGATACATGAAATTAAAATAGACGCCATGT
ATATCATGTGACAAAATATCATAACTGAGATTAACTAGTGTACGTATAAA
TAATATAGAGCTGTTGTGTCGTAAGAAAATGTAATGTTTAACATTCAAAG
CTAATAAGAAGTTGTACATTGTGAAGAGTTTATAAAATTAATATAATTTA
CATTTGCTATTATGATTTAAAGGTTGTATATATATGTACAAATAACATCA
ATACAATATAATTTTTAAAAAAAAAAATCAATAGTTAATAATATAAAACA
ATAAATATTACAAATAATAAGAGATAAAATAAAATTTTAAATAAATTAAT
AATTGTAATTTAATTATTATCTTTTAGTATATTGTGTGAAATATGAATTA
AATAAATAACAGAAATATAAGATCGTCGAGGCAGGTTATTTTTCTGTAAA
CATTAAACGTGTGTGTTGAGAAAATGTATAAAGAAACATATTTATATAAT
ACGTGTTTATTTAAAATTTTAATTTATTAGAATCAAAATTGTATTATTAA
ACATCAGTCAGTTATGGTTCCGGAAATACTTTATAAAAGCTATTCTTATT
AAACTTAAATTGCGTGAGGTTTAATTGAGTAAGAGAGCTGAAAATAATAC
TAATATTATATAGATTTTCTAGATTTTTACCAAAAATATCAATGACAACC
TTTAAAAACTATAATTTTGTTTACAGGGGATTCGGGTTCGTTACTTTTGC
TGATCCGTCCAGCGTGGACAAAGTTCTGGCACTAGGATCACACGAGTTGG
ATGGCAAAAAAGTAAGTAAACAAACTGTTTTTTTATTTATTTATCTAATA
TTAAGATTTCAAAGACTCAAAAACATAAAAATAATAAGATCCCAATGTTT
TCATTGTTGGAAAATATTTGTTTGAATTTTATGGGTTTAAAAGTTAATAT
AATCGATTCATTATTTTTAATGTTTCCTCAAACACATATTCATTTAAAAA
TACAATAATATTTTTTTCAAAAAATGTAGTTATATATAATATAATATTAT
ATATGCACGTTTTGTTAATATAATATCTTAAGTTTAAATAATAATATAAA
AAAAAACACATTATTTTAAGATCAAAACCCATCAGATAAAATTTACATTA
TAGATTCTGCGAAAACACAAAATGAACATCGATAATCCCATTTTATTTTT
TATGCTTTTTTTTGTACTTGCAAATTGCCTATTTAAAAAATACAATATTT
TTACGATTGCTATCTCGGAAGGTTTTCATATTCAATATGACAAAATAATG
ATGTCGATAGAAATCAGAAATATAATATTAAAATAACTTTATATGCGAAC
GTTTGTTATGTATTGTTTTTCAACCGTAGTCTTTCGTTATTTGATTGTGG
ATTATAGTTAAGCTCGTTTGTTTTTGTCGGTGTACCAAAATTTATAATAA
AAATCAACTATGCATAAGCTAATGACATTATAATATTATGCGAGCTTATA
TATTATAATATAAAGATCATCGAGAGAGATGGAAATATGATGAATAGGAA
ACGACGAATATATGTTTGCTCTATCTCGTGTTACTTTCTTAAAGTATTTA
TATACTCGTCGGTAGATTTGGGTTAGCTATTTTGCTTGGAATCGGATTAT
AACGCCACCACGCCTCACCATATAATGGAATAAGATTCTTAAACCCAAAA
TCGAGACTGTAATCCATGTTTGATATAAATGACGTTTATACCCGATTAAA
CGGCGATAGTGTGTTTGGGTTTTTAAATAAAACGTATATAACTATTACAC
AACCAGCTACCTTGAAATGTTATTTTTTGAGTTACCTACGGAGAGAGAAA
AATGTAATTAAATACTAGAAAAACCTAGTATTCAACCATAGAAATGTATA
TTAAATTAAAATACTGTACCTACTATAGTAATGTGTATTACAAAAACCCA
TATAATATTTTACATCATCACAGTGTTACTTCGATTGCAACTCAATAGCC
ATGGTGATTGGGGTGGATGATTCTAGCGTCCCCTTTTTGCAGGTAAGGCG
GGCGGTAGTGATGGGCCAGTTGATAGAACTATAGTGGTGGTGGAGGGTGA
GATTAGCTCGTTTAAGTAAAGACCCGGCTGGCAGCCTCCACTCTGGCACT
GTGCTCTGGTATACAACTACGCTTGTCTCATCGTCGTCGTGAGAATTTCT
TCACATGACGGACTGGCGACTTTCCGGCCGGTTTCATCCCCACCCACCGA
CACTCCCGTCATCCGTTTCTTTCGGCGTTGTCGTATATTGTATTCTTCTT
CTTGTCCCTCTCTTTTCGTCATAGTTTAGCGATTACCGCCGCTACCACTT
TACGTCATTCTGCACGCGTTTTTAATCATTGTTTCTCTCTATTCAGTTTA
GGAAGCTACTGCTTGCCTTTTTTTAGTCACGAGTGTTTTCACTTCACGGT
CTATTACCAGCGTGGAATAATACCATTATTAAATGCAGTCGAAGATGTTT
AATACATTCGAGTATACAGCTGTCAAAGCGCCTCGTCGATTCTTTAAAAC
CTACCCTTTCCCTTTTCCATGGTTATTCATTAGATGAGTGCGTTGTTATG
AGTGATTTATTAAGAGCCTTTAAAAATAATAATAAAATATTGGTGTAATT
TTAAGTATTATAAAATCCTCTTTGATAGGTATTTAGAATATACAAAATGG
TATCTGGTATACGTTAACTTACAAAGATAGTAACCTACGGATTTTCGCTG
ATTTATATATAATATATATATATATATATGTACATTCGTATAAAATACAG
CTACATATAGTACTTTCGTTTCATTTTAAATTATAAATTGTCTATACGTT
CCATTTTGAACAGTATTGTATATGGGTAGAGATCAGTTTAATTAATGTTA
TCAAAGAAGTCATTTGAAAAGTTCTGTAGAAATTGTTAACTTTGTATTTG
AACTGTGCTATCAACCATGAGTTGACGGTTCATTTATAATCAGTGGCCAA
CCTGAAATGGACACAAATAGATTTATTTTGAGGAGACCTTGTAGCATGAT
CAAGTGATTGAATGTCATAGGCAGAAAACATGTTGTATACAGTGAAATTG
ATAAAATAGTTTAACTGTATAAGGTATATATTTATATATATTTTGATGGA
ATCATTATATAAAATATAATATTAGCTAATAGTAGTATAGACGTTTTATA
ATTAAAATAAAATCAATTTATTAAATTATTAATAATAAAAACATTTATTA
TACTTTACAAAAATATTAAAATGTTTTTTTAAATAAATATAATAAAAAAT
AATATATTTATAAAATATCAAAATTGTTTAAAAATACTGTTATATGAAAT
TTGTATAATATATATCTTATTTAATATTAATGGAATTAAAACATATTATT
TAAATTTAAGTAATCATAGTTTGTTGGTGTAACTAAGATAATTATAATAA
TTTTTAAATAAAAATATAAAATTGATTTTTCAACGTTTATTAATAGTTAA
TTTAATATATTTTAATTATATAAACACGATAATATACTTAATATTATATG
AATTTATATCAGTTATTAATAATTTATAATTGTCTGGTGTATCAAATAAC
CATTTTGAAAAATATTCATTCGATTAATTAATTTTATTATTTGTATTTTA
TTAGTACAATATTTTAACTAAAGCAATAATTATAAAAAACAGTCACATTT
CATGAATTTTTATTTGAGGTATTTTACTATTAAATGCAAATTACAGTTTA
CAGTAATTCATAATATTATGTAGGTTGACAGTTTGATTAAGTGGTGGTAT
TTTTGATATCGAACTGCTGCAGAATTATATTATGATATGTGAGGTGATTA
ATGGGTAAATGCCGTTAGAAAGAGGTGACTTGATGGAAAAAGCTACCGCC
ATTGCACGATTGTAGGGGGTGACAAACCGTTAGACGTCCGTAAATCTAAT
TGGAGCTGGTATATACACCGATGGCCCAAATATTAGACGGGTATTACGAA
CAGATTGATGTGGAAGAGAAAAGAAGAAAAGTCAAAGTGGTGAGCAAGAG
GGAAAAAATATAGGGTCTTACCAGAGTCCGAGAGATCAATTAATTAAAAG
AGACACACGGTGACTGCGACGGTCGTGGAAAAAAGAGCAGTGGTGGTGAG
AAGCTGCAGGTTTTCGAGAGATAGTAATTCATTTGGTATTTTTCATCGTG
GACGGGAAGGACGCAAGAGATTATCCTATACGGTTGTATGGTAGCAAGAC
CGTATGACGTTGTTCGGAGTCACGGTCGATTATTACCACACTGGCGGTAG
TTGTAGTGATGTCACCCTACCGCAGAAACGACAGTTTGATTAAAAAACTC
ACCTCCACCCTTAGATACATGAACTTTTGTAGACTAACCTTTACTTTTTT
TCCGTCCCTTCGGCCACCGTTCAGGTTCTATACCCACCCAGTTACCAAAT
GTCACACAATCTGGTGCTGGCAATGAGAAAAATGACATTTGTTATCAACT
ACCTTATACCTACCTACCTACGTTTCCTTTCCATTAATAATAACTTATTT
TATCCAATAGTGACTTTTATATCGGAAATTGATTTTGTTTCACCACCATT
GGGCATTTAGAGTCGGCTGACAAGTTTTCATTTGTGAATATTGTGAGAAA
AAAAACTCACTCAACGTAATTTTATCACAGTATTTTTATTATTATTATTA
TCTTTTTAATTAAATACAAATCCATTTTAAGATAAAATAAATATAAAAAA
CAGCTTATTTCCTTCCAACTATTTGCCATGGATACATTGATTATGCCCGA
GTAAACTACCAAGTTTTTACCCTTTACAATAATGTAAAGAATTTCAAAGT
ATTTTTTCCGGCACCATTTCAAATTGAATACTATAATGGTCGTCTTGATT
CTTGGTAGTCAATATTATTATTCTTACATTATTTATTCAATTTAAATCAT
TAACCTTTATAGCTTAAATATTCAAGTATTGATGATATTTAAATATTGTT
TTATCGTTAAACTTGTTTTCAATTAAAGAAAAAAAATCATAATAAATAAT
GCAAAGAAGTCCACGTTCTATTAGTTTATAATCGATTGTATGACACATTT
TGAAGAAGTAGTAAAGTTTTTAATAACAACGAAAGTAATAGCCGTTTAAT
ATTGACAATTATTATATTTTTTATTGTTGAAAATATGGAAATTGAGCAAC
TAAACACCGTACTGGTTAAAAATAATATTTTCGGTGACCGCGTTGAAAAT
TTGTATTGTACATATGATTTTTTATGTGAATCTAATGTTAATGTCTATGA
ATCCGTTTTTGTTAGATATGTCTGAACAACGCGTGACGTACATATTCATA
ATAAAATACAATACAGTTTATGGTTTAGTATTGTATTTGTATATATATAT
GTAATATAATATATTTATTAATCTTGTAATGTGTATAATAAACAGAAGTT
TATTGTTGTTATTTGAGATGTGTGATGAATGTAAATTATATTTTCTCCTC
ATCCCTTCCAAATAATTGTAAACTTAGCTTTAAACGCACACTAATAATAG
TCAACTGTCGACGAAATCATCAAAAGTTAATTTTGTTTTATGGTCAATTA
TACAAACTGATAAGTTTTTTCTAAAATTATCCGACGCATTTATTTTTTAT
TCATTATATTCATAGGTTATAAATCGTACTTTTTTTGTGATTGTAAATAA
GGGAGCAATATTATTAAAGATAGAAACTAATATTCTACTCTGATAATAAT
GAAGAATATCAGAAATTGCAATGTATTTTTTTTCACTTTGATAACTATTT
TTTGCGGTATACGGTGTTACGTCCGTTTAGCACGTCACTTACAAAGGTTT
TGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGTCATGTAATGCGCTATTTAG
ATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAATTTTACACCACCGCTGAGA
CGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGTTTGTAATTAATAAACCCTA
G
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Coding sequence (CDS) from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+

>AG6000769-RA ID=AG6000769-RA|Name=AG6000769-RA|organism=Aphis glycines Ag_bt1|type=CDS|length=420bp|location=Sequence derived from alignment at SBAphidCtg1001:6204598..6212748+ (Aphis glycines Ag_bt1)
ATGCTCGGGAACGGTTTCCGCGACGGTGGTAACGTTTTCACAAATAATAC
GTTCCATGCTAAAACTGAACATAAATCAACCGTTTCGCCCCGTTTGCTGC
AGCTCCTCGCATTTTTACCAAAAATATCAATGACAACCTTTAAAAACTAT
AATTTTGTTTACAGGGGATTCGGGTTCGTTACTTTTGCTGATCCGTCCAG
CGTGGACAAAGTTCTGGCACTAGGATCACACGAGTTGGATGGCAAAAAAC
ACGTCACTTACAAAGGTTTTGGAGTTAGACGAACGACTATAAAATTGGGT
CATGTAATGCGCTATTTAGATAATGACCGTCGTGTCGCCGAAGGGGTCAA
TTTTACACCACCGCTGAGACGTTTTCAAACTTCTCCCGCGAAGAGATCGT
TTGTAATTAATAAACCCTAG
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Synonyms
The feature 'AG6000769-RA' has the following synonyms
Synonym
maker-SBAphidCtg1001-augustus-gene-62.1-mRNA-1