DV3001944-RA (mRNA) Daktulosphaira vitifoliae

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>DV3001944-RA ID=DV3001944-RA|Name=DV3001944-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=855bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold120:11893..14187- (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGCATAATCCAAATAATCCAACATCAGGAATAATCAAATTAAGTCATAT
GTTTAACACTTTGTCATTAAAAAATTTACCAAGATCGCTCGATTTAATTC
ATATTTGTATTGCTAACTCAAACTTAAATCCAACAATTGAAATTAAAAAA
GTACCAGTTTCGAGACTGCAGTCGAAGAACGCGAAATTTAAAGCGCAGAA
AACGAAAAATTCTTCCAGATTAATCAAGGGAAACTCAAAAACTATAAACG
ATAGCCCATTGAAATGTGTTATAAAAATTATGAACAGTCTAATCGAAAAA
GAAAATTCATCAAAATGTATGGTTGTAGTGATGTCTAAATTATACATTTC
TGTTTATTTATTACAAAATTCAATATTAATGAAAATAAATATTTTTGCAA
AATACAAACTCCGTGTAAGACGACGAGATCCACTTGAAGATCATGATACT
AATTCACAGGACAGTGGTTCTCTTACTGCTCATTCAGATGATTCTAGATC
AGTGTCAACATTATCTCAGAGCAATACATCATATACAGCTGATTCAGATG
ATGAATTCTTAGACATTGCTGTATCCCCAACAGAATCGTCTCCAGATTCA
CTTCTACTTGGATTCAGTACATTAATAGAAGGAGATATGATTAGCCAGTC
ATCAATTATTGTTAAAAGAAAAATTCCAAAATATTCTTCAGATACTCCTC
GCAAGACTGATTTATTGTTTGGTGATAATAAAAATAATGAAGCAGTTACG
AGAAAAAGAAAGTTGACACGTGATTTAGAATCAAATCCTGAAATTAATGT
ATTAATAAAGAAAACTAGACCTAGTACGAAATCTAAACCGGCCGAGAGAA
GTTAA
back to top

protein sequence of DV3001944-RA

>DV3001944-PA ID=DV3001944-PA|Name=DV3001944-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=285bp
MHNPNNPTSGIIKLSHMFNTLSLKNLPRSLDLIHICIANSNLNPTIEIKK
VPVSRLQSKNAKFKAQKTKNSSRLIKGNSKTINDSPLKCVIKIMNSLIEK
ENSSKCMVVVMSKLYISVYLLQNSILMKINIFAKYKLRVRRRDPLEDHDT
NSQDSGSLTAHSDDSRSVSTLSQSNTSYTADSDDEFLDIAVSPTESSPDS
LLLGFSTLIEGDMISQSSIIVKRKIPKYSSDTPRKTDLLFGDNKNNEAVT
RKRKLTRDLESNPEINVLIKKTRPSTKSKPAERS.
back to top

mRNA from alignment at scaffold120:11893..14187-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>DV3001944-RA ID=DV3001944-RA|Name=DV3001944-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=2295bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold120:11893..14187- (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGCATAATCCAAATAGTACATGTTTATTAATAGGGAATAATAGATCCAA
CATCAGGAATAATCAAATTAAGTCATATGTTTAACACTTTGTCATTAAAA
AATTTACCAAGATCGCTCGATTTAATTCATATTTGTATTGCTAACTCAAA
CTTAAATCCAACAATTGAAATTAAAAAAGGTAAGACAATTAAATAACTTT
TAAATCCTTATATATTTAAAATAATTAAAAAAAACGTTGATTGTTAAAAT
GGTAAAACAAGCTTTTTTTTTTGTAATTTACTACAATATTAATAAAGTTA
ATAAATTTTTACAAGAAAAAGAAGTAAAAAATAATCTTAATACTCATTTC
AAAGCCATTTTCAAGGGCTTTTTTAATACAAATATTAAAATCTTTGTAAC
ATTATTGTATTTGTATTTGTATTGAGTTCCTACTTAGGATGAGACACGGG
GACGTGTTGGAGTGGACTGTACACTTAACTTTTACGAATAACTACAATAA
TATAATTTAAGTTCTAGAATTTACAGTTATTATTAAATGAATAATATTAT
AATAATCATTCACAATTTTATATTTATGTGACACTTTATACAACATCAGG
TCAAACATTATTGAAAATTGCTTACCCAGACTATTAGTTGTACACTTACT
AATTAACTAACTAAATCGTACTAACATTAATACTACAGTAATACGGGTTG
GGTTAATTATTCATAAATTATTGTTGTTTTCAAATTAAAATTTAATACTG
ATCATTATATGTGTTTATATTCTATTTCAATATATTACTTAATGAATATT
TACAATATTAAAAATTAAAAAAAAATTAGGGTGCTGAAAAATCCTCATCG
AGGTCGCAAAAGATGTGAAACAATAATTTCTATTGAACAGTACCAGTTTC
GAGACTGCAGTCGAAGAACGCGAAATTTAAAGCGCAGAAAACGAAAAATT
CTTCCAGGTGACTCATATTTTGAGGGGTTTACGAAAATAGGATGTAGAGG
GAGTTAGAGAGAGACAAATTATTTTTTATTTATAGATTAATCAAGGGAAA
CTCAAAAACTATAAACGATAGCCCATTGAAATGTGTTATAAAAATTATGA
ACAGTCTAATCGAAAAAGAAAATTCATCAAAATGTATGGTTGTAGTGATG
TCTAAAGTAAGATATACAATAAACGCATGTAACTATTTAAATTTAACCTT
GGCTAATATATCAATAACAATTAAATTGTATAGATATTTTTATTATTAAT
ACCTTAAATAAACAAATATTTATTTAAACTAAATCATAAAATAATTTTTT
AAATCCTTAAAAATATATTATTTTATGTAAACACAAAACTTAAAAAGATA
TTTTAAATAATATAATTATACAAATTTGTATTAGTTATACATTGTATATT
ATTTGTACAATAATTATGTCAAGCAAGATTCCATACTGTTGTGCATTCTT
AAACTGTGAAGTTTGTATTAATAATATATTAACATTAATTAATCCCAGCA
TAAATTAAATCATTAACTTTAGTCTGTTTATTTATTACAGTAAATTTAAT
TAAATTTTTTATTCATCTCTAAACTGTTAATTATGTAATGTTAAATAGCT
ATAGTTAAAAAGAACGATCAATGTTAGATATCCAATTTACTATTAAATTT
AATAATTTTCTAGAAATTCAATATTAATGAAAATAAATATTGTAATTTAT
GGTTTTTAGTTTGCAAAATACAAACTCCGTGTAAGACGACGAGATCCACT
TGAAGATCATGATACTAATTCACAGGACAGTGGTTCTCTTACTGCTCATT
CAGATGATTCTAGATCAGTGTCAACATTATCTCAGAGCAATACATCATAT
ACAGCTGATTCAGATGATGAATTCTTAGACATTGCTGTATCCCCAACAGA
ATCGGTAATTATTTTACCTTTTAAAAAGGTTAACAGTTTTTTCCTAATTT
TATTTTATTTCTAGTCTCCAGATTCACTTCTACTTGGATTCAGTACATTA
ATAGAAGGAGATATGATTAGCCAGTCATCAATTATTGTTAAAAGAAAAAT
TCCAAAATATTCTTCAGATACTCCTCGCAAGACTGTAATTATTATAAAAC
AATTTATTATTGCAATAATCATAGATTTAATACGTGTATAACTTATAGGA
TTTATTGTTTGGTGATAATAAAAATAATGAAGCAGTTACGAGAAAAAGAA
AGTTGACACGTGATTTAGAATCAAATCCTGAAATTAATGTATTAATAAAG
AAAACTAGACCTAGTACGAAATCTAAACCGGCCGAGAGAAGTTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold120:11893..14187-

>DV3001944-RA ID=DV3001944-RA|Name=DV3001944-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=855bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold120:11893..14187- (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGCATAATCCAAATAATCCAACATCAGGAATAATCAAATTAAGTCATAT
GTTTAACACTTTGTCATTAAAAAATTTACCAAGATCGCTCGATTTAATTC
ATATTTGTATTGCTAACTCAAACTTAAATCCAACAATTGAAATTAAAAAA
GTACCAGTTTCGAGACTGCAGTCGAAGAACGCGAAATTTAAAGCGCAGAA
AACGAAAAATTCTTCCAGATTAATCAAGGGAAACTCAAAAACTATAAACG
ATAGCCCATTGAAATGTGTTATAAAAATTATGAACAGTCTAATCGAAAAA
GAAAATTCATCAAAATGTATGGTTGTAGTGATGTCTAAATTATACATTTC
TGTTTATTTATTACAAAATTCAATATTAATGAAAATAAATATTTTTGCAA
AATACAAACTCCGTGTAAGACGACGAGATCCACTTGAAGATCATGATACT
AATTCACAGGACAGTGGTTCTCTTACTGCTCATTCAGATGATTCTAGATC
AGTGTCAACATTATCTCAGAGCAATACATCATATACAGCTGATTCAGATG
ATGAATTCTTAGACATTGCTGTATCCCCAACAGAATCGTCTCCAGATTCA
CTTCTACTTGGATTCAGTACATTAATAGAAGGAGATATGATTAGCCAGTC
ATCAATTATTGTTAAAAGAAAAATTCCAAAATATTCTTCAGATACTCCTC
GCAAGACTGATTTATTGTTTGGTGATAATAAAAATAATGAAGCAGTTACG
AGAAAAAGAAAGTTGACACGTGATTTAGAATCAAATCCTGAAATTAATGT
ATTAATAAAGAAAACTAGACCTAGTACGAAATCTAAACCGGCCGAGAGAA
GTTAA
back to top