Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
AED | 0.87 |
QI | 0|0|0|0.5|1|1|8|0|145 |
eAED | 0.92 |
Full name | DV3016633 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >DV3016633-RA ID=DV3016633-RA|Name=DV3016633-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=438bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold584:74728..78371+ (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGAATAAATATACCTATAAATTTTATTTTGAGGAGTTTTTTATGACATC TTTGTTACAGTCACGGAGTTTATTGTCAATTATCACTAGCAATTGGTATA ATTTCTATATTGCCAGAATAGAGTTGCTAGCGTATGGTGAGCGGGGTGGG GTGAATGCGTTTCGACAGTCTAGTCTCAAGACCATAGACGACTGGATACG CAAGAATAATAATACGTGTCGCGTGGAAGGTTACAAACTTACAACAAACA AACATACATGTGAAATTAATATAAGTTTACACATTATTCTTGAATTATTA ACTATTTCATCCCTTATGCCTGTAATTGAGTGGTCTCAAGCATTATCACT TTTACCCGAGTTAAGAGTCGTCGAACCTTTAGACCTACTGTTGCGCCATG ACACTCCTAAATTAACGGTTGGCGTCAATAGCTTATAA back to topprotein sequence of DV3016633-RA >DV3016633-PA ID=DV3016633-PA|Name=DV3016633-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=146bp
MNKYTYKFYFEEFFMTSLLQSRSLLSIITSNWYNFYIARIELLAYGERGG VNAFRQSSLKTIDDWIRKNNNTCRVEGYKLTTNKHTCEINISLHIILELL TISSLMPVIEWSQALSLLPELRVVEPLDLLLRHDTPKLTVGVNSL. back to topmRNA from alignment at scaffold584:74728..78371+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >DV3016633-RA ID=DV3016633-RA|Name=DV3016633-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=3644bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold584:74728..78371+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGAATAAATATACCTATAGTAAATAATTATTAATTTAATTTTGCTTTTT
TTATTTGTTGGTGTTTATTTATAATTATTATATTAAACTATAATTTAGGA
ATAATAATAACAATAATATATTAATAATGCATTATTAATAAGTGCTTTAA
ATAAAAGACAAGTTGTTATTTTTATTATTTAATAATTATTACCTATATTT
TAAAAAAACCGATAACAAATTTAAAAATAAAAACATAAGATAAGGTAGCA
ATAGCCTGCTTGACCATCATAATTAAAACACCTAATTCCACACCTAATTG
ATTTTTCATAAATTCACAACTAGTGAGAGAATCAGAACTCAGTAGTTTAG
CCAGTTCAGGACAAAACTTTGTTCTAATCGTCACATACTTCCCAAAAATG
TGACAGATAAGGTGTTGCCATGAGTAGCGATTGAACGAGTTGAAAATAAG
AAGACTCGAAGTCAACAATTTAATAATAATTCGACTATAATTTATGCTAA
ATAAAAACTTAAAAATAGTATTCTCTCGTTTCATCGTTTCATGGACATCA
TTCGAAATAACTTTTATTCGATTATATACATTTCAAGATCAAGAAATCAT
TGTTTTTATAATAAACGAGAAATCATTAGAAATAATCACTCGATTATAGA
ATAATCAATATTATTTAAAAAATCAGAATATCTCGATTATATAATAGATA
TGATTTCAATAATCGAAATATCTCGATTATGAAAATAATCGAGATATCTC
GATTATATATCTCGATTATGCCCATCACTAATTTTAATAAAAATAATATT
TTAAAATATTTAGAATTTTATTTTGAGGAGGTATTATAGACAAATTAGTC
GTAAAAGAAACGAAATATAAATTAAGTTAAAATCAAGTAAACGTAAAGTC
TAATTATCTGCGTTAAATTAAAAAATATAATTTAACTTTAACTTATAAAC
TCGTTTATGCCTAGCCATGTATTTTAATTTAGCATAATAATCTTCAATAT
CATAGTATTTAAGTTATAAAATAAAAGCTTTATCACATTTTAAATACAAT
CTCAATAAAAAATTGAGTTTTTACTTTCCAAATTTATACACAATAAGTTT
CACTTTAAGTTAATATAAATTCATAGTGAATTTCTTATATTGAATACTGA
ACTTTTATTTGCACTAAGCCATTCATATAGTTGTTTTTTCTTACTAAACA
TTTTAATGTTTTAAAATATAAATAAACAGCTCGACCCCGGACACTACACC
ACTGTACTCTTTAAATTTATTATTAACCCCTTTTCGAAAAATTTTAATTA
TTTTAGCCTAATCGTGCATTGATAGCCCTTAAAATCCTTTATAACTATCA
TAAATGAATTATTTATATAATGTTTATAAAACGGGCGCAAAATTGTAAAA
TGAATAATTTTTGTTAAAAATATAGTTTAATAAAACTGAAAAACACGCTT
TTAAAGAATATCGAACTAAAAAGTTAAAAATAAGCTTAAAACAATAATAC
TAGTATTTTTCGTTCATTATTGTTTTAAGCTTATTTTTAACTTTTTAGTT
CGATATTCTTTAAAAGCGTGTTTTTCAGTATTTTAAAACTATATTTATTT
TTCACTTTTTAGTTTTTTATGACATCTTTGTTACAGTCACGGAGTTTATT
GTCAATTATCACTAGCAATTGGTATAATTTCTATATTGCCAGTTAGTGTG
TTTATAAACTCACGACTATGTGTCTTACCATTGATAATAAAGGCTATATG
CTTGCTAATATCGTCATAAAAAACCAATTAGCTACCTGTATTTGTAATCC
TTTATGTATTATACATGTATATTAACTCAAAAAAATTTGAATCTTTAAAT
GTTAAAATAATATATATATAATATTGATGATAAGCACGCATGTACGGGTA
TGAAAGCGAAAATTAAAATTATACAGGAATAGAGTTGCTAGCGTATGGTG
AGCGGGGTGGGGTGAATGCGTTTCGACAGTCTAGTCTCAAGACCATAGAC
GACTGGATACGCAAGAATAATAATACGTGTCGCGTGGAAGGTTACAAACT
TACAACAAACAAACATACATGTGAAATTAATATAAGTGTGTTAAAAATTA
TGTTATCTGTTATGATTTGCATATAACTTTAATGTCATTTAGATTTATTG
ATACTTGGATTTTTTGGTCGAAAATTGTATTTAGTTTACTACTTATAATA
ATATTTTTGTACTTACAAAACTTTGTTGAACTTAATATCTATTGATCGAT
ACGGATGTCGAAGGAACAATTCGGTGAAATGCCGGGCTGTAAAATATATT
AGCTAGGCATATAATTAATAGAAAATATTATCGTTATCGCATTGCCGTCT
CAAAGCTCATCTATAAATATAATGTAAGTTACTTTTTCTGAGTATTTTAA
GTCAATNAGAAGTTTCTTTTTCTGAGTATTTTAAGTCAATTGAATGCGGA
AAAGTGTTAGCTTATGATCTCGGTATTAAAGCAAATTTTTCTGATTAACA
AAAGAGGAAATATAGATGAAATTGCTGAAGATTTTTAATTTTTGTACGGT
AGTAGCTTGTTGGTTAATTCATTGGACTATACAGGGTGATTTTTTTTATC
ATAACCCACTCAATTACTTACAGAATAATAATAATTAAAAATTTTTTTTT
TATTATTATCTTTAGTTACACATTATTCTTGAATTATTAACTATGTAATA
CTTTTTAAGTTCATCCCTTATGCCTGGTAAGGGTGTCAACTTTGTTTTTT
TAAATGGTAACACATATTTTGAATTTAATAAAATGTTTGAGTTTTTAATT
TAATAACAAATGTCATTTGAATTTTTAATATAACTTTATTCGTTTATTAG
ATATAAACATTTAAAGTTTCAATTTTTTGAGTTAATATACATGTATAATA
CACTAGGGATTAAAATTACAGGTAGCTAATTGGTTTTTTATGACATCGAT
ATTAGCAGGTACAAAGCATTGTTATTATCAATGGTAGTAAGGCACATTGT
TGTGAGTTTATAAATACACTAACTGACAATACAGAAAGTATATCTATTGA
TAGTCATAATTGATAATAAACAATCCGTGACTGTGATAGCAATATCATAA
AAAATCAATTAGCTACCTGTATTTGTAATCCCTTGTGTATTATACCTATA
TATTAACTCAAAAAATTGAAACTTTAAATGTTTATATCTAATAAACGAAT
AAAGTTATATTAAAAATTCAAATGACATTTGTTATTAAATTAAAAACTCA
AACATTTTATTAAATTCAAAATATGTGTTACCATTTAAAAAAACAAAGTT
GACACCCTTACCAGGCATAAGGGATGAACTTAAAAAGTATTACATAGTTA
ATAATTCAAGAATAATGTGTAACTAAAGATAATAATAAAAAAAAATTTTT
TAATTATTATTATTCTGTAAGTAATTGAGTGGGTTATGATAAAAAAAATC
ACCCTGTATACAAAAATATGCAATTAAGCAACCATTAAGTATAAAATCTA
AATGCTTCCGATTTTAGTTTTGAAATAAAACATTTTAAGTCTCAAGCATT
ATCACTTTTACCCGAGTTAAGAGTCGTCGAACCTTTAGACCTACTGTTGC
GCCATGACACTCCTAAATTAACGGTTGGCGTCAATAGCTTATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold584:74728..78371+ >DV3016633-RA ID=DV3016633-RA|Name=DV3016633-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=438bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold584:74728..78371+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGAATAAATATACCTATAAATTTTATTTTGAGGAGTTTTTTATGACATC TTTGTTACAGTCACGGAGTTTATTGTCAATTATCACTAGCAATTGGTATA ATTTCTATATTGCCAGAATAGAGTTGCTAGCGTATGGTGAGCGGGGTGGG GTGAATGCGTTTCGACAGTCTAGTCTCAAGACCATAGACGACTGGATACG CAAGAATAATAATACGTGTCGCGTGGAAGGTTACAAACTTACAACAAACA AACATACATGTGAAATTAATATAAGTTTACACATTATTCTTGAATTATTA ACTATTTCATCCCTTATGCCTGTAATTGAGTGGTCTCAAGCATTATCACT TTTACCCGAGTTAAGAGTCGTCGAACCTTTAGACCTACTGTTGCGCCATG ACACTCCTAAATTAACGGTTGGCGTCAATAGCTTATAA back to top
Synonyms
The feature 'DV3016633-RA' has the following synonyms
Synonym |
maker-scaffold584-snap-gene-0.115-mRNA-1 |
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