Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| AED | 0.07 |
| QI | 0|0.5|0.28|1|1|1|7|0|454 |
| eAED | 0.07 |
| Full name | DV3023131 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >DV3023131-RA ID=DV3023131-RA|Name=DV3023131-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold2485:2..2372- (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGTTTTTTTATAGAGAGGGTAATTATGCAGCATGTCAGCTACCTATTTT
GGATCCATTCGATCCATTAATGATGAAATTTATTAAGGTGGAACCTCCTC
TAGTATGTGATTTAGAAGATGATTGGGTAGTTGTTAAAGGAAATATTGCT
CGCATTACTGAAAAAGCTCGTAAAAAGTATGGAGATATTCAGTGCAAGTT
TATTGATGTTCTACGAGCCAATGAATATTCCTCATCATTGGGTATTGTAA
CTACAACTCATACAGAGTATAATTTAGAGACAACTGACTTTTTTAGGGTG
TACTGTGAGTCAGAGAATGGTAAAAATAGGTGGGAAAATCGAATGGCAGG
TATTCGCTATGATGAAGATGTAATGAATAGAGCTGGCTGGGACCGTGTCC
CTCAAGGTAGCTTAAAATTAAATATTTTAATGCTTGGTTTCGACTCGTTA
TCACATATGATGGTTCAGAGAAAATTACCAAGGGTTTATGCTAAGCTTCA
ATCAATGGGTGCACATATATTAGAGGGATATAATATAATTGGCGATGGTA
CACCTCAAGCATTAATACCTTTACTGACAGGAAGAACTGAATTAGAATTA
CCTGATACTCGAAAACGAATGGGAAAAAAAGCATCTTATCTAGATGTATT
TCCTTTCATGTGGAATGTATTCAAAAAATTTGGATATGTTACAGGTTATG
CTGAAGATTGTTCTAATGCAGGAGTTTTCACTTACAGACTAAAGGGTTTT
GATCAACAACCAACTGATCATTATTTACGAACTTATTATGTAGATTCAAC
ACCAATGTTTGATAAACAAAAGCCCTTTTGTTATGGTTCTTTACCTAGGC
ACAAAATAATGCTAAATTACATTCAAGATATGTTTAGGGTTTATGAAGAT
AAACCAAAATTTATGTTTGCATTTCATGGAGAACTATCTCATGATTATGT
AAACAAAATTAGTGTGGCCGAAAATGATTTAATAGAATGGCTTGAGTGGT
TTCAAAAATCTGACTATTTAAACAACACTATGTTATTATTTATGAGTGAT
CATGGCCAAAGATTTGCTTCTATACGTGATACACAGCAAGGTAAATTAGA
GGAACGGATGCCATTTTTTTCAGTAAATCTTCCTAAGTGGTTTGACAAAA
AATATCCAAAAATGGCTGCAAATATTAAAAAAAATACTAAACGGTTAACA
ACACCATTTGACATTTATGCAACAATAATGAATGTGTTACAAAAAGAAGA
ATATAAAAATAATGTCAACAAACGTTCAATTTCTCTATTTAATGAAGTAA
ATTGTTGTTTTTTTTTTTTTATAGAAATTCACTTATTTTATTCATTGCAT
ATTTCTTATAAT back to topprotein sequence of DV3023131-RA >DV3023131-PA ID=DV3023131-PA|Name=DV3023131-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=454bp
MFFYREGNYAACQLPILDPFDPLMMKFIKVEPPLVCDLEDDWVVVKGNIA
RITEKARKKYGDIQCKFIDVLRANEYSSSLGIVTTTHTEYNLETTDFFRV
YCESENGKNRWENRMAGIRYDEDVMNRAGWDRVPQGSLKLNILMLGFDSL
SHMMVQRKLPRVYAKLQSMGAHILEGYNIIGDGTPQALIPLLTGRTELEL
PDTRKRMGKKASYLDVFPFMWNVFKKFGYVTGYAEDCSNAGVFTYRLKGF
DQQPTDHYLRTYYVDSTPMFDKQKPFCYGSLPRHKIMLNYIQDMFRVYED
KPKFMFAFHGELSHDYVNKISVAENDLIEWLEWFQKSDYLNNTMLLFMSD
HGQRFASIRDTQQGKLEERMPFFSVNLPKWFDKKYPKMAANIKKNTKRLT
TPFDIYATIMNVLQKEEYKNNVNKRSISLFNEVNCCFFFFIEIHLFYSLH
ISYN back to topmRNA from alignment at scaffold2485:2..2372- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >DV3023131-RA ID=DV3023131-RA|Name=DV3023131-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=2371bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold2485:2..2372- (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGTTTTTTTATAGAGAGGGTAATTATGCAGCATGTCAGCTACCTATTTT
GGATCCATTCGATCCATTAATGATGAAATTTATTAAGGTGGAACCTCCTC
TAGTATGTGATTTAGAAGATGATTGGGTAGTTGTTAAAGGAAATATTGCT
CGCATTACTGAAAAAGCTCGTAAAAAGTATGGAGATATTCAGTGCAAGTT
TATTGGTTGGTTTTCTAGTTTTTTGTATGTATTTTCTAAGTTAATAATAT
AATTTATTTTAATAGATGTTCTACGAGCCAATGAATATTCCTCATCATTG
GGTATTGTAACTACAACTCATACAGAGTATAATTTAGAGACAACTGACTT
TTTTAGGGTGTACTGTGAGTCAGAGAATGGTAAAAATAGGTAATTTCATA
TTATGTATTATAATCTATCAAAAGAATATATATTATCGTTGCTGTGCTAA
AAGTGGCTAAAGAAAGTGTTTTGACATAAGAAAAATAAATGCCTAGTGGT
AGGGTTTGTTGATATAACTCTTGGGTTACAGAATTTAATTCTATATTGTG
CCACTCTTTTAAAATTATTTCCATTATTATTCTTTTAATGACCTACCCCA
TCAATCCTCCAGAACTACATCAGACGTAAAAATAGATAAGGTACAATTAA
TTTGTGGTAAAATATTGAATTGTAATTATATTAGTTAATTGGGGTAAATT
AAAAAAAGTATATCCATATTTTAATTTTTACTTCTCTGATATGTATCATG
TTCCCTCAATTAATGTATTCAATATACATATAGTAAAATAATATATTTTA
ATTATAAAAAAATATATTTGAAAGGTGGGAAAATCGAATGGCAGGTATTC
GCTATGATGAAGATGTAATGAATAGAGCTGGCTGGGACCGTGTCCCTCAA
GGTAGCTTAAAATTAAATATTTTAATGCTTGGTTTCGACTCGTTATCACA
TATGATGGTTCAGAGAAAATTACCAAGGGTTTATGCTAAGCTTCAATCAA
TGGGTGCACATATATTAGAGGGATATAATATAATTGGCGATGGTACACCT
CAAGCATTAATACCTTTACTGACAGGTTGATTATTTTTTTGTTGAAATAG
TTATTTCCTAATACATCTGAAAAATATTTATGTTTTACTTAAAGGAAGAA
CTGAATTAGAATTACCTGATACTCGAAAACGAATGGGAAAAAAAGCATCT
TATCTAGATGTATTTCCTTTCATGTGGAATGTATTCAAAAAATTTGGATA
TGTTACAGGTAATTAATTGATGATGTACTTTTATAGATATATTAGATTAT
TAATTGAAGTAAAAATTATACTTCTTAGGTTATGCTGAAGATTGTTCTAA
TGCAGGAGTTTTCACTTACAGACTAAAGGGTTTTGATCAACAACCAACTG
ATCATTATTTACGAACTTATTATGTAGATTCAACACCAATGTTTGATAAA
CAAAAGCCCTTTTGTTATGGTTCTTTACCTAGGCACAAAGTAAAATGAAG
TTGATTGTGTTTATAATACTTAGAATTGTTTTTTGTTTTATTTTTTTATT
AGTTATTGGCTATTCATTGAAAAGTAATGTGATACTATTTAATCAAGCTA
ACTATTAAATTATGAATTTATTAAAACAATTTAAAATTGCTTATATTATG
AAAACACATAAGTCTTATAATTTTATTATATTTCATAAGAATAATTAATG
TTCTCAAAAACATAATATTTCTTATATTATGGCTGATATGAAAATAATTT
ACATTTTATCATTCATATATTTTTAATAATTATTATTATTTTTTAGATAA
TGCTAAATTACATTCAAGATATGTTTAGGGTTTATGAAGATAAACCAAAA
TTTATGTTTGCATTTCATGGAGAACTATCTCATGATTATGTAAACAAAAT
TAGTGTGGCCGAAAATGATTTAATAGAATGGCTTGAGTGGTTTCAAAAAT
CTGACTATTTAAACAACACTATGTTATTATTTATGAGTGATCATGGCCAA
AGGTCAGGTTTATAATTTTATAACTTTCTTTAAGTTTATGTAATTTATAT
TCATTTTTTTATGCAAATAGATTTGCTTCTATACGTGATACACAGCAAGG
TAAATTAGAGGAACGGATGCCATTTTTTTCAGTAAATCTTCCTAAGTGGT
TTGACAAAAAATATCCAAAAATGGCTGCAAATATTAAAAAAAATACTAAA
CGGTTAACAACACCATTTGACATTTATGCAACAATAATGAATGTGTTACA
AAAAGAAGAATATAAAAATAATGTCAACAAACGTTCAATTTCTCTATTTA
ATGAAGTAAATTGTTGTTTTTTTTTTTTTATAGAAATTCACTTATTTTAT
TCATTGCATATTTCTTATAAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold2485:2..2372- >DV3023131-RA ID=DV3023131-RA|Name=DV3023131-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold2485:2..2372- (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGTTTTTTTATAGAGAGGGTAATTATGCAGCATGTCAGCTACCTATTTT
GGATCCATTCGATCCATTAATGATGAAATTTATTAAGGTGGAACCTCCTC
TAGTATGTGATTTAGAAGATGATTGGGTAGTTGTTAAAGGAAATATTGCT
CGCATTACTGAAAAAGCTCGTAAAAAGTATGGAGATATTCAGTGCAAGTT
TATTGATGTTCTACGAGCCAATGAATATTCCTCATCATTGGGTATTGTAA
CTACAACTCATACAGAGTATAATTTAGAGACAACTGACTTTTTTAGGGTG
TACTGTGAGTCAGAGAATGGTAAAAATAGGTGGGAAAATCGAATGGCAGG
TATTCGCTATGATGAAGATGTAATGAATAGAGCTGGCTGGGACCGTGTCC
CTCAAGGTAGCTTAAAATTAAATATTTTAATGCTTGGTTTCGACTCGTTA
TCACATATGATGGTTCAGAGAAAATTACCAAGGGTTTATGCTAAGCTTCA
ATCAATGGGTGCACATATATTAGAGGGATATAATATAATTGGCGATGGTA
CACCTCAAGCATTAATACCTTTACTGACAGGAAGAACTGAATTAGAATTA
CCTGATACTCGAAAACGAATGGGAAAAAAAGCATCTTATCTAGATGTATT
TCCTTTCATGTGGAATGTATTCAAAAAATTTGGATATGTTACAGGTTATG
CTGAAGATTGTTCTAATGCAGGAGTTTTCACTTACAGACTAAAGGGTTTT
GATCAACAACCAACTGATCATTATTTACGAACTTATTATGTAGATTCAAC
ACCAATGTTTGATAAACAAAAGCCCTTTTGTTATGGTTCTTTACCTAGGC
ACAAAATAATGCTAAATTACATTCAAGATATGTTTAGGGTTTATGAAGAT
AAACCAAAATTTATGTTTGCATTTCATGGAGAACTATCTCATGATTATGT
AAACAAAATTAGTGTGGCCGAAAATGATTTAATAGAATGGCTTGAGTGGT
TTCAAAAATCTGACTATTTAAACAACACTATGTTATTATTTATGAGTGAT
CATGGCCAAAGATTTGCTTCTATACGTGATACACAGCAAGGTAAATTAGA
GGAACGGATGCCATTTTTTTCAGTAAATCTTCCTAAGTGGTTTGACAAAA
AATATCCAAAAATGGCTGCAAATATTAAAAAAAATACTAAACGGTTAACA
ACACCATTTGACATTTATGCAACAATAATGAATGTGTTACAAAAAGAAGA
ATATAAAAATAATGTCAACAAACGTTCAATTTCTCTATTTAATGAAGTAA
ATTGTTGTTTTTTTTTTTTTATAGAAATTCACTTATTTTATTCATTGCAT
ATTTCTTATAAT back to top
Synonyms
The feature 'DV3023131-RA' has the following synonyms
| Synonym |
|---|
| maker-scaffold2485-augustus-gene-0.7-mRNA-1 |
|