SFRICE017661-RA (mRNA) Spodoptera frugiperda rice

spliced messenger RNA

>SFRICE017661-RA ID=SFRICE017661-RA|Name=SFRICE017661-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=1074bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_000383:9..8017- (Spodoptera frugiperda rice)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGACCTACAACTCTTCACTGGATAGTTTTTGCGGCTCTACTTTCTGGGA
CAGCAACCTAACATGGTATACAGACAATCCGGATTTAAGTCCGTGTTTCC
AAAAGACATTTTTAGTATGGGTACCATGTGGCTTCATGTGGTTGGCAGCC
CTGGTTGATGTCTACCATATAGTAAGCAGCAAAGAAGGCAATATACCATG
GAATAAGTTAAACATAAGCAAGCTGGTTATAGCATTGTCCCTAGTTGTAT
TACAGATTCTAAATCTGATCTTAGTGACATATGCATCTTCAAACGAAGAA
AATAAAATATATGACGCAGATTTCTATGAACCAGTTGTTAAATTATTAAC
TTTGATGTTATGTATAACGATAATATGCTACAATCGAAAATATGGCGTAA
TGACGTCAGGAGTGTTGTTTATATTCTGGTTACTCCTGATCTTGGCTGGG
TTACCACAACTCAGGACTGAAATAGTCAACTACGACCCAAACAGCAGCGG
GTATGCACGATATACATTTGCTAGCTATATCGTGTACTATACGCTTGTAA
TTATTATGTTCATATTAAGCTGTTTCGCCGATTTACCGCCTACAGATTCT
CCATATACTTACGACAAGGCCCAATCTCCCGAGAAAAGATCTAGTGTACC
TAGTGAACTCACCTTTAGCTGGTTTGATCCACTAGTCTTAACAGGCTTCC
GAAGAAGTCTCAAAGAAGAAGACTTATGGCCGTTAAATCCTGAAATGACG
TCTAAAGAAGTCGTCCCTAGATTTGAGAAGTACTGGCAGAGAGCTTCGCA
AAAACGTGCAAAGGCTGCGGACACAAGTGCCTCGACTGCTGATGCTACTG
CTCCCATAAATCAAAAGCAGTCAACTAAACCGATATCGATACTGCCAGTG
TTGTGCTTAACTTTTGGATACCACTTCTTATTCGCTGTATTTCTTAAGGT
TATCCACGATTTGCTCATCTTCGTATCGCCTCAATTACTTGAACATATTA
TTGGATTCATCCAAGGCGACGATCCCGTATGGAAGGGCTATCTCTACGCA
GTCAGCATGTTCTTATGTTGTATC

protein sequence of SFRICE017661-RA

>SFRICE017661-PA ID=SFRICE017661-PA|Name=SFRICE017661-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=polypeptide|length=358bp
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LVDVYHIVSSKEGNIPWNKLNISKLVIALSLVVLQILNLILVTYASSNEE
NKIYDADFYEPVVKLLTLMLCITIICYNRKYGVMTSGVLFIFWLLLILAG
LPQLRTEIVNYDPNSSGYARYTFASYIVYYTLVIIMFILSCFADLPPTDS
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SKEVVPRFEKYWQRASQKRAKAADTSASTADATAPINQKQSTKPISILPV
LCLTFGYHFLFAVFLKVIHDLLIFVSPQLLEHIIGFIQGDDPVWKGYLYA
VSMFLCCI

mRNA from alignment at SFRU_RICE_000383:9..8017-

>SFRICE017661-RA ID=SFRICE017661-RA|Name=SFRICE017661-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=8009bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_000383:9..8017- (Spodoptera frugiperda rice)
ATGACCTACAACTCTTCACTGGATAGTTTTTGCGGCTCTACTTTCTGGGT
TAGTAAATTTACTTAAATATCCAGATCCAAGTGTTAAAATTATTTTCAGT
CATAACTTTTTAGCTGCCAAGTTTTTACCAGGGTTTGTCATGTCATGACT
TAAATATAGTTATCACTGTATTGTACGTTCTAATGTTGTATTAAATAAAT
CATACGAACTGAGTCTCGGTGATGTAAATGAAATTAATTCCTAATTAGAA
ATAGTTAATGCAATGATTGCAATATTGCGCAATTATTAATGAGTAATCTA
GTCTTACTCCAAGAGCTGCAGTTAACCACACTGGCTCAAGTTAGGGTTAA
GTTAAAACTATTCAAACTTTATTAATAACTTCACTTTAATTCATTAATAT
TTGTGTGATAAAAGTGGTTATTTATTTATATTTTTGTTATTGTGCACAAT
ATTGTGCAATCTATATTGCAATACATTAATGTTGTAACAACTTAACAAAG
TTTTAATTAAAATTATATATTAAATGAAATAAAATATAGATATTATGATT
TAATATAGGACACATTATTATTACGCCTTTATTTTAGTTTTAAGTTAGTT
TTTATTCCTTATTTTTTTTTTTGTATTTTTAAGTTGTAAATAATGTGTCC
TAAATATAGATTATGTATATTATAATTACATTATTATTAAAATTAAAATT
ATATATTTTAGGACAGCAACCTAACATGGTATACAGACAATCCGGATTTA
AGTCCGTGTTTCCAAAAGACATTTTTAGTATGGGTACCATGTGGCTTCAT
GTGGTTGGCAGCCCTGGTTGATGTCTACCATATAGTAAGCAGCAAAGAAG
GCAATATACCATGGAATAAGTTAAACATAAGCAAGCTGGTTATAGCATTG
TCCCTAGTTGTATTACAGATTCTAAATCTGATCTTAGTGACATATGCATC
TTCAAACGAAGAAAATAAAATATATGACGCAGATTTCTATGAACCAGTTG
TTAAATTATTAACTTTGGTGAGTATTATATTTTATTATTTTATTTAAATA
CTACAATTTCATCCTCTCTAATATACCATAAAATAAAATTGAGCCCACAT
TATCAAAGTTTTAACAAAATGTAGGGAATTCCGTATTTGTTTTATTACAC
TTAGTTTTTGTTTAAATAAGCCTCATTACAATATTATGTCTAGGTGGTAT
TTCTAAGAACTGTAAATTGATAAACTAAAATATGATAAAATTCAGTTAGA
CCCTAGATTGTCTGTTATGTTTTACAGAAGTTATAATTAAAAATTAATTC
TTGTAAATACCAAGTATATAATTGGGTGAATTTACATTAGTGGCTTTGCA
TAGCATTCGCTATACATAGTAAATGTAACAATATTTTGTAGATTATATTA
TGTAGTAAGGTATTTAAAGATTATAGTATATCTCAAGTATGTTACAGTTA
AGATATATGTATAATAAAGATATTTGTATGATACATGTAAATAAATAATA
TACCAAGTACTTGATACAGGTAAAACTGTACATATATCAAGAAAAATTGT
TTTCTAGATCTAAATTTTATATAAGAAAATGGTAATTTATTGTTGTTGCT
GACTGTACCATACTTAACAGGTATTTCTAACAAGAAAACTACATTACCTA
CCTCATTATCACACTAAATAAATAAACAGCTCCTAGAGTTGTTTATAATT
ACTGCACAGAGTTTGCACTGATAAAAATAAAACATTTCATAATGTTTTTC
TTAATAAATAAAGATTCATTAAACATTATGCAAGACCTAAGTACTAAGTT
CACAAGAATATCGTTAAGTTGTATGGCTTAGAACAGGAAAATTGTGAATT
GGTACCTAAAGTACCTACATAAGGTTTATATTTATTTTATCAGTTTCGTA
GGCATCTTCCATTCAATAGGAATCAGTGGTTAGTTCTAAATGAGTCTGTA
TTTGTAACACTTTGTCATTTTCCAGCTTATTTAACTACTTAATATGTTGT
GATATAGGTATACTTTTTAAAGAATAGGAAATCCCATTGCTTGTACGGAA
GATCGTAAAAATATGTACTGTTAATACCTATTGATAACTGCTATCTTATT
CACGTAAATTTTATCAGTGTTTTGAATCAGATTTATGTTTTATTACCTTG
GTAGACGCATCCTTGAGAAAACACTGCTATTCTAATCATAATATCTACCT
TTTTTATTGGATCGTATTTGCTAAAGATTATACATAATTATTATAACTAA
AGAAATAAAAACATATAAGTACTTTTTTACCTGGGCCTTCCCACGTAAAT
AATGAAGTTATAAAAATGGCAAAACAAATGTTTTTGTCTATACTATAAAT
ACTGCAAAACAGGCAAGTCATGTTCCTGGTATCCACTGGTACCATCCTGA
AGAAGCTCAATACAGGGGTGTGTCATAAAAAATACCGTGATAAAGCAATT
TGTAGACTAAAAGTACCAGAGGCGCACCCCGAGCGTTGCGAATATGTATT
CACATCCGCATCCACAAATGCGGAGTTTTTACGGATGCAGATTCCCATCA
ACATGTAACTACTCGTCTGGTGTTTTTTTTTTTATATGACTTACTTAAGT
AAATAAATAAAAAGTGAATGTACTTAAAATGTAAACAAAGCCATTTAAAA
CCCCAAAATCCGCATCAGCGTCACATCTGCATCCGTGATTGTGAACTTTT
AATATTCCGCATTTGCATCCGCGGATATCTTGATTTTGACACTGTAACAA
TCCTGTTAGGTACCTATTTACAGTCTTAAACGTCCCTATTGATTTTGTTA
TTTACGTCATAATATAGAATAGATAATGTATTTCCTAGCAATCAGTAGAT
AATAATTATGAGACAGCGACGCGACGCCGCCGGTTCGTAATTATTGACAC
ACATATGAATTTCAAACAAAATAGACTATTCATGTTACTATTCTATTTAT
TTACAGTAGACGCCGTTTTTTCTTTTATCAAATTTATAAACTTATATGCA
TTGCATAACCATATGGATGTATCATGAAAAAACGTCCCTACTATTAAAAA
TATAGAGCACAAAATATCAAATCTCTCCCGATCCGTGAAAATATTTATCT
ATTTCTTGGCCTTTATCCAACTGGTTTTAGCCAGTCTTAGTTGAATCTGA
GTATTTTATTCGCGAACGGAGTGACATCTGCCCTTCACAATGCAACATGT
GCATATTTGTTTCGAAGTACAGTCAGTCACAAAAATTAATTACCGAATTT
AATCATTAAGTTACTTATATGTATAAATACTTGTTAGAGGTAGATATTAA
AGTTACTATTAATTTCTTCCCTCAAATAAAAGAAGAAGTTACATTTTAAC
TTTGAAATTCAATGAGATTGGAGCTCGTGCATCTTCATCCAACCAAGTTA
AATTTACTGGACGCATGAGCAACATGTTCAATTGGCTATTTCATTCACTA
ATTGAAATGCCTTTCATATTATTTCAGTCAATTTATCGTACGGTGGTCTA
ATGCTGGTCTTATTTGCAGATGTTATGTATAACGATAATATGCTACAATC
GAAAATATGGCGTAATGACGTCAGGAGTGTTGTTTATATTCTGGTTACTC
CTGATCTTGGCTGGGTTACCACAACTCAGGACTGAAATAGTCAACTACGA
CCCAAACAGCAGCGGGTATGCACGATATACATTTGCTAGCTATATCGTGT
ACTATACGCTTGTAATTATTATGTTCATATTAAGCTGTTTCGCCGATTTA
CCGCCTACAGATTCTCCATATACTTACGACAAGGTAACACATTTATTTTT
CTTCAAAAGTTTCACAAACAAGTGGATTGTGTCCTAAGGGTCAACTTTAT
TAAAACCACATAAACCTTACAGGCCCAATCTCCCGAGAAAAGATCTAGTG
TACCTAGTGAACTCACCTTTAGCTGGTTTGATCCACTAGTCTTAACAGGC
TTCCGAAGAAGTCTCAAAGAAGAAGACTTATGGCCGTTAAATCCTGAAAT
GACGTCTAAAGAAGTCGTCCCTAGATTTGAGAAGTACTGGCAGAGAGCTT
CGCAAAAACGTGCAAAGTAAGTTTTTTAAATTGATATTCTAGCTTTAACA
CAGTAGTCATGTGCTACCGTGCACTTACACAGCAAGGTTCAAGGAAGACG
CACATCTCCCTAGAGATGTGCCGCAACAGGCGTTGCACCACAGGGGCTCC
GCAGCAGGTTGGTAGAATCGGTGCCTTTTAAAAGTGCTGAGATTGGTTTT
AATGAGGTAAAAACCCCACACTCCCTAGTCTCCACGAAAAGCTAGGCGCC
TTTTGAAGGTTTCCCCCATCATAAAAAAACAAAACAAAAAGGTGTATAAA
ATGAAATAAGATAATTCAATGAGCATATTAAATAAGCGACTAACGAGTCA
ACAGATAATTTATTTTTTTATTTTGACCGAGATAAAAAAGGAAGAGGTTT
CGAGTTAGAATTTAGGTATTTACCAGTTTATCTATCTATTAAAGTTTTTA
TCATTAACATGTGATACAAGCATGACACTGTGGCATTCATTTAAACATGC
AGGAGTTCCTATTCTCGGAAATCCCTGCTGTAACTACCTGAGATTTATTT
TTATGAGTAAACAAATAGTAGAGGCTTTTCGGGGGAAATACCTGCGTTGT
ATTACGTAATTAGGCGGAAATCACAGACAAAAGACGTCATACGCCTGAGT
GCGTGAGTTCACTGCACCTTGCCAGATAAATTAGATACACCATGTCAAGT
GTGAAAAAGCCATGCTTCGGCACGAATGGGCTGGCTCGACCGGAGTGATA
CCACGGCCTCACAGAAAACCGACGTGAAACAACGCTCGCGTTGTGTTTCG
TTGTGTGAGTGAGGTTACCGAAGGTCCAATTCCCCCTTCCCAATCTTCCC
AATCAAAAAACACTCATGTATTAGACGAATACTAGATACTTACACTAGAT
ATTTTACTTAAGTAGGCTGTCGAATAGTATTTCGTCAATTGGAAATGTAT
TTAGTGATATGCACGTAAATATTGTTATTAGATTGAAGATAACCAACTAA
TTAATCCAAAAGACTTAATTATGACTCACAAATATAGGAAAGAAATATGT
TATCTATTCTGCAATATTCAGTAAAGCTCAAGATCGAATCCATTAAGATT
GATAATACAGTAGGTATACCAACAAGGAGAAATCTCTTTGATAACACTGA
CAAATATCTGATTATTGCCGACGTGTTATCTGCGTGCACAGTAATTCCTA
AAACCACGCTATGAATGACTAAACCCTAGAGATAGCAAAATGTTTGTAGA
GATAGCAATTATTATTAGCATGAGCAAATACTAACTTCAATTTTGTAATC
ATTGCGCAATGCCATGTTACATATTACGTGATATTACTAAGATTTATGTT
TATTTTATACTCGAGTTTACGCGGATGTTTCTGTTTAAGTAATTAAGTTA
ATCACATACTTACAAACTTTTTACTTCCGAAAAACGCTTGTTGGCCTATT
ACCTTAAAAAATACTGGCTTTAACATGCATAGCAGTATAAAAATGTTTTA
TTTTTGAAGTAAAATTGCAATACTACCTCTCACATCTTGTACGAAGAGGA
AACCGGTCAAAAACTAGGCCTAAAATTTAAAAAAAGTTAGTCTTATAAAT
ATGATTATTTTAGTACAGCTACTGTCTATAAATAATACTGTTGAATAATT
GGAGACAGCGTACCTAGGTGCCTACTTACTTGTTTTTACAATAAAAGTGA
AAGTAAAACTGCTTGGGTCTTTGTGACCTCGCTTTCGTTTTTAGGTTTTT
TTGCGCTTGTCCAATAACTGCCTGCAGAGAGCAAAATATTTTGTTCTGGC
TTCGCACCAACCGGTACATTTCTCTCCACTACCCTTTGGTTGATTGTCAG
AGAAGTTGCGTTTAAGGCATTGAGTCAGTCATTAAATAATAATACAGCAT
ATTGTACCTCAAATTAATGTAGGTACTGAAGTATGCCTAATGTAGGTAAC
CTAGTCTATGCTACATTTATTTTATTCAAAATTTATCCTTTATTGTTAAG
ATGCTTAATCTTGAAAATATAGAGTCTGACAATTCCCATTTTGTTTTAAA
AATTGTCGCATCCGTGTTTTCTTGTTTAAACGTGATCGATTGATGTCAGA
ATATTTTTTTTATTTAGATATAACAACTTTACTATCGTATAATCATTATT
CAACGTCCTTGTAATTACTTACCTATAACCTTATCAATAATAAACCTCAG
GTTATCGCCATTGGTGTATGTGTATGACCTTCTTTTCTGTTCAACCTACT
TTTTTCCTTTCCCTTTTAATTAAAAAAAACCCAAATTCTCCTGCAATCTT
CATGTCATTTTATTCTACACAGACGAAGTCGCGATATAATAAGATTAAGC
CGATAGATATGAGCCTTGATAAAATTGTTTCCATCGGGTTTTCCGATATT
AGTCATCAATAAAATAATGACAAATGTTTGACATGTAATAAGTATAATAT
TTTTATCTTTTACGTTGTCACGTACCTACTTACCTAATTACTTAAGTAGT
TTAGGTACTGTATATTTATGTACCTACGATGATTAGTCGACTTCAATTGT
TGTCATAAGACGTCAACGTCATGCTTGCATCTTTTGTACTTAAACGTGGC
GCCTTGATGTTGTTATTTTGATTGGTAAAGAAATTAATATTAGGTACATT
AATTATTACTGTTTACTGAACAGAGTGTCATTTTTACTCCTATGTTGGCC
ACACTTTGAAAAAATTAGGTAGGTACAAGGAAGACCATCCAGGTACCAAC
AGGGAAGACTCTGTATCAGTATTAGTTGATTGGTACCTATATAGGTTTTT
ATACACTTTCTAGCAGACCCGGCAAATTTCGTACACTAATAATTCAAGAC
AAATTTTATCATCAGCGGTTTTCGAGTTTTAGTGACATAGATTTTTATAT
CCTACTGGCATGAAGTTAGGTTTTCAAAATAAAGTTCTAGTTATGCAATG
TAAAATATCGGTGAAACACCGTTGACAGATTAAAAGGCATGATGTTATTA
TAACGCCATGTTATTATAACATTATTTAAATTCAACTAAGCAAGTATTAC
AGAACGAAGAACTTCTCCGTCACTAATTAACTGGACTGTTATTCTAATCA
ATATTAATTTTCCCAATGAACGCTCACAAGACGACTGCGGGTCATTGAAG
TAATTCGTTTTAATTACTACTGTGGCTAATAAATAAGGGTTCACGATATT
AGTCGCGGAACAATGAATACTTATTTACAAATTCTCTCTGTTTGGAGATT
ATATTGAGTTCCCTTGTTTTGCCTAAAAGAAAAACTTATTGCAGAAAACC
TGGCTCTTCTCTGTCCTAAGCTTTAATTATCAGTTTTGATGTATTACTAT
TTACAGACACGCGAAAGCACATCAGCCAAGTATACTTTTTACCGGAATAG
ACCTAAGGAATTTTAGAGTCTATATTGTTTAAAAGCATTGATGTATGCAC
TAGATTTTCTTCAATACCTACACATTATGATATTTTTTCCCTCAGGGCTG
CGGACACAAGTGCCTCGACTGCTGATGCTACTGCTCCCATAAATCAAAAG
CAGTCAACTAAACCGATATCGATACTGCCAGTGTTGTGCTTAACTTTTGG
ATACCACTTCTTATTCGCTGTATTTCTTAAGGTTATCCACGATTTGCTCA
TCTTCGTATCGCCTCAATTACTTGAGTAAGTAACAATATTAAGTACTAAC
CAAATTCCATTTTATTCTAGCATGTGATTAAAACTATGTGAATTTGTAAG
TAGAGTACCTACCCACCCTCTGGTAATCTTAAGTTCCACATTGACACCAA
GCCATGAAGGTTTATTTCACATTGTCGGCAACTTAAGATTACTGAATCAG
TTTCAACATCAAACTTTATGATTACAGACATATTATTGGATTCATCCAAG
GCGACGATCCCGTATGGAAGGGCTATCTCTACGCAGTCAGCATGTTCTTA
TGTTGTATC

Coding sequence (CDS) from alignment at SFRU_RICE_000383:9..8017-

>SFRICE017661-RA ID=SFRICE017661-RA|Name=SFRICE017661-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=CDS|length=1074bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_000383:9..8017- (Spodoptera frugiperda rice)
ATGACCTACAACTCTTCACTGGATAGTTTTTGCGGCTCTACTTTCTGGGA
CAGCAACCTAACATGGTATACAGACAATCCGGATTTAAGTCCGTGTTTCC
AAAAGACATTTTTAGTATGGGTACCATGTGGCTTCATGTGGTTGGCAGCC
CTGGTTGATGTCTACCATATAGTAAGCAGCAAAGAAGGCAATATACCATG
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TACAGATTCTAAATCTGATCTTAGTGACATATGCATCTTCAAACGAAGAA
AATAAAATATATGACGCAGATTTCTATGAACCAGTTGTTAAATTATTAAC
TTTGATGTTATGTATAACGATAATATGCTACAATCGAAAATATGGCGTAA
TGACGTCAGGAGTGTTGTTTATATTCTGGTTACTCCTGATCTTGGCTGGG
TTACCACAACTCAGGACTGAAATAGTCAACTACGACCCAAACAGCAGCGG
GTATGCACGATATACATTTGCTAGCTATATCGTGTACTATACGCTTGTAA
TTATTATGTTCATATTAAGCTGTTTCGCCGATTTACCGCCTACAGATTCT
CCATATACTTACGACAAGGCCCAATCTCCCGAGAAAAGATCTAGTGTACC
TAGTGAACTCACCTTTAGCTGGTTTGATCCACTAGTCTTAACAGGCTTCC
GAAGAAGTCTCAAAGAAGAAGACTTATGGCCGTTAAATCCTGAAATGACG
TCTAAAGAAGTCGTCCCTAGATTTGAGAAGTACTGGCAGAGAGCTTCGCA
AAAACGTGCAAAGGCTGCGGACACAAGTGCCTCGACTGCTGATGCTACTG
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TTGTGCTTAACTTTTGGATACCACTTCTTATTCGCTGTATTTCTTAAGGT
TATCCACGATTTGCTCATCTTCGTATCGCCTCAATTACTTGAACATATTA
TTGGATTCATCCAAGGCGACGATCCCGTATGGAAGGGCTATCTCTACGCA
GTCAGCATGTTCTTATGTTGTATC