SFRICE019101-RA (mRNA) Spodoptera frugiperda rice

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Overview
NameSFRICE019101-RA
Unique NameSFRICE019101-RA
TypemRNA
OrganismSpodoptera frugiperda rice (Fall armyworm - rice variant)
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
SFRU_RICE_006079contigSFRU_RICE_006079:69..13576 -    View in Apollo
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Spodoptera frugiperda rice annotation OGS2.32015-12-04
Properties
Property NameValue
Full nameSFRICE019101
eAED0.20
QI493|1|0.9|1|1|1|10|0|463
AED0.20
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE019101SFRICE019101Spodoptera frugiperda ricegeneSFRU_RICE_006079 69..13576 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE019101-RASFRICE019101-PASpodoptera frugiperda ricepolypeptideSFRU_RICE_006079 69..13083 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-10Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 69..209 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-9Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 980..1204 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-8Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 1526..1631 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-7Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 4806..4970 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-6Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 6996..7234 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-5Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 7735..7884 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-4Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 9904..10081 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-3Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 11128..11176 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-2Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 12317..12443 -
SFRICE019101-RA-exonSFRICE019101-RA-exon-1Spodoptera frugiperda riceexonSFRU_RICE_006079 13075..13576 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-10Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 69..209 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-9Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 980..1204 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-8Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 1526..1631 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-7Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 4806..4970 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-6Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 6996..7234 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-5Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 7735..7884 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-4Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 9904..10081 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-3Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 11128..11176 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-2Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 12317..12443 -
SFRICE019101-RA-CDSSFRICE019101-RA-CDS-1Spodoptera frugiperda riceCDSSFRU_RICE_006079 13075..13083 -


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
SFRICE019101-RA-five_prime_UTRSFRICE019101-RA-five_prime_UTR-11Spodoptera frugiperda ricefive_prime_UTRSFRU_RICE_006079 13084..13576 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>SFRICE019101-RA ID=SFRICE019101-RA|Name=SFRICE019101-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=1882bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_006079:69..13576- (Spodoptera frugiperda rice)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
GTTTATATGCAAGAGAGTCGTCAGAGGGCATGTATCTTTGTAAACAACCT
CAGAACTAATGTACTATAATTCTTTTTTTATCTTTTATATGAACAATGAT
TACTATATTTGCGCTCGACGCGACGACCTCTCATTTCACCACAGTCTTTT
GTTAATTGTTACATTTCTTGTGATTATAATGTTTTTAATAAATAGTATTT
TAATTTAATTAGTAATTAGTGTTGCGAAATGGAATTAGGATCGGTAGGTT
GGCATTTAGCGTTCTGTGTCGTGGTTCTAGTGTATTTTCGTACGTACTTG
TGTGCTATAGTGAAATTTTTGTGACTTTTTCCTCTGTTTTGTGCATGTTT
TGTAAGTGCGTAGTATCTCTAAGTTATAAGTGTAATTGTGTAGAAATGTA
TGTGTTATGGTTTTTTAAACTAGTGCATTGATGTGCTGTTTAATTAGGTG
TTAACATATTTCTGACGTAATCTGCTATCTAAATAAACTTAATATGGAAA
TACAAGACAAAGAATCGATGGAAAATGATGTGGTGATTAATATCAAAGGG
CTGAAAGTATGGACGCCTGAGGAAAAGTCGTGGTGGAGACGGAAACCTAC
CAAACCTCAGAATGTTATACTTAACAATGTTACAGGAAATATTAGACGAA
GTGAATTTGCAGCTGTCATTGGACCAAGCGGCGCCGGAAAAACAACATTC
CTGGTATCTTTAGCGGGGAAATGTACGCTACCATCGGAGGGTTCAGTGAC
CCTGTATGGGCAAAATGTCAAGGCATGTCCCGGGGCTGTGGAGATAGCCC
CACAGCATGAGTCGTTCATGGATGGGCTCAGCGTAATGGAGCACTTGGTA
TTCATGACAGAAATGAAACTAGGCAGCTGTAAGGACCGAAGAATTAAAGC
TACGCTGGACAGCTTAGTCGAGGAGTTTAAGATGAAACCTCACATCAACA
CCCCCGTCGGAGGACTCTCTGGAGGGGAGAGGAGGCTGCTGTCTCTTGCT
ACTACGTTCCTATCAGACCCTCAAATACTGATCTGTGATGAGCCGACCAC
GGGGCTGGACAGCTACAACGCCCTCCTCGTGATTGGAGTCCTGAAGAAAC
TATCAGCATCAGGCAGGATCGTCATCTGTTCCGTCCACCAGCCTTCTTGT
GACCTGTTTAAGGAGTTCAGCTCTATACTCCTAATGGCTGAAGGTAGACT
GCTGTTCCATGGGTCGCAGGATGAGTGCAAAGATGTTTTTGAAAGCATAG
GTTTGCGGTGTCCCCTAAACTACAACCCAGCAGAGTTCTACATCAGAGCA
GTCAGCTCCAGTAGCAACGTCCATAGACTTGTGGAAATTTCCCAAAACCG
GTCGGAGTACCAGGGAACCAGTTCCCCACGACCCGATTTGGTCCACACTT
ATAATAGGCCTGTCCAAAGGAATTGGTTCAAACAAGTGCATTTACTGCTA
TGGAGGCTCTCATTAACATTGAAAAGAGAACTTAGGAATCAAATTCTACA
ATTATTTATTACTGTGGTAATAACCTCAATGGTCCTAGGAGTGGCCTACG
TAGGAGCTACAGGCACCACTCAGCGCGGAGTCCAGGAGATACGTGGCTTC
TTGTGGCTCCTCACCAGCGAAGTATCCTTCGGAGTGTCATACAGCGCTCT
CTATGCGTTCGAGTACGAGATATCGCTGTTCAAGAGAGAAGTCGGTGTCT
ACAAGTGTTCCGCATATTTTGTGTCGCGGTTTTTGAGTTTTATACCACGC
TGCATAATATGGCCTGTCGTGCTGGTGTCCATCTCGTCTCTAGCAGTAGA
CCTACCCAACCACATCATCACGACATTGGAGTTCATTGCCCTACTGGTCG
TGAGCGCCATTCCAGCTGTTGCTTATGGTAAG
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protein sequence of SFRICE019101-RA

>SFRICE019101-PA ID=SFRICE019101-PA|Name=SFRICE019101-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=polypeptide|length=463bp
MEIQDKESMENDVVINIKGLKVWTPEEKSWWRRKPTKPQNVILNNVTGNI
RRSEFAAVIGPSGAGKTTFLVSLAGKCTLPSEGSVTLYGQNVKACPGAVE
IAPQHESFMDGLSVMEHLVFMTEMKLGSCKDRRIKATLDSLVEEFKMKPH
INTPVGGLSGGERRLLSLATTFLSDPQILICDEPTTGLDSYNALLVIGVL
KKLSASGRIVICSVHQPSCDLFKEFSSILLMAEGRLLFHGSQDECKDVFE
SIGLRCPLNYNPAEFYIRAVSSSSNVHRLVEISQNRSEYQGTSSPRPDLV
HTYNRPVQRNWFKQVHLLLWRLSLTLKRELRNQILQLFITVVITSMVLGV
AYVGATGTTQRGVQEIRGFLWLLTSEVSFGVSYSALYAFEYEISLFKREV
GVYKCSAYFVSRFLSFIPRCIIWPVVLVSISSLAVDLPNHIITTLEFIAL
LVVSAIPAVAYGK
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mRNA from alignment at SFRU_RICE_006079:69..13576-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>SFRICE019101-RA ID=SFRICE019101-RA|Name=SFRICE019101-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=mRNA|length=13508bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_006079:69..13576- (Spodoptera frugiperda rice)
GTTTATATGCAAGAGAGTCGTCAGAGGGCATGTATCTTTGTAAACAACCT
CAGAACTAATGTACTATAATTCTTTTTTTATCTTTTATATGAACAATGAT
TACTATATTTGCGCTCGACGCGACGACCTCTCATTTCACCACAGTCTTTT
GTTAATTGTTACATTTCTTGTGATTATAATGTTTTTAATAAATAGTATTT
TAATTTAATTAGTAATTAGTGTTGCGAAATGGAATTAGGATCGGTAGGTT
GGCATTTAGCGTTCTGTGTCGTGGTTCTAGTGTATTTTCGTACGTACTTG
TGTGCTATAGTGAAATTTTTGTGACTTTTTCCTCTGTTTTGTGCATGTTT
TGTAAGTGCGTAGTATCTCTAAGTTATAAGTGTAATTGTGTAGAAATGTA
TGTGTTATGGTTTTTTAAACTAGTGCATTGATGTGCTGTTTAATTAGGTG
TTAACATATTTCTGACGTAATCTGCTATCTAAATAAACTTAATATGGAAA
TAGTAAGTAGTTTTTTCACTACAACACTTTTTTACAGAGATTGTAAACGT
CATAACCATAATAATTTTTGTCTTACACAGTTGAGTAATAAAGGACAAAC
AAATACTTAGGTATCATTAAAACTTTATCTTGTAAGACAAAGAAATGTAA
TTGAGAATGTTTTTGTTTATTTAATTTATATTTTCGAGATGAAACGCTGT
GAAGGTGATATGATAACACCAGAGGCAATCGTAACCCGAGAAATGTTTCA
TTATTTTACTAAAACTTAATGCATAAAACACTAACCGCCGTACTCAGAGT
CATTTAATGGTTACTTAACCCTGTCCTTAGCAATTGTTTTCGGAACAAAA
TTATAACTAAGGAATCGCTATAATCATTAAATGACTCTGAGTACGGCAAT
AAGTAAGTTATAATTATTTTTCCTGCCACAAGTCTACAGAAAGAAAATTC
AATAGGAAAATGATTATTATCTATTGGCGTTTGTGTTATATGTATGTACA
TAACATAATAAATACCTAAGCTATAACTCTCAATGATATTGTAGCGTGCG
TTAGAAATCTAGTTAAAGTAGGCACTAAATACCTTTATCATATTTAAGCT
TTTTATCCATTAATTCTGCTGTCATTTTTGTAGCAAGACAAAGAATCGAT
GGAAAATGATGTGGTGATTAATATCAAAGGGCTGAAAGTATGGACGCCTG
AGGAAAAGTCGTGGTGGAGACGGAAACCTACCAAACCTCAGAATGTTATA
CTTAACAATGGTACGTACCTCCTTAATATGAATACTGTCTCCTACATACT
AGACGTAGAGACACGGCAGCTCATCAAACTAGCCCAGTCTATTAAATCTG
CTTTGATTTTCTATCTTATGCCTTTGCAATAAAGTTTAAAGTAGTATCTT
TGAGTTTGCGTTACTTTGTATTGCAAGCGGATGCACTTAGTAAAAATATA
TAAACGAGCATACATACCTACACGTAGTGTCTGCTATATCATTAAATAGA
AAAAAAATCATTTAAATTAAGACATAAATACAGTAGGTTCACACAAAACG
TCACTCATTTAATCACCAGTTGCGCAGTGACCGTTGTGAAATAAAATTAA
CATGTTTAACACCAACTTTTCACCAATTTTACTATGAGCCCCCTTTACCT
AATACGCGTAAATAATTACTACCATTCACTGTAATATTACTATGTCCGAT
CTAGGAATCTAACCTGAAACGCCTTGCTTAGCAATCGCACATGTCACCTC
TCGGGGCAAAAGTTCACTTATGAAATGTGTCATCTACTTTTCGCCAAATT
ATTTTTATTTATTTATTTATTCATTTATTGCACAATTTACATACATAGAG
GCATTACATGCTACTAGTACCATCTGGTAACTAAATAATCATCTTATTTA
GGTATGAAATATTATACTTATTGTTAACTTACTTACTATACATCATTTTC
ATAACTTTGTAGCCACGTAGAGTAAAATCAAATTACTTAAGTTTTTTATT
ATTTACTTTTTATGAAACGAAAACGGTTTCAAAAAATGCATCAAAAGTTT
TGTTTTTAGTTTTTCACCAAGGAATATTTGGTCGTGGCTTCAGAAACCAT
TTAAGAGCTTAAATAGTAAATATTTGTAAATATTAAGAGAGAAAGACGTA
TGTAAGATTCTTAGCAATTTGCGTCCCATTGTCTCTGCCAACCCCAATGA
GGTTGTGTATATCTGTTAAAAAAATATTACTATTTTCCCTAATTTAATAC
ATACGATCTACTACTAGTATTGCTTCAAACTTTAATTATAGTGACCTCTA
TTGGTCATGACACGAACTATTAAGATGTGAATATATTATTCAACAACCAA
TATAAATATTTTTTTTGTTGTTGTACTTTTTACCATATTTTTTTGTTTAG
TTACAGGAAATATTAGACGAAGTGAATTTGCAGCTGTCATTGGACCAAGG
TTAGTATTCAAAGTACATTTTCTTATTTTCTCAGTTTTTTATAGCTATGC
TGTAATACTATGTGACCGTTTCCAGTGATACTAAGTTATGTAGCTATGTT
ATGAAGATGTTCCGCTTAAAAGTAGCTGCACGAGGAAACCGTCCAAACCG
CACGCATCTTTCAATATTACATATCTTAGTTGAAATCATTTCCACCAGTG
CTAAGCTACGTATACCAAATATGATTGGTGGAAGCCAAACGTATCTACAG
CAACGTAGCATAGCACATTCCTTGTGGAAAAGTACACTAAAGCTCCATCT
AGCGGAAAACTGTGGAATTAATGAAAAGTATTAAGCGGATCAAATAGAAA
TTAAAACATCAAATTTAACTGCCATTGCAATAAATATTCCTATCTATCTA
TTTAATCTCCAACTTGAATATAATCTGAATCTAAAGTTTCTAACAATAAC
CAGTGCTTATCTATAGTAAATCTGATATTGTTTGCACGAATTTGCATTCA
ATTTAGATTTTGTTGATAACGAAACTTGATCAGTTTCCATCGTTGTTCCA
CATTATTTTATTGCTACGTTATACGAGAATTAATGAAATATTTAGCCAGG
AAAATTTAGAGGTATTCCTGGCTAAATATTGGGCACCTGTTTAAATGACA
TCCGAGCTAATAGCACCCGAAATATTCCGCTTACGGCACCTATAGGTATT
TGTTGAATGTGCCATTTGTAGAATAATATCTTATTTTAAATCCTCCTCCA
AATATAACACTAAAAATTAATTATAGTGATTTTAGCTTGACGGAAAATGT
AAAAATGTTTAGTTTTAGGACCTAATCTAGCATGGTCTTTTTTATAATGA
AAATTTTGAAATAGTATAGGCCTCCGATCAAGTAAGAATTAAATAAAATT
AAAATCCAACTAGCAAGATAGCGTCTCATCTTTGCTTTACGATTTACCAT
GTCTGCAGAACTTCTAAACACGTATAATAATTTATTAACTTATATTTTTT
TGTATCTTTCTAATACTTACTTATAATTTCTTGTACCTTTCACAGCGGCG
CCGGAAAAACAACATTCCTGGTATCTTTAGCGGGGAAATGTACGCTACCA
TCGGAGGGTTCAGTGACCCTGTATGGGCAAAATGTCAAGGCATGTCCCGG
GGCTGTGGAGATAGCCCCACAGCATGAGTCGTTCATGGATGGGCTCAGCG
TAATGGAGCACTTGGTATTCATGGTCAGTTTGCCTTTATGCCTTTATGAG
CTATTGGAGATTTCCTGGTTTAGCTAAATGTCATTTTTATAAATGCAAAA
AAAGGTTTGCACAGCAAGCCCTGTCTTAAAGGACAAAGATTTAGTTTCCT
GCACCCTCTTGAGTACTTAAATGCCTGAACTCTCCTGAACGGTTATATAT
CTGAACGGTTTTTAGTAATTAAGTATCTGACTGCTGAAAATGGAATATCC
TCAAGGAATATTTTATAATAATTAGTCTTTAGATAGTTTTAGTTTAGTTT
TCCAATGGCTTCTCCCGCCTTGGGCGAGGCGAGAGAGAGTGTCAGACTAT
TACCGGCTAAATTCCACCCCGTTCCTACTCCTGTTTTTCGAGCCGGAGCT
CCGGTGAACCCGCTAGGTAATCCGCAACTCCGGATCAGTCTTTGGTAGGT
AGAGTTAGACTAACAACAAAAGAGGTGGTATGTTTGGTTTTTCATNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTTT
AGTGACTCCCATAAAATGAATAGGCACAAATTATGCTAAAGAACTAAAAT
GTCAGTTTATAATTTCTAAAACTTAATTCTAAGAATTAAAGACAATTAAT
CTGGTCCGGCTGGCAACATACGCAGGTGTGGAGAGCTTTTTAAATATATT
TAGCATATAATATGTTGTATTGATATCAATAAATATACAATAAGGTCGAC
TGGTACAAAAATGTCGCTATTGTCTGCATTATTTTTTTTTATTTTTAGCT
AAAAGAATAAATAAATGACAATATGACATTTTTTATTATTTTGTAGGTTA
TACTTTTTAAGTGTTTAGGTTATTTCTTTATCTATGTTTAAGCTAATTTT
ATTTAGTTTTATATTCGATATTGGAATTATAACAATGCTTTTATTATGTA
CGACATAAGTCTGCATATAAAGCATCTAATATAATCTTGTTATGTAAATC
TGTTCGTATTATTATATTGATCTAGTACTGTTAAAAACAAACGTTATTTG
TTATTATCCGAACAGATATAATATATGATAATATACTGAAGATCTATAAT
TAACGCTGTTAAAAAAGGTGCGAACCTCAAATAAAAAATTGTATGAGGCA
ACGAATTTCCAAACAGAACCATTTCATTTCTGAAAATAATTTTGGTAAGA
AAATCTACCATAAATTAGAAAATTAAATATATATTTTTTTATTAAATTTT
TGAGAAATTTACCTAAACTACGCTTTATATATGTATTTATTTTTAACTTA
ATCTGAGTAAGTAAAACAAATGGGTCGGTTAATAATTCTGGTTCGGTTCT
GTTGACGACTGTACACGCATGTAAATTGAGTTTCAAACTTTCTCGTTTCG
ATATTATCAGAAACTGATAACATCAAAGCTAAAATAGTACTAAAATAAAA
AGAATCTTCGCCTTTGTTATTGTTATATCGATATTATAAGATTAAAAAAA
AGAAAACATTTAGAATTGCTGACGTATTTTAAAAAATATCTGAAAATAGT
ATCATTCAAATTAATGCCTTATTTTTAATGAATGCCACATTAATTAAGTC
GCTTTAGATATAATATTTTTAAATATAATTTTAATTCTATAATAATAAAG
AAATTTAAAAACCAACTTTAAATAAATGATGTAATAAGTATTTTGAATTG
CTTAAAGTATGAGGATTTTCCACGTTGAGCTCAAAAATAAAGATTTTTTT
CTGGAAGTAAAAGTCAAAGTTAAAATTGTTTATTTTATAATAGACCGAAA
AACTCTTTTGATCGTCGAAGTAAATATTATAATATTAAAAAATCATTCTT
GTTCTTTCTTCACCAGAGGACTGCTATTTCCTCGTTTCAAAGTATAGATT
CTTATGGAAAAGAACGAGTAAGAAACTCCATAGGTAACATAGCTTAATTA
CCGTAAATCAAATTGTGCTAGAGATTAGATGCAAAGAATTGAAGATCCTA
GTGGCATACCTCCTACAAAGAAAATGTCCATTAATTTTTCAGACAGAAAT
GAAACTAGGCAGCTGTAAGGACCGAAGAATTAAAGCTACGCTGGACAGCT
TAGTCGAGGAGTTTAAGATGAAACCTCACATCAACACCCCCGTCGGAGGA
CTCTCTGGAGGGGAGAGGAGGCTGCTGTCTCTTGCTACTACGGTAAACTA
CCTAATATTGGACTTTAACTATAAATCACGGTTTACTCACGAAAATTAAT
GGAGTAAAGTGCAGATTTGGTGACGTCGCCGCGTCTGCGCTGCTCATAAT
GAAGAGTCCTTCAGTGACTCGAAACTAGTAGAGATTTTCTCAATTAATGT
ACATGAGAAAACTGTGATTTTTAGTTTATTTAGTATGTCTCGCGATAATT
ATTATAAAAAAATATTGAGTACATTTGTTTTTACTACCTACATCCGATAG
AACTTAACCCATTTTAAATAACTTATTATTTATGATTCAGAGTCTTGCAT
TAACAATTACCTAATTTGACACGATTTCAAGAGATGAGCATGCACAATAA
GAATATATAGCTTTAGCTCCAGTTCGTTCTCGAATGTTAGTTTAAATCCA
GAATGGTATTATGATTTCATTTTACCTCTACTGACAAAGCAAGCCGTTTT
AGCAAATAAATATGTATCATTACATTATATCTTTTGTTACAGTTCCTATC
AGACCCTCAAATACTGATCTGTGATGAGCCGACCACGGGGCTGGACAGCT
ACAACGCCCTCCTCGTGATTGGAGTCCTGAAGAAACTATCAGCATCAGGC
AGGATCGTCATCTGTTCCGTCCACCAGCCTTCTTGTGACCTGTTTAAGGA
GTTCAGCTCTATACTCCTAATGGCTGAAGGTAGACTGCTGTTCCATGGGT
CGCAGGATGAGTGCAAAGATGTTTTTGAAAGGTAAGCATAAGTGATTAAT
TTCATTTAGGAGGTTTTTGTATGGTATAAGCCGGTAAACGAGTAAGCGTA
AGCAATCGTCGCCACCCTTAGATACCCGAAACACCAAAGGCATAACAAGT
GCGTTGCCGGCCTTTTGGGCTTCCTTTAACATTACTTACACAACGTAAGC
GTTTACGTCATTTTTGTGAAGCCGTAGTATCACTCCGGTCGAGCCGGCCC
ATTCGTGCCGAAGCATGGCTCTCCCACACTTGATCATTTTCGTCTCCTAT
TTTTTAAGTTTAGTATGTATGTGATTTGATGTCTATTCTGAGTGAATAAG
AAATGCTTTGGGTGGTCAAGTCAAGGTCATTATTATGGAAGGTTTCAAGA
ACTTACAACGTTCATTAGGGCATCGCCAGTTATATCGGTTTAGCCACAAA
TGTCCTTTTTTATGACCGTCTAAAAAGTCATTGGCAGAATTAAAACCATG
ATCTGTAGGCTTGTTTAGCAGATTATAAAAAATATTTATATTTACATATT
CATACATAAAATGGTGTTTAGGTACGTATATAAAAAATTGCTATATTTAG
TTCTTGTTTCATAGCAACCGCCTACAAGTTCGTTAAGGCGTAAACTATCA
AATGAATTATAAAATTATACACAGATTTGTTCCGGAGCCATCGAAGCTGC
TCACTCGTCGACAACATAGCGATATTTCATCTTCAAAACGTTATGACATT
ATCTACTATGATATTTTATTTATTTAATAAAATTTTATAACCGTGTAGTG
TCTAGATTCCGACGAGTATTTAACTACTACATAAAATATAAAAGCTACCA
TTTGACCAAAATTTACGCCTCCTGCTATAGAATATAAAATCTGTTGGTCA
AACAATAACTATTATTTGTCGTTTTAATACCTAATAACCTAAAACCTTCA
TTAAATAAATAAAGTTAAAGAGTTTGTATGTTTGAACACGCTAAACTCTG
GAATTACTGGTCCAATTTGAAAAAGTATTTTTGTGTTGGATAATCCATTT
ATTGAGGAAGGAGAAAGGAAGAAAGCGAGGAGTTAATAATTCAAAAGAAG
CTAGTATAAAGTATTGCGAAATGGTTTGTATCCATTTAAAAAAATTCGGA
TTGTGGAAAATACATTTTTTAAGTAGGTACCTATTCTCTATACTAGGTAT
AATACATTGACGCTTATGGAAAAATAGCATCACTTAATGTGTCATATAAA
AAAAACAAAGCCATTTGTTTTCTGCATGCATATTCAATCGGTCTACTACT
GAATTTATTATAGCTGATAAAAGCTATATCACAAAGAACAATAAAACAAC
GCCATTTAGGATTGATTTAAGTCATTTTTATTATGTAAATTATTTTATTA
ATTGCTAAGCTCCTGGCGTGATGGCGATCATAAATTCATTCTCTTCAAAC
ATTTATGAGCAACATTTAACATATTAAAGAAATTACGCTGTTGTTCTTCT
AGGATTCAAAATATCAAGTGATGATCTTGTCATATAAATTCATGTTTAAG
TGCTGCAAATTGCGATGCCTGACCATATTTTATACGAATAGGAGTAAACG
TTTTGCAGTCTCATGAATCAGAAACGCTTCTTTTTTTCGTCATATTTTTG
GGAGTATCAATAAAACGCATGTTATGCATGCATAACGCATGTTATCTGTG
TTGTTTGAACATTAGTATTTTAACAGTTCTATTAGAAACATATTTGGATT
AAAGATTTTTTGTTTTAGGTACTTTATCACACTATAATTTTTTTTCATCA
ATTTTAGCTTGAACTTCGTAACTATTGTTGAAGGTGTTTTTGGTTTAACA
TTTTTTCAGACATATTTCGGCGAAAAGCCGGAATACCTTGATCATTGCAA
TGATCATATTATATGTTTTAAAGAAAAATTACATAATTGTCTCGTCAGTT
CCTCAAACTGAAGGTTTTCAGCGGACATATCTTTGTACGAATTCCTAAAA
TTGAGGCATTTTTTACTACATTTTCGTTCAATTTAACGCTTTATTTCTTC
TTCCAGCATAGGTTTGCGGTGTCCCCTAAACTACAACCCAGCAGAGTTCT
ACATCAGAGCAGTCAGCTCCAGTAGCAACGTCCATAGACTTGTGGAAATT
TCCCAAAACCGGTCGGAGTACCAGGGAACCAGTTCCCCACGACCCGATTT
GGTCCACACTTATAATAGGCCGTGAGTATATTGCTTTTTACTACCATTTT
TTATCAATGGGTTCTGTTTGTGACAGTTTTTATGGGTAAATGAGTTTAAT
GAACTTTTTAGGTTGTAGTAAGTAGTTTAGGAGTAGGTGCTTATTGGTTA
GTGTGAATTTCAAATGAAATAGACATGGTACATAGTACATATACAATTAT
ACATACATAGACAAGTAAAACCTGCCGTAATCTGCACCTCGGCCTACCCC
ATCGGGGATAAAAGGCATGACGTTGACACAATAGACATGGTTTGCAAGTC
AAAATATACAATTGTATTGTGTTGTTTATTTAGTTTTCTTGTTATTGCGA
TATTTTTTTTTTTTTAGTACTTTTGACTGTTATCACACGCTATTGACATT
TGTTTATATACTTTTTACCAATTTTTTTAATTTTTTTGACATATTATAAA
ATTTTGTACGCTTTCCGAAGCAAAACATAGCAGGATCTATACTTGTATAG
CAGCATACCCTACAACTTATAATGTACCCTATGTTTCACAAATAAAAATA
AAACTTTGACTTTGACAAATGATTGCTTTGAGATTCATCTTTTAATGAAC
TTATTACAAAAATATTTTCATCTGAATTTCTTATTTCGTATTACTTAGTT
ATATAAAATTAAATATTCTTTCTTTAGATAAACACTATGTGAAACAAAAT
ATATTAACAAAGATTCAGCAATTTATGCATGTGCACAAAAATAAACAATA
ACAAAATAACTTTTTTATTTTAATTACAAGAAAATATTAACATTAATTAG
CTGTCAACTACCGTATTGATTTTCATCTGATAAATTAAAATGACAGACTG
CAACAAAATAGACATGGTCTAAACCGCAGCTAATTAGGAATATTTCGGAA
GGTAATTAAGTAATTTGAAGAAACAACTATCACATTACCTATTGCAATAT
GTCAGCAAAAAGTGACACTAACATTGAGATAGTGTTCATATCAGTAATCT
ATGTACAAAATATTTTTAAACGTCGACTTTTTTTGCTATAATTTAAGTCA
TTATTAAATTGTTAGCTGTCTTGTAAGGTTAAACTTAGTAAGTTTTTCGA
CTACTGGACTGAGTGTATAAACGATCTCATTACCATTTGTTAAGTTTTAA
TATTAGGTACCTACTGCACGGGTGGCGCGGTGTCTCGATTCTAGCACGGA
GCAACTCTTTGTGTGATCGTCAAATTGTTGTTTTTGGACGTCATGTCTAT
GTGAACTTGTATGTTTGTAAAGGCACTAGGCAAAATCCTAGTGTTTTCAT
AAGAAAATTTACTCAAGAAAGAAAATGTTTACTATTATAAAATATCTAAA
GTCCAAATCTCTATTTATAGTTGCCAACCATATTGTTAAAAACATTAATT
ATACCGTACTGTTTTGTTTTTAGTTGGTTTATTCGCGCCGGCCAATCAGT
CTCGTTTCGTTTAACGTAAAGCAGATTCGTATTGAGGTTACTGTATCTAG
GAAAATAGTGGAGATCTATTAATTCCAATTTCATCGTACATTTACAATTA
CCTTTTAACACTCTCAGCAACCTTAATAAATTCTCCGTAGTGTGGATAAA
AGTTTTTCATAAGCTCCAAACAAAATGAATCGTACAAAATATGACATCTG
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GTGTCCATCTCGTCTCTAGCAGTAGACCTACCCAACCACATCATCACGAC
ATTGGAGTTCATTGCCCTACTGGTCGTGAGCGCCATTCCAGCTGTTGCTT
ATGGTAAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at SFRU_RICE_006079:69..13576-

>SFRICE019101-RA ID=SFRICE019101-RA|Name=SFRICE019101-RA|organism=Spodoptera frugiperda rice|type=CDS|length=1389bp|location=Sequence derived from alignment at SFRU_RICE_006079:69..13576- (Spodoptera frugiperda rice)
ATGGAAATACAAGACAAAGAATCGATGGAAAATGATGTGGTGATTAATAT
CAAAGGGCTGAAAGTATGGACGCCTGAGGAAAAGTCGTGGTGGAGACGGA
AACCTACCAAACCTCAGAATGTTATACTTAACAATGTTACAGGAAATATT
AGACGAAGTGAATTTGCAGCTGTCATTGGACCAAGCGGCGCCGGAAAAAC
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GCCTACGTAGGAGCTACAGGCACCACTCAGCGCGGAGTCCAGGAGATACG
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CAGTAGACCTACCCAACCACATCATCACGACATTGGAGTTCATTGCCCTA
CTGGTCGTGAGCGCCATTCCAGCTGTTGCTTATGGTAAG
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Synonyms
The feature 'SFRICE019101-RA' has the following synonyms
Synonym
SFRICE019101-PA
SFRICE019101
maker-SFRU_RICE_006079-augustus-gene-0.8-mRNA-1