Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
AED | 0.11 |
QI | 0|0|0|1|1|1|6|0|364 |
eAED | 0.11 |
Full name | DV3005151 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=1095bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGAATAACTGAACAAGTAGAACA TTTTTCAAATATTGGCGTTTCGGCTATTTGGCTTACTCCAATTTATCAGA CTCCTGGAGTTGACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGAT GAAACTTTTGGAACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCA TAGATACGGAATAAAAATTATTTTGGATTTTGTTCCAAATCATACAAGTG ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA GACTATTATATATGGCATGATGGAATTAAAAATAGTGAAGGCAAAAGGAT GCCTCCTAACAATTGGCTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAAT GGAATGAGCAAAGAAACCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAA CCAGATTTGAACTTCAGGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAAAAGC GTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCTG CTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGAA AACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACATA TACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAAC TACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTACTAGTTGTT GAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACTATGAAGTACTATGGTAACAGTAC TGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAATTTTATGTTAATTATAAATTTCA ATCGACAATCCAATGCGAATCAATTACAAACTTTGGTCACTAAATGGATA AAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCTAACTGGGTGGTAAGTTAA back to topprotein sequence of DV3005151-RA >DV3005151-PA ID=DV3005151-PA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=365bp
MIKEIIFLVLILIQIINCELIYSGQDASFNPDWWQKEIIYQIYVRSFKDS DGDGIGDLRGITEQVEHFSNIGVSAIWLTPIYQTPGVDFGYDISDFERID ETFGTMSDFDNLVVTYHRYGIKIILDFVPNHTSDKHVWFKKSVQRIAPYT DYYIWHDGIKNSEGKRMPPNNWLSVFNSGSAWKWNEQRNQYYLHQFLEEQ PDLNFRNPNVVHEIRKALYFWLERGVDGFRLDSANFLFESKDLSNEPKAE NNTNMKDTDYYSLNHTYTIDQPETYELHHTWRELLDEYKEKDGSTRLLVV ECYSPFNQTMKYYGNSTVPGAHFPFNFMLIINFNRQSNANQLQTLVTKWI KNMPKGMWPNWVVS. back to topmRNA from alignment at scaffold56:550414..558481+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=8068bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA
TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT
GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT
GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGTAAATGACATTCCAAAAATTT
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AGAATATTGTAATTTATTTATTATCATTAAAATTTAAAGAATTTTACAAT
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TGTTATAGTTAAGTGTTTTCAAAAAATTACACTCCCTACTTGTAGGAACT
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TGTATCAATACCAATGTTATTATTTATGGGTATTTTTGTATGTATATTAT
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TAAGTTTTTAGACAATAATTTTTGAAGCAACTTTCTTCTTATAATAATTT
TATTGTACACACCCATTATTTGAAACATAACTATTTATTCAAATTAAAAT
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ATGTTCCTATACAACATGAAAATATATCATGTAATAGCTTTATGGTAGAT
ACAATTAAAAATCATAATCAATAAAAAATTATTTCTATTAAATAATTTTA
GGTCTCAACAATTTCCATTTTGATGGGTTATTAAATAACTAAGCTTTTTT
CTTTTATAAATTGAGTTTTATTGAACATTAAATTAAGTTAATAGTAGATC
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AGATTTGTATAGTAAGCTCAAACAATTATGTTTGTTGAAATTATAAATTA
ATTACTGTTTACCTAAAATTAAATGAAATTTCTGGTGGACTTAAACCATA
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TCGGCTATTTGGCTNAGGAATAACTGAACAAGTAGAACATTTTTCAAATA
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GACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGATGAAACTTTTGG
AACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCATAGATACGGTA
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ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA
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GCCTCCTAACAATTGGGTAAAATTAAATATATATTATATATTTTTTGATA
ATACATCTATTAATAATTATTAATAGATGTATTTTTATCAAAAAAGTAAT
ATAAATATTAATTAATAAAAGTGTATTACGTATAATTAGTGATGAAAGAA
GTGAAAAATTCAAAACAAATATTAGAAATTTACACGAGTATTTAGACTAA
ATTTTTGTTAGAAGTATTAATTATATAGTACAATAGTTTTATCTAACCGG
TTTGGATGTGTGACTCATGATAAGATCGTTTATTTACTTATTTATATTAA
ATTACGTTTGTGAAGTGCTTAGTATTTACACGTATATTTATGATTATAAT
AGTTGGTATGATCGTTAACCTTAATATTTGCCGTGATTATTTGTTTGTTA
AGTTTTGGTGTTAATATATTGTATATATATCAACCCAGTATCCCCATCTA
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TTCTAAAAGGTGTTATGTACTCGTTGCGAAGTTTACATTATGAGGTTCAA
TCAATAAAAAATTAATTTCTAACCTAAGAAAACACTTCAGAAATAATTCT
GCATAAAATATATTATCTCATTAACGACATTATACTACATAAAAAACAAC
ATTTAGATCTTAAAAAAGATATAAACATTTTAATTACTAAGTTACCTGCC
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AATAGAGTCAAAATTTTGTAATTTAATCTTATCAATATCAAAGAATCTAT
TCCTAATCATAAATCAATTATTGGACGTAAATTAGGTTAAACCTAAAATT
ACCCTTTATTTTCGTTAGTCAATTAGGTAAAGAATCAAATAAGTCTAGAC
TTAATTCAACTGAAACAATTCGCTTAACATTGTAATCAAAAATATTTTTA
TCCAAGCTCCCAGATTGCATAAACATAGGAATAAGTTCTGATTTTACATT
TTACCAGTAATTCGTTCTGCTATGAAGAAGGAAGGAGCATGATCATAGAA
ATACATCTACTGTAGATAATTAATAGTTTATATATGCATTCATAGAGATA
TAAATTTTATAGAAATAACTAATTAAAAGCGCAATTGATTATAAATGTAT
AACTTAGAATTTGTCTTATTTTATAATTAATAAACTTTTATATGGTTATT
TACAAAATACTTGTGGTTTAAAAACAAAAATAAATATGCCGAGTTTAAAT
TATTTTGTAATTACTGAAACTTGGCTCACTTCTGAGATTAATGATTTAAA
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AATTACTTACCACTTCAAACTTAGATTGCGAGCAGTTGACAATATTAGTT
ACATCTTTAATATGTTACATTTTCACTATTGAAAATCTTTATAAGACAAA
ATGTGACTTTTATTTTGTCCGTGACAATTATTATCCTATAGATTTGTGTT
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AAAGCTAAAAATTGTATATTTCGTAAAAAAACTTAATCATAAAAATTATA
AGCTCCATATTTTATGACTAGTTCAAAAAAATTAGTTTGTAAATTTAGAC
CCGCAGGAAACTTTGGAATCTTCCAAAACTATGAAATCTATTAGAATCAA
TTTTGTCTAATATATTTAGTAATACGCTGTCATTATTTCACCATAGATTT
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TTAAATCTATTGTAAATAATCATCAAGTTGACGTCATATATAATGATTTT
CACAAGGCATTTGATTATCAATTTACAACTACTTTAATCCCTCGAAAAAT
TGCACATTTATTATTCCTTTCATCCAAATTAGTAAATGNCATTTATTATT
CCTTTCATCCAAATTAGTAAATGCAACTATTTCATGCTCATGTTCTCGTT
TTTATGAACTCATTACATTCCATGTACTCTCGCATTGTTAACTTTACATA
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TTAAATAGAGTAATACAATAAAGTTGATATTTTTTAAGATAGTCTAACTG
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ATTGATTTTACTATGATGTGTTTATTTTATTTTGTATCTATCTCTACTTT
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TAATAGTATTTGAGCCTTAAATGTCGTTAATTTTATATAAAATAATTAGA
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TTATAGAATTAGTTTACACTATCTCAAACTACTTAACATAAATATTGCAA
TGAGATTATAGTAGGAAGGTCCACAGCCAACTGGCCGGCTAATAAAATTG
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AAAAAAAAATTAAAAAGTAAAACCCTTTTGTTAATATTATTTTTGTTCAG
CTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAATGGAATGAGCAAAGAAA
CCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAACCAGATTTGAACTTCA
GGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAGTCAGTACCTAAAATATGAAA
CTATATTTAATAATACTTTTTAACAAAAGTTCTATTGATTAATTAGAAAG
CGTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCT
GCTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGA
AAACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACAT
ATACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAA
CTACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTTTAAGATTA
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AGGTCCATTCTGCACATAAGATTGTATTAAATGTAATAATTAACGTTTAA
TTATTTTGATTCTTGTAAAATCTTATACTTCCTTTGTTGGACATTTTTTT
TTTAAGGTTTTAAAAAAAATTAGGCAAATATTTCTTTTGTGTATTTTATG
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TTATTTATATGATTATTTTATTGAAACAAATCTACTTTATTAGACACTTA
TGAGTAAAATGTTTTTCAAATATATTTTTTTAATGCTTATTTCAGAAATT
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GTTGACGAATTAAAAACCAAAAATACTTAAAAGTTGGGTTTTTTAACGCT
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GGCCAGGTTTATAGAGCACTTAAAAAACATTAAAAATCAAAAAGTTAATA
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GCACTTAAAAAACATTAAAAATCAAAAAGTTAATAAATTTTCGATGACTG
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AACATTAATAATTACAAAGAATTTAATATAATGGAGGCAATAGAAATGTT
TAAAAATAAGAACAATTTAATTAATTGGGATCTTCGTCCAATGAAAAATT
AATTATTAAACTTGTGTAAACAAGCAAAATATGATAATATTACTTTGTGA
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ATTTAAATATAGTTTTAATATTAAATATCAACATTTAATTGCAGTTTTTC
AATGGCTTAATGTTAAAATATAATCAATTTTTTGCTATACTACAGATTAA
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GTTTTATGTGATAAAAATTTATCCATAATTTAATAAATATAACTCTTTAT
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TTTATCATATCATTAGTAGAGATATACTTTTTTAGATGAAATTTAACATT
AATTACCAAATTCATCATAAGTAAAGTTCTACTTTTATTTTTCAAATACA
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TTACTTCACAAATCTTTCATAATAATTTATTTTATTTTTAATTTCCTAAA
ACGCAATATTACTAATTTTATTACATGTTTATAATTGTTTGACACTCGCT
ATAAAATATAAGTTTAAAAAATGTGTTAAGCTACCTAGCAATGTTCCATT
TATTAAGCCATATTTTTTAGATGACTTAATAACTAACGACGTAACTTTTA
ACCAGCTATTTTTTGCCCGTAAATGTTTACATTTTCTAAACTAGCATAAT
AAACTAAACTAATTTAATAAAAAAATTTTGAAAAAAAACGGTGTCTCATA
AAGTAGATTTTACCATTTTTTTAATTATTTATAACAAGTATGTGTTTAAC
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AATATTGTAGGTTACTAGTTGTTGAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACT
ATGAAGTACTATGGTAACAGTACTGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAA
TTTTATGTTAATTATAAATTTCAATCGACAATCCAATGCGAATCAATTAC
AAACTTTGGTCACTAAATGGATAAAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCT
AACTGGGTGGTAAGTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold56:550414..558481+ >DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=1095bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae) ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGAATAACTGAACAAGTAGAACA TTTTTCAAATATTGGCGTTTCGGCTATTTGGCTTACTCCAATTTATCAGA CTCCTGGAGTTGACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGAT GAAACTTTTGGAACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCA TAGATACGGAATAAAAATTATTTTGGATTTTGTTCCAAATCATACAAGTG ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA GACTATTATATATGGCATGATGGAATTAAAAATAGTGAAGGCAAAAGGAT GCCTCCTAACAATTGGCTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAAT GGAATGAGCAAAGAAACCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAA CCAGATTTGAACTTCAGGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAAAAGC GTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCTG CTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGAA AACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACATA TACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAAC TACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTACTAGTTGTT GAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACTATGAAGTACTATGGTAACAGTAC TGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAATTTTATGTTAATTATAAATTTCA ATCGACAATCCAATGCGAATCAATTACAAACTTTGGTCACTAAATGGATA AAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCTAACTGGGTGGTAAGTTAA back to top
Synonyms
The feature 'DV3005151-RA' has the following synonyms
Synonym |
maker-scaffold56-augustus-gene-4.109-mRNA-1 |
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