DV3005151-RA (mRNA) Daktulosphaira vitifoliae

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Properties


Property Name	Value
AED	0.11
QI	0\|0\|0\|1\|1\|1\|6\|0\|364
eAED	0.11
Full name	DV3005151

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at scaffold56:550414..558481+
coding sequence from alignment at scaffold56:550414..558481+

spliced messenger RNA

>DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=1095bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA
TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT
GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT
GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGAATAACTGAACAAGTAGAACA
TTTTTCAAATATTGGCGTTTCGGCTATTTGGCTTACTCCAATTTATCAGA
CTCCTGGAGTTGACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGAT
GAAACTTTTGGAACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCA
TAGATACGGAATAAAAATTATTTTGGATTTTGTTCCAAATCATACAAGTG
ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA
GACTATTATATATGGCATGATGGAATTAAAAATAGTGAAGGCAAAAGGAT
GCCTCCTAACAATTGGCTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAAT
GGAATGAGCAAAGAAACCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAA
CCAGATTTGAACTTCAGGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAAAAGC
GTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCTG
CTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGAA
AACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACATA
TACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAAC
TACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTACTAGTTGTT
GAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACTATGAAGTACTATGGTAACAGTAC
TGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAATTTTATGTTAATTATAAATTTCA
ATCGACAATCCAATGCGAATCAATTACAAACTTTGGTCACTAAATGGATA
AAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCTAACTGGGTGGTAAGTTAA

protein sequence of DV3005151-RA

>DV3005151-PA ID=DV3005151-PA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=polypeptide|length=365bp
MIKEIIFLVLILIQIINCELIYSGQDASFNPDWWQKEIIYQIYVRSFKDS
DGDGIGDLRGITEQVEHFSNIGVSAIWLTPIYQTPGVDFGYDISDFERID
ETFGTMSDFDNLVVTYHRYGIKIILDFVPNHTSDKHVWFKKSVQRIAPYT
DYYIWHDGIKNSEGKRMPPNNWLSVFNSGSAWKWNEQRNQYYLHQFLEEQ
PDLNFRNPNVVHEIRKALYFWLERGVDGFRLDSANFLFESKDLSNEPKAE
NNTNMKDTDYYSLNHTYTIDQPETYELHHTWRELLDEYKEKDGSTRLLVV
ECYSPFNQTMKYYGNSTVPGAHFPFNFMLIINFNRQSNANQLQTLVTKWI
KNMPKGMWPNWVVS.

mRNA from alignment at scaffold56:550414..558481+

Legend: exonpolypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=mRNA|length=8068bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA
TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT
GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT
GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGTAAATGACATTCCAAAAATTT
TAAAAATGTAATTTAATATTCTCAAAATATTTAACTTTGGGTATTTTACA
CACAAAGTTAGTTGTTTTGAATATTCTACATTTTACTTTAAAATAATAAA
AGAATATTGTAATTTATTTATTATCATTAAAATTTAAAGAATTTTACAAT
TATTGTTTTTTTCTATTTTGTTTCATTAAGAAAAATTACATTTGATTTAC
AATATTTCTTCCGCCGATATATGCTATTAGGTAATTATACTGCATTGTAT
GCTGACTTGTTGTTTTTTCATTAGGTGTTTTTGTTTTTAAATTCGTCCAT
GCTTATAAAGTTATATGACTTTGTTTAAATTCGTATTGATATTGTGTCAA
TGTTATAGTTAAGTGTTTTCAAAAAATTACACTCCCTACTTGTAGGAACT
TTAAAACAGGCTTATAAAATAAAAAATAGAGAATATCCATTTTGTTATCA
TGTATCAATACCAATGTTATTATTTATGGGTATTTTTGTATGTATATTAT
GGACACGATTGTTATCTAGATAATTATCTATCAACAACGGTGTTCAATGT
TAAGTTTTTAGACAATAATTTTTGAAGCAACTTTCTTCTTATAATAATTT
TATTGTACACACCCATTATTTGAAACATAACTATTTATTCAAATTAAAAT
ATAATAACTTTGTAATAATATTACTATGATGTGTTTGATTGTGCTTATTA
CCACAAATAATTGGCTATTACTAAATTACGAAAAAGATTACATATTGTAG
CTAGTTGAAGTCATACCTTCATAGATTGAAAAAGTTATCGAGATTCTATG
AAAATAAGGGAAAACCCTCAAAATATTATGATTTTGAAAATTAGTAGATC
AGATTAAACATTTTAGATATCTTCCTTGTTCATCGATAATCTAACTCTCG
ACGTACTTGCATGGTGATGGGGTTCAAAATATTTAACTTTCTCTTTCTTA
ATTTTTAAAAAAGGTTCCGAAAACCCTTTATAATTTAAATATATATTAAA
TAAGTTATGTTATATACTTGTATTGAGTAAAAAAAAAGACTTCTGAACAG
TGTTTTATGTGTAATCTATCAAAGTTAAAAAAAAGAAACGTTTTTTTTGT
AAAAATTCAGAAAGTCTATTCGTATTTTATTATTAAACATTTTCTAGGGA
AGAAATTATACAATTTAGTACGTATTTAAGTAATTTCATTGATGTATAAT
GGAAAGGTGGCTAAGAAACTTATTACATTCAATTTTTTTTTTATCTTTTA
TTACACATTGTCATTGAAGCCTTTTATAATAGTCATGTTAATGTCTGTCA
GATTACAATCTATATTTAACTCAGCTACGCCACATCTTCATAGCAATGGT
TCTTTTAATTTAGTATAATTTTTGAAAATTAGCAATAATATAAATTTCTG
GGGCGTATTTTTTGATGCAGCCAGAAAAGAACAAGCCTCTATAAAAATCA
TGCGGTGACTTTTTTGTTATTTTTAAGGAAATTTCAGAAAACAAAAAAAA
GTTCATTCAATAACACTTAATATAAATTTATAAAAAAAATTCCTTTAGGC
CTATAAAAAAAGAATTCTTAATATCTACCTATAATAAATTTACATTCATG
ATGTTCCTATACAACATGAAAATATATCATGTAATAGCTTTATGGTAGAT
ACAATTAAAAATCATAATCAATAAAAAATTATTTCTATTAAATAATTTTA
GGTCTCAACAATTTCCATTTTGATGGGTTATTAAATAACTAAGCTTTTTT
CTTTTATAAATTGAGTTTTATTGAACATTAAATTAAGTTAATAGTAGATC
AAGATTTAATAAAATTTTAAAAATATTTTATGTATAAACAAGTAGATTAT
AGATTTGTATAGTAAGCTCAAACAATTATGTTTGTTGAAATTATAAATTA
ATTACTGTTTACCTAAAATTAAATGAAATTTCTGGTGGACTTAAACCATA
TATTTTTAGGAATAAATGAACAAGTAGAACATTTTTCAAATATTGGCGTT
TCGGCTATTTGGCTNAGGAATAACTGAACAAGTAGAACATTTTTCAAATA
TTGGCGTTTCGGCTATTTGGCTTACTCCAATTTATCAGACTCCTGGAGTT
GACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGATGAAACTTTTGG
AACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCATAGATACGGTA
AGCACTACAATGACGTGTAAAACAATCCAAAATAAACAAAATTTTATTGT
TTTACTAGGAATAAAAATTATTTTGGATTTTGTTCCAAATCATACAAGTG
ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA
GACTATTATATATGGCATGATGGAATTAAAAATAGTGAAGGCAAAAGGAT
GCCTCCTAACAATTGGGTAAAATTAAATATATATTATATATTTTTTGATA
ATACATCTATTAATAATTATTAATAGATGTATTTTTATCAAAAAAGTAAT
ATAAATATTAATTAATAAAAGTGTATTACGTATAATTAGTGATGAAAGAA
GTGAAAAATTCAAAACAAATATTAGAAATTTACACGAGTATTTAGACTAA
ATTTTTGTTAGAAGTATTAATTATATAGTACAATAGTTTTATCTAACCGG
TTTGGATGTGTGACTCATGATAAGATCGTTTATTTACTTATTTATATTAA
ATTACGTTTGTGAAGTGCTTAGTATTTACACGTATATTTATGATTATAAT
AGTTGGTATGATCGTTAACCTTAATATTTGCCGTGATTATTTGTTTGTTA
AGTTTTGGTGTTAATATATTGTATATATATCAACCCAGTATCCCCATCTA
TTAAATCTGCTCAACATCTATTTCAAAACATAAATTAACAGATGATTTTT
TTCTAAAAGGTGTTATGTACTCGTTGCGAAGTTTACATTATGAGGTTCAA
TCAATAAAAAATTAATTTCTAACCTAAGAAAACACTTCAGAAATAATTCT
GCATAAAATATATTATCTCATTAACGACATTATACTACATAAAAAACAAC
ATTTAGATCTTAAAAAAGATATAAACATTTTAATTACTAAGTTACCTGCC
AATAATTTAATTTAATCCATAAGCCACGTTTGGACTTGTTTGAAAAATAA
AATAGAGTCAAAATTTTGTAATTTAATCTTATCAATATCAAAGAATCTAT
TCCTAATCATAAATCAATTATTGGACGTAAATTAGGTTAAACCTAAAATT
ACCCTTTATTTTCGTTAGTCAATTAGGTAAAGAATCAAATAAGTCTAGAC
TTAATTCAACTGAAACAATTCGCTTAACATTGTAATCAAAAATATTTTTA
TCCAAGCTCCCAGATTGCATAAACATAGGAATAAGTTCTGATTTTACATT
TTACCAGTAATTCGTTCTGCTATGAAGAAGGAAGGAGCATGATCATAGAA
ATACATCTACTGTAGATAATTAATAGTTTATATATGCATTCATAGAGATA
TAAATTTTATAGAAATAACTAATTAAAAGCGCAATTGATTATAAATGTAT
AACTTAGAATTTGTCTTATTTTATAATTAATAAACTTTTATATGGTTATT
TACAAAATACTTGTGGTTTAAAAACAAAAATAAATATGCCGAGTTTAAAT
TATTTTGTAATTACTGAAACTTGGCTCACTTCTGAGATTAATGATTTAAA
ATTAGGTATGATAGACTATACTCTATATAATTTACACTAAAATTCTAGCA
AAAGTATTCATAATATAAATGGTGGCTTATAGCTATACAATATTTCTTTA
AATTACTTACCACTTCAAACTTAGATTGCGAGCAGTTGACAATATTAGTT
ACATCTTTAATATGTTACATTTTCACTATTGAAAATCTTTATAAGACAAA
ATGTGACTTTTATTTTGTCCGTGACAATTATTATCCTATAGATTTGTGTT
CAATTGTAGAGATATTTTACCAAATATTATATGATACCTTCTATAAATTT
ATATTTAAAATTAAGAGCATTAAAAAACACATTTATAAATGATATAGTTA
AAAGCTAAAAATTGTATATTTCGTAAAAAAACTTAATCATAAAAATTATA
AGCTCCATATTTTATGACTAGTTCAAAAAAATTAGTTTGTAAATTTAGAC
CCGCAGGAAACTTTGGAATCTTCCAAAACTATGAAATCTATTAGAATCAA
TTTTGTCTAATATATTTAGTAATACGCTGTCATTATTTCACCATAGATTT
AAATCTGAACTGTCTACCAAAATCAATATTTTACTTTTGTTGAGATTTAC
TTAAATCTATTGTAAATAATCATCAAGTTGACGTCATATATAATGATTTT
CACAAGGCATTTGATTATCAATTTACAACTACTTTAATCCCTCGAAAAAT
TGCACATTTATTATTCCTTTCATCCAAATTAGTAAATGNCATTTATTATT
CCTTTCATCCAAATTAGTAAATGCAACTATTTCATGCTCATGTTCTCGTT
TTTATGAACTCATTACATTCCATGTACTCTCGCATTGTTAACTTTACATA
TTTAATTTTACTGTACAAATTACGGTCTAAATAATCCAATCGAATGAATG
TTAAATAGAGTAATACAATAAAGTTGATATTTTTTAAGATAGTCTAACTG
CCATTAATCTTATTCTCTTATTTTTAGTTTCAATGTAAAGCTGAGAAGGT
ATTGATTTTACTATGATGTGTTTATTTTATTTTGTATCTATCTCTACTTT
TTATCAGGTCTCACTGGACTAATTTTTTTCAACGATACGTCAAGAGACCA
CAAATCGTATCTAGTTGAAGAAATTAACCCCAAAAGTTAAAAAAATCTAT
TAATAGTATTTGAGCCTTAAATGTCGTTAATTTTATATAAAATAATTAGA
AATACGAGGAGTAAAAAATTATTTACACCTTAACACATAAACATATAAAA
TTTACAACTCATGATGATTCATCCACAACATTAGATAGTGTGTCTCTCTT
TTATAGAATTAGTTTACACTATCTCAAACTACTTAACATAAATATTGCAA
TGAGATTATAGTAGGAAGGTCCACAGCCAACTGGCCGGCTAATAAAATTG
TATGACAAATTCTTTATTCAGTTTAAACATTTTCAATTTCGTTTGACAAA
AAAAAAAAATTAAAAAGTAAAACCCTTTTGTTAATATTATTTTTGTTCAG
CTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAATGGAATGAGCAAAGAAA
CCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAACCAGATTTGAACTTCA
GGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAGTCAGTACCTAAAATATGAAA
CTATATTTAATAATACTTTTTAACAAAAGTTCTATTGATTAATTAGAAAG
CGTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCT
GCTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGA
AAACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACAT
ATACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAA
CTACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTTTAAGATTA
TACTAGTTATTATAGATGTGGGCAATAACTGCCCATGCATTTAGACCTAT
AGGTCCATTCTGCACATAAGATTGTATTAAATGTAATAATTAACGTTTAA
TTATTTTGATTCTTGTAAAATCTTATACTTCCTTTGTTGGACATTTTTTT
TTTAAGGTTTTAAAAAAAATTAGGCAAATATTTCTTTTGTGTATTTTATG
ACACATTTTATTGATTAATAATTGATTAGTAATTAGTCATCGCATCATAA
AGTTTTAATTGCTTTTCTAAATTATTGTTTCATATAATTATTATCTAATA
TTATTTATATGATTATTTTATTGAAACAAATCTACTTTATTAGACACTTA
TGAGTAAAATGTTTTTCAAATATATTTTTTTAATGCTTATTTCAGAAATT
TTTAAAAAATATGGCAGTGACAAGTGGTTTGAATGTTACAACTTTTCAAA
GTTGACGAATTAAAAACCAAAAATACTTAAAAGTTGGGTTTTTTAACGCT
TTTTAATAAATTTTATAATGCAACAATAAATTTAAAAATGATCAAAATTT
AAAGATAAAGTTGAAGAAGAGGGGAAAAATTGGGTATTTACAAATAATAA
TATGAAAGTGGTAATAAATTTTACGTAGGATAAACAAAAAGAAATATAGA
GGCCAGGTTTATAGAGCACTTAAAAAACATTAAAAATCAAAAAGTTAATA
AATTTTCGATNAGGATAAACAAAAAGAAATATAGAGGCCAGGTTTATAGA
GCACTTAAAAAACATTAAAAATCAAAAAGTTAATAAATTTTCGATGACTG
AACATTTATTGACACATAATAACTCCATTAGAACCATAAAACTAATTAAA
AACATTAATAATTACAAAGAATTTAATATAATGGAGGCAATAGAAATGTT
TAAAAATAAGAACAATTTAATTAATTGGGATCTTCGTCCAATGAAAAATT
AATTATTAAACTTGTGTAAACAAGCAAAATATGATAATATTACTTTGTGA
TAACGTCACTAGGAGTATTTTCCGGTCGGGATGTCAGTATGTGTTAAATG
TTGATAGTGGTGACATTATTTCCGAAATACGTAATCATGATTTTTAGTCA
ACTTTTGATAGCTTATTGAGTTTAATATGTTTTAGATTTAAATGAATAAT
ATTTAAATATAGTTTTAATATTAAATATCAACATTTAATTGCAGTTTTTC
AATGGCTTAATGTTAAAATATAATCAATTTTTTGCTATACTACAGATTAA
AGCAAAAAAAGACTACGATAGAGTTCAATTGTTTTATAAAATAGAACAAT
GTTTTATGTGATAAAAATTTATCCATAATTTAATAAATATAACTCTTTAT
TTTAATTTGTTTTGAATTATAATCCATTTTAACTTTGTTTAAAATGATTG
TAGTCAATCACATTAGTTTGACGAGTATAGATAAAGGTATCACGACAGTA
TTTATCATATCATTAGTAGAGATATACTTTTTTAGATGAAATTTAACATT
AATTACCAAATTCATCATAAGTAAAGTTCTACTTTTATTTTTCAAATACA
CACTGTAGTGTATTGATATTTACCTTAAATCTGTGTTACGACTTTTCCCT
TTACTTCACAAATCTTTCATAATAATTTATTTTATTTTTAATTTCCTAAA
ACGCAATATTACTAATTTTATTACATGTTTATAATTGTTTGACACTCGCT
ATAAAATATAAGTTTAAAAAATGTGTTAAGCTACCTAGCAATGTTCCATT
TATTAAGCCATATTTTTTAGATGACTTAATAACTAACGACGTAACTTTTA
ACCAGCTATTTTTTGCCCGTAAATGTTTACATTTTCTAAACTAGCATAAT
AAACTAAACTAATTTAATAAAAAAATTTTGAAAAAAAACGGTGTCTCATA
AAGTAGATTTTACCATTTTTTTAATTATTTATAACAAGTATGTGTTTAAC
AACGAATGTGATAATTTATTTTATAGGTAACCTTTTATATATCATTACTT
AATATTGTAGGTTACTAGTTGTTGAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACT
ATGAAGTACTATGGTAACAGTACTGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAA
TTTTATGTTAATTATAAATTTCAATCGACAATCCAATGCGAATCAATTAC
AAACTTTGGTCACTAAATGGATAAAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCT
AACTGGGTGGTAAGTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold56:550414..558481+

>DV3005151-RA ID=DV3005151-RA|Name=DV3005151-RA|organism=Daktulosphaira vitifoliae|type=CDS|length=1095bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold56:550414..558481+ (Daktulosphaira vitifoliae)
ATGATTAAAGAAATCATTTTTCTAGTGTTAATATTAATCCAAATTATTAA
TTGTGAACTCATATATTCTGGTCAAGATGCATCATTTAATCCAGATTGGT
GGCAAAAAGAAATAATTTATCAAATTTATGTAAGATCATTTAAAGATAGT
GATGGTGATGGAATTGGAGATTTAAGAGGAATAACTGAACAAGTAGAACA
TTTTTCAAATATTGGCGTTTCGGCTATTTGGCTTACTCCAATTTATCAGA
CTCCTGGAGTTGACTTTGGTTATGATATTTCAGACTTTGAAAGAATTGAT
GAAACTTTTGGAACAATGAGTGATTTTGATAATTTGGTTGTAACGTATCA
TAGATACGGAATAAAAATTATTTTGGATTTTGTTCCAAATCATACAAGTG
ATAAACATGTTTGGTTTAAAAAATCTGTTCAAAGAATAGCACCATATACA
GACTATTATATATGGCATGATGGAATTAAAAATAGTGAAGGCAAAAGGAT
GCCTCCTAACAATTGGCTGTCAGTGTTTAATAGTGGTTCCGCGTGGAAAT
GGAATGAGCAAAGAAACCAATATTACCTTCATCAATTCCTAGAAGAACAA
CCAGATTTGAACTTCAGGAATCCAAATGTTGTACATGAAATAAGAAAAGC
GTTATATTTTTGGCTTGAACGCGGAGTAGATGGATTCAGATTGGATTCTG
CTAATTTCTTGTTTGAGAGCAAAGATTTAAGTAATGAACCAAAAGCTGAA
AACAATACTAACATGAAAGATACCGATTATTATTCACTAAATCATACATA
TACTATTGACCAACCTGAAACCTATGAGTTACACCATACATGGCGAGAAC
TACTTGATGAATACAAAGAGAAAGATGGTTCAACCAGGTTACTAGTTGTT
GAATGTTACTCTCCTTTTAATCAGACTATGAAGTACTATGGTAACAGTAC
TGTACCCGGTGCACATTTTCCGTTTAATTTTATGTTAATTATAAATTTCA
ATCGACAATCCAATGCGAATCAATTACAAACTTTGGTCACTAAATGGATA
AAAAACATGCCCAAAGGCATGTGGCCTAACTGGGTGGTAAGTTAA